BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-065N12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 116,471,521 - 116,627,645
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042061, Mon1b, 4930481F22Rik, Adamts18
Downstream geneNudt7, AI427515, Clec3a, Wwox
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-065N12.bB6Ng01-065N12.g
ACCDH885200DH885201
length9251,036
definitionDH885200|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065N12, 5' end.DH885201|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065N12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,626,721 - 116,627,645)(116,471,521 - 116,472,562)
sequence
gaattcctctttgccgctggttccccatctgtctactgagaagcgaagct
agcatgagctgggccatcattttgtttagcaagatgaatgtgaaaacttg
agaaaattgcttggaagtgtgtctggctcacaggatgtgtttgttgttac
gtggctggtgggactctcattgagaaaaagatggcgtgtaggagtaagcc
tcgggaaatgtcagcatccaagactgaacgaaacaggaggagacagcagg
aataagtaactggagccgaggaaggggtttgtagtggggtgacatcacag
ggtgggggagggtgagcccatcagtataggaataaagggatgggtgtatc
ctgtactacaaaggcagtttgagcttggggtgctcctaattgacattgcc
ctggtgctacacacaaggaggcctgggagaagaacacagtgcagtatatt
tcattgagaggaaacactaattagttagagtctaggattgcctaggagtg
attgttttatagcatcctcaaatggtgctcagatatactcatgacatctt
ggtaaagaatcctctcttggacccagatggatagtcactggaaacaatag
acctagtgatgagtgagtggtaaaccatgtaggtggatactgaggttgta
gctctgtgccccttgcacaaggcaaaggaggcatggtgaatgcatgacgg
tcatgcgtgtttggagcaaaaccgacttcatttatatagtccaacacttt
ttgttaccaagggaaagaagcccctctgtgatggttagtctccgttgtta
gcttgacagtctctggatcattaaaaggcagaccaatagacacccttgaa
aaggagctttccggatctgatgattggaagtgggaagcacttacccaaat
gggggcctctggtgacctggataat
gaattctctgtcccttgagcttctccttaggcctcctggaatgggaccct
gttcatctgcccttgtatgccttgactaggtgggagatagagaaagaaca
atccagatgaggaaaagatgacatgtcacctgactttgtgactgtcatgc
tatggcacctcaatattgctttggagaccccattgttgggttttggtttt
ccagtggaatttatagtttcattggctgccaaaggacattaaccatgaga
ggcctctctttttgtggaggtcccagagaaacagggagtgtcctggttgg
ctgccacaggaagaagggtcttctcgtttgtgaacaacagtgttttccaa
gagtgtgaagaaagccttatgttcctatcaaaaggaggataaaactccat
caccatagatttgttgtcagagacttcgcttcctcagtgcttggcagcct
ctgtgcagtggtctttttactagttacattctcaagtccagcagagactt
ggcttctcagtgtattttgaattagatatataaaagctccattaaaaaaa
aactgtgtggaattaagctaatgaagtcctaaaagacaagaacttctgtg
gttatgagggtcaaggactttgaaaaatatcctatctgagtgttctagtc
cctggattggacagatgttttattagatttgtagactctcaggaatggag
aaaactttagagatctacttgatccatattccatcagatataatgtagag
atacaaagaactatttcagtggttttgaccaggcacctccaatttaatat
gggccctttgacctcatttgggatactagctcctctcctcggggtgtctg
aatccagtcacgttttcctgggcttttgtcatgagaatgactatcacatg
acttgctaagaccaacgctacaacagccctgcatgtccctactgttaccc
tactcttacactgaaaaacaaaattaaataatgtcgtaaacatgtggtgg
ggctttcatgtttctttttcaaaatttctttaatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_116626721_116627645
seq2: B6Ng01-065N12.b_49_973 (reverse)

seq1  ATTATCCAGGTCACCAGAGGCACACATTTGGGGTAGGTGC-TCCCACTCC  49
      ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||| |
seq2  ATTATCCAGGTCACCAGAGGCCCCCATTT-GGGTAAGTGCTTCCCACTTC  49

seq1  AAATCATCAGATCCGGAAAGCTCC-TTTCAGGGGTGTCTATTGGTCTGCC  98
       ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAATCATCAGATCCGGAAAGCTCCTTTTCAAGGGTGTCTATTGGTCTGCC  99

