BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087I01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 103,222,392 - 103,370,887
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042069, LOC436054, LOC100042078, LOC100042086, LOC100042092, LOC384895
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087I01.bB6Ng01-087I01.g
ACCDH900610DH900611
length9971,191
definitionDH900610|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087I01, 5' end.DH900611|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087I01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,222,392 - 103,223,346)(103,369,671 - 103,370,887)
sequence
gaattccttagtgcctacacaagtttacattcacatcaacagagaatgaa
gtttccatcccacatctcctccagcatttgctgtcacttctttggttgat
atttgccaatatgatgagcaatgatgaaaactcaaaggttcctttgagtt
acaattccatagtaggtagatacagtgaacatatgttgtgatatttctca
gataatttgttcttcttttgagaactctctgttcaggtcccagatatagg
ttttccaatgggtcattttttttttttacttttttaaaaaagaaatcttt
atatattttggctattaatcttatcagatatacaggtgtcataaattttg
taccactctgtaggattcttcccaattacttgatcttttatttggtttca
ttaatttgatctcttatttgtctgtgaagaagcttatgagaagaaagaag
cctataatacatataattctgcatataaatactcatatttactttaaatg
agatttctcatttaggatggtaatgctccttccaaaatgcaatgagttcc
taacaagagctctaatactaaccatgagaagccctcttttgagttgttgg
ccaaggctatccaaaacgaaatatagagtattgctactgtcatttgttgt
tccctaagatggaaggtaagtccatattgctgaagataccacatatatca
aaagaggcttccagagatcccctgagctgaacctgacctgcctgtttcct
ccctgaggactaattttcagcacactagagggcacaaaataagcttccat
aggatggaagggacatagttatgacacctatgaaccatatcaacaaccaa
tctggatttataaccttaagaatgcagtagtagcatgtatatcacagcag
tggccaacaaccctctaattggactaagattcattcactagaggggaacc
atttctcatactgcatcctagactggtattcaatgcttgctaagtca
gaattcaatcttagctgaaatctggagggagaagctgatacaggcggatg
ctgcttactgtcttgctttgatcgcttccacagcctgctttccatagaac
ccaggactaccagcacagggacggcaccatccaccatgagctgggccctt
cccacttgatcactagttgagacaatgccttacagctgaatctcagggag
gcattcctcaattgagtgtccttcctctctgatgactttaacttgtgaca
agttggcataaaaaatgcagtttcaggaggttgtgagatacccaattccc
atgcttggaacttaaccctgatccttatagagacaagagcagcaggggct
cctcactgctaagcaatgtttccagctccagttttaaacttcttaatgtt
gagaatatctttacatcttgctcatttttcagctgcaactaatggagtgg
acaagggatatgcagagctgaatagtagagggaaatctggagcaaatact
agaacgccattgcccaatagacatacagtgaagcacaaaggtttgagtca
catttaacattaaaatatttaaaactgagataaaattgtttagcaaaaga
acattctaaaaaaataaattaagacaccagctttctccattaagtaaaca
tcaatttattttgctgttttacttcttttcaaattatgctatatcataag
ctgagttcaactgataatttttcttaaatcatattatcaaatatcaaatt
ttaagagtcttagatctgagttaaatttctcaaaacaaaattatgacata
ctattcaacatctcacatatattttaggaaaattgctaggcactgcgtag
acactctaaacaaggtattttaacagtttgtcttcaaatcacatctcttg
caaataatcaatgtttatctttctccttcatgttcagtcttcatgttgca
tttttgaaagggttaggatttctatgaaactacaaagtattaataaggga
aaacagctggctgactcagtaaagaaagcttctgggactcatcaatgaga
agtggctgtgctaagtgctcaatgatgaggctgcattctattctcccaca
agtacagaagataaatgccagtccgcgactgaattccatgccatctctcc
ccttcctatataatagcccacacacaatggcatatgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_103222392_103223346
seq2: B6Ng01-087I01.b_46_999

seq1  GAATTCCTTAGTGCCTACACAAGTTTACATTCACATCAACAGAGAATGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGTGCCTACACAAGTTTACATTCACATCAACAGAGAATGAA  50

seq1  GTTTCCATCCCACATCTCCTCCAGCATTTGCTGTCACTTCTTTGGTTGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCATCCCACATCTCCTCCAGCATTTGCTGTCACTTCTTTGGTTGAT  100

seq1  ATTTGCCAATATGATGAGCAATGATGAAAACTCAAAGGTTCCTTTGAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCCAATATGATGAGCAATGATGAAAACTCAAAGGTTCCTTTGAGTT  150

seq1  ACAATTCCATAGTAGGTAGATACAGTGAACATATGTTGTGATATTTCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTCCATAGTAGGTAGATACAGTGAACATATGTTGTGATATTTCTCA  200

