BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128E10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 63,413,287 - 63,585,776
singlet/doubletdoublet
Overlap geneClcn3, B230317F23Rik, Nek1
Upstream geneAadat, Mfap3l, LOC100040679, 2700029M09Rik
Downstream geneSh3rf1, EG664975, Cbr4, Palld, LOC100040872, BC013672, Anxa10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128E10.bB6Ng01-128E10.g
ACCDH930171DH930172
length989823
definitionDH930171|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128E10, 5' end.DH930172|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,584,792 - 63,585,776)(63,413,287 - 63,414,104)
sequence
gaattcttgctcttagtttttggtggagaatcagagtgagatcgaattgg
aattggttcttctggtgagcaatgaactgcctgaactaagttcaagtcct
tagaatgaaccactttctggaaaatcgattctggctgtactgacttctct
acatcacagccagactgcggagaatcgtctactgcaggatctgtggaata
cagaagagtttatacactaagtctacaaaagagcatttaaattctaaata
tcaacaagttttatatactatttaacatgaactccatccaaagggctgga
gagagagatggcttagtggttacaagcacttgttgttcttacagggacct
gggtttggctctcaggacccatataacagctcaaaaacatctttatttga
gctcaatgagatctgacatgctcttctggccttcatgggtagcaagacta
catgtgcaatacacaattgtgtatacaaacgcaaacttctcaggcacata
aaatattttttaattaaaaagtgaattccatcccaaaacaacctcatacc
aggaaaacggaatcaaagtatacatggaagtatactgaatattaccatat
aaataatctctaaggaaatatagtattttaatttcaggatttaatagatg
ctttcattaagttgcaagttttatttatttattttatttatttatttatt
tgcttgtagtttttttttcttttccattttttattaggtatttagctcat
ttacatttccaatgctataccaaaagtcccccatacccacccacccccac
tcccctacccacccactccccctttttagccctggcgttcccctgtattg
gggcatataaagtttgcgtgtccaatgggcctctctttcagtgatggccg
actaggcatctttttgatacatatgcagctagagacaagagctccggggt
actggttagttcataatgatgttcacctatagggttgca
gaattccagagccacaggcatatggagcaaatactttcaccaaagaaact
gcaagaaaggcaaaactcaaagcccaaaagatgtacatgatgtagttcat
gatataagatccagggccctaaaaagcaaaacagctcatagtgtgaacat
gctctacagcgcagcacgaattcaagcagctggcacataaggaacggatg
gagaacttaccagtactgctctttgtacctgcagggttccattcagatat
gctgtccagactgagttcacacttctaagctcaaaacatcctcttacttc
agcttccttcccaagtagctgggactacataagcacgtgccaccacatgc
acacatctgggtaaaagctctaaaagcctcttggtttatttctactataa
taaaagctctatgtgaacaaggtatttaagtaggatccaaaagctaacca
ctgtacatactaagtaagaagccttatttccgcttggtaaatttcccagt
tttcttgatgcctaaagtcttgttatatagacacattaattacacactga
catatgcttacccacaaatgtttcacaaactgttagtggaggtaaaagtc
tgtttagcacttagattttcctttttttgttgtcttttgttttgtttggg
gttttttttgtaattttgttttgttttaatgtgtatatgtgtttgggctg
tgtagttcactgaaccacatgcagaagccaacaacatgcatttcaggagt
tccgaaaaggtgcaatgtgattccctggaaactcaactacgctaagagct
tcatggtagtgctgaaactgaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_63584792_63585776
seq2: B6Ng01-128E10.b_54_1037 (reverse)

seq1  TGCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGC  50
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACCCTATAGGT-GAACATCATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGC  49

seq1  TCTTGTCTCTAGCTGCATATGTATC-AAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCA  99
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCTTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAAAAAGAT-GCCTAGTCGGCCATCA  98

seq1  CTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAG  149
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CT-GAAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAAACTTTATATGCCCCAATACAG  147

seq1  GGGAACGCCAGGGCTAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGTGGGGGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACGCCAGGGCTAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGTAGGGGAGTGGGGGT  197

seq1  GGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTA  247

seq1  AATACCTAATAAAAAATGGAAAAGAAAAAAAAACTACAAGCAAATAAATA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCTAATAAAAAATGGAAAAGAAAAAAAAACTACAAGCAAATAAATA  297

seq1  AATAAAT-AAATAAATAAATAAAACTTGCAACTTAATGAAAGCATCTATT  348
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAAATAAATAAATAAAACTTGCAACTTAATGAAAGCATCTATT  347

seq1  AAATCCTGAAATTAAAATACTATATTTCCTTAGAGATTATTTATATGGTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCTGAAATTAAAATACTATATTTCCTTAGAGATTATTTATATGGTA  397

seq1  ATATTCAGTATACTTCCATGTATACTTTGATTCCGTTTTCCTGGTATGAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCAGTATACTTCCATGTATACTTTGATTCCGTTTTCCTGGTATGAG  447

seq1  GTTGTTTTGGGATGGAATTCACTTTTTAATTAAAAAATATTTTATGTGCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTTTGGGATGGAATTCACTTTTTAATTAAAAAATATTTTATGTGCC  497

seq1  TGAGAAGTTTGCGTTTGTATACACAATTGTGTATTGCACATGTAGTCTTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGTTTGCGTTTGTATACACAATTGTGTATTGCACATGTAGTCTTG  547

seq1  CTACCCATGAAGGCCAGAAGAGCATGTCAGATCTCATTGAGCTCAAATAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCATGAAGGCCAGAAGAGCATGTCAGATCTCATTGAGCTCAAATAA  597

