BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392F07.T7 (MSMg01no392_f07.b1) | MSMg01-392F07.TJ (MSMg01no392_f07.g1) |
ACC | AG493890 | AG493891 |
length | 771 | 730 |
length of high quality (start - end) | 490 (50 - 539) | 398 (75 - 472) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_f07.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_f07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_f07.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_f07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:49 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NAATCTATTACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTCATATTCCTAAAATGTTACAGATGAAGGCACTTTTTAAAA
TGAGATTATCTGGATGTAACAGTTTATACCTATTACCATAACATTCAACT
GAACCCAGAGGCCATGGGTTTGAGGTCAGCTTATGCTACAGTGACAACAC
ACATACACACACACACACATACACACATACACACGCATAATGTGTATGGG
TATGCATGCAAAATTAGTTTAGATCTGTAGTATATGGGCTACTTCACAAT
TAAAGTGTGTCTAGAGCATTTATTTAATGGTCTATCTTAAGATAATTTTG
TTCAGATACTTAGAACACCTGAACTATGAAAGAAAGCTACTTGATTTGCT
AGCACATTAATGCAGACAAAATATTCACATACATAAGATAAATAAAATAA
AGGAATGCAATGGGATGGTGATAAATCCAGTACTTTATAATAGGTTCAAA
TACTAAGCTAAAAATACATGAAATTGGTCAAATTGTTTCAGTTTCAGAAA
ATCATCATATTCTTATTTTGAGTTGTATATGTTTTAAAGTGTTTGACGCC
CCCATAACATGTGGGCCACTATTGTACCCACGGGTATATCTTGCAGGCAG
GTTGCTATTGTAACTTGCCCAGTTTGTAGCTGAGTAAAGTCAATGACTAC
TCTTGCTCCTGGGAACCTTACAAAACCCTCCGCCACCATGAATACTTGGC
CGGTAGGGAGGAAAAAGTACN
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAA
CTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCTCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTG
CGCCACCACTGCCCAGCTCAATTATCTAAATTTTTAACTAAAAACTTTCT
CTTTTATCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTCACTCTCTCCTTTCTTT
CTTCACTCTCTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT
TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCCTTTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTT
CTTTCTTTCTTTGAGACAGAGTTTCACTGGATAGCCCTAACTGGCCTATA
ATTTGCTGTGTAGATCAGGCTAGCCTCAGTTTCACAGGGTTCTCCCTTCC
TCTACCTCCCTATTGCTGGATTTTAAAGGTGCGGCTTTTTCTACATGTTT
TGAGAGAAAATCTCACTCTATAACTGAAGCCGGCCTCAAATTCTCTCTTA
TTGTTTTTTAACCTACAACAAATTATTTCGCGTGGTCACCCGCTGTTACG
CGGATCCCGTCTTCTTGCCCCTCGCTCTCTCTTGCCTTTTTGTCCCGTAT
ACCCTGTTCTCCCGTATCCTTCTTCCGCCT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 9 9 9 10 10 12 20 19 11 11 11 11 11 30 30 33 33 33 37 33 28 35 35 23 23 15 13 12 9 11 11 14 12 12 12 13 21 23 20 20 26 26 28 22
28 28 31 23 32 30 33 33 33 33 21 21 11 10 13 11 10 10 13 15 16 37 28 28 28 37 32 37 36 36 36 39 44 53 53 50 48 48 57 57 50 53 59 57 53 53 57 57 54 54
48 48 42 48 48 54 50 50 50 48 48 47 50 50 57 57 57 54 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 50 50 50 47 47 47 47 57
57 57 57 54 50 50 43 57 57 57 57 54 54 57 57 52 57 59 59 59 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 52 62 62 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 45 45 45 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 44 43 31 31 29 38 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62
62 43 62 39 39 43 57 59 68 59 59 57 44 38 38 38 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 59 59
59 59 52 57 52 54 52 57 59 59 59 57 52 43 32 32 20 20 23 43 43 52 52 44 43 28 28 28 43 43 59 37 37 35 44 42 37 37 57 57 68 57 59 57 48 48 59 59 59 57
54 57 57 57 57 57 57 47 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 43 43 31 31 23 36 44 47 46 57 57 57 68 68 59 59 48 48 43 39 36 39 39 42 47
43 43 43 39 32 39 37 43 57 57 48 57 57 57 43 43 43 43 41 37 33 33 33 32 29 27 25 30 30 37 37 46 43 43 35 35 24 25 16 12 11 18 22 23 12 10 10 15 21 27
18 22 17 19 19 23 23 23 34 30 32 20 20 20 34 34 46 43 59 28 28 13 13 13 14 17 18 30 23 30 15 15 15 26 21 27 18 23 11 11 9 9 9 23 23 37 32 32 26 29
17 17 10 10 11 15 16 30 24 24 15 13 9 11 11 12 13 20 28 35 32 24 24 18 18 20 17 19 11 11 9 11 9 11 12 11 18 16 19 11 11 10 13 10 10 10 10 10 16 11
14 15 15 16 16 17 16 16 18 11 9 9 9 12 13 15 18 16 11 11 11 11 11 15 23 13 13 9 14 9 15 15 11 11 11 12 16 15 10 9 9 10 10 12 11 24 24 24 24 11
11 11 11 11 11 9 9 9 10 10 12 10 14 10 10 10 10 10 10 17 12 15 12 14 12 10 9 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 13 9 8 10 11 18 14 16 16 11 12
11 11 10 9 9 8 8 8 8 9 11 11 11 10 9 8 10 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 10 10 10 10 9 23 3 0 3 19 23 31 31 43 37 37 41 42 50 50 50 50 50 50 47 37 25 23 10 9 9 11 12 10 9 9 9 9 17 16 26 21 29 25 26 11 15
15 27 27 53 53 53 53 43 28 19 10 15 11 10 10 10 18 23 19 32 36 36 36 40 42 42 47 57 57 57 68 68 57 54 54 54 54 54 54 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57
50 50 50 50 50 50 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 48 48 46 46 46 50 59 68 68 68 68 68 68 68
57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 68 44 44 35 35 43 59 43 43 43 44 44 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59
57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 47 47 42 42 43 44 46 43 59 44 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 46 57 57 48 43 43 43 31 44 28 30 30 37 37
43 39 37 37 30 30 30 34 32 33 28 18 14 14 28 28 28 30 28 28 20 18 18 18 29 30 24 18 15 15 18 12 12 12 19 25 21 30 32 27 21 27 25 37 41 39 43 40 40 39
43 59 47 48 48 48 48 47 47 47 35 35 32 32 30 30 22 22 22 22 25 28 34 33 31 31 30 34 22 19 11 11 11 14 18 28 34 31 26 21 14 14 17 14 14 13 19 19 12 12
12 15 11 14 13 14 13 17 9 10 10 16 17 13 16 11 10 10 10 8 6 6 6 8 15 21 17 18 22 21 15 13 10 9 9 8 8 12 9 8 8 10 10 10 8 10 6 6 8 6
8 8 10 10 11 10 11 19 11 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 16 19 12 12 12 12 10 13 10 9 10 8 10 8 8 10 15 15 10 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 8 6 9 9 11 11 15 10 10 10 10 8 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 10 19 13 21 13 9 8 8 8 12 14 10 10 8 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 |