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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-080H23
Chromosome	8 (Build37)
Map Location	62,253,890 - 62,255,092
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	4930431L04Rik, BC030500, LOC665116, LOC436042
Downstream gene	Aadat, Mfap3l, LOC100040679
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-080H23.b	B6Ng01-080H23.g
ACC	DH895619	DH895620
length	1,182	1,044
definition	DH895619\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-080H23, 5' end.	DH895620\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-080H23, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcatttatataacttcaaaatcagtgacataattaatattaattca taataaagctataacccaaacagctgatgaaatccttgaagtaacatgtt agtatgagatcctcatacaacaaataaaaataccacacaaaatatgtaag catacattgatcctccaaatttcccttaaatactttggctagcagagaca actgtgtcacttccacatagtcttgatgatttatcactgttatcataaat tatatcactaataccataaccttggaactcttgtggcagatttccttttt acctttataatgcaattagataaaataaactctttgtatagcaagatcta cttgaaaagaatatcttctattagttaaagttttggtactatagctgtca gttttcctttgtatatacaaatccatcagtaatgatgcatttgcctagga taaacaatttattgtgtggtgcacaaccttttaggagtggtgtcaaaatt tgctagtttagctaattatgtcatggaccttatgataagcatataaacat acttaaaacaaattctcaagtattttatagagtaaaatatggagtccaac aggaatgaagtacagaactggatagattagtgtatgcttactcatgcaac cactaactgtattttcaattttttcttctgtgtttaataatgtgtcagga gagagaacatcagggtctatgcagagatctgtgagattaaagggacagaa aataattcattaatacaaccagactttccaatttcagaggatataaatga tattataaggagaaaaacaggtgaaaagaatccaattaaagcctcacccc caaatttttatgcctccaacaaatctataaacacaacccaatttttcatt tcaccaacaactacaagaaaaagtgtcatcattaaaaatatgaatggtga atggacattgatttgtgatatataaatttttgcttggtaaatataatgag tcatagatggggccataagtttgtgaccataactgtcagtcacaatgtaa agtcactctgaaaaaaaataagctataatgttggcagactcctcacgccc tccccattccagctaggaaatcagagaagtcagatatggttctacggaat acatttcagtttcctgttctcctcaaggtaac	gaattctgttcttcttttaggtttgttgaagaattactttcttgcttttt gtaggctgtcatttaacctccttgtgttggagtttttccttcattatcct ttgaagatctggattcatggaaagatgttgtgtgaatttgattttgtctt ggagtactttgttttctccaattatggtaatttaaagttttgctggatat agtagtctggactggcattcgtgttctcttagggtctgtatgacatctgt ccaggatcttctggctttcatagtctctggtgaaaagtgtggtgtaatac taataggtctgcctttatattttactctacccttttcctttactgctttt aatattgtttatttagtgtatttattgtttttttttttcaggtctagtct atttggagttccataggcttcttgtatgttcatgggcatttctttcttta ggttagggaagttttctttataattttgtcgaagatattactggcccttt aagttaaaaaatcttcattctcatatatacctattatccttaggtttggt cttctcattctgtcctggatttccttgatgttttgagtcagcgtcttttt gcatttttgcatctttgattgttgtgtccatgttttctatggaatcttct gcacctgagattctctcttccatctcttgtattctgttgctgatgctcgc atctatgatttctttcctaggatttcttaccttcagagtaatttctcttt ggatattctttattgtttctacctccattttttagatcttggacggtttt tatttgaattcaatcacctcttttgtattgttttcctctaattctttagg gatttttgtgttttcctctttaaagacttctaactgtttagcagtgttct tctgtatttctttgagttattaatgcccttcttccaatcccctaccagaa tcataagacatccaatttaaatctgaatcttactttaccggtgtgctggg gtatccaggactcacttgtgggtgggagtctgggtttctgatgt
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr8_62253890_62255092 seq2: B6Ng01-080H23.b_46_1227 seq1 GAATTCATTTATATAACTTCAAAATCAGTGACATAATTAATATTAATTCA 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCATTTATATAACTTCAAAATCAGTGACATAATTAATATTAATTCA 50 seq1 TAATAAAGCTATAACCCAAACAGCTGATGAAATCCTTGAAGTAACATGTT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAATAAAGCTATAACCCAAACAGCTGATGAAATCCTTGAAGTAACATGTT 100 seq1 AGTATGAGATCCTCATACAACAAATAAAAATACCACACAAAATATGTAAG 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTATGAGATCCTCATACAACAAATAAAAATACCACACAAAATATGTAAG 