BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095O10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 36,963,256 - 37,146,152
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC671641
Upstream geneTnks, LOC666792, LOC666797, LOC666804, Ppp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23
Downstream geneD8Ertd82e, Lonrf1, EG544878, 6430573F11Rik, Dlc1, LOC100042892, A730069N07Rik, AI429214
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095O10.bB6Ng01-095O10.g
ACCDH906713DH906714
length606669
definitionDH906713|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095O10, 5' end.DH906714|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095O10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,963,256 - 36,963,861)(37,145,484 - 37,146,152)
sequence
gaattcagcctgggaggctggatctggagcgtcaggatttgctatggcct
tgctttggggtctatctttatttgtgaccctcttgttttttccgttagga
gtgggttgtttgccgtgtcccactgcattttggaagtatgcgactagtgc
tttggctgtatgatgtctcacaggtaaacatgcctcgagggtcaagactc
ttgagattgttgaggttggactgagtgtgttttgaatgatgagacggcca
gagcctctggaggccggggccagaatgttatggctcaaatataaaatatc
aggggatgggtttgatactggtgctcagctggtgctaatgctttgggaca
ttgtgggacctggtgagcagaagtgcgcttatgttcatagctaccccttt
tacaatggtcgaggagtagaagccgacggagggaaattctggcacatgct
acagcattgctaacccttaggaacactacacaaagcacaacagggcagac
acaactactgtgtaacttcactcactctgaagcacatataatgggacatt
ttcagggtgtcagaagtaggaggtggtttccaggagtgggggtgggggta
ggggaa
gaattcagtcctagctgactgaggacggatgggtagagaaacagaatctt
gacagggttgggacaagacagatagataagccaaccttgactgaagtgac
tatctcaacttgcacccagcggtgacctgaactatgaaccatctccatag
ggtcatttgcatattgtcctcccttcttcatattcaccagggtctaaacc
tgtttacttctcagctaaatagggtcattaatgcatcatgcactgctgcc
tggtctgcagctaactacaccgccactgcagtccctcccttcctgtgaaa
gttgcagaaaccacatcgttagcaccgtgctatcatctactcgaccaagc
attggatatcaagttcagaagccggctctctctgggccacctgtgttctt
ctgtgctgagactactcatctggcacattccctgaaccaagtcccctttt
ctgagtttcacatagtttactgtttctcaacaacctgaggctctgggttg
agttggactctcagctttgcagactggagcactgacttgggttttgtttt
tgtaacttatcaccttggtgttggcttaacagtaacctgtgatgataagg
attgcataggaatagatgaggtccttcagttagaacagttgccctggtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_36963256_36963861
seq2: B6Ng01-095O10.b_51_656

seq1  GAATTCAGCCTGGGAGGCTGGATCTGGAGCGTCAGGATTTGCTATGGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCCTGGGAGGCTGGATCTGGAGCGTCAGGATTTGCTATGGCCT  50

seq1  TGCTTTGGGGTCTATCTTTATTTGTGACCCTCTTGTTTTTTCCGTTAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGGGGTCTATCTTTATTTGTGACCCTCTTGTTTTTTCCGTTAGGA  100

seq1  GTGGGTTGTTTGCCGTGTCCCACTGCATTTTGGAAGTATGCGACTAGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTTGTTTGCCGTGTCCCACTGCATTTTGGAAGTATGCGACTAGTGC  150

seq1  TTTGGCTGTATGATGTCTCACAGGTAAACATGCCTCGAGGGTCAAGACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCTGTATGATGTCTCACAGGTAAACATGCCTCGAGGGTCAAGACTC  200

seq1  TTGAGATTGTTGAGGTTGGACTGAGTGTGTTTTGAATGATGAGACGGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATTGTTGAGGTTGGACTGAGTGTGTTTTGAATGATGAGACGGCCA  250

seq1  GAGCCTCTGGAGGCCGGGGCCAGAATGTTATGGCTCAAATATAAAATATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTCTGGAGGCCGGGGCCAGAATGTTATGGCTCAAATATAAAATATC  300

seq1  AGGGGATGGGTTTGATACTGGTGCTCAGCTGGTGCTAATGCTTTGGGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGATGGGTTTGATACTGGTGCTCAGCTGGTGCTAATGCTTTGGGACA  350

