BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-072E03
Chromosome8 (Build37)
Map Location 126,725,286 - 126,876,699
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalnt2
Upstream geneChmp1a, 4732415M23Rik, Cdk10, Spata2L, 1300018I17Rik, Zfp276, Fanca, Spire2, Tcf25, Mc1r, Tubb3, Def8, Afg3l1, Dbndd1, Gas8, Rn5s-ps1, Rhou, LOC100042484, LOC100042490, Rab4a, 1700054N08Rik, LOC100043296, Acta1, Nup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535
Downstream genePgbd5, Cog2, Agt, Capn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67, 2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8, Gm505, Egln1, Tsnax, Disc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-072E03.bB6Ng01-072E03.g
ACCDH889725DH889726
length1,1191,113
definitionDH889725|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072E03, 5' end.DH889726|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-072E03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,725,286 - 126,726,408)(126,875,587 - 126,876,699)
sequence
gaattccaggctctgactcaggacagatagaggtgacactcttctttcct
tagggcatctgcaggtggccttggcctcagtttctgtaccaccctaaacc
aagttcagctcttcaagagaaagccaagtgttctggtggtggggaggaag
ctagtttctctagacccagctggaccctttcttcctgatcatcctggtct
gctttgtatccatcccatgtaggcatgagctgcagacgtggattaaatcc
gttgtttataattgagttcacttcccatcgcgtaccctcttcagaagcca
gcatggcctatgaaagtctccctctctgctgaggtcagcgatggggtaag
tccctatgagctggacagtggtctagcctccctccctggctcgggaagga
gagtttttcccagcaggggcctgatgacagggtagggatgtttcataact
gaaaacccttcttaaacactgtttataagccatgccacttcgagctcaat
gagctggggccactggtgttgcgtaatcgtccccaggagcactgtggagc
tcagcctatgtatgaagaggaacggaaggaagaaaagaccaaatgtaaac
ttataagtaaaactgtttgtggattgtaaaacttactttcgaagcttctg
gcattataggtacatctgggacaacccaaacttctgcgtctctaaatttt
tttatttaattttaagtgtctatgtgtgtgtgtgttcatgggccactact
gggtcccctgggagattactcagcgttcttaactgctggggaggtggatt
aaaatccacatcttcctaaatcgggagagcactccagtttaccacaatct
ctcatggcaggatttcacacaggtggctaaattgctcgacaaacacattg
tatcaacttgaaagggtctttttctttagactgatactttttctccgaag
ctaagctcaagttggctgcaaactaccctccaccccattggtaggtagtg
atcctgatgtctctaggacaaatcctgtgtactacccctcctaggggtcc
ctttccagctatggttccatagccttctaacttacacatggatcatttaa
gccttattgggtgggtggg
gaattcttaataactaaataggggacaccgtgactttgtctcagctcaac
actgcagccctgacctgcggccaagggagacaggcccactgttgttttta
aagaagctaaccaactggcaaggccagacaagacacttggaaggtcctac
tccaaggattgatttggactgtccttctcccaggacctccgagactggtc
aagtccccataaaaacctcgctccaacatgtacatgacctttgcctctgt
ggggaatctagggagagactcaagggccccccaactttctagtcataagg
ggatataaggtctctagagaaaagacacaacctgagttctaggtaaacgc
atagagaacctcagccatcttcaagacgtggggtcactgttccccatatg
ggagcccgtctcataagaatcccctttcttggacctgcactcccccgaga
cgatgcccctttcctcagccatcacccctgcccctgacagcagtggctgt
tgctctctgaacagcagggattgagagtgtttgacagggaatgtgacagc
aggtccccgaggtgatggtggcttattctcaagagaccttgtgaaaagaa
acagcttcaaggctgagtgccttaaacaggaccaatagaggaccctgtaa
aatagtcagcccagggctggagaaatggctgctcttccagaggacccagc
ttcagctcccagcacctatctccatggcggctcacaaccatctgtaactc
cagttccagggattcaactcggtgttttggcctctgtaccaggcacatga
gatacacagacatagatgcaggtaaagcgcccatactccttaatagaaac
atttcccaagtcagaggccctgtctctgtgggtttggacttcgctctttc
ctggatgttcaattctttgtccatcccagagaatgagctcagcggagccc
ctagatggcactagggggccaggacacagcatcctcctcctctccctctt
gcttagagctcaagtctgggtccctcagctgttcttccacaggagtaaat
gtcaaagtggtactttagagcaagaattctggggcgatgccccctgaaag
gaaaaaaccttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_126725286_126726408
seq2: B6Ng01-072E03.b_40_1158

