BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032K13
Chromosome8 (Build37)
Map Location 36,141,137 - 36,293,657
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666797, LOC666804
Upstream geneDctn6, LOC100042777, Mboat4, Leprotl1, LOC666694, Tmem66, LOC619780, LOC666718, EG234159, LOC666746, Dusp4, LOC675578, Tnks, LOC666792
Downstream genePpp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23, LOC671641, D8Ertd82e, Lonrf1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032K13.bB6Ng01-032K13.g
ACCDH861922DH861923
length932941
definitionDH861922|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032K13, 5' end.DH861923|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032K13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,292,729 - 36,293,657)(36,141,137 - 36,142,078)
sequence
gaattcatacactgattcacacgcaaaaatccaatgttgcagatctgtag
ccaggggtttctgagttggcaccaggcacatccccataacagactctgac
cccataagccttaaccagtcttcattgttaacctgaatgccacattccac
aaaaaaactccaagatctcctttcccaccatggtcactattacctgttga
aaggcagacttccatgtcagagatacctgaagatgaggcttagcatgtca
cttataaggttcctgcaggcaacacttcacctaagccaccagtgggcaga
agggacaagaataagaccaccatgcagagagagacattgtcttagtcagg
gtttctgttcctgcagaaacatcatgaccaagaagcaagttggggaggaa
agggtttattcagcttacaattccatactgctgttcatcaccaaaggaag
tcaggactggaactcaagcagggcaggaagcaggagctgatgcagaggcc
atggaggcatgttacttactggcttgcttcccctggcttgctcagcctgc
tctcttatagaaccaagactaccagcccagtgatggtcccacccacaagg
ggcctttcccccttgatcactaattgagaaaatgccttacagttgtatct
catggaggcatttcctcaactgaagctcctttctctgtgataactccagc
tgcgtcaagttgacacaaaaccagccagtacagacatcatctggaatgtg
gaataggggatataaatggattctctggattcacaccatgtaatcttgac
tagtaactttgttccctaagggaatcttcttatctatccaacagcaatgt
atgggtggcctcatgggttttccatggaaaattctgtcagaaaacaagtc
ccgggtggtgttgaagggcgtcagagaggatc
gaattcacctgctgtgattccagctaggggagtgtgtgttcaagcaaatt
acaagcagcatgtggatgctggcacgtcctcctctgtcaagtgcaagcgt
atgcaacacacatacatgggtttcacttcagcagagagctgtggaagaac
ctagcactgagcgcggaagcataaacctttagctttgtttccgaaataga
agaaaagaaacacgggaggcttgacagtgcagagagaccgatgatctgga
aactccttaaaaatgcaggatgttattccggtcctgcaagcatcgacccc
agacgagaaaaaaaaatcccaagaaaggatggagggacgggagccgaatc
actgataactctgtattgaagagtttcattttttgtgtgtggaggtcagc
agctctgagtgagttatttccatatatgaaaactcattatttctctgaga
caagtgacgtcctgctcgtagaaccagccacttgctcttgtggtatgact
tcccagaaggatttctgaaagcttttagttttccactgatcttcgaaatc
ggtgccagtcagtattgatacactgctaccttgctttgggtcatttgatg
gattgtatgacatagtgtgatttagggagaccatggagatctcatggttg
gctggagtcagaggtcacaagatcagtgacttctcttgctgtggaccatc
aggcaaaacagaaacttatgcacggagtcgttctgttggggatacggcgt
gctctaccacaaaaaagggagccctcaaaatgtcatgctccccaccatca
caacaaaagcccaagaaccttggatgctgtggactcttttttgggctttg
ttccaattctttatctgggctaatttccgccctcggatatcatttttctt
atcgtttgccttatccattcatttttccaaaaccttgtttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_36292729_36293657
seq2: B6Ng01-032K13.b_33_964 (reverse)

seq1  GATCCCCTCTGAC-ACCATCAACACCACCCCGGACTTGTTCTCTGACAGA  49
      ||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GATCCTCTCTGACGCCCTTCAACACCACCCGGGACTTGTTTTCTGACAGA  50

