BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026I21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 129,913,934 - 130,063,958
singlet/doubletdoublet
Overlap genePard3
Upstream geneSlc35f3, 1810063B05Rik, EG619653, Irf2bp2, Tomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1
Downstream geneEG628847, Nrp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026I21.bB6Ng01-026I21.g
ACCDH857566DH857567
length1,146993
definitionDH857566|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026I21, 5' end.DH857567|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026I21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,062,794 - 130,063,958)(129,913,934 - 129,914,929)
sequence
gaattccatggtgactgtggtaactgttacttcaccatagtccaaagtcc
cagggtcagcacaacgcagaatggaacctagacaacaatgaagcaacaga
ggctcttctttatgtaagtgaactgtgttttgtgatagtaaagaaggctg
accagcaggcatgtgcaatgttcaaccctaaggttacagaactcgcatta
cactagaatgtcagaatctatcatggtttaggctttagtgcaacaaatga
aaaacccaccaccagaggttaaactgaacactgcaatcagcagggctgat
cccaggaactgacataacaacctgctacccctaagccagacatctcatac
tataaaacatgaccatagtgttctctggggaacgtcttattgatacagaa
ccatagcccattggcagaatcatatgcatttagcattgttgattctagga
aaagttaatttttaatttctctgcgatattacaaatatggcaattgtcaa
ataattggttctttatccaaataataaaccaaaggttcctttggggtccc
agtaagttctaagagtgtaacgtggggaaagaggcatggagaaatgggtc
actgggttaaagggcttagcataagtatgacaacctaagttgtctccaga
atccatgcagagccaagacaggagtttatgtctgtgacagggtgaagaca
agaaaatccctaggagctctcaggacttcctggtgtatacagtggcacac
aagagaacctgcctcaaacaaggtagttggtgaagactgatcgctgaggt
tgttctctgatctccacacacacactgtggcacacagggacctgtacact
taggcagaacatgctttcaaaagcacagaagggggcttgagtactcccct
gcattagtcactatccaggcactggctcacccaccagcttctacacaaat
ctaccagctaagtaacaacaacaaattggctgtggtactatgaactcata
gtcgccatagtaactacccagccctgttgtaatgaactatgatgtacatg
ccacaggaaaggcaaaggatctctgacctttagccgccagagcaggagtg
gattcccctttaaaaagaaactatcgacgctgggggggggtgggga
gaattcaaatttgatcctgagagtcttgttgcccacaggactgcccctct
ttattctactagtggtgctaaggggtggattccagatattacactggctg
gtcatgtgttcttactgacttgcatctcagcctttcagtgatgtcttgaa
cagtggttatgttttgtcaaatcattgtttggtatttttattccaagtta
tgtagatgcttgtgaatagttctcagaatggtgtacaacacacgtatcta
tattaagtagttatttagagaaatgagttgtttccaattcccaaggatag
tggtcagcggacagatatgtattaaacatcttctgtatgttagaaatttt
gataggttctgagaacacagcagtgtgtattcacaaaagtatcatagctt
ttaaaaagcacgatccagaggctaagaagacagcagagagggaagatgct
gctgcacaaacataaggacttccatcccagatacatagagacaaaagaat
ccatgggttctggagctcactggccatccatctggctgcatctctgagcc
ccaggttcaataagagattctgactcagataaaataaagcacagagccat
agagggtatcaactgctggcatgtacacacacatacatacatgcatggat
gcatgcatacgcccccccccaaacacacacattcatatatatatatatac
tcacacatactctcacataaacacacacacacacacacacacacacacac
acacacaccctgaatatggaatagtgtgggagagttttgcaataaagagt
aacaaagatcattctgtttctgtaggattctgattccccaagagtaaggg
aaacgtgcaccagcttgaaaatgttttgataaaggcactgatttattcca
ttttgctctatgaaagatgtgagtctagattccctactgaaatatccctg
tccatttactctactttgaatttacgtgaatgaagaaaattta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_130062794_130063958
seq2: B6Ng01-026I21.b_44_1189 (reverse)

seq1  TCCCCA-CCCCCCCCAGCTGCTCGCTCAGTTCTCTTCTTAAAGTGGGATC  49
      |||||| |||||||||||   ||| | |||| |||| |||||| || |||
seq2  TCCCCACCCCCCCCCAGC--GTCGAT-AGTT-TCTTTTTAAAGGGGAATC  46

seq1  TCACTCCTGGCTCTTGGCTGGCCTAAAAGTCAGAGATCCTCTTGCCTCTC  99
       ||||||| |||| ||||  | ||||| |||||||||||| |||||| | 
seq2  -CACTCCT-GCTC-TGGC--GGCTAAAGGTCAGAGATCCT-TTGCCT-TT  89