seq1  GAATTCCAGGCTCTGACTCAGGACAGATAGAGGTGACACTCTTCTTTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCTCTGACTCAGGACAGATAGAGGTGACACTCTTCTTTCCT  50

seq1  TAGGGCATCTGCAGGTGGCCTTGGCCTCAGTTTCTGTACCACCCTAAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGCATCTGCAGGTGGCCTTGGCCTCAGTTTCTGTACCACCCTAAACC  100

seq1  AAGTTCAGCTCTTCAAGAGAAAGCCAAGTGTTCTGGTGGTGGGGAGGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCAGCTCTTCAAGAGAAAGCCAAGTGTTCTGGTGGTGGGGAGGAAG  150

seq1  CTAGTTTCTCTAGACCCAGCTGGACCCTTTCTTCCTGATCATCCTGGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTTCTCTAGACCCAGCTGGACCCTTTCTTCCTGATCATCCTGGTCT  200

seq1  GCTTTGTATCCATCCCATGTAGGCATGAGCTGCAGACGTGGATTAAATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGTATCCATCCCATGTAGGCATGAGCTGCAGACGTGGATTAAATCC  250

seq1  GTTGTTTATAATTGAGTTCACTTCCCATCGCGTACCCTCTTCAGAAGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTATAATTGAGTTCACTTCCCATCGCGTACCCTCTTCAGAAGCCA  300

seq1  GCATGGCCTATGAAAGTCTCCCTCTCTGCTGAGGTCAGCGATGGGGTAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGCCTATGAAAGTCTCCCTCTCTGCTGAGGTCAGCGATGGGGTAAG  350

seq1  TCCCTATGAGCTGGACAGTGGTCTAGCCTCCCTCCCTGGCTCGGGAAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTATGAGCTGGACAGTGGTCTAGCCTCCCTCCCTGGCTCGGGAAGGA  400

seq1  GAGTTTTTCCCAGCAGGGGCCTGATGACAGGGTAGGGATGTTTCATAACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTTTCCCAGCAGGGGCCTGATGACAGGGTAGGGATGTTTCATAACT  450

seq1  GAAAACCCTTCTTAAACACTGTTTATAAGCCATGCCACTTCGAGCTCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACCCTTCTTAAACACTGTTTATAAGCCATGCCACTTCGAGCTCAAT  500

seq1  GAGCTGGGGCCACTGGTGTTGCGTAATCGTCCCCAGGAGCACTGTGGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGGGCCACTGGTGTTGCGTAATCGTCCCCAGGAGCACTGTGGAGC  550

seq1  TCAGCCTATGTATGAAGAGGAACGGAAGGAAGAAAAGACCAAATGTAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCTATGTATGAAGAGGAACGGAAGGAAGAAAAGACCAAATGTAAAC  600

seq1  TTATAAGTAAAACTGTTTGTGGATTGTAAAACTTACTTTCGAAGCTTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGTAAAACTGTTTGTGGATTGTAAAACTTACTTTCGAAGCTTCTG  650

seq1  GCATTATAGGTACATCTGGGACAACCCAAACTTCTGCGTCTCTAAA-TTT  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GCATTATAGGTACATCTGGGACAACCCAAACTTCTGCGTCTCTAAATTTT  700