seq1  GATAATTTGTTCTTCTTTTGAGAACTCTCTGTTCAGGTCCCAGATATAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATTTGTTCTTCTTTTGAGAACTCTCTGTTCAGGTCCCAGATATAGG  250

seq1  TTTTCCAATGGGTCATTTTTTTTTTTTACTTTTTTAAAAAAGAAATCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAATGGGTCATTTTTTTTTTTTACTTTTTTAAAAAAGAAATCTTT  300

seq1  ATATATTTTGGCTATTAATCTTATCAGATATACAGGTGTCATAAATTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTTTGGCTATTAATCTTATCAGATATACAGGTGTCATAAATTTTG  350

seq1  TACCACTCTGTAGGATTCTTCCCAATTACTTGATCTTTTATTTGGTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACTCTGTAGGATTCTTCCCAATTACTTGATCTTTTATTTGGTTTCA  400

seq1  TTAATTTGATCTCTTATTTGTCTGTGAAGAAGCTTATGAGAAGAAAGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTGATCTCTTATTTGTCTGTGAAGAAGCTTATGAGAAGAAAGAAG  450

seq1  CCTATAATACATATAATTCTGCATATAAATACTCATATTTACTTTAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATAATACATATAATTCTGCATATAAATACTCATATTTACTTTAAATG  500

seq1  AGATTTCTCATTTAGGATGGTAATGCTCCTTCCAAAATGCAATGAGTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTCTCATTTAGGATGGTAATGCTCCTTCCAAAATGCAATGAGTTCC  550

seq1  TAACAAGAGCTCTAATACTAACCATGAGAAGCCCTCTTTTGAGTTGTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAGAGCTCTAATACTAACCATGAGAAGCCCTCTTTTGAGTTGTTGG  600

seq1  CCAAGGCTATCCAAAACGAAATATAGAGTATTGCTACTGTCATTTGTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGCTATCCAAAACGAAATATAGAGTATTGCTACTGTCATTTGTTGT  650

seq1  TCCCTAAGATGGAAGGTAAGTCCATATTGCTGAAGATACCACATATATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAAGATGGAAGGTAAGTCCATATTGCTGAAGATACCACATATATCA  700

seq1  AAAGAGGCTTCCAGAGATCCCCTGAGCTGAACCTGACCTGCCTGTTTCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGGCTTCCAGAGATCCCCTGAGCTGAACCTGACCTGCCTGTTTCCT  750

seq1  CCCTGAGGACTAATTTTCAGCACACTAGAGGGCACAAAATAAGCTTCCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGGACTAATTTTCAGCACACTAGAGGGCACAAAATAAGCTTCCAT  800

seq1  AGGATGGAAGGGACATAGTTATGACACCTATGAACCATATCAACAACCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGGAAGGGACATAGTTATGACACCTATGAACCATATCAACAACCAA  850

seq1  TCTGGATTTATAACCTTAAGAATGCAGTAGTAGCATGTATATCACAGCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGATTTATAACCTTAAGAATGCAGTAGTAGCATGTATATCACAGCAG  900

seq1  TGGCCAACAACCCTCTAATTGGACTAAGATTCATTCAACTAGAGGGGAAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGCCAACAACCCTCTAATTGGACTAAGATTCATTC-ACTAGAGGGGAAC  949

seq1  CATTT  955
      |||||
seq2  CATTT  954

seq1: chr8_103369671_103370887
seq2: B6Ng01-087I01.g_67_1257 (reverse)

seq1  ACACACATATGCATATGTGTGT-GCATATATATATAGAGAGAGGGGGAGA  49
      ||||||||||||   ||||||| |  ||| |||||||   || |||||| 
seq2  ACACACATATGCCATTGTGTGTGGGCTAT-TATATAG---GAAGGGGAG-  45

seq1  AGATATGCATGTGAAATCAGTCGCGGACTTGCATTTATTCCTTTTCTTGT  99
      ||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||    |||
seq2  AGAT-GGCATG-GAATTCAGTCGCGGACTGGCATTTAT--CTT---CTGT  88

seq1  ACTTGGTGGGAGGAATAGAATGCAAGCCCCTTCAACCATTGAGCCACTTA  149
      |||| |||||| ||||||||||| |||| |    | ||||||| ||||||
seq2  ACTT-GTGGGA-GAATAGAATGC-AGCCTC----ATCATTGAG-CACTTA  130

seq1  GCACAGCAACTTCTCATTTGATGAGTCCCAG-AGCTTTCCTTTAACTGGG  198
      ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||| |
seq2  GCACAGCCACTTCTCA-TTGATGAGTCCCAGAAGCTTTC--TTTACTGAG  177