150 seq1 CATACATTGATCCTCCAAATTTCCCTTAAATACTTTGGCTAGCAGAGACA 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATACATTGATCCTCCAAATTTCCCTTAAATACTTTGGCTAGCAGAGACA 200 seq1 ACTGTGTCACTTCCACATAGTCTTGATGATTTATCACTGTTATCATAAAT 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTGTGTCACTTCCACATAGTCTTGATGATTTATCACTGTTATCATAAAT 250 seq1 TATATCACTAATACCATAACCTTGGAACTCTTGTGGCAGATTTCCTTTTT 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATATCACTAATACCATAACCTTGGAACTCTTGTGGCAGATTTCCTTTTT 300 seq1 ACCTTTATAATGCAATTAGATAAAATAAACTCTTTGTATAGCAAGATCTA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCTTTATAATGCAATTAGATAAAATAAACTCTTTGTATAGCAAGATCTA 350 seq1 CTTGAAAAGAATATCTTCTATTAGTTAAAGTTTTGGTACTATAGCTGTCA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTGAAAAGAATATCTTCTATTAGTTAAAGTTTTGGTACTATAGCTGTCA 400 seq1 GTTTTCCTTTGTATATACAAATCCATCAGTAATGATGCATTTGCCTAGGA 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTTTCCTTTGTATATACAAATCCATCAGTAATGATGCATTTGCCTAGGA 450 seq1 TAAACAATTTATTGTGTGGTGCACAACCTTTTAGGAGTGGTGTCAAAATT 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAAACAATTTATTGTGTGGTGCACAACCTTTTAGGAGTGGTGTCAAAATT 500 seq1 TGCTAGTTTAGCTAATTATGTCATGGACCTTATGATAAGCATATAAACAT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCTAGTTTAGCTAATTATGTCATGGACCTTATGATAAGCATATAAACAT 550 seq1 ACTTAAAACAAATTCTCAAGTATTTTATAGAGTAAAATATGGAGTCCAAC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTTAAAACAAATTCTCAAGTATTTTATAGAGTAAAATATGGAGTCCAAC 600 seq1 AGGAATGAAGTACAGAACTGGATAGATTAGTGTATGCTTACTCATGCAAC 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGAATGAAGTACAGAACTGGATAGATTAGTGTATGCTTACTCATGCAAC 650 seq1 CACTAACTGTATTTTCAATTTTTTCTTCTGTGTTTAATAATGTGTCAGGA 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACTAACTGTATTTTCAATTTTTTCTTCTGTGTTTAATAATGTGTCAGGA 700 seq1 GAGAGAACATCAGGGTCTATGCAGAGATCTGTGAGATTAAAGGGACAGAA 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGAGAACATCAGGGTCTATGCAGAGATCTGTGAGATTAAAGGGACAGAA 750 seq1 AATAATTCATTAATACAACCAGACTTTCCAATTTCAGAGGATATAAATGA 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATAATTCATTAATACAACCAGACTTTCCAATTTCAGAGGATATAAATGA 800 seq1 TATTATAAGGAGAAAAACAGGTGAAAAGAATCCAATTAAAGCCTCACCCC 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATTATAAGGAGAAAAACAGGTGAAAAGAATCCAATTAAAGCCTCACCCC 850 seq1 CAAATTTTTATGCCTCCAACAAATCTATAAACACAACCCAATTTTTCATT 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAATTTTTATGCCTCCAACAAATCTATAAACACAACCCAATTTTTCATT 900 seq1 TCACCAACAACTACAAGAAAAAGTGTCATCATTAAAAATATGAATGGTGA 950 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCACCAACAACTACAAGAAAAAGTGTCATCATTAAAAATATGAATGGTGA 950 seq1 ATGGACATTGATTTGTGATATATTAAATTTTTTGCTTGGTAAAATATAAA 1000 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\| seq2 ATGGACATTGATTTGTGATATAT--AAATTTTTGCTTGGT-AAATAT-AA 996 seq1 TGAGTCATAGATGGGGCCATAAGTTTGTGGACCATAACTGTCAAGTCACA 1050 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAGTCATAGATGGGGCCATAAGTTTGT-GACCATAACTGTC-AGTCACA 1044 seq1 ATTGTAAAGTCACTTCTGAAAAAAATAAGGCTATTAAATGTTTGCCAGAC 1100 \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| seq2 A-TGTAAAGTCAC-TCTGAAAAAAAATAAGCTAT--AATG-TTGGCAGAC 1089 seq1 TCCTCACCGCCCCTCCCCCATTTCCAGCTAAGGAGAATCAGAGAAAGTCA 1150 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 TCCTCAC--GCCCTCCCC--ATTCCAGCT-AGGA-AATCAGAG-AAGTCA 1132 seq1 GATATGTTTCTTACAGGAAATACATGTCATGTTCCTGTTCTGCTCAAGGT 1200 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GATATGGTTCT---ACGGAATACATTTCAGTTTCCTGTTCTCCTCAAGGT 1179 seq1 AAC 1203 \|\|\| seq2 AAC 1182