seq1  TTTATTTAATTTTAAGTGTCTATGTGTGTGTGTGTTCATGGGCCACTACT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTAATTTTAAGTGTCTATGTGTGTGTGTGTTCATGGGCCACTACT  750

seq1  GGGTCCCCTGGGAGATTACTCAGCGTTCTTAACTGCTGGGGAGGTGGATT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCCCTGGGAGATTACTCAGCGTTCTTAACTGCTGGGGAGGTGGATT  800

seq1  AAAATCCACATCTTCCTAAATCGGGAGAGCACTCCAGTTTACCACAATCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCACATCTTCCTAAATCGGGAGAGCACTCCAGTTTACCACAATCT  850

seq1  CTCATGGCAGGATTTCAACACAGGTGGCTAAATTGCTCGACAAACACATT  899
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGCAGGATTTC-ACACAGGTGGCTAAATTGCTCGACAAACACATT  899

seq1  GTATCAACTTGAAAGGGTC-TTTTCTTTAGACTGATACTTTTTCTCCGAA  948
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAACTTGAAAGGGTCTTTTTCTTTAGACTGATACTTTTTCTCCGAA  949

seq1  GCTAAGGCTCAAGTTGGCTGCAAACTACCCTCCACCCCATTGGTAGGTAG  998
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAA-GCTCAAGTTGGCTGCAAACTACCCTCCACCCCATTGGTAGGTAG  998

seq1  TGATCCTGATGTCTCTTAGGGACAAACCCTGTGTACTAACCCTCCTAGGT  1048
      ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| 
seq2  TGATCCTGATGTCTCT--AGGACAAATCCTGTGTACTACCCCTCCTAGGG  1046

seq1  GTCCCTTTCAAGGCTATGGTTCCATAGCCTTCTGACTTACCACATTGTAT  1098
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||
seq2  GTCCCTTTCCA-GCTATGGTTCCATAGCCTTCTAACTTA-CACA-TGGAT  1093

seq1  CATTATAGCCTTATT-GGTGGGTGGG  1123
      ||||  ||||||||| ||||||||||
seq2  CATTTAAGCCTTATTGGGTGGGTGGG  1119

seq1: chr8_126875587_126876699
seq2: B6Ng01-072E03.g_68_1180 (reverse)

seq1  TCAAGGTCTCTTTTCCTTCAGGGTGCATCTGCCCCAGGAAATCTTTGCTC  50
      ||||||| | ||| | ||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||
seq2  TCAAGGT-TTTTTCCTTTCAGGGGGCATC-GCCCCAG--AATTCTTGCTC  46

seq1  TAAAAGTACCACTTTGACA-TTACTCCTGTGGAAGGACAGCTGAGGG-CC  98
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  T-AAAGTACCACTTTGACATTTACTCCTGTGGAAGAACAGCTGAGGGACC  95

seq1  CAGACCTGAGCTCTGAGCCAGAGGGAG-GGAGGAGGATGCTGGTGTCCTG  147
      ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGACTTGAGCTCTAAGCAAGAGGGAGAGGAGGAGGATGCT-GTGTCCTG  144

seq1  G-CCCCTAGTGGCCATCTAGGGGCT-CGCTGAGCTCATTCTCTGGGATGG  195
      | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTAGT-GCCATCTAGGGGCTCCGCTGAGCTCATTCTCTGGGATGG  193

seq1  ACAAAGAATTGAACATCCAGGAAAGAGCGAAGTCC-AAGCCACAGAGACA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
seq2  ACAAAGAATTGAACATCCAGGAAAGAGCGAAGTCCAAACCCACAGAGACA  243

seq1  GGGCCTCTGACTTGGG-AATGTTTCTATTTAGGAGTATGGGCGCTTTACC  293
      |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTCTGACTTGGGAAATGTTTCTATTAAGGAGTATGGGCGCTTTACC  293

