BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-008M07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,363,236 - 118,487,509
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-008M07.bB6Ng01-008M07.g
ACCDH844913DH844914
length563990
definitionDH844913|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008M07, 5' end.DH844914|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008M07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,363,236 - 118,363,797)(118,486,518 - 118,487,509)
sequence
gaattcaaagtggactctcaggcaaattccaaaccttggtcaggtcccct
gtggcttcaccatgggactgctgaccaagtgtctttatgcccatctcttg
cccctcttaagccccctactctggcatcctggagatccatgtttaaaaat
gcttcacagcaggaaactgggctgatggattaatcaatcaaccaacaagt
atttattgagagcacctaatttttacccagtaaatgctgaccagagaaga
tgacagagtggcaggtaatggagcacctttcaaagtcagatggaggactc
acaggggatacagagatacgcctctgcccaacaaatagttatgggagcct
tttgtgatctgtgtgggggcatggggaaaaggagactgcatgacctccgg
gtctggatattctagttcctctcaggtgtgaaagcatttttccctggaat
ttcctggagcatgttagaagcttcactcaagactttttgtttctggaact
ataatgaaataaatttcatgtttaaaacttttaaacgtgtgtgtgtctgt
ctgtgtgtgtgtc
gaattccaaagcttcagtctaaggtcatgcgctcagataggaaccccaga
atctagttctaaatctctgactgtagagcatccccttcccacgaagcatg
tagcaaatacaggtccatgtgacgcaaggagttgaaagtatataaaaggt
tctttttcatgctcaaagcatcaatgttgtatctttgttggttatgccta
tcttgactactttcaaaagcctgaccctgtcctttctatctcacctcctg
tgcaaggcatggatgctcagtaccagatgcgtgtgtttgactcttccata
tgtgaagaaaatttatagaaattaacactgggggttcaggacagggcaag
gggggttcctctgacagtcactgggagctgtcttatcactggagtgtgcc
ccctcactctctacccatttctctttaatcagagaatgtgcttcacttaa
attcatgcagtatctagtaattttgtggcccagtttacacatacacacac
acacccatcaaagctggagaaaatatggtgggcttccaatgagatctgaa
ctctgcaaatgttggcatgatgaaaattatgaggtaaagcgtttcctacc
acagcaagtctctgctactcaaggtgagttcctgggtggaagatgttatg
agaggacagagacttgcagtgctcagaaacctacataccatcaagtttaa
actaggaaatctggatgctggaagctaaactccctctggaatgacttggt
tctaaagtcttctggagtttcagatggcagatgataagtcccccaaacca
taaaaatacctagatcttagaggctggagagatgcttacttctagtgtta
cacgacttcctgtaactccagtaactccaaccccaaggtatcaacacctt
ctcttcatggcccttgcactgttgacccacacccctacacacacacgaga
gagagagagagagagagagatagagagagagagagagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_118363236_118363797
seq2: B6Ng01-008M07.b_37_599

seq1  GAATTCAAAGTGGACTCTCAGGCAAATT-GAAACCTTGGTCAGGTCCCCT  49
      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTGGACTCTCAGGCAAATTCCAAACCTTGGTCAGGTCCCCT  50

seq1  GTGGCTTCACCATGGGACTGCTGACCAAGTGTCTTTATGCCCATCTCTTG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTTCACCATGGGACTGCTGACCAAGTGTCTTTATGCCCATCTCTTG  100

seq1  CCCCTCTTAAGCCCCCTACTCTGGCATCCTGGAGATCCATGTTTAAAAAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCTTAAGCCCCCTACTCTGGCATCCTGGAGATCCATGTTTAAAAAT  150

seq1  GCTTCACAGCAGGAAACTGGGCTGATGGATTAATCAATCAACCAACAAGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACAGCAGGAAACTGGGCTGATGGATTAATCAATCAACCAACAAGT  200

seq1  ATTTATTGAGAGCACCTAATTTTTACCCAGTAAATGCTGACCAGAGAAGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTGAGAGCACCTAATTTTTACCCAGTAAATGCTGACCAGAGAAGA  250

seq1  TGACAGAGTGGCAGGTAATGGAGCACCTTTCAAAGTCAGATGGAGGACTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGAGTGGCAGGTAATGGAGCACCTTTCAAAGTCAGATGGAGGACTC  300

seq1  ACAGGGGATACAGAGATACGCCTCTGCCCAACAAATAGTTATGGGAGCCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGATACAGAGATACGCCTCTGCCCAACAAATAGTTATGGGAGCCT  350

seq1  TTTGTGATCTGTGTGGGGGCATGGGGAAAAGGAGACTGCATGACCTCCGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGATCTGTGTGGGGGCATGGGGAAAAGGAGACTGCATGACCTCCGG  400

seq1  GTCTGGATATTCTAGTTCCTCTCAGGTGTGAAAGCATTTTTCCCTGGAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGATATTCTAGTTCCTCTCAGGTGTGAAAGCATTTTTCCCTGGAAT  450

seq1  TTCCTGGAGCATGTTAGAAGCTTCACTCAAGACTTTTTGTTTCTGGAACT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGAGCATGTTAGAAGCTTCACTCAAGACTTTTTGTTTCTGGAACT  500

seq1  ATAATGAAATAAATTTCATGTTTAAAACTTTTAAACGTGTGTGTGTCTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGAAATAAATTTCATGTTTAAAACTTTTAAACGTGTGTGTGTCTGT  550

seq1  CTGTGTGTGTGTC  562
      |||||||||||||
seq2  CTGTGTGTGTGTC  563

seq1: chr8_118486518_118487509
seq2: B6Ng01-008M07.g_68_1057 (reverse)

