BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-025D12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 32,643,399 - 32,754,109
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC547008, Dusp26, Rnf122, BC019943, Rbm13, Fut10, LOC666330, LOC666568, 7420700N18Rik, LOC100041329
Downstream geneEG330731, LOC100041340, Nrg1, 2010007E15Rik, EG666589, EG546052
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-025D12.bB6Ng01-025D12.g
ACCDH856633DH856634
length1,1711,116
definitionDH856633|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025D12, 5' end.DH856634|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025D12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,752,931 - 32,754,109)(32,643,399 - 32,644,539)
sequence
gaattctctacttcatataatattgcaggtgggcataattgaatttatac
ttctaatttgcatctcttacttgataaaattaagatgtatcttttatttc
tatacaaactctccccatattactattctatagattgtcattaagagata
atgtatttattcaagcaagttcttggttcagagttctctgggaaagaaaa
gaacttagagcatctggaagacatttagatcatcagtgtccagcttgaaa
gcaggctttcaggttagatcagagaagacactcacttccttagggtaatt
ttcatataatctagctatctggaaagtcatcataattaattatcaaacta
ataaaatatagagaaatctagagcagaatgtgggtagtttaaagaagtga
cataaaatcatgttcttttttgagggtgaagtaagtgagaaaaggtattt
ttaaaagatgagggagagagggagaaagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagagagaaagagagaaagagagagagagaaccag
tggctacatctggccttgttagtcatatttggttagaaagaaccaatgtt
ttatgaaacagacagacaaagcaacattgtgggtgggatagaacacacta
agtgccctagtcaataccatacttatgaaacatacaagccacaaagagca
gatatagcatttcccatatctcttaattatttgattacctggctaccata
aatacttaaatttatgaggtccttttaattttttaaatatttaaattctt
gaaatatcccttcagaaaggtaaaatttatactgcatagaaaagtgagct
gagtgattgggtgctgagtgtggtggtgcacgttttgatcccagcactca
ggaggcagaggagggaaagaagatctctgtaagttctagagccttggggt
ctactttgcagatcctatctataaaacctataacctaccaactaaccaac
caagtaacaatgattctgttacatgctaaccagcagggcagactgtctta
acagcttatggcaaaccatctaagttattccttatcagccaataaaaata
acaatatgaactacctgacctgctcttaccttactccctaaggaaaattt
ctaaacaatcaggtaaaaagg
gaattcttagtagacttagcagacatctcaaactgttcctcatggaaagg
cagagtggtagccgatggaatgaagaaaatcaagacatggtgaagagaca
ggtttatagttagaaggagacaagcattagttgcaacctgttttgttgtt
gcttcctgggtcattcatatggaagttgctgagagctggttttaagggaa
gagacatgtgttagaaagagaatgaggctgtgttgagatagctggaaagt
atcgtcaatgtcaggacttttagtgattgttcaagtaggtagatgaatgc
cagacaatcagttctagagaactatgtttctcaaatccccttgtatctac
tcctgaatccagggttggctgcaaaagcagcctcagtttccagtctctgt
ttctggattctagtctgctgctcaaacagtgtcctcccttcttgcaagag
actcctcccaattcctttctaatagtatgcccctttctctgttagagctc
ccacataggttgtcctttatcaagtagtcagctgggaaacatgtacaata
caagtaatgccgaatggactcagggttgttgttgtatgtgtgtagatata
gatatctatgtatatatgcatacaatgataataattacagaatatgaatt
tgtgagcatgggaggagttgtttcagggaaggaaggataggaatgatata
tagtgcttacatatgaagttccccaaaaaggttaagaaaaaaatatacta
taaaaacttaagagggtgatcttgaacttcagcctgagtttgaggtaaaa
gatgtttgttactatgctcctttgactgtctaatataactaactgtttca
gtaggggatataggtattgatttgtcactgactccgtgatgctagattgc
atattcttctgtatgtgagcataatcaccatatattacttatctcagaat
aaaattgtggctaacacattgataagatgatacagcaaaaaaatattgca
atagctcctatacattaaagaggattgtgagagaagaatatttctatagg
ctttatttctgagattgtagcaagcatgaatataatgtaggatcgattac
taaatgaaagttcctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_32752931_32754109
seq2: B6Ng01-025D12.b_46_1216 (reverse)

seq1  CCTTTTTACCTGATTGTTTAGAAATCTTCCTCTGGGAGTCATGGTAGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | ||||  ||
seq2  CCTTTTTACCTGATTGTTTAGAAATTTTCCTTAGGGAGT-AAGGTAAGAG  49

seq1  CAGGTCAGGTAAGTTCTATTTGTTATGTTTTATTTGCTGATAAGGAAATA  100
      |||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||  |
seq2  CAGGTCAGGT-AGTTCATATTGTTAT-TTTTATTGGCTGATAAGGAATAA  97

seq1  CTTCAGATGGTTTGCCATTAAGCTGTTAAGACAGTCTGCCCCTGCTGGTT  150
      ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTT-AGATGGTTTGCCA-TAAGCTGTTAAGACAGTCTG-CCCTGCTGGTT  144