seq1  TTTTAATTGATTCCAGAGACTGTCAAGCTAACAACGGAGACTAACCATCA  148
      |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAA-TGA-TCCAGAGACTGTCAAGCTAACAACGGAGACTAACCATCA  147

seq1  CAGAGGGGCTTCTTTCCCTTGGTAAC-AAAAGTGTTGGACTATATAAATG  197
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGGCTTCTTTCCCTTGGTAACAAAAAGTGTTGGACTATATAAATG  197

seq1  AAGTCGGTTTTGCTCCAAACACGCATGACCGTCATGCATTCACCATGCCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCGGTTTTGCTCCAAACACGCATGACCGTCATGCATTCACCATGCCT  247

seq1  CCTTTGCCTTGTGCAAGGGGCACAGAGCTACAACCTCAGTATCCACCTAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGCCTTGTGCAAGGGGCACAGAGCTACAACCTCAGTATCCACCTAC  297

seq1  ATGGTTTACCACTCACTCATCACTAGGTCTATTGTTTCCAGTGACTATCC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTACCACTCACTCATCACTAGGTCTATTGTTTCCAGTGACTATCC  347

seq1  ATCTGGGTCCAAGAGAGGATTCTTTACCAAGATGTCATGAGTATATCTGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGTCCAAGAGAGGATTCTTTACCAAGATGTCATGAGTATATCTGA  397

seq1  GCACCATTTGAGGATGCTATAAAACAATCACTCCTAGGCAATCCTAGACT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATTTGAGGATGCTATAAAACAATCACTCCTAGGCAATCCTAGACT  447

seq1  CTAACTAATTAGTGTTTCCTCTCAATGAAATATACTGCACTGTGTTCTTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTAATTAGTGTTTCCTCTCAATGAAATATACTGCACTGTGTTCTTC  497

seq1  TCCCAGGCCTCCTTGTGTGTAGCACCAGGGCAATGTCAATTAGGAGCACC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGCCTCCTTGTGTGTAGCACCAGGGCAATGTCAATTAGGAGCACC  547

seq1  CCAAGCTCAAACTGCCTTTGTAGTACAGGATACACCCATCCCTTTATTCC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCTCAAACTGCCTTTGTAGTACAGGATACACCCATCCCTTTATTCC  597

seq1  TATACTGATGGGCTCACCCTCCCCCACCCTGTGATGTCACCCCACTACAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGATGGGCTCACCCTCCCCCACCCTGTGATGTCACCCCACTACAA  647

seq1  ACCCCTTCCTCGGCTCCAGTTACTTATTCCTGCTGTCTCCTCCTGTTTCG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTTCCTCGGCTCCAGTTACTTATTCCTGCTGTCTCCTCCTGTTTCG  697

seq1  TTCAGTCTTGGATGCTGACATTTCCCGAGGCTTACTCCTACACGCCATCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTCTTGGATGCTGACATTTCCCGAGGCTTACTCCTACACGCCATCT  747

seq1  TTTTCTCAATGAGAGTCCCACCAGCCACGTAACAACAAACACATCCTGTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCAATGAGAGTCCCACCAGCCACGTAACAACAAACACATCCTGTG  797

seq1  AGCCAGACACACTTCCAAGCAATTTTCTCAAGTTTTCACATTCATCTTGC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGACACACTTCCAAGCAATTTTCTCAAGTTTTCACATTCATCTTGC  847

seq1  TAAACAAAATGATGGCCCAGCTCATGCTAGCTTCGCTTCTCAGTAGACAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAAAATGATGGCCCAGCTCATGCTAGCTTCGCTTCTCAGTAGACAG  897

seq1  ATGGGGAACCAGCGGCAAAGAGGAATTC  925
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGAACCAGCGGCAAAGAGGAATTC  925

seq1: chr8_116471521_116472562
seq2: B6Ng01-065N12.g_66_1101

seq1  GAATTCTCTGTCCCTTGAGCTTCTCCTTAGGCCTCCTGGAATGGGACCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTCCCTTGAGCTTCTCCTTAGGCCTCCTGGAATGGGACCCT  50

seq1  GTTCATCTGCCCTTGTATGCCTTGACTAGGTGGGAGATAGAGAAAGAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATCTGCCCTTGTATGCCTTGACTAGGTGGGAGATAGAGAAAGAACA  100

