BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010C04
Chromosome8 (Build37)
Map Location 103,251,162 - 103,403,371
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042069, LOC436054, LOC100042078, LOC100042086, LOC100042092, LOC384895
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010C04.bB6Ng01-010C04.g
ACCDH845893DH845894
length9971,082
definitionDH845893|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010C04, 5' end.DH845894|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010C04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,402,711 - 103,403,371)(103,251,162 - 103,252,238)
sequence
gaattctaaggtggagtctgaacacaaagacttggcctctcactaccata
tgattcaaattacttataaaatattttgaaaatagaaatcgtggttataa
ctctagctttatgatttggtatcactctgtttgcaataaaaatctaaatt
attttaaaatgtagtgttctgatcaaatctgcacctgatgccatcctctt
caattcctccccctataatcctaccaatattttctcattttagtttagtg
aactcttttttaaacccattaagtccatttaatgctgccagagtgtgcat
ggttatagggccacacgctagcacatagggagcctcttacagtcctcata
acaagaatgttgacttccccccctcccgcagctattgctcccaattgctt
ctcaggtaagggtggggctttgggaacacagtccctttcccattcatgct
gtaatttggggaaacttgatcttttgttgatctgcacatgtggtcacagc
cactgtgaattcttatgtacaataacaatgccatgtccaaaactcagcgt
cttaagagttctataacttctggcatttctaagctttgcaccaatgattg
gcaaatgatctctgggcatgtaacaaggggctgactatcatatctcacat
ggacatgggcacgcgatagtcactttgtttctgtattttcatgagttgtg
aatatctgtgctactcaccatttattatgcaaagtaacatctctgataag
agtttgtggatgcactaatctagggtgataaagataatccagaagtagga
gtcaatttatgactatgcctatttagcagaataattataataagatcttc
cctagaatctatgtcatggctcacttaacagagattgtgtaaaatgtaat
tcttcttatcaacaacttcctcacctaggctttggaaacgatgagaaaga
ttacttgggatgataatacaagcagaaaatagatactttagtatgaa
gaattcctgcttgcattttggcctgctgctcctattctttgttggtgtga
tgctgctacagtgctgagctttgaatccctatttgggacatgctatacaa
atgtttcctccactgaattacaggaccaaactccatggagttattgttga
acactaaaataaccacatgagaactttcaatggtttatactaaataagaa
aagttttgataagtaattgaaggtatgacatctttactacaggtcttgct
tttctgttttagaatataattcatgagtcttttctttctattacttgaaa
tatctgatcagatattgagaaaactgtatccagacactagatgtgcttgt
tgatactggactgatatccattatagatttccttatgtgtgcatatgtaa
aatgcatgcatacaattctctgtaattgataatagataacatctgaatct
ttgaaaaacatgtcctactgcatatatattagctgtatgcatgaaacctt
atatacgtaaatactggattcagtgtttttttctaaagaccttagagtaa
ttttgctgtctttctgttcaatcaacattataatttaacactaaatgaga
atatgtgctaataaaatagatcaatataatatttactgtttttgttgtta
caattacatgaaaaaggatattttgtgactgtaagtattataatttcttg
gcattgctaaatgtcagcaccaaaatagtatctctgtatcatttgtatga
attcaatgtgattcttcaaaatgtttgtgtgtaatattcatgtaagtgtt
tctcatctgtgggttgagacctctttggtgggggaattcaacagacccta
ttacaggggtctccaaagactatctgtatattatatatttatattacaat
ttataatattagttacactacagtaatgaaatgaatgacaataaatttat
gattggagcaattatgataatatggaactataataaaggatcacagcatt
aggaggttgaagagccacctgaatttaagtaagtatttaagtctacaact
aaaccaatatttctaatatattgcctgttaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_103402711_103403371
seq2: B6Ng01-010C04.b_44_704 (reverse)