seq1  AGCATGGTAACAGAATCATTTGTTTACTTGGTTGGTTAGTTGGTTGGTTT  200
      ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| 
seq2  AGCAT-GTAACAGAATCATT--GTTACTTGGTTGGTTAGTTGGTAGGTTA  191

seq1  TAGGTTTTATAAGATA-GATCTGCTAAGTAGACCACAAGGCTCTAGAACT  249
      |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAGGTTTTAT-AGATAGGATCTGCAAAGTAGACCCCAAGGCTCTAGAACT  240

seq1  TACAGAGATCTTCCTTCCTTCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATCAAAAC  299
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGATCTTCTTTCCCTCCTCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATCAAAAC  290

seq1  GTGCACCACCACACTCAGC-CCCAATCACTCAGCTCACTTTTCTATGCAG  348
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACCACCACACTCAGCACCCAATCACTCAGCTCACTTTTCTATGCAG  340

seq1  TATAAATTTTACCTTTCTGAAGGGATATTTCAAGAATTTAAATATTTAAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATTTTACCTTTCTGAAGGGATATTTCAAGAATTTAAATATTTAAA  390

seq1  AAATTAAAAGGACCTCATAAATTTAAGTATTTATGGTAGCCAGGTAATCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAAAGGACCTCATAAATTTAAGTATTTATGGTAGCCAGGTAATCA  440

seq1  AATAATTAAGAGATATGGGAAATGCTATATCTGCTCTTTGTGGCTTGTAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTAAGAGATATGGGAAATGCTATATCTGCTCTTTGTGGCTTGTAT  490

seq1  GTTTCATAAGTATGGTATTGACTAGGGCACTTAGTGTGTTCTATCCCACC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCATAAGTATGGTATTGACTAGGGCACTTAGTGTGTTCTATCCCACC  540

seq1  CACAATGTTGCTTTGTCTGTCTGTTTCATAAAACATTGGTTCTTTCTAAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATGTTGCTTTGTCTGTCTGTTTCATAAAACATTGGTTCTTTCTAAC  590

seq1  CAAATATGACTAACAAGGCCAGATGTAGCCACTGGTTCTCTCTCTCTCTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATGACTAACAAGGCCAGATGTAGCCACTGGTTCTCTCTCTCTCTT  640

seq1  TCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  690

seq1  TCTCTTTCTCCCTCTCTCCCTCATCTTTTAAAAATACCTTTTCTCACTTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCTCCCTCTCTCCCTCATCTTTTAAAAATACCTTTTCTCACTTA  740

seq1  CTTCACCCTCAAAAAAGAACATGATTTTATGTCACTTCTTTAAACTACCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACCCTCAAAAAAGAACATGATTTTATGTCACTTCTTTAAACTACCC  790

seq1  ACATTCTGCTCTAGATTTCTCTATATTTTATTAGTTTGATAATTAATTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTGCTCTAGATTTCTCTATATTTTATTAGTTTGATAATTAATTAT  840

seq1  GATGACTTTCCAGATAGCTAGATTATATGAAAATTACCCTAAGGAAGTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACTTTCCAGATAGCTAGATTATATGAAAATTACCCTAAGGAAGTGA  890

seq1  GTGTCTTCTCTGATCTAACCTGAAAGCCTGCTTTCAAGCTGGACACTGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTCTCTGATCTAACCTGAAAGCCTGCTTTCAAGCTGGACACTGAT  940

seq1  GATCTAAATGTCTTCCAGATGCTCTAAGTTCTTTTCTTTCCCAGAGAACT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAAATGTCTTCCAGATGCTCTAAGTTCTTTTCTTTCCCAGAGAACT  990

seq1  CTGAACCAAGAACTTGCTTGAATAAATACATTATCTCTTAATGACAATCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACCAAGAACTTGCTTGAATAAATACATTATCTCTTAATGACAATCT  1040

seq1  ATAGAATAGTAATATGGGGAGAGTTTGTATAGAAATAAAAGATACATCTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAATAGTAATATGGGGAGAGTTTGTATAGAAATAAAAGATACATCTT  1090

seq1  AATTTTATCAAGTAAGAGATGCAAATTAGAAGTATAAATTCAATTATGCC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTATCAAGTAAGAGATGCAAATTAGAAGTATAAATTCAATTATGCC  1140

seq1  CACCTGCAATATTATATGAAGTAGAGAATTC  1179
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGCAATATTATATGAAGTAGAGAATTC  1171

seq1: chr8_32643399_32644539
seq2: B6Ng01-025D12.g_68_1183

seq1  GAATTCTTAGTAGACTTAGCAGACATCTCAAACTGTTCCTCATGGAAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGTAGACTTAGCAGACATCTCAAACTGTTCCTCATGGAAAGG  50

seq1  CAGAGTGGTAGCCGATGGAATGAAGAAAATCAAGACATGGTGAAGAGACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGGTAGCCGATGGAATGAAGAAAATCAAGACATGGTGAAGAGACA  100