seq1  A-TTTCCATGGAAAACCCATGAGGCCACCC-TACATTGCTGTTGGATAGA  97
      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCATGGAAAACCCATGAGGCCACCCATACATTGCTGTTGGATAGA  100

seq1  TAAGAAGATTCCCTTAGGGAACAAAGTTACTAGGTCAAGATTACATGGTG  147
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGATTCCCTTAGGGAACAAAGTTACTA-GTCAAGATTACATGGTG  149

seq1  TGAATCCAGAGAATCCATTTATATCCCCTATTCCACATTCCAGATGATGT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCCAGAGAATCCATTTATATCCCCTATTCCACATTCCAGATGATGT  199

seq1  CTGTACTGGCTGGTTTTGTGTCAACTTGACGCAGCTGGAGTTATCACAGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACTGGCTGGTTTTGTGTCAACTTGACGCAGCTGGAGTTATCACAGA  249

seq1  GAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCATGAGATACAACTGTAAGGC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCATGAGATACAACTGTAAGGC  299

seq1  ATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCA  349

seq1  TCACTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTATAAGAGAGCAGGCTGAGCAAGCCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTATAAGAGAGCAGGCTGAGCAAGCCA  399

seq1  GGGGAAGCAAGCCAGTAAGTAACATGCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGCAAGCCAGTAAGTAACATGCCTCCATGGCCTCTGCATCAGCTC  449

seq1  CTGCTTCCTGCCCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCTGCCCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAA  499

seq1  CAGCAGTATGGAATTGTAAGCTGAATAAACCCTTTCCTCCCCAACTTGCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGTATGGAATTGTAAGCTGAATAAACCCTTTCCTCCCCAACTTGCT  549

seq1  TCTTGGTCATGATGTTTCTGCAGGAACAGAAACCCTGACTAAGACAATGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTCATGATGTTTCTGCAGGAACAGAAACCCTGACTAAGACAATGT  599

seq1  CTCTCTCTGCATGGTGGTCTTATTCTTGTCCCTTCTGCCCACTGGTGGCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTGCATGGTGGTCTTATTCTTGTCCCTTCTGCCCACTGGTGGCT  649

seq1  TAGGTGAAGTGTTGCCTGCAGGAACCTTATAAGTGACATGCTAAGCCTCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTGAAGTGTTGCCTGCAGGAACCTTATAAGTGACATGCTAAGCCTCA  699

seq1  TCTTCAGGTATCTCTGACATGGAAGTCTGCCTTTCAACAGGTAATAGTGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGGTATCTCTGACATGGAAGTCTGCCTTTCAACAGGTAATAGTGA  749

seq1  CCATGGTGGGAAAGGAGATCTTGGAGTTTTTTTGTGGAATGTGGCATTCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGTGGGAAAGGAGATCTTGGAGTTTTTTTGTGGAATGTGGCATTCA  799

seq1  GGTTAACAATGAAGACTGGTTAAGGCTTATGGGGTCAGAGTCTGTTATGG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAACAATGAAGACTGGTTAAGGCTTATGGGGTCAGAGTCTGTTATGG  849

seq1  GGATGTGCCTGGTGCCAACTCAGAAACCCCTGGCTACAGATCTGCAAC-T  896
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGATGTGCCTGGTGCCAACTCAGAAACCCCTGGCTACAGATCTGCAACAT  899

seq1  TGGATTTTTGCGTGTGAATCAGTGTATGAATTC  929
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTTTTGCGTGTGAATCAGTGTATGAATTC  932

seq1: chr8_36141137_36142078
seq2: B6Ng01-032K13.g_67_1007

seq1  GAATTCACCTGCTGTGATTCCAGCTAGGGGAGTGTGTGTTCAAGCAAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTGCTGTGATTCCAGCTAGGGGAGTGTGTGTTCAAGCAAATT  50

seq1  ACAAGCAGCATGTGGATGCTGGCACGTCCTCCTCTGTCAAGTGCAAGCGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCAGCATGTGGATGCTGGCACGTCCTCCTCTGTCAAGTGCAAGCGT  100