seq1  TGCCCATGTCCATGTGAGATATGATAGTCAGCCCCTTGTTACATGCCCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCATGTCCATGTGAGATATGATAGTCAGCCCCTTGTTACATGCCCAG  50

seq1  AGATCATTTGCCAATCATTGGTGCAAAGCTTAGAAATGCCAGAAGTTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCATTTGCCAATCATTGGTGCAAAGCTTAGAAATGCCAGAAGTTATA  100

seq1  GAACTCTTAAGACGCTGAGTTTTGGACATGGCATTGTTATTGTACATAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCTTAAGACGCTGAGTTTTGGACATGGCATTGTTATTGTACATAAG  150

seq1  AATTCACAGTGGCTGTGACCACATGTGCAGATCAACAAAAGATCAAGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCACAGTGGCTGTGACCACATGTGCAGATCAACAAAAGATCAAGTTT  200

seq1  CCCCAAATTACAGCATGAATGGGAAAGGGACTGTGTTCCCAAAGCCCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAATTACAGCATGAATGGGAAAGGGACTGTGTTCCCAAAGCCCCAC  250

seq1  CCTTACCTGAGAAGCAATTGGGAGCAATAGCTGCGGGAGGGGGGGAAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACCTGAGAAGCAATTGGGAGCAATAGCTGCGGGAGGGGGGGAAGTC  300

seq1  AACATTCTTGTTATGAGGACTGTAAGAGGCTCCCTATGTGCTAGCGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCTTGTTATGAGGACTGTAAGAGGCTCCCTATGTGCTAGCGTGTG  350

seq1  GCCCTATAACCATGCACACTCTGGCAGCATTAAATGGACTTAATGGGTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTATAACCATGCACACTCTGGCAGCATTAAATGGACTTAATGGGTTT  400

seq1  AAAAAAGAGTTCACTAAACTAAAATGAGAAAATATTGGTAGGATTATAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGAGTTCACTAAACTAAAATGAGAAAATATTGGTAGGATTATAGG  450

seq1  GGGAGGAATTGAAGAGGATGGCATCAGGTGCAGATTTGATCAGAACACTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGAATTGAAGAGGATGGCATCAGGTGCAGATTTGATCAGAACACTA  500

seq1  CATTTTAAAATAATTTAGATTTTTATTGCAAACAGAGTGATACCAAATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAAAATAATTTAGATTTTTATTGCAAACAGAGTGATACCAAATCA  550

seq1  TAAAGCTAGAGTTATAACCACGATTTCTATTTTCAAAATATTTTATAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCTAGAGTTATAACCACGATTTCTATTTTCAAAATATTTTATAAGT  600

seq1  AATTTGAATCATATGGTAGTGAGAGGCCAAGTCTTTGTGTTCAGACTCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGAATCATATGGTAGTGAGAGGCCAAGTCTTTGTGTTCAGACTCCA  650

seq1  CCTTAGAATTC  661
      |||||||||||
seq2  CCTTAGAATTC  661

seq1: chr8_103251162_103252238
seq2: B6Ng01-010C04.g_67_1148

seq1  GAATTCCTGCTTGCATTTTGGCCTGCTGCTCCTATTCTTTGTTGGTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCTTGCATTTTGGCCTGCTGCTCCTATTCTTTGTTGGTGTGA  50

seq1  TGCTGCTACAGTGCTGAGCTTTGAATCCCTATTTGGGACATGCTATACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTACAGTGCTGAGCTTTGAATCCCTATTTGGGACATGCTATACAA  100

seq1  ATGTTTCCTCCACTGAATTACAGGACCAAACTCCATGGAGTTATTGTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCCTCCACTGAATTACAGGACCAAACTCCATGGAGTTATTGTTGA  150

seq1  ACACTAAAATAACCACATGAGAACTTTCAATGGTTTATACTAAATAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAAAATAACCACATGAGAACTTTCAATGGTTTATACTAAATAAGAA  200