seq1  GGTTTATAGTTAGAAGGAGACAAGCATTAGTTGCAACCTGTTTTGTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTATAGTTAGAAGGAGACAAGCATTAGTTGCAACCTGTTTTGTTGTT  150

seq1  GCTTCCTGGGTCATTCATATGGAAGTTGCTGAGAGCTGGTTTTAAGGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTGGGTCATTCATATGGAAGTTGCTGAGAGCTGGTTTTAAGGGAA  200

seq1  GAGACATGTGTTAGAAAGAGAATGAGGCTGTGTTGAGATAGCTGGAAAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATGTGTTAGAAAGAGAATGAGGCTGTGTTGAGATAGCTGGAAAGT  250

seq1  ATCGTCAATGTCAGGACTTTTAGTGATTGTTCAAGTAGGTAGATGAATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTCAATGTCAGGACTTTTAGTGATTGTTCAAGTAGGTAGATGAATGC  300

seq1  CAGACAATCAGTTCTAGAGAACTATGTTTCTCAAATCCCCTTGTATCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAATCAGTTCTAGAGAACTATGTTTCTCAAATCCCCTTGTATCTAC  350

seq1  TCCTGAATCCAGGGTTGGCTGCAAAAGCAGCCTCAGTTTCCAGTCTCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAATCCAGGGTTGGCTGCAAAAGCAGCCTCAGTTTCCAGTCTCTGT  400

seq1  TTCTGGATTCTAGTCTGCTGCTCAAACAGTGTCCTCCCTTCTTGCAAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGATTCTAGTCTGCTGCTCAAACAGTGTCCTCCCTTCTTGCAAGAG  450

seq1  ACTCCTCCCAATTCCTTTCTAATAGTATGCCCCTTTCTCTGTTAGAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTCCCAATTCCTTTCTAATAGTATGCCCCTTTCTCTGTTAGAGCTC  500

seq1  CCACATAGGTTGTCCTTTATCAAGTAGTCAGCTGGGAAACATGTACAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATAGGTTGTCCTTTATCAAGTAGTCAGCTGGGAAACATGTACAATA  550

seq1  CAAGTAATGCCGAATGGACTCAGGGTTGTTGTTGTATGTGTGTAGATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAATGCCGAATGGACTCAGGGTTGTTGTTGTATGTGTGTAGATATA  600

seq1  GATATCTATGTATATATGCATACAATGATAATAATTACAGAATATGAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCTATGTATATATGCATACAATGATAATAATTACAGAATATGAATT  650

seq1  TGTGAGCATGGGAGGAGTTGTTTCAGGGAAGGAAGGATAGGAATGATATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCATGGGAGGAGTTGTTTCAGGGAAGGAAGGATAGGAATGATATA  700

seq1  TAGTGCTTACATATGAAGTTCCCCAAAAAGGTTAAGAAAAAAATATACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCTTACATATGAAGTTCCCCAAAAAGGTTAAGAAAAAAATATACTA  750

seq1  TAAAAACTTAAGAGGGTGATCTTGAACTTCAGCCTGAGTTTGAGGTAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACTTAAGAGGGTGATCTTGAACTTCAGCCTGAGTTTGAGGTAAAA  800

seq1  GATGTTTGTTACTATGCTCCTTTGACTGTCTAATATAACTAACTGTTTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTTGTTACTATGCTCCTTTGACTGTCTAATATAACTAACTGTTTCA  850

seq1  GTAGGGGATATAGGTATTGATTTGTCACTGACTCCGTGATGCTAGATTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGGATATAGGTATTGATTTGTCACTGACTCCGTGATGCTAGATTGC  900

seq1  ATATTCCTTCTGTATGTGAGCATAATCACCATTATATTACTTATCCCAGA  950
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  ATATT-CTTCTGTATGTGAGCATAATCACCA-TATATTACTTATCTCAGA  948

seq1  ATAAAA-TGTGGCTAACACATTGAATAAAGATGATACAAGCAAAAAAAAA  999
      |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||||||
seq2  ATAAAATTGTGGCTAACACATTGA--TAAGATGATAC-AGC--AAAAAAA  993

seq1  TATTGCACATAGCT-CTATACAATTAAAAGAAGGAATGTGTGAGAGAAGA  1048
      ||||||| |||||| |||||| ||||||   ||||   ||||||||||||
seq2  TATTGCA-ATAGCTCCTATAC-ATTAAA--GAGGA--TTGTGAGAGAAGA  1037

seq1  ATA-TTCTATTAAGGCTTTA-TTCTGAGATAGTTAGCAAAAGCATGTAAT  1096
      ||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||||  |||||||    
seq2  ATATTTCTAT--AGGCTTTATTTCTGAGATTG-TAGC--AAGCATG----  1078

seq1  TATTAGATGGTAGGATCAGATTACTAATTTGGAAAGTATCTCCTG  1141
       | || |  |||||||| ||||||||| |  ||||||   |||||
seq2  -AATATAATGTAGGATC-GATTACTAAAT--GAAAGT---TCCTG  1116