seq1  ATGCAACACACATACATGGGTTTCACTTCAGCAGAGAGCTGTGGAAGAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAACACACATACATGGGTTTCACTTCAGCAGAGAGCTGTGGAAGAAC  150

seq1  CTAGCACTGAGCGCGGAAGCATAAACCTTTAGCTTTGTTTCCGAAATAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACTGAGCGCGGAAGCATAAACCTTTAGCTTTGTTTCCGAAATAGA  200

seq1  AGAAAAGAAACACGGGAGGCTTGACAGTGCAGAGAGACCGATGATCTGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGAAACACGGGAGGCTTGACAGTGCAGAGAGACCGATGATCTGGA  250

seq1  AACTCCTTAAAAATGCAGGATGTTATTCCGGTCCTGCAAGCATCGACCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTTAAAAATGCAGGATGTTATTCCGGTCCTGCAAGCATCGACCCC  300

seq1  AGACGAGAAAAAAAAATCCCAAGAAAGGATGGAGGGACGGGAGCCGAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGAGAAAAAAAAATCCCAAGAAAGGATGGAGGGACGGGAGCCGAATC  350

seq1  ACTGATAACTCTGTATTGAAGAGTTTCATTTTTTGTGTGTGGAGGTCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATAACTCTGTATTGAAGAGTTTCATTTTTTGTGTGTGGAGGTCAGC  400

seq1  AGCTCTGAGTGAGTTATTTCCATATATGAAAACTCATTATTTCTCTGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGAGTGAGTTATTTCCATATATGAAAACTCATTATTTCTCTGAGA  450

seq1  CAAGTGACGTCCTGCTCGTAGAACCAGCCACTTGCTCTTGTGGTATGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGACGTCCTGCTCGTAGAACCAGCCACTTGCTCTTGTGGTATGACT  500

seq1  TCCCAGAAGGATTTCTGAAAGCTTTTAGTTTTCCACTGATCTTCGAAATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGAAGGATTTCTGAAAGCTTTTAGTTTTCCACTGATCTTCGAAATC  550

seq1  GGTGCCAGTCAGTATTGATACACTGCTACCTTGCTTTGGGTCATTTGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCAGTCAGTATTGATACACTGCTACCTTGCTTTGGGTCATTTGATG  600

seq1  GATTGTATGACATAGTGTGATTTAGGGAGACCATGGAGATCTCATGGTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTATGACATAGTGTGATTTAGGGAGACCATGGAGATCTCATGGTTG  650

seq1  GCTGGAGTCAGAGGTCACAAGATCAGTGACTTCTCTTGCTGTGGACCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGTCAGAGGTCACAAGATCAGTGACTTCTCTTGCTGTGGACCATC  700

seq1  AGGCAAAACAGAAACTTATGCACGGAGTCGTTCTGTT-GGGATACGGCGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGGCAAAACAGAAACTTATGCACGGAGTCGTTCTGTTGGGGATACGGCGT  750

seq1  GCTCTACCACAGAAAAGGGAGCCCTCAAAATGTCATGCTCCCAACCATCA  799
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCTCTACCACAAAAAAGGGAGCCCTCAAAATGTCATGCTCCCCACCATCA  800

seq1  CAACAAAAGCCCAAGAACCTTGGATGCTGTGGACTCTTTCTTGGCTTTGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |
seq2  CAACAAAAGCCCAAGAACCTTGGATGCTGTGGACTCTTTTTTGGGCTTTG  850

seq1  TTCCAATTCATTATCTGGGCTAATTTCCGCCCTCGGATATCA-TTTTCTT  898
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTCCAATTCTTTATCTGGGCTAATTTCCGCCCTCGGATATCATTTTTCTT  900

seq1  ATCGTTTGCCTTATCCATTCATTTTTCCCATAAATCTTTGTTTG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||
seq2  ATCGTTTGCCTTATCCATTCATTTTTCC---AAAACCTTGTTTG  941