BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009M02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,609,779 - 119,755,574
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBcmo1, Gan
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2
Downstream gene4933407C03Rik, Plcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009M02.bB6Ng01-009M02.g
ACCDH845613DH845614
length6331,081
definitionDH845613|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009M02, 5' end.DH845614|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009M02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,754,942 - 119,755,574)(119,609,779 - 119,610,854)
sequence
gaattcagatccatctttcatgtcatagcaacagaaaggaacaaaaaagc
cccagacagaagctgacagccaaacaacctgcatctgcagataggtgtgc
agagcccagcaccaagaaacaaacagcagccaggaagagtaaacaaatcc
gctgtccaacctcccacgccccaacacattagagacaactgtgtggggct
cccacctgagcccccaagccagccactgagataggggagccctgtgattg
agagggaaccaggcacatttacagaggccaggagcccagggcactagtgt
gagaccagaccaaagccagttggtctcagggacacgaggagaacaccagg
aggtcctgggttatggtctcaaagactagctgtgagtgctttgagggact
aagattgaagaaccatcttatgctatttctaatttttgtttgtttgttgt
ttgtttgttgttgtttttcaagatagagtttctgtcctggctgtcctgga
actcccagtgtagaccaggctggcctctaactcacagagatccgcctgcc
tctatgtcccaaatactgggattaaaggtgtgtgtgaccactgccaggct
agttccagatttttcacatgttgctaccaaatg
gaattctgataaagtgtaagttgccagccttgggatccgtcttggtgaaa
tcaccggttctcaatgtcccttagcctccgtgtctgtgagagccacatat
ctagtagccaggacacaactggcctcatatgagcatattgctattgaccg
gctcagccatctgagcctgtagctcagcaaacacagagggcagaaaggca
gcttgtttggtctaaaaagagcatgggtcctctaaggctctaaaatgacc
tctaattaggcaatggggagatggctgttagttaagtgctttgccaacaa
gcatgaggaccgagcttgggccctagcgcctatgtagaaaagacagcttt
ggtgctacatggtataatcccaaccctggagagaggcagatgcctggggc
tcactggccggcgaattttgtgagctccagatcagtgagagaaatccaac
ctggtttaaaaagaaaaaggagcagggaagcacgcaaacttgttctctgg
tctccacacccatgtgcatgcacaaacacatggctcaaaaagaactgcta
taataggtgcatcctgtgaccccagtatccattctggggatgatacctat
tttagcttgggttcccctgaagccaacacaaggcagggtctcctgcaagc
aatctatgtgggaggagacccagaaaccactcgaagaccctccacagaca
cctgtttatcagtcatagaatctcttgaattcttctatcaccctaacatg
tttgcctcacagaaatgggccttgtgaccatgttctcttgagggtaggtg
ctatccagacacagtacgtgtgccccacactgtgttctgcattccatctg
gcatagcccgaaagccttctctgtgttgttaagaattgtggtcatggttg
ttgccatggtgatgcccaagcatctctctacggacaccatggggtcttgt
ctccttcttcatgtggtggcaggaccggaaggtcagcatttctcaggaga
acctcaaacatgactcagtcagagttcagtgggcctttatccttgtgggt
tgatcatagagggtcaactttacaaagatct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119754942_119755574
seq2: B6Ng01-009M02.b_45_677 (reverse)

seq1  CATTTGGTAGCAACATGTGAAAAATCTGGAACTAGCCTGGCAGTGGTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGTAGCAACATGTGAAAAATCTGGAACTAGCCTGGCAGTGGTCAC  50

seq1  ACACACCTTTAATCCCAGTATTTGGGACATAGAGGCAGGCGGATCTCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCTTTAATCCCAGTATTTGGGACATAGAGGCAGGCGGATCTCTGT  100

seq1  GAGTTAGAGGCCAGCCTGGTCTACACTGGGAGTTCCAGGACAGCCAGGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAGAGGCCAGCCTGGTCTACACTGGGAGTTCCAGGACAGCCAGGAC  150

seq1  AGAAACTCTATCTTGAAAAACAACAACAAACAAACAACAAACAAACAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTCTATCTTGAAAAACAACAACAAACAAACAACAAACAAACAAAA  200

seq1  ATTAGAAATAGCATAAGATGGTTCTTCAATCTTAGTCCCTCAAAGCACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAAATAGCATAAGATGGTTCTTCAATCTTAGTCCCTCAAAGCACTC  250

seq1  ACAGCTAGTCTTTGAGACCATAACCCAGGACCTCCTGGTGTTCTCCTCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTAGTCTTTGAGACCATAACCCAGGACCTCCTGGTGTTCTCCTCGT  300

seq1  GTCCCTGAGACCAACTGGCTTTGGTCTGGTCTCACACTAGTGCCCTGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTGAGACCAACTGGCTTTGGTCTGGTCTCACACTAGTGCCCTGGGC  350

seq1  TCCTGGCCTCTGTAAATGTGCCTGGTTCCCTCTCAATCACAGGGCTCCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGCCTCTGTAAATGTGCCTGGTTCCCTCTCAATCACAGGGCTCCCC  400

seq1  TATCTCAGTGGCTGGCTTGGGGGCTCAGGTGGGAGCCCCACACAGTTGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCAGTGGCTGGCTTGGGGGCTCAGGTGGGAGCCCCACACAGTTGTC  450

seq1  TCTAATGTGTTGGGGCGTGGGAGGTTGGACAGCGGATTTGTTTACTCTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGTGTTGGGGCGTGGGAGGTTGGACAGCGGATTTGTTTACTCTTC  500

seq1  CTGGCTGCTGTTTGTTTCTTGGTGCTGGGCTCTGCACACCTATCTGCAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGCTGTTTGTTTCTTGGTGCTGGGCTCTGCACACCTATCTGCAGA  550