seq1  TCAAGGCCAGCCTGTTTTCCCTTATTAATACTTTGTAGTTTCATAGAAAT  248
      |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCA--GCCAG-CTGTTTTCCCTTATTAATACTTTGTAGTTTCATAGAAAT  224

seq1  CCTAACCCTTTCAAAAATGCAACATGAAGAACTGAACATGAAGGAGAAAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACCCTTTCAAAAATGCAACATGAAG-ACTGAACATGAAGGAGAAAG  273

seq1  ATAAAACATTGATTATTTGCAAGAGATGTGATTTGAAGACAAACTGTTAA  348
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AT-AAACATTGATTATTTGCAAGAGATGTGATTTGAAGACAAACTGTTAA  322

seq1  AATACCTTGTTTAGAGTGTCTACGCAGTGCCTAGCAATTTTCCTAAAATA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCTTGTTTAGAGTGTCTACGCAGTGCCTAGCAATTTTCCTAAAATA  372

seq1  TATGTGAGATGTTGAATAGTATGTCATAATTTTGTTTTGAGAAATTTAAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGAGATGTTGAATAGTATGTCATAATTTTGTTTTGAGAAATTTAAC  422

seq1  TCAGATCTAAGACTCTTAAAATTTGATATTTGATAATATGATTTAAGAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCTAAGACTCTTAAAATTTGATATTTGATAATATGATTTAAGAAA  472

seq1  AATTATCAGTTGAACTCAGCTTATGATATAGCATAATTTGAAAAGAAGTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATCAGTTGAACTCAGCTTATGATATAGCATAATTTGAAAAGAAGTA  522

seq1  AAACAGCAAAATAAATTGATGTTTACTTAATGGAGAAAGCTGGTGTCTTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGCAAAATAAATTGATGTTTACTTAATGGAGAAAGCTGGTGTCTTA  572

seq1  ATTTATTTTTTTAGAATGTTCTTTTGCTAAACAATTTTATCTCAGTTTTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATTTTTTTAGAATGTTCTTTTGCTAAACAATTTTATCTCAGTTTTA  622

seq1  AATATTTTAATGTTAAATGTGACTCAAACCTTTGTGCTTCACTGTATGTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTTAATGTTAAATGTGACTCAAACCTTTGTGCTTCACTGTATGTC  672

seq1  TATTGGGCAATGGCGTTCTAGTATTTGCTCCAGATTTCCCTCTACTATTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGGCAATGGCGTTCTAGTATTTGCTCCAGATTTCCCTCTACTATTC  722

seq1  AGCTCTGCATATCCCTTGTCCACTCCATTAGTTGCAGCTGAAAAATGAGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGCATATCCCTTGTCCACTCCATTAGTTGCAGCTGAAAAATGAGC  772

seq1  AAGATGTAAAGATATTCTCAACATTAAGAAGTTTAAAACTGGAGCTGGAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTAAAGATATTCTCAACATTAAGAAGTTTAAAACTGGAGCTGGAA  822

seq1  ACATTGCTTAGCAGTGAGGAGCCCCTGCTGCTCTTGTCTCTATAAGGATC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGCTTAGCAGTGAGGAGCCCCTGCTGCTCTTGTCTCTATAAGGATC  872

seq1  AGGGTTAAGTTCCAAGCATGGGAATTGGGTATCTCACAACCTCCTGAAAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTAAGTTCCAAGCATGGGAATTGGGTATCTCACAACCTCCTGAAAC  922

seq1  TGCATTTTTTATGCCAACTTGTCACAAGTTAAAGTCATCAGAGAGGAAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTTTTATGCCAACTTGTCACAAGTTAAAGTCATCAGAGAGGAAGG  972

seq1  ACACTCAATTGAGGAATGCCTCCCTGAGATTCAGCTGTAAGGCATTGTCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTCAATTGAGGAATGCCTCCCTGAGATTCAGCTGTAAGGCATTGTCT  1022

seq1  CAACTAGTGATCAAGTGGGAAGGGCCCAGCTCATGGTGGATGGTGCCGTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAGTGATCAAGTGGGAAGGGCCCAGCTCATGGTGGATGGTGCCGTC  1072

seq1  CCTGTGCTGGTAGTCCTGGGTTCTATGGAAAGCAGGCTGTGGAAGCGATC  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGCTGGTAGTCCTGGGTTCTATGGAAAGCAGGCTGTGGAAGCGATC  1122

seq1  AAAGCAAGACAGTAAGCAGCATCCGCCTGTATCAGCTTCTCCCTCCAGAT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAGACAGTAAGCAGCATCCGCCTGTATCAGCTTCTCCCTCCAGAT  1172

seq1  TTCAGCTAAGATTGAATTC  1217
      |||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTAAGATTGAATTC  1191