seq1  AAGTTTTGATAAGTAATTGAAGGTATGACATCTTTACTACAGGTCTTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTGATAAGTAATTGAAGGTATGACATCTTTACTACAGGTCTTGCT  250

seq1  TTTCTGTTTTAGAATATAATTCATGAGTCTTTTCTTTCTATTACTTGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTTTAGAATATAATTCATGAGTCTTTTCTTTCTATTACTTGAAA  300

seq1  TATCTGATCAGATATTGAGAAAACTGTATCCAGACACTAGATGTGCTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGATCAGATATTGAGAAAACTGTATCCAGACACTAGATGTGCTTGT  350

seq1  TGATACTGGACTGATATCCATTATAGATTTCCTTATGTGTGCATATGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACTGGACTGATATCCATTATAGATTTCCTTATGTGTGCATATGTAA  400

seq1  AATGCATGCATACAATTCTCTGTAATTGATAATAGATAACATCTGAATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATGCATACAATTCTCTGTAATTGATAATAGATAACATCTGAATCT  450

seq1  TTGAAAAACATGTCCTACTGCATATATATTAGCTGTATGCATGAAACCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAACATGTCCTACTGCATATATATTAGCTGTATGCATGAAACCTT  500

seq1  ATATACGTAAATACTGGATTCAGTGTTTTTTTCTAAAGACCTTAGAGTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACGTAAATACTGGATTCAGTGTTTTTTTCTAAAGACCTTAGAGTAA  550

seq1  TTTTGCTGTCTTTCTGTTCAATCAACATTATAATTTAACACTAAATGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTGTCTTTCTGTTCAATCAACATTATAATTTAACACTAAATGAGA  600

seq1  ATATGTGCTAATAAAATAGATCAATATAATATTTACTGTTTTTGTTGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGCTAATAAAATAGATCAATATAATATTTACTGTTTTTGTTGTTA  650

seq1  CAATTACATGAAAAAGGATATTTTGTGACTGTAAGTATTATAATTTCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTACATGAAAAAGGATATTTTGTGACTGTAAGTATTATAATTTCTTG  700

seq1  GCATTGCTAAATGTCAGCACCAAAATAGTATCTCTGTATCATTTGTATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGCTAAATGTCAGCACCAAAATAGTATCTCTGTATCATTTGTATGA  750

seq1  ATTCAATGTGATTCTTCAAAATGTTTGTGTGTAATATTCATGTAAGTGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAATGTGATTCTTCAAAATGTTTGTGTGTAATATTCATGTAAGTGTT  800

seq1  TCTCATCTGTGGGTTGAGACCTCTTTGGTGGGGGAATTCAACAGACCCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCTGTGGGTTGAGACCTCTTTGGTGGGGGAATTCAACAGACCCTA  850

seq1  TTACAGGGGTCTCCAAAGACTATCTGTATATTATATATTTATATTACAAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGGGTCTCCAAAGACTATCTGTATATTATATATTTATATTACAAT  900

seq1  TTATAATATTAGTTACACTACAGTAATGAAATGAATGACAATAAATTTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATATTAGTTACACTACAGTAATGAAATGAATGACAATAAATTTAT  950

seq1  GATTGGAGCAATTATGAT-ATATGGAACTATATTAAGGGATCACAGCATT  999
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||
seq2  GATTGGAGCAATTATGATAATATGGAACTATAATAAAGGATCACAGCATT  1000

seq1  AGGGAGGTTG-AGAGCCA-CTGATTTTAAGTAAGTATTT-AGTCTACAAC  1046
      | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  A-GGAGGTTGAAGAGCCACCTGAATTTAAGTAAGTATTTAAGTCTACAAC  1049

seq1  TAAACC-ATATTTCTAAT-TATTGCTTGTTAAA  1077
      |||||| ||||||||||| |||||| |||||||
seq2  TAAACCAATATTTCTAATATATTGCCTGTTAAA  1082