seq1  TGCAGGTTGTTTGGCTGTCAGCTTCTGTCTGGGGCTTTTTTGTTCCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGTTGTTTGGCTGTCAGCTTCTGTCTGGGGCTTTTTTGTTCCTTTC  600

seq1  TGTTGCTATGACATGAAAGATGGATCTGAATTC  633
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTATGACATGAAAGATGGATCTGAATTC  633

seq1: chr8_119609779_119610854
seq2: B6Ng01-009M02.g_68_1148

seq1  GAATTCTGATAAAGTGTAAGTTGCCAGCCTTGGGATCCGTCTTGGTGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGATAAAGTGTAAGTTGCCAGCCTTGGGATCCGTCTTGGTGAAA  50

seq1  TCACCGGTTCTCAATGTCCCTTAGCCTCCGTGTCTGTGAGAGCCACATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGGTTCTCAATGTCCCTTAGCCTCCGTGTCTGTGAGAGCCACATAT  100

seq1  CTAGTAGCCAGGACACAACTGGCCTCATATGAGCATATTGCTATTGACCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTAGCCAGGACACAACTGGCCTCATATGAGCATATTGCTATTGACCG  150

seq1  GCTCAGCCATCTGAGCCTGTAGCTCAGCAAACACAGAGGGCAGAAAGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCCATCTGAGCCTGTAGCTCAGCAAACACAGAGGGCAGAAAGGCA  200

seq1  GCTTGTTTGGTCTAAAAAGAGCATGGGTCCTCTAAGGCTCTAAAATGACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTTGGTCTAAAAAGAGCATGGGTCCTCTAAGGCTCTAAAATGACC  250

seq1  TCTAATTAGGCAATGGGGAGATGGCTGTTAGTTAAGTGCTTTGCCAACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATTAGGCAATGGGGAGATGGCTGTTAGTTAAGTGCTTTGCCAACAA  300

seq1  GCATGAGGACCGAGCTTGGGCCCTAGCGCCTATGTAGAAAAGACAGCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAGGACCGAGCTTGGGCCCTAGCGCCTATGTAGAAAAGACAGCTTT  350

seq1  GGTGCTACATGGTATAATCCCAACCCTGGAGAGAGGCAGATGCCTGGGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTACATGGTATAATCCCAACCCTGGAGAGAGGCAGATGCCTGGGGC  400

seq1  TCACTGGCCGGCGAATTTTGTGAGCTCCAGATCAGTGAGAGAAATCCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGCCGGCGAATTTTGTGAGCTCCAGATCAGTGAGAGAAATCCAAC  450

seq1  CTGGTTTAAAAAGAAAAAGGAGCAGGGAAGCACGCAAACTTGTTCTCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTAAAAAGAAAAAGGAGCAGGGAAGCACGCAAACTTGTTCTCTGG  500

seq1  TCTCCACACCCATGTGCATGCACAAACACATGGCTCAAAAAGAACTGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCACACCCATGTGCATGCACAAACACATGGCTCAAAAAGAACTGCTA  550

seq1  TAATAGGTGCATCCTGTGACCCCAGTATCCATTCTGGGGATGATACCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGGTGCATCCTGTGACCCCAGTATCCATTCTGGGGATGATACCTAT  600

seq1  TTTAGCTTGGGTTCCCCTGAAGCCAACACAAGGCAGGGTCTCCTGCAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTTGGGTTCCCCTGAAGCCAACACAAGGCAGGGTCTCCTGCAAGC  650

seq1  AATCTATGTGGGAGGAGACCCAGAAACCACTCGAAGACCCTCCACAGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATGTGGGAGGAGACCCAGAAACCACTCGAAGACCCTCCACAGACA  700

seq1  CCTGTTTATCAGTCATAGAATCTCTTGAATTCTTCTATCACCCTAACATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTTATCAGTCATAGAATCTCTTGAATTCTTCTATCACCCTAACATG  750

seq1  TTTGCCTCACAGAAATGGGCCTTGTGACCATGTTCTCTTGAGGGTAGGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTCACAGAAATGGGCCTTGTGACCATGTTCTCTTGAGGGTAGGTG  800

seq1  CTATCCAGACACAGTACGTGTGCCCCACACTGTGTTCTGCATTCCATCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCAGACACAGTACGTGTGCCCCACACTGTGTTCTGCATTCCATCTG  850

seq1  GCATAGCCCGAAAGCCTTCTCTGTGTTGTTAAGAATTGTGGTCATGGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGCCCGAAAGCCTTCTCTGTGTTGTTAAGAATTGTGGTCATGGTTG  900

seq1  TTGCCATGGTGATGCCCAAGCATCTCTCCTACGGACAACCAATGGGGTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||
seq2  TTGCCATGGTGATGCCCAAGCATCTCT-CTACGGACA--CCATGGGG-TC  946

seq1  TTGGCCTCCTTC-TCATGT-GTGGCAGGACCGG-AGGTCAGCATTTCTCA  997
      || | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TT-GTCTCCTTCTTCATGTGGTGGCAGGACCGGAAGGTCAGCATTTCTCA  995

seq1  GGAGAA-CTCAAACATGAC-CAGCCAGAG-TCAGTGGGCCTTTA-CCTTG  1043
      |||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||
seq2  GGAGAACCTCAAACATGACTCAGTCAGAGTTCAGTGGGCCTTTATCCTTG  1045

seq1  TGTG-TGATCA-ATAGTGTCAACTTGAC-AAGATCT  1076
      || | |||||| | || |||||||| || |||||||
seq2  TGGGTTGATCATAGAGGGTCAACTTTACAAAGATCT  1081