BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-464F15.T7 (MSMg01no464_f15.b1) | MSMg01-464F15.TJ (MSMg01no464_f15.g1) |
ACC | AG548787 | AG548788 |
length | 768 | 751 |
length of high quality (start - end) | 139 (337 - 475) | 477 (79 - 555) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no464_f15.b1 PHD_FILE: MSMg01no464_f15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:39:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no464_f15.g1 PHD_FILE: MSMg01no464_f15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:39:05 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTATTCCTCCTGTCACTAAANGAGGNACTATTGCGNTACCCGCCGNGGA
ANNCNNAANGTTTCGANCACCAGACANGCAGANAGGNNNCANTCAGGCAN
CAACATAACGCAATTATTCGCCCCACTGGACACCCCTTAATAAAATAATA
TATTATAAATAAGTTTCTTTATATAGAAATATGGATAAAGCAAGGCTATG
CACTAACTCATTGATGAACTAGTGTGTCCAGAGCAGAGCACAATAGCTCT
TGCTGATAGTCCCAACTATTTGGAAGGTAACGTAAGAAGCTCATCTGAGC
CCAGGAGCCTGGTTTTTCTCTTTTCACAAAGCAAACATACTTCTTTCCCC
TCTACCTTTCTGTTCCCCTGTCCTCTCCTCCTCTCCCACCCTCTCCCCCT
CTCCCTCTTATCCTTGGCTGGCCATGAACTTGCAGTAGGGAAGGCTGACC
TGTTCCTTGTGCTCTCACCTCCCAGGAATTACCAGCGTATGCCCATGTTC
CCTTCATGGGTGCCGGGGAACAAACCCGATACTTCATACGTGCTAAACCC
ATATTACCAACTGAGCTACATTTCCAGCCATGACCCCCCCATATTCCCAC
ATCACGCTATTTCACCCCCCCCTTTATTTACATATCCGATACAAATTTTT
TATTTTTTTTTCTCCCCCCCCTTTCTCTTCCTTTACCCCTCTCCCCTTTC
ACCCATCCTGCCAAAAAAACTACCTTATACTTTTCCACCCCTCTTTTCAT
CATCCCCGTTTCCTTTCN
| TCATGCTGTGGGTAGGCCGGGGGCGCCTGGTTCCAAAATTTAGGNGACCT
ATAGAAGTAACGAAGAAATCCAGGNCCCAGCTCAGCTTCTTCCTTGCCAG
GTGACCAACCACAGGCCTGTCACCTCCCCTTCGAGGAGCCTCTGCTTAGC
TACTAATGGGTAGTCCTTCAAGGGAGGAGCTCAAGGGTCCCAGAACTGAT
CATAGTGATAACTCCCTGCTACTGACTCTTCCCTAACCTTCGTGGGTAGA
TGGATTTGAACTTGTCCCCAACAGCCTGGGAGCTTGTCCCCTTCTCACAG
GTGTAGAGTGGTTTTTTTCCAGAAGCCACCAGAGCTGAGAGGCCATCTCT
TAGCTACTTCAAGGTGCAAGAGCATCACTCTGGGGCCGGACTTGTGATAC
TGACTCCCACCTGCCTCTCCACCTTCCAGGCCACATTTGACAAGTTTGAT
GAAGATGCCTCTGGGACAATGAACTCCTGTGAACTGAGGCTGGCACTGAC
TGCTGCAGGTGTGGCTGAGGACCTGGGATGGCTGTAGGGACAGCAACCCA
TCCTCTTATTCTTGTCTGCATCCCTTCAGCTGTGGGCATCCCCAATAGGC
TGTCCACAAGTCCCAGAGCCTATTTCCTTCCCTGGAGGCTCTGACTGCTT
ATCTGTGGGATGGCATATGTGGATTATGGTTGGAGTCCCCTATATGCCAT
GAAACCCTCTTGATACCCTACTGTTCTCTATGTAGTCTATTGAGCTTTAC
N
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 6 6 7 9 10 14 11 10 9 9 9 9 9 9 11 11 12 3 0 3 9 9 3 0 3 15 6 6 6 6 6 6 3 0 3 7 8 8 10 11 11 11 3 0 3 13 13
3 0 0 3 0 0 3 3 0 3 6 7 12 9 9 3 0 3 6 6 6 7 7 10 9 3 0 3 16 15 27 3 0 3 27 3 0 0 0 3 3 0 3 10 10 12 12 21 3 0
3 11 17 17 28 34 34 25 16 12 17 11 10 9 11 12 10 9 9 9 10 12 10 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 9 10 10 11 27 26 30 30 32 33 37 39 43 48 48 48 39
39 32 28 28 28 28 22 24 24 19 19 12 12 12 12 11 15 23 21 28 21 22 18 28 24 28 24 26 26 17 13 13 12 12 12 23 23 30 33 37 36 36 24 26 14 14 14 34 28 28
19 19 16 24 18 15 15 19 15 18 17 16 26 29 28 13 12 8 8 8 8 12 13 21 25 15 15 13 22 24 28 28 21 19 12 12 11 12 12 30 24 22 22 12 11 11 11 9 11 11
13 12 12 12 20 16 18 21 18 13 12 24 16 19 20 32 35 57 43 32 28 14 13 13 18 18 18 15 15 12 12 12 15 12 12 12 10 8 8 8 8 8 9 9 9 10 19 20 36 43
39 34 25 16 11 11 10 10 11 16 13 14 9 9 9 12 9 9 9 9 10 11 10 13 19 15 12 12 12 19 21 36 23 24 17 17 11 16 25 47 34 36 28 28 25 37 43 48 48 48