seq1  TGCATCTATGTCTGTGTATCTCATGTGCCTGGTACAGAGGCCAAAACACC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCTATGTCTGTGTATCTCATGTGCCTGGTACAGAGGCCAAAACACC  343

seq1  GAGTTGAATCCCTGGAACTGGAGTTACAGATGGTTGTGAGCCGCCATGGA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGAATCCCTGGAACTGGAGTTACAGATGGTTGTGAGCCGCCATGGA  393

seq1  GATAGGTGCTGGGAGCTGAAGCTGGGTCCTCTGGAAGAGCAGCCATTTCT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGTGCTGGGAGCTGAAGCTGGGTCCTCTGGAAGAGCAGCCATTTCT  443

seq1  CCAGCCCTGGGCTGACTATTTTACAGGGTCCTCTATTGGTCCTGTTTAAG  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCTGGGCTGACTATTTTACAGGGTCCTCTATTGGTCCTGTTTAAG  493

seq1  GCACTCAGCCTTGAAGCTGTTTCTTTTCACAAGGTCTCTTGAGAATAAGC  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCAGCCTTGAAGCTGTTTCTTTTCACAAGGTCTCTTGAGAATAAGC  543

seq1  CACCATCACCTCGGGGACCTGCTGTCACATTCCCTGTCAAACACTCTCAA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCACCTCGGGGACCTGCTGTCACATTCCCTGTCAAACACTCTCAA  593

seq1  TCCCTGCTGTTCAGAGAGCAACAGCCACTGCTGTCAGGGGCAGGGGTGAT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGCTGTTCAGAGAGCAACAGCCACTGCTGTCAGGGGCAGGGGTGAT  643

seq1  GGCTGAGGAAAGGGGCATCGTCTCGGGGGAGTGCAGGTCCAAGAAAGGGG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGAGGAAAGGGGCATCGTCTCGGGGGAGTGCAGGTCCAAGAAAGGGG  693

seq1  ATTCTTATGAGACGGGCTCCCATATGGGGAACAGTGACCCCACGTCTTGA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTATGAGACGGGCTCCCATATGGGGAACAGTGACCCCACGTCTTGA  743

seq1  AGATGGCTGAGGTTCTCTATGCGTTTACCTAGAACTCAGGTTGTGTCTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCTGAGGTTCTCTATGCGTTTACCTAGAACTCAGGTTGTGTCTTT  793

seq1  TCTCTAGAGACCTTATATCCCCTTATGACTAGAAAGTTGGGGGGCCCTTG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGAGACCTTATATCCCCTTATGACTAGAAAGTTGGGGGGCCCTTG  843

seq1  AGTCTCTCCCTAGATTCCCCACAGAGGCAAAGGTCATGTACATGTTGGAG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTCCCTAGATTCCCCACAGAGGCAAAGGTCATGTACATGTTGGAG  893

seq1  CGAGGTTTTTATGGGGACTTGACCAGTCTCGGAGGTCCTGGGAGAAGGAC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGTTTTTATGGGGACTTGACCAGTCTCGGAGGTCCTGGGAGAAGGAC  943

seq1  AGTCCAAATCAATCCTTGGAGTAGGACCTTCCAAGTGTCTTGTCTGGCCT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAAATCAATCCTTGGAGTAGGACCTTCCAAGTGTCTTGTCTGGCCT  993

seq1  TGCCAGTTGGTTAGCTTCTTTAAAAACAACAGTGGGCCTGTCTCCCTTGG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGTTGGTTAGCTTCTTTAAAAACAACAGTGGGCCTGTCTCCCTTGG  1043

seq1  CCGCAGGTCAGGGCTGCAGTGTTGAGCTGAGACAAAGTCACGGTGTCCCC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAGGTCAGGGCTGCAGTGTTGAGCTGAGACAAAGTCACGGTGTCCCC  1093

seq1  TATTTAGTTATTAAGAATTC  1113
      ||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAGTTATTAAGAATTC  1113