BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145O18
Chromosome8 (Build37)
Map Location 130,002,254 - 130,138,222
singlet/doubletdoublet
Overlap genePard3, EG628847
Upstream geneIrf2bp2, Tomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1
Downstream geneNrp1, LOC668494
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145O18.bB6Ng01-145O18.g
ACCDH943198DH943199
length1,088229
definitionDH943198|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145O18, 5' end.DH943199|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145O18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,002,254 - 130,003,368)(130,137,994 - 130,138,222)
sequence
gaattcattgctcaaaacaatttgatagatctcatagccagaggtgtaga
tgcaacataggaaatatattaaaagtgtcacaattgggaacactttccca
gctctttgtattgtatgtