BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-135N07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 60,113,005 - 60,284,098
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalnt7, LOC100040711
Upstream geneEG624433, LOC654355, LOC100040515, Hand2, Scrg1, Sap30, Hmgb2, LOC547012, LOC100040634
Downstream gene4930431L04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-135N07.bB6Ng01-135N07.g
ACCDH935771DH935772
length1,047413
definitionDH935771|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135N07, 5' end.DH935772|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135N07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,283,054 - 60,284,098)(60,113,005 - 60,113,423)
sequence
gaattctctccacgctgggatagtaatgctgatagacgcagaacaactaa
tcccatgttaaacaccagctgaacgagaaaaggctctcaattcagagggc
agggccccaggccactccctctagtgcattaccaataactaactttgctg
catccagctgtaattttgtcttttgaactctgtcatggatttttttttgt
tttattttattttttattggttattttatttctttacatttcaaatgtga
tccatcttcttggtttcccctttgcaaatcctctatcccgtccctcctcc
ccctgcttctatgagggtgctcccccacctacccacccactcctgcctta
gcatcctagcattcccctacagtggggcatcaagcctccatagtaccaaa
ggcttcccctcccattgatgtcagataaggcaatcctctgtacatatgca
gctggagccatgggtccctccatgtgtactctttggttggtggtttagtc
cctgggagttctgagagggtctggttggttggtattgttgttcttcctat
ggggttgcaaaccccttcagctcctttagtcctccccctaacttgtggtc
tcgtgctcagtccaatgattgactgcaagcatccacctctgtattggtca
ggcactggcaaagcctctcaggagacagccatatcagggttctctcagca
agcacttcttggcatctgcaatagtgtctgggtttagtgcctgcatatgg
aatggatccccaggtggagcggtctccatggttttattttattttatttc
acacacagactatgttatattttcatgtccccatttttctcaacaaacta
cgtataaattcaaggcatcttgctagtcattgtcatcaaaagacagacca
aggaagacccttatggattccaggattgtcaggaatagtgacacagcccg
tgcttgatgtggttcttgatacagattcgagtgtggcagccaacttatgg
tgttggatagcaagcatggagcacagggaccgagctcagctggacgt
aggcacatcatttctcctacttaaacacaaatccctgcatcgataagatg
ttagaataaaacactgagaatctaaacatgtctagcagatggtattgtta
agaaattaaagatacgccagtagtacttgatactgctgggtcttcaagct
agagtctggctccatccttgaatggaagtgatgacaccaacctgtggtag
agcaatggacagaaagcgtgctgagtattggttttaaaatggaaagagcc
agtgagagagcctggttgtaaagagttgtttaacaggcacaagacctgtt
caatccctaatatcatagctagataaagacatagatagatagatagatag
atagatagatagatagatagatagatagatagatagatgatagatagata
gatagatagatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_60283054_60284098
seq2: B6Ng01-135N07.b_46_1092 (reverse)

seq1  ACGTCCAGCCTGAGCTCGGTCCCTGTGGCTCCATGCTTGCTATCC-ACA-  48
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| 
seq2  ACGTCCAG-CTGAGCTCGGTCCCTGT-GCTCCATGCTTGCTATCCAACAC  48

seq1  CATAAGTTGGCTGCCACACTTCGAATCTGTATCAAGAA-CACATCAAGCA  97
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CATAAGTTGGCTGCCACAC-TCGAATCTGTATCAAGAACCACATCAAGCA  97

seq1  CGGGCTGTGTCACTATTCCTGACAATCCTGGAATCCATAAGGGTCTTCCT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGCTGTGTCACTATTCCTGACAATCCTGGAATCCATAAGGGTCTTCCT  147

seq1  TGGTCTGTCTTTTTGATGAC-ATGACTAGCAAGATGCCTTGAATTTATAC  196
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTGTC-TTTTGATGACAATGACTAGCAAGATGCCTTGAATTTATAC  196

seq1  GTAGTTTGTTGAGAAAAATGGGGACATG-AAATATAACATAGTCTGTGTG  245
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTTGTTGAGAAAAATGGGGACATGAAAATATAACATAGTCTGTGTG  246

seq1  TGAAATAAAATAAAAT-AAACCATGGAGACCGCTCCACCTGGGGATCCAT  294
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATAAAATAAAATAAAACCATGGAGACCGCTCCACCTGGGGATCCAT  296

seq1  TCCATATGCAGGCACTAAACCCAGACACTATTGCAGATGCCAAGAAGTGC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATATGCAGGCACTAAACCCAGACACTATTGCAGATGCCAAGAAGTGC  346

seq1  TTGCTGAGAGAACCCTGATATGGCTGTCTCCTGAGAGGCTTTGCCAGTGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGAGAGAACCCTGATATGGCTGTCTCCTGAGAGGCTTTGCCAGTGC  396