seq1  CCTGTTGGCATGTACCATCATAGTTTCATTACATACAGGGCTTGTGTAGG  149
      |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |
seq2  CCTG-TGGCATGTA-CATCATAG-TTCATTACA-ACAGGGC-TGGGTA-G  133

seq1  TAACTATGGCGACTATGAGTTCATAGTGCCACAGCCAATTTGTTGTTGTT  199
      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATGGCGACTATGAGTTCATAGTACCACAGCCAATTTGTTGTTGTT  183

seq1  ACTTAGCTGGTAGGTTTTGTGGTAGAAGCTGGTGGGTGAGCCAGTGCCTG  249
      |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGCTGGTA-GATTTGT-GTAGAAGCTGGTGGGTGAGCCAGTGCCTG  231

seq1  GATAGTGACTAATGCAGGGGAGTACTCAAGCCCCCTTTCTGTGCTTTTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GATAGTGACTAATGCAGGGGAGTACTCAAGCCCCC-TTCTGTGCTTTTGA  280

seq1  AAGCATGTTCTGCCTAAGTGTACAGGTCCCTGTGTGCCACAGTGTGTGTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATGTTCTGCCTAAGTGTACAGGTCCCTGTGTGCCACAGTGTGTGTG  330

seq1  TGGAGATCAGAGAACAACCTCAGCGATCAGTCTTCACCAACTACCTTGTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATCAGAGAACAACCTCAGCGATCAGTCTTCACCAACTACCTTGTT  380

seq1  TGAGGCAGGTTCTCTTGTGTGCCACTGTATACACCAGGAAGTCCTGAGAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCAGGTTCTCTTGTGTGCCACTGTATACACCAGGAAGTCCTGAGAG  430

seq1  CTCCTAGGGATTTTCTTGTCTTCACCCTGTCACAGACATAAACTCCTGTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAGGGATTTTCTTGTCTTCACCCTGTCACAGACATAAACTCCTGTC  480

seq1  TTGGCTCTGCATGGATTCTGGAGACAACTTAGGTTGTCATACTTATGCTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTCTGCATGGATTCTGGAGACAACTTAGGTTGTCATACTTATGCTA  530

seq1  AGCCCTTTAACCCAGTGACCCATTTCTCCATGCCTCTTTCCCCACGTTAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTTTAACCCAGTGACCCATTTCTCCATGCCTCTTTCCCCACGTTAC  580

seq1  ACTCTTAGAACTTACTGGGACCCCAAAGGAACCTTTGGTTTATTATTTGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTAGAACTTACTGGGACCCCAAAGGAACCTTTGGTTTATTATTTGG  630

seq1  ATAAAGAACCAATTATTTGACAATTGCCATATTTGTAATATCGCAGAGAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAACCAATTATTTGACAATTGCCATATTTGTAATATCGCAGAGAA  680

seq1  ATTAAAAATTAACTTTTCCTAGAATCAACAATGCTAAATGCATATGATTC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAATTAACTTTTCCTAGAATCAACAATGCTAAATGCATATGATTC  730

seq1  TGCCAATGGGCTATGGTTCTGTATCAATAAGACGTTCCCCAGAGAACACT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAATGGGCTATGGTTCTGTATCAATAAGACGTTCCCCAGAGAACACT  780

seq1  ATGGTCATGTTTTATAGTATGAGATGTCTGGCTTAGGGGTAGCAGGTTGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCATGTTTTATAGTATGAGATGTCTGGCTTAGGGGTAGCAGGTTGT  830

seq1  TATGTCAGTTCCTGGGATCAGCCCTGCTGATTGCAGTGTTCAGTTTAACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCAGTTCCTGGGATCAGCCCTGCTGATTGCAGTGTTCAGTTTAACC  880

seq1  TCTGGTGGTGGGTTTTTCATTTGTTGCACTAAAGCCTAAACCATGATAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGGTGGGTTTTTCATTTGTTGCACTAAAGCCTAAACCATGATAGA  930

seq1  TTCTGACATTCTAGTGTAATGCGAGTTCTGTAACCTTAGGGTTGAACATT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACATTCTAGTGTAATGCGAGTTCTGTAACCTTAGGGTTGAACATT  980

seq1  GCACATGCCTGCTGGTCAGCCTTCTTTACTATCACAAAACACAGTTCACT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGCCTGCTGGTCAGCCTTCTTTACTATCACAAAACACAGTTCACT  1030

seq1  TACATAAAGAAGAGCCTCTGTTGCTTCATTGTTGTCTAGGTTCCATTCTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAAAGAAGAGCCTCTGTTGCTTCATTGTTGTCTAGGTTCCATTCTG  1080