seq1  AGATGTTTTTGAGCTGTTATATGGGTCCTGAGAGCCAAACCCAGGTCCCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTTTTTGAGCTGTTATATGGGTCCTGAGAGCCAAACCCAGGTCCCT  647

seq1  GTAAGAACAACAAGTGCTTGTAACCACTAAGCCATCTCTCTCTCCAGCCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAACAACAAGTGCTTGTAACCACTAAGCCATCTCTCTCTCCAGCCC  697

seq1  TTTGGATGGAGTTCATGTTAAATAGTATATAAAACTTGTTGATATTTAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGATGGAGTTCATGTTAAATAGTATATAAAACTTGTTGATATTTAGA  747

seq1  ATTTAAATGCTCTTTTGTAGACTTAGTGTATAAACTCTTCTGTATTCCAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAATGCTCTTTTGTAGACTTAGTGTATAAACTCTTCTGTATTCCAC  797

seq1  AGATCCTGCAGTAGACGATTCTCCGCAGTCTGGCTGTGATGTAGAGAAGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCTGCAGTAGACGATTCTCCGCAGTCTGGCTGTGATGTAGAGAAGT  847

seq1  CAGTACAGCCAGAATCGATTTTCCAGAAAGTGGTTCATTCTAAGGACTTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACAGCCAGAATCGATTTTCCAGAAAGTGGTTCATTCTAAGGACTTG  897

seq1  AACTTAGTTCAGGCAGTTCATTGCTCACCAGAAGAACCAATTCCAATTCG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAGTTCAGGCAGTTCATTGCTCACCAGAAGAACCAATTCCAATTCG  947

seq1  ATCTCACTCTGATTCTCCACCAAAAACTAAGAGCAAG  985
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCACTCTGATTCTCCACCAAAAACTAAGAGCAAG  984

seq1: chr8_63413287_63414104
seq2: B6Ng01-128E10.g_69_891

seq1  GAATTCCAGAGCCACAGGCATATGGAGCAAATACTTTCACCAAAGAAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGCCACAGGCATATGGAGCAAATACTTTCACCAAAGAAACT  50

seq1  GCAAGAAAGGCAAAACTCAAAGCCCAAAAGATGTACATGATGTAGTTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAAAGGCAAAACTCAAAGCCCAAAAGATGTACATGATGTAGTTCAT  100

seq1  GATATAAGATCCAGGGCCCTAAAAAGCAAAACAGCTCATAGTGTGAACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAAGATCCAGGGCCCTAAAAAGCAAAACAGCTCATAGTGTGAACAT  150

seq1  GCTCTACAGCGCAGCACGAATTCAAGCAGCTGGCACATAAGGAACGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTACAGCGCAGCACGAATTCAAGCAGCTGGCACATAAGGAACGGATG  200

seq1  GAGAACTTACCAGTACTGCTCTTTGTACCTGCAGGGTTCCATTCAGATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTTACCAGTACTGCTCTTTGTACCTGCAGGGTTCCATTCAGATAT  250

seq1  GCTGTCCAGACTGAGTTCACACTTCTAAGCTCAAAACATCCTCTTACTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCCAGACTGAGTTCACACTTCTAAGCTCAAAACATCCTCTTACTTC  300

seq1  AGCTTCCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACATAAGCACGTGCCACCACATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTTCCCAAGTAGCTGGGACTACATAAGCACGTGCCACCACATGC  350

seq1  ACACATCTGGGTAAAAGCTCTAAAAGCCTCTTGGTTTATTTCTACTATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATCTGGGTAAAAGCTCTAAAAGCCTCTTGGTTTATTTCTACTATAA  400

seq1  TAAAAGCTCTATGTGAACAAGGTATTTAAGTAGGATCCAAAAGCTAACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGCTCTATGTGAACAAGGTATTTAAGTAGGATCCAAAAGCTAACCA  450

seq1  CTGTACATACTAAGTAAGAAGCCTTATTTCCGCTTGGTAAATTTCCCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACATACTAAGTAAGAAGCCTTATTTCCGCTTGGTAAATTTCCCAGT  500

seq1  TTTCTTGATGCCTAAAGTCTTGTTATATAGACACATTAATTACACACTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGATGCCTAAAGTCTTGTTATATAGACACATTAATTACACACTGA  550

seq1  CATATGCTTACCCACAAATGTTTCACAAACTGTTAGTGGAGGTAAAAGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCTTACCCACAAATGTTTCACAAACTGTTAGTGGAGGTAAAAGTC  600

seq1  TG-TTAGCACTTAGATTTTCCTTTTTTTGTTGTCTTTTGTTTTGTTTGGG  649
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGCACTTAGATTTTCCTTTTTTTGTTGTCTTTTGTTTTGTTTGGG  650

seq1  G-TTTTTTTGTAA-TTTGTTT--GTTTAATGTGTATATGTGTTT-GGCTG  694
      | ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTTTTTTTTGTAATTTTGTTTTGTTTTAATGTGTATATGTGTTTGGGCTG  700

seq1  TGTAGTTCACTGAACCACATGCAGAAGCCAACAACATGCATTTCAGGAGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTTCACTGAACCACATGCAGAAGCCAACAACATGCATTTCAGGAGT  750

seq1  TCCGAAAAGG-GCAATGTGATTCCCTGGAAACTCAACTACAGCTAAGAGC  793
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCCGAAAAGGTGCAATGTGATTCCCTGGAAACTCAACTAC-GCTAAGAGC  799

seq1  TTCCATGTAGTGCTGAAAACTGAAC  818
      |||   ||||||||| |||||||||
seq2  TTCATGGTAGTGCTG-AAACTGAAC  823