seq1  TTGTGGGACCTGGTGAGCAGAAGTGCGCTTATGTTCATAGCTACCCCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGGACCTGGTGAGCAGAAGTGCGCTTATGTTCATAGCTACCCCTTT  400

seq1  TACAATGGTCGAGGAGTAGAAGCCGACGGAGGGAAATTCTGGCACATGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGGTCGAGGAGTAGAAGCCGACGGAGGGAAATTCTGGCACATGCT  450

seq1  ACAGCATTGCTAACCCTTAGGAACACTACACAAAGCACAACAGGGCAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCATTGCTAACCCTTAGGAACACTACACAAAGCACAACAGGGCAGAC  500

seq1  ACAACTACTGTGTAACTTCACTCACTCTGAAGCACATATAATGGGACATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTACTGTGTAACTTCACTCACTCTGAAGCACATATAATGGGACATT  550

seq1  TTCAGGGTGTCAGAAGTAGGAGGTGGTTTCCAGGAGTGGGGGTGGGGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGGTGTCAGAAGTAGGAGGTGGTTTCCAGGAGTGGGGGTGGGGGTA  600

seq1  GGGGAA  606
      ||||||
seq2  GGGGAA  606

seq1: chr8_37145484_37146152
seq2: B6Ng01-095O10.g_73_741 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACCAGGGCAACTGTTCTAACTGAAGGACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACCAGGGCAACTGTTCTAACTGAAGGACC  50

seq1  TCATCTATTCCTATGCAATCCTTATCATCACAGGTTACTGTTAAGCCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTATTCCTATGCAATCCTTATCATCACAGGTTACTGTTAAGCCAAC  100

seq1  ACCAAGGTGATAAGTTACAAAAACAAAACCCAAGTCAGTGCTCCAGTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGTGATAAGTTACAAAAACAAAACCCAAGTCAGTGCTCCAGTCTG  150

seq1  CAAAGCTGAGAGTCCAACTCAACCCAGAGCCTCAGGTTGTTGAGAAACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTGAGAGTCCAACTCAACCCAGAGCCTCAGGTTGTTGAGAAACAG  200

seq1  TAAACTATGTGAAACTCAGAAAAGGGGACTTGGTTCAGGGAATGTGCCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTATGTGAAACTCAGAAAAGGGGACTTGGTTCAGGGAATGTGCCAG  250

seq1  ATGAGTAGTCTCAGCACAGAAGAACACAGGTGGCCCAGAGAGAGCCGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTAGTCTCAGCACAGAAGAACACAGGTGGCCCAGAGAGAGCCGGCT  300

seq1  TCTGAACTTGATATCCAATGCTTGGTCGAGTAGATGATAGCACGGTGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAACTTGATATCCAATGCTTGGTCGAGTAGATGATAGCACGGTGCTA  350

seq1  ACGATGTGGTTTCTGCAACTTTCACAGGAAGGGAGGGACTGCAGTGGCGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATGTGGTTTCTGCAACTTTCACAGGAAGGGAGGGACTGCAGTGGCGG  400

seq1  TGTAGTTAGCTGCAGACCAGGCAGCAGTGCATGATGCATTAATGACCCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTTAGCTGCAGACCAGGCAGCAGTGCATGATGCATTAATGACCCTA  450

seq1  TTTAGCTGAGAAGTAAACAGGTTTAGACCCTGGTGAATATGAAGAAGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTGAGAAGTAAACAGGTTTAGACCCTGGTGAATATGAAGAAGGGA  500

seq1  GGACAATATGCAAATGACCCTATGGAGATGGTTCATAGTTCAGGTCACCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATATGCAAATGACCCTATGGAGATGGTTCATAGTTCAGGTCACCG  550

seq1  CTGGGTGCAAGTTGAGATAGTCACTTCAGTCAAGGTTGGCTTATCTATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGCAAGTTGAGATAGTCACTTCAGTCAAGGTTGGCTTATCTATCT  600

seq1  GTCTTGTCCCAACCCTGTCAAGATTCTGTTTCTCTACCCATCCGTCCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGTCCCAACCCTGTCAAGATTCTGTTTCTCTACCCATCCGTCCTCA  650

seq1  GTCAGCTAGGACTGAATTC  669
      |||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCTAGGACTGAATTC  669