BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032O06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 51,558,254 - 51,712,093
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039966
Upstream geneLOC100039919, EG667495, LOC100039954
Downstream geneLOC667517
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032O06.bB6Ng01-032O06.g
ACCDH862096DH862097
length990712
definitionDH862096|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032O06, 5' end.DH862097|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032O06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,711,100 - 51,712,093)(51,558,254 - 51,558,993)
sequence
gaattcactcaagcaaatggtgagttcattaaaaaaaaaaaaaaaagttc
aaaactgcatggtcttcagcagtccagaattaaagatactgtatacaaaa
cactctgttacttcataaaataccattaaatcttatgtttaggtgggagc
tatagtaatatcatgagcaatataagccctctctgatttgagcttactac
acgtataattaccaaactagttctttatattgtagctagagctgatccac
ggccaaaaaaggggcatgtttaccttggtgactcctttacaatgcaagtg
gttcgatggtaatggccattattctatctgagctgtataatgaaatgaaa
acacacaccacttgtgatatttcagctaaaaatgtgaggccctattcctg
tctaacagtttatgacttaattttagtagaatattagaatcccattgtgc
tactgcaataaaagctctattctactgcagttttttttgaaaagtataat
actatgcaaaactaactgtataaaaacaattatcagttaaatgggcaatt
ctgttatttcaaaactatataagattatagaataatataattgttcaact
ctttagctaaattgagtaataattaggtatttattagttgttaaacgtag
ggtacttgaatttttatatcttacatcaaattgtaaaaggtatagtactg
cggatcgtgagccaatatatttttatttaattgcatttattttaattgta
ataccaaacaattaattaaacatttgaaggtagcatatgtttctcatgca
ttaagtatagttggaaatttgagtcactagaactctctgccgaatttatt
aatcagttcatactagttatacatatcacacttcatggtaattttacaat
gtgatgaaagtgtgttagacatcaatgtattgtcaaggttcatataaata
gcatctgtaatgttttcaacttctagtgtttctgcttgta
gaattcattagagataaagaaaaacatcagaaagacgtgaaagcacatgg
aggattgattatgggaaatctattcacctggtatgcagaggtcagcttag
acactgaaatcattgggtatttcatggttgggtacagcacatgtgaccca
cactaacacaatgagaaaaataaaagtattaaagctatgattaaaagtct
gaatatgtgttggttaccatcaagttgggcaagtgtattatttaatacgg
gctattcctgtggcacataggcattatagatgggtagagttgttggttgc
ttctctcctttgcaagcttatatagtgtcttttggtatcatgaaagccag
tctccttcaagttagttctaaatcaggagcctctaggacctgtaactgaa
gttcatggtctttccagcaaaagccgaaaagatgcatctacaatacaaaa
atctcacctaagactcaaggaatgcattagaagaggcgaaggaaagatta
tacaagccacagaaacagggagtttactgtgaaattgtgttttctacgaa
tgtcagaagctaccatcatatagcctcaccaatacaacttcataaacgag
ttgaccaaggaaagcatacacattcacaaacacactcatgcacacaaaaa
tacacatacatgtacacatgtctattctcttttctctctctctctctctc
tctctctctcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_51711100_51712093
seq2: B6Ng01-032O06.b_46_1035 (reverse)

seq1  TACAAGCAGAAAACACTAAGAAGTTGAAAACATTAACAGATGCTATTTAT  50
      ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| 
seq2  TACAAGCAG-AAACACT-AGAAGTTGAAAACATT-ACAGATGCTATTTA-  46

seq1  TATGAACCTTGACAATACATTGATGTCTAACACCACTTCATCAACATTGT  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||
seq2  TATGAACCTTGACAATACATTGATGTCTAACACACTTTCATC-ACATTGT  95

seq1  AAAATTACCATGAAGTGTGATATGTATAACTAGTATGAACTGATTAAT-A  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAAATTACCATGAAGTGTGATATGTATAACTAGTATGAACTGATTAATAA  145

seq1  ATTCGGCAGAGAGTTCTAGTGACTCAAATTTCCAACTATACTTAATGCAT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCGGCAGAGAGTTCTAGTGACTCAAATTTCCAACTATACTTAATGCAT  195

seq1  GAGAAACATATGCTACCTTCAAATGTTTAATTAATTGTTTGGTATTACAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACATATGCTACCTTCAAATGTTTAATTAATTGTTTGGTATTACAA  245

seq1  TTAAAATAAATGCAATTAAATAAAAATATATTGGCTCACGATCCGCAGTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATAAATGCAATTAAATAAAAATATATTGGCTCACGATCCGCAGTA  295

seq1  CTATACCTTTTACAATTTGATGTAAGATATAAAAATTCAAGTACCCTACG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACCTTTTACAATTTGATGTAAGATATAAAAATTCAAGTACCCTACG  345

seq1  TTTAACAACTAATAAATACCTAATTATTACTCAATTTAGCTAAAGAGTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACAACTAATAAATACCTAATTATTACTCAATTTAGCTAAAGAGTTG  395

seq1  AACAATTATATTATTCTATAATCTTATATAGTTTTGAAATAACAGAATTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTATATTATTCTATAATCTTATATAGTTTTGAAATAACAGAATTG  445

seq1  CCCATTTAACTGATAATTGTTTTTATACAGTTAGTTTTGCATAGTATTAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTAACTGATAATTGTTTTTATACAGTTAGTTTTGCATAGTATTAT  495