48 40 40 25 25 25 43 43 32 25 18 12 12 25 25 37 44 28 25 20 23 23 29 40 43 43 43 46 44 47 47 47 48 48 48 44 42 30 30 30 44 44 54 54 57 54 54 48 47 44
39 39 46 46 43 43 47 42 35 35 33 36 24 16 12 11 11 12 12 15 15 15 17 27 27 42 30 30 30 34 30 14 14 15 21 21 23 20 28 20 20 31 36 37 43 36 46 46 48 37
37 32 32 37 39 43 42 39 35 35 21 23 12 13 18 18 18 25 28 34 39 32 32 19 19 15 15 22 24 13 10 8 6 6 8 8 11 11 12 11 10 16 11 11 10 10 10 17 19 10
12 12 21 13 16 15 15 12 11 12 12 18 18 15 12 11 11 11 12 22 16 17 13 13 10 13 10 11 11 12 12 12 12 12 11 11 11 15 12 11 11 15 18 15 10 10 13 10 11 9
11 11 12 12 21 20 21 12 12 12 15 20 18 11 11 18 18 15 14 13 13 18 12 15 10 9 9 9 10 10 10 10 10 9 9 9 8 10 8 9 12 8 10 9 10 9 12 10 10 10
10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 10 15 14 16 10 10 15 12 11 10 10 8 10 8 9 10 10 8 8 13 10 10 6 6 6 8 8 8 8 11 9 14 15 15 10 10
8 8 8 13 18 12 11 11 8 10 10 10 10 10 12 18 16 22 11 11 11 10 10 9 9 8 8 8 8 12 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 10 10 15 13 13 13 13 8 8 8
6 8 8 8 8 10 11 8 9 8 8 8 8 10 9 10 10 9 9 9 10 9 11 10 10 10 10 10 8 9 10 10 14 14 14 11 11 11 17 13 8 8 8 8 19 14 12 10 8 8
8 8 8 10 10 13 10 10 9 12 10 10 10 10 17 12 3 0 | Open.Hide. 7 7 11 8 6 6 6 8 8 12 10 10 10 10 8 9 11 11 11 10 10 10 18 22 18 19 12 12 9 6 6 8 6 6 6 6 6 8 10 10 15 12 12 3 0 3 12 12 14 25
22 24 21 19 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 11 9 12 10 15 10 13 13 3 0 3 15 16 20 25 27 36 37 37 37 37 42 41 39 44 39 39 39 39 39 19 13 13 14 19
19 39 39 30 24 23 27 24 13 13 12 12 13 21 24 25 24 34 28 37 37 39 31 32 37 37 33 33 33 33 33 33 37 47 47 59 59 44 41 41 44 44 44 47 59 59 59 59 59 59
47 57 57 47 42 42 39 43 39 48 48 48 48 48 43 43 43 43 40 43 43 46 48 48 68 68 68 68 57 57 46 46 43 43 46 46 48 43 43 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 68 57 57 57 44 36 28 23 23 23 24 23 37
38 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 57 48 48 48 57 59 59 48 48 48 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 48 48 48 48 47 32 31 18 15 15 9 10 10 12 8 8 8 8 8 8 24 28 41 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57
43 40 19 19 21 25 36 30 32 44 46 43 37 39 35 35 37 39 39 59 57 48 48 48 59 57 68 68 68 68 57 57 68 59 59 43 43 44 44 48 57 57 57 57 54 54 57 59 54 54
54 57 47 47 47 50 50 57 57 57 54 57 54 57 57 57 57 52 52 43 52 52 52 57 57 54 54 52 57 57 59 59 52 52 48 59 57 57 57 50 44 57 43 43 43 57 57 50 54 48
42 42 35 35 32 42 42 57 46 46 43 36 36 28 37 42 42 42 37 43 43 46 42 47 37 39 39 44 42 48 43 43 43 43 36 44 36 43 43 39 37 37 28 28 37 37 39 47 43 43
43 46 42 37 28 23 23 23 28 37 43 43 43 36 36 32 37 28 28 28 30 32 33 34 30 22 25 25 24 20 22 24 23 25 28 28 28 30 37 39 39 34 31 24 24 24 22 25 28 31
31 35 27 21 13 11 11 11 18 16 19 16 12 8 8 15 11 10 11 24 19 19 19 11 11 10 17 10 11 12 19 12 13 10 10 10 10 10 10 21 13 12 8 8 8 8 11 9 9 8
8 8 8 8 8 8 12 21 14 10 10 9 9 10 10 10 9 11 11 10 10 10 16 14 9 10 10 12 26 26 33 29 27 20 18 22 14 13 16 13 15 13 18 9 9 9 11 11 13 11
11 12 12 12 22 19 19 10 11 12 12 16 9 10 8 8 8 8 10 10 10 10 12 16 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 10 13 17 15 21 15 15 9 10 8 10 8 8 6 6 10
10 10 14 21 12 12 8 8 8 8 8 8 11 12 11 10 8 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 12 12 11 11 10 10 10 14 13 10 12 3
0 |