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTGT  50
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTGT  50

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTC-ACAGTGCAAGGGGCCATGAAG-GAAGGTGTTG  98
      ||||  | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| 
seq2  GTGTAGGGGTGTGGGTCAACAGTGCAA-GGGCCATGAAGAGAAGGTGTT-  98

seq1  GATACCTTGGGGTTGGAGTTACTGGAGTTACAGGGAGTCGTGTAACACCT  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
seq2  GATACCTTGGGGTTGGAGTTACTGGAGTTACAGGAAGTCGTGTAACA-CT  147

seq1  AGAAGTAAGCATCTCTCCAGCCTCTAAGATTCTAGGTA-TTTTATGGTTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  AGAAGTAAGCATCTCTCCAGCCTCTAAGA-TCTAGGTATTTTTATGGTTT  196

seq1  GGGGGACTTATCATCCTGCCATCTGAAACTCCAGAAGACTTTAGAACCAA  247
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGACTTATCAT-CTGCCATCTGAAACTCCAGAAGACTTTAGAACCAA  245

seq1  GTCATTCCAGAGGGAGTTTAGCTTCCAGCATCCAGATTTCCTAGTTTAAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTCCAGAGGGAGTTTAGCTTCCAGCATCCAGATTTCCTAGTTTAAA  295

seq1  CTTGATGGTATGTAGGTTTCTGAGCACTGCAAGTCTCTGTCCTCTCATAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGGTATGTAGGTTTCTGAGCACTGCAAGTCTCTGTCCTCTCATAA  345

seq1  CATCTTCCACCCAGGAACTCACCTTGAGTAGCAGAGACTTGCTGTGGTAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCCACCCAGGAACTCACCTTGAGTAGCAGAGACTTGCTGTGGTAG  395

seq1  GAAACGCTTTACCTCATAATTTTCATCATGCCAACATTTGCAGAGTTCAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACGCTTTACCTCATAATTTTCATCATGCCAACATTTGCAGAGTTCAG  445

seq1  ATCTCATTGGAAGCCCACCATATTTTCTCCAGCTTTGATGGGTGTGTGTG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATTGGAAGCCCACCATATTTTCTCCAGCTTTGATGGGTGTGTGTG  495

seq1  TGTATGTGTAAACTGGGCCACAAAATTACTAGATACTGCATGAATTTAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGTAAACTGGGCCACAAAATTACTAGATACTGCATGAATTTAAG  545

seq1  TGAAGCACATTCTCTGATTAAAGAGAAATGGGTAGAGAGTGAGGGGGCAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCACATTCTCTGATTAAAGAGAAATGGGTAGAGAGTGAGGGGGCAC  595

seq1  ACTCCAGTGATAAGACAGCTCCCAGTGACTGTCAGAGGAACCCCCCTTGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGTGATAAGACAGCTCCCAGTGACTGTCAGAGGAACCCCCCTTGC  645

seq1  CCTGTCCTGAACCCCCAGTGTTAATTTCTATAAATTTTCTTCACATATGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTGAACCCCCAGTGTTAATTTCTATAAATTTTCTTCACATATGG  695

seq1  AAGAGTCAAACACACGCATCTGGTACTGAGCATCCATGCCTTGCACAGGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTCAAACACACGCATCTGGTACTGAGCATCCATGCCTTGCACAGGA  745

seq1  GGTGAGATAGAAAGGACAGGGTCAGGCTTTTGAAAGTAGTCAAGATAGGC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGATAGAAAGGACAGGGTCAGGCTTTTGAAAGTAGTCAAGATAGGC  795

seq1  ATAACCAACAAAGATACAACATTGATGCTTTGAGCATGAAAAAGAACCTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCAACAAAGATACAACATTGATGCTTTGAGCATGAAAAAGAACCTT  845

seq1  TTATATACTTTCAACTCCTTGCGTCACATGGACCTGTATTTGCTACATGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATACTTTCAACTCCTTGCGTCACATGGACCTGTATTTGCTACATGC  895

seq1  TTCGTGGGAAGGGGATGCTCTACAGTCAGAGATTTAGAACTAGATTCTGG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTGGGAAGGGGATGCTCTACAGTCAGAGATTTAGAACTAGATTCTGG  945

seq1  GGTTCCTATCTGAGCGCATGACCTTAGACTGAAGCTTTGGAATTC  992
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCTATCTGAGCGCATGACCTTAGACTGAAGCTTTGGAATTC  990