seq1  ACTTTTCAAAAAAAACTGCAGTAGAATAGAGCTTTTATTGCAGTAGCACA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTCAAAAAAAACTGCAGTAGAATAGAGCTTTTATTGCAGTAGCACA  545

seq1  ATGGGATTCTAATATTCTACTAAAATTAAGTCATAAACTGTTAGACAGGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGATTCTAATATTCTACTAAAATTAAGTCATAAACTGTTAGACAGGA  595

seq1  ATAGGGCCTCACATTTTTAGCTGAAATATCACAAGTGGTGTGTGTTTTCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGCCTCACATTTTTAGCTGAAATATCACAAGTGGTGTGTGTTTTCA  645

seq1  TTTCATTATACAGCTCAGATAGAATAATGGCCATTACCATCGAACCACTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTATACAGCTCAGATAGAATAATGGCCATTACCATCGAACCACTT  695

seq1  GCATTGTAAAGGAGTCACCAAGGTAAACATGCCCCTTTTTTGGCCGTGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGTAAAGGAGTCACCAAGGTAAACATGCCCCTTTTTTGGCCGTGGA  745

seq1  TCAGCTCTAGCTACAATATAAAGAACTAGTTTGGTAATTATACGTGTAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTCTAGCTACAATATAAAGAACTAGTTTGGTAATTATACGTGTAGT  795

seq1  AAGCTCAAATCAGAGAGGGCTTATATTGCTCATGATATTACTATAGCTCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCAAATCAGAGAGGGCTTATATTGCTCATGATATTACTATAGCTCC  845

seq1  CACCTAAACATAAGATTTAATGGTATTTTATGAAGTAACAGAGTGTTTTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAAACATAAGATTTAATGGTATTTTATGAAGTAACAGAGTGTTTTG  895

seq1  TATACAGTATCTTTAATTCTGGACTGCTGAAGACCATGCAGTTTTGAACT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGTATCTTTAATTCTGGACTGCTGAAGACCATGCAGTTTTGAACT  945

seq1  TTTTTTTTTTTTTTTAATGAACTCACCATTTGCTTGAGTGAATTC  994
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTTTTAATGAACTCACCATTTGCTTGAGTGAATTC  990

seq1: chr8_51558254_51558993
seq2: B6Ng01-032O06.g_70_781

seq1  GAATTCATTAGAGATAAAGAAAAACATCAGAAAGACGTGAAAGCACATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAGAGATAAAGAAAAACATCAGAAAGACGTGAAAGCACATGG  50

seq1  AGGATTGATTATGGGAAATCTATTCACCTGGTATGCAGAGGTCAGCTTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTGATTATGGGAAATCTATTCACCTGGTATGCAGAGGTCAGCTTAG  100

seq1  ACACTGAAATCATTGGGTATTTCATGGTTGGGTACAGCACATGTGACCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGAAATCATTGGGTATTTCATGGTTGGGTACAGCACATGTGACCCA  150

seq1  CACTAACACAATGAGAAAAATAAAAGTATTAAAGCTATGATTAAAAGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACACAATGAGAAAAATAAAAGTATTAAAGCTATGATTAAAAGTCT  200

seq1  GAATATGTGTTGGTTACCATCAAGTTGGGCAAGTGTATTATTTAATACGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGTGTTGGTTACCATCAAGTTGGGCAAGTGTATTATTTAATACGG  250

seq1  GCTATTCCTGTGGCACATAGGCATTATAGATGGGTAGAGTTGTTGGTTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCCTGTGGCACATAGGCATTATAGATGGGTAGAGTTGTTGGTTGC  300

seq1  TTCTCTCCTTTGCAAGCTTATATAGTGTCTTTTGGTATCATGAAAGCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCCTTTGCAAGCTTATATAGTGTCTTTTGGTATCATGAAAGCCAG  350

seq1  TCTCCTTCAAGTTAGTTCTAAATCAGGAGCCTCTAGGACCTGTAACTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTCAAGTTAGTTCTAAATCAGGAGCCTCTAGGACCTGTAACTGAA  400

seq1  GTTCATGGTCTTTCCAGCAAAAGCCGAAAAGATGCATCTACAATACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGGTCTTTCCAGCAAAAGCCGAAAAGATGCATCTACAATACAAAA  450

seq1  ATCTCACCTAAGACTCAAGGAATGCATTAGAAGAGGCGAAGGAAAGATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCACCTAAGACTCAAGGAATGCATTAGAAGAGGCGAAGGAAAGATTA  500

seq1  TACAAGCCACAGAAACAGGGAGTTTACTGTGAAATTGTGTTTTCTACGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGCCACAGAAACAGGGAGTTTACTGTGAAATTGTGTTTTCTACGAA  550

seq1  TGTCAGAAGCTACCATCATATAGCCTCACCAATACAACTTCATAAACGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGAAGCTACCATCATATAGCCTCACCAATACAACTTCATAAACGAG  600

seq1  TTGACCAAGGAAAGCATACACATTCACAAACACACTCATGCACACAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCAAGGAAAGCATACACATTCACAAACACACTCATGCACACAAAAA  650

seq1  TACACATACATGTACACATGTCTATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
seq2  TACACATACATGTACACATGTCTATTCTCT-TTTCTCTCTCTCTCTCTCT  699

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCAC  740
      ||||||||||| |                           
seq2  CTCTCTCTCTCAC---------------------------  712