seq1  CGTTGTGCTGACCCTGGGACTTTGGACTATGGTGAAGTAACAGTTACCAC  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGTGCTGACCCTGGGACTTTGGACTATGGTGAAGTAACAGTTACCAC  1130

seq1  AGTCACCATGGAATTC  1165
      ||||||||||||||||
seq2  AGTCACCATGGAATTC  1146

seq1: chr8_129913934_129914929
seq2: B6Ng01-026I21.g_69_1061

seq1  GAATTCAAATTTGATCCTGAGAGTCTTGTTGCCCACAGGACTGCCCCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTTGATCCTGAGAGTCTTGTTGCCCACAGGACTGCCCCTCT  50

seq1  TTATTCTACTAGTGGTGCTAAGGGGTGGATTCCAGATATTACACTGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTACTAGTGGTGCTAAGGGGTGGATTCCAGATATTACACTGGCTG  100

seq1  GTCATGTGTTCTTACTGACTTGCATCTCAGCCTTTCAGTGATGTCTTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGTGTTCTTACTGACTTGCATCTCAGCCTTTCAGTGATGTCTTGAA  150

seq1  CAGTGGTTATGTTTTGTCAAATCATTGTTTGGTATTTTTATTCCAAGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTTATGTTTTGTCAAATCATTGTTTGGTATTTTTATTCCAAGTTA  200

seq1  TGTAGATGCTTGTGAATAGTTCTCAGAATGGTGTACAACACACGTATCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATGCTTGTGAATAGTTCTCAGAATGGTGTACAACACACGTATCTA  250

seq1  TATTAAGTAGTTATTTAGAGAAATGAGTTGTTTCCAATTCCCAAGGATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAGTAGTTATTTAGAGAAATGAGTTGTTTCCAATTCCCAAGGATAG  300

seq1  TGGTCAGCGGACAGATATGTATTAAACATCTTCTGTATGTTAGAAATTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGCGGACAGATATGTATTAAACATCTTCTGTATGTTAGAAATTTT  350

seq1  GATAGGTTCTGAGAACACAGCAGTGTGTATTCACAAAAGTATCATAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGTTCTGAGAACACAGCAGTGTGTATTCACAAAAGTATCATAGCTT  400

seq1  TTAAAAAGCACGATCCAGAGGCTAAGAAGACAGCAGAGAGGGAAGATGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGCACGATCCAGAGGCTAAGAAGACAGCAGAGAGGGAAGATGCT  450

seq1  GCTGCACAAACATAAGGACTTCCATCCCAGATACATAGAGACAAAAGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCACAAACATAAGGACTTCCATCCCAGATACATAGAGACAAAAGAAT  500

seq1  CCATGGGTTCTGGAGCTCACTGGCCATCCATCTGGCTGCATCTCTGAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGGTTCTGGAGCTCACTGGCCATCCATCTGGCTGCATCTCTGAGCC  550

seq1  CCAGGTTCAATAAGAGATTCTGACTCAGATAAAATAAAGCACAGAGCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTCAATAAGAGATTCTGACTCAGATAAAATAAAGCACAGAGCCAT  600

seq1  AGAGGGTATCAACTGCTGGCATGTACACACACATACATACATGCATGGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGTATCAACTGCTGGCATGTACACACACATACATACATGCATGGAT  650

seq1  GCATGCATACGCCCCCCCCCAAACACACACATTCATATATATATATATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCATACGCCCCCCCCCAAACACACACATTCATATATATATATATAC  700

seq1  TCACACATACTCTCACATAAACACACACACACACACACACACACACACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACATACTCTCACATAAACACACACACACACACACACACACACACAC  750

seq1  ACACACACCCTGAATATGGAATAGTGTGGGAGAGTTTTGCAATAAAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACCCTGAATATGGAATAGTGTGGGAGAGTTTTGCAATAAAGAGT  800

seq1  AACAAAGATCATTCTGTTTCTGTAGGATTCTGATTCCCCAAGAGTAAGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AACAAAGATCATTCTGTTTCTGTAGGATTCTGATTCCCCAAGAGTAAGGG  850

seq1  AAACGTGCACCAGCTTGAAAATGTTTTGATAAAGGCACTGATTTATTCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTGCACCAGCTTGAAAATGTTTTGATAAAGGCACTGATTTATTCCA  900

seq1  TTTTGCCCTATGAAAGATGTGAGTCTAGATTCCCTACTGAAATATCCCTG  950
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTCTATGAAAGATGTGAGTCTAGATTCCCTACTGAAATATCCCTG  950

seq1  TCACATTTACTTCTACGTTTGAATTTACGTGAATGAAGAAGATTTA  996
      || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TC-CATTTAC-TCTAC-TTTGAATTTACGTGAATGAAGAAAATTTA  993