seq1  CTGACCAATACAGAGGTGGATGCTTGCAGTCAATCATTGGACTGAGCACG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCAATACAGAGGTGGATGCTTGCAGTCAATCATTGGACTGAGCACG  446

seq1  AGACCACAAGTTAGGGGGAGGACTAAAGGAGCTGAAGGGGTTTGCAACCC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCACAAGTTAGGGGGAGGACTAAAGGAGCTGAAGGGGTTTGCAACCC  496

seq1  CATAGGAAGAACAACAATACCAACCAACCAGACCCTCTCAGAACTCCCAG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAAGAACAACAATACCAACCAACCAGACCCTCTCAGAACTCCCAG  546

seq1  GGACTAAACCACCAACCAAAGAGTACACATGGAGGGACCCATGGCTCCAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAAACCACCAACCAAAGAGTACACATGGAGGGACCCATGGCTCCAG  596

seq1  CTGCATATGTACAGAGGATTGCCTTATCTGACATCAATGGGAGGGGAAGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATATGTACAGAGGATTGCCTTATCTGACATCAATGGGAGGGGAAGC  646

seq1  CTTTGGTACTATGGAGGCTTGATGCCCCACTGTAGGGGAATGCTAGGATG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTACTATGGAGGCTTGATGCCCCACTGTAGGGGAATGCTAGGATG  696

seq1  CTAAGGCAGGAGTGGGTGGGTAGGTGGGGGAGCACCCTCATAGAAGCAGG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGCAGGAGTGGGTGGGTAGGTGGGGGAGCACCCTCATAGAAGCAGG  746

seq1  GGGAGGAGGGACGGGATAGAGGATTTGCAAAGGGGAAACCAAGAAGATGG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGAGGGACGGGATAGAGGATTTGCAAAGGGGAAACCAAGAAGATGG  796

seq1  ATCACATTTGAAATGTAAAGAAATAAAATAACCAATAAAAAATAAAATAA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATTTGAAATGTAAAGAAATAAAATAACCAATAAAAAATAAAATAA  846

seq1  AACAAAAAAAAATCCATGACAGAGTTCAAAAGACAAAATTACAGCTGGAT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAAAAATCCATGACAGAGTTCAAAAGACAAAATTACAGCTGGAT  896

seq1  GCAGCAAAGTTAGTTATTGGTAATGCACTAGAGGGAGTGGCCTGGGGCCC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAAAGTTAGTTATTGGTAATGCACTAGAGGGAGTGGCCTGGGGCCC  946

seq1  TGCCCTCTGAATTGAGAGCCTTTTCTCGTTCAGCTGGTGTTTAACATGGG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTGAATTGAGAGCCTTTTCTCGTTCAGCTGGTGTTTAACATGGG  996

seq1  ATTAGTTGTTCTGCGTCTATCAGCATTACTATCCCAGCGTGGAGAGAATT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTGTTCTGCGTCTATCAGCATTACTATCCCAGCGTGGAGAGAATT  1046

seq1  C  1045
      |
seq2  C  1047

seq1: chr8_60113005_60113423
seq2: B6Ng01-135N07.g_69_487

seq1  GAATTCAGGCACATCATTTCTCCTACTTAAACACAAATCCCTGCATCGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGCACATCATTTCTCCTACTTAAACACAAATCCCTGCATCGAT  50

seq1  AAGATGTTAGAATAAAACACTGAGAATCTAAACATGTCTAGCAGATGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTTAGAATAAAACACTGAGAATCTAAACATGTCTAGCAGATGGTA  100

seq1  TTGTTAAGAAATTAAAGATACGCCAGTAGTACTTGATACTGCTGGGTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAAGAAATTAAAGATACGCCAGTAGTACTTGATACTGCTGGGTCTT  150

seq1  CAAGCTAGAGTCTGGCTCCATCCTTGAATGGAAGTGATGACACCAACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTAGAGTCTGGCTCCATCCTTGAATGGAAGTGATGACACCAACCTG  200

seq1  TGGTAGAGCAATGGACAGAAAGCGTGCTGAGTATTGGTTTTAAAATGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGAGCAATGGACAGAAAGCGTGCTGAGTATTGGTTTTAAAATGGAA  250

seq1  AGAGCCAGTGAGAGAGCCTGGTTGTAAAGAGTTGTTTAACAGGCACAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGTGAGAGAGCCTGGTTGTAAAGAGTTGTTTAACAGGCACAAGA  300

seq1  CCTGTTCAATCCCTAATATCATAGCTAGATAAAGACATAGATAGATAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTCAATCCCTAATATCATAGCTAGATAAAGACATAGATAGATAGAT  350

seq1  AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGA  400

seq1  TAGATAGATAGATAGATAG  419
      |||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATAGATAG  419