seq1  ATCCAGATGAGGAAAAGATGACATGTCACCTGACTTTGTGACTGTCATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGATGAGGAAAAGATGACATGTCACCTGACTTTGTGACTGTCATGC  150

seq1  TATGGCACCTCAATATTGCTTTGGAGACCCCATTGTTGGGTTTTGGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCACCTCAATATTGCTTTGGAGACCCCATTGTTGGGTTTTGGTTTT  200

seq1  CCAGTGGAATTTATAGTTTCATTGGCTGCCAAAGGACATTAACCATGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGGAATTTATAGTTTCATTGGCTGCCAAAGGACATTAACCATGAGA  250

seq1  GGCCTCTCTTTTTGTGGAGGTCCCAGAGAAACAGGGAGTGTCCTGGTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCTCTTTTTGTGGAGGTCCCAGAGAAACAGGGAGTGTCCTGGTTGG  300

seq1  CTGCCACAGGAAGAAGGGTCTTCTCGTTTGTGAACAACAGTGTTTTCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACAGGAAGAAGGGTCTTCTCGTTTGTGAACAACAGTGTTTTCCAA  350

seq1  GAGTGTGAAGAAAGCCTTATGTTCCTATCAAAAGGAGGATAAAACTCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGAAGAAAGCCTTATGTTCCTATCAAAAGGAGGATAAAACTCCAT  400

seq1  CACCATAGATTTGTTGTCAGAGACTTCGCTTCCTCAGTGCTTGGCAGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATAGATTTGTTGTCAGAGACTTCGCTTCCTCAGTGCTTGGCAGCCT  450

seq1  CTGTGCAGTGGTCTTTTTACTAGTTACATTCTCAAGTCCAGCAGAGACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAGTGGTCTTTTTACTAGTTACATTCTCAAGTCCAGCAGAGACTT  500

seq1  GGCTTCTCAGTGTATTTTGAATTAGATATATAAAAGCTCCATTAAAAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCTCAGTGTATTTTGAATTAGATATATAAAAGCTCCATTAAAAAAA  550

seq1  AACTGTGTGGAATTAAGCTAATGAAGTCCTAAAAGACAAGAACTTCTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTGTGGAATTAAGCTAATGAAGTCCTAAAAGACAAGAACTTCTGTG  600

seq1  GTTATGAGGGTCAAGGACTTTGAAAAATATCCTATCTGAGTGTTCTAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGAGGGTCAAGGACTTTGAAAAATATCCTATCTGAGTGTTCTAGTC  650

seq1  CCTGGATTGGACAGATGTTTTATTAGATTTGTAGACTCTCAGGAATGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGATTGGACAGATGTTTTATTAGATTTGTAGACTCTCAGGAATGGAG  700

seq1  AAAACTTTAGAGATCTACTTGATCCAATATTCCATCAGATATAATGTAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTTAGAGATCTACTTGATCC-ATATTCCATCAGATATAATGTAGA  749

seq1  GATACAAAGAACTATTTCAGTGGTTTTGACCAGGCACCTCCAATTAATTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
seq2  GATACAAAGAACTATTTCAGTGGTTTTGACCAGGCACCTCCAATTTAATA  799

seq1  T-GGCCCTTTGACCTCATTTTGGATACTAGCTCCTCTCCTCGGGGTGTCT  849
      | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCCTTTGACCTCATTTGGGATACTAGCTCCTCTCCTCGGGGTGTCT  849

seq1  GAATCCAGTCACGTTTTCCTGGGCTTTTGTCATGAGAATGACTATCACAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCAGTCACGTTTTCCTGGGCTTTTGTCATGAGAATGACTATCACAT  899

seq1  GACTTGCTAAGAACCAACGCTACAACAGCCCCTGCATGTCCCTACTGGTA  949
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  GACTTGCTAAG-ACCAACGCTACAACAG-CCCTGCATGTCCCTACTGTTA  947

seq1  CCCCTACTCTTACACCTGAAAAACAAAATTAAATTAATGTCGTTAAACAT  999
       ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||
seq2  -CCCTACTCTTACA-CTGAAAAACAAAATTAAA-TAATGTCG-TAAACAT  993

seq1  GTG--TGGGCTTTCATTGTTTCTTTTTCAAAATTTCTTTTAATGG  1042
      |||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGGTGGGGCTTTCA-TGTTTCTTTTTCAAAATTTC-TTTAATGG  1036