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr8_62253890_62255092
seq2: B6Ng01-080H23.b_46_1227

seq1  GAATTCATTTATATAACTTCAAAATCAGTGACATAATTAATATTAATTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTATATAACTTCAAAATCAGTGACATAATTAATATTAATTCA  50

seq1  TAATAAAGCTATAACCCAAACAGCTGATGAAATCCTTGAAGTAACATGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAGCTATAACCCAAACAGCTGATGAAATCCTTGAAGTAACATGTT  100

seq1  AGTATGAGATCCTCATACAACAAATAAAAATACCACACAAAATATGTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGAGATCCTCATACAACAAATAAAAATACCACACAAAATATGTAAG  150

seq1  CATACATTGATCCTCCAAATTTCCCTTAAATACTTTGGCTAGCAGAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATTGATCCTCCAAATTTCCCTTAAATACTTTGGCTAGCAGAGACA  200

seq1  ACTGTGTCACTTCCACATAGTCTTGATGATTTATCACTGTTATCATAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTCACTTCCACATAGTCTTGATGATTTATCACTGTTATCATAAAT  250

seq1  TATATCACTAATACCATAACCTTGGAACTCTTGTGGCAGATTTCCTTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCACTAATACCATAACCTTGGAACTCTTGTGGCAGATTTCCTTTTT  300

seq1  ACCTTTATAATGCAATTAGATAAAATAAACTCTTTGTATAGCAAGATCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTATAATGCAATTAGATAAAATAAACTCTTTGTATAGCAAGATCTA  350

seq1  CTTGAAAAGAATATCTTCTATTAGTTAAAGTTTTGGTACTATAGCTGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAAAGAATATCTTCTATTAGTTAAAGTTTTGGTACTATAGCTGTCA  400

seq1  GTTTTCCTTTGTATATACAAATCCATCAGTAATGATGCATTTGCCTAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCCTTTGTATATACAAATCCATCAGTAATGATGCATTTGCCTAGGA  450

seq1  TAAACAATTTATTGTGTGGTGCACAACCTTTTAGGAGTGGTGTCAAAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAATTTATTGTGTGGTGCACAACCTTTTAGGAGTGGTGTCAAAATT  500

seq1  TGCTAGTTTAGCTAATTATGTCATGGACCTTATGATAAGCATATAAACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTAGTTTAGCTAATTATGTCATGGACCTTATGATAAGCATATAAACAT  550

seq1  ACTTAAAACAAATTCTCAAGTATTTTATAGAGTAAAATATGGAGTCCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAAACAAATTCTCAAGTATTTTATAGAGTAAAATATGGAGTCCAAC  600

seq1  AGGAATGAAGTACAGAACTGGATAGATTAGTGTATGCTTACTCATGCAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATGAAGTACAGAACTGGATAGATTAGTGTATGCTTACTCATGCAAC  650

seq1  CACTAACTGTATTTTCAATTTTTTCTTCTGTGTTTAATAATGTGTCAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACTGTATTTTCAATTTTTTCTTCTGTGTTTAATAATGTGTCAGGA  700

seq1  GAGAGAACATCAGGGTCTATGCAGAGATCTGTGAGATTAAAGGGACAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAACATCAGGGTCTATGCAGAGATCTGTGAGATTAAAGGGACAGAA  750

seq1  AATAATTCATTAATACAACCAGACTTTCCAATTTCAGAGGATATAAATGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTCATTAATACAACCAGACTTTCCAATTTCAGAGGATATAAATGA  800

seq1  TATTATAAGGAGAAAAACAGGTGAAAAGAATCCAATTAAAGCCTCACCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAAGGAGAAAAACAGGTGAAAAGAATCCAATTAAAGCCTCACCCC  850

seq1  CAAATTTTTATGCCTCCAACAAATCTATAAACACAACCCAATTTTTCATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTTTATGCCTCCAACAAATCTATAAACACAACCCAATTTTTCATT  900

seq1  TCACCAACAACTACAAGAAAAAGTGTCATCATTAAAAATATGAATGGTGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAACAACTACAAGAAAAAGTGTCATCATTAAAAATATGAATGGTGA  950

seq1  ATGGACATTGATTTGTGATATATTAAATTTTTTGCTTGGTAAAATATAAA  1000
      |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||
seq2  ATGGACATTGATTTGTGATATAT--AAATTTTTGCTTGGT-AAATAT-AA  996

seq1  TGAGTCATAGATGGGGCCATAAGTTTGTGGACCATAACTGTCAAGTCACA  1050
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  TGAGTCATAGATGGGGCCATAAGTTTGT-GACCATAACTGTC-AGTCACA  1044

seq1  ATTGTAAAGTCACTTCTGAAAAAAATAAGGCTATTAAATGTTTGCCAGAC  1100
      | ||||||||||| |||||||||||  | |||||  |||| ||| |||||
seq2  A-TGTAAAGTCAC-TCTGAAAAAAAATAAGCTAT--AATG-TTGGCAGAC  1089

seq1  TCCTCACCGCCCCTCCCCCATTTCCAGCTAAGGAGAATCAGAGAAAGTCA  1150
      |||||||   ||||||||   |||||||| |||| |||||||| ||||||
seq2  TCCTCAC--GCCCTCCCC--ATTCCAGCT-AGGA-AATCAGAG-AAGTCA  1132

seq1  GATATGTTTCTTACAGGAAATACATGTCATGTTCCTGTTCTGCTCAAGGT  1200
      |||||| ||||   | | ||||||| |||  |||||||||| ||||||||
seq2  GATATGGTTCT---ACGGAATACATTTCAGTTTCCTGTTCTCCTCAAGGT  1179

seq1  AAC  1203
      |||
seq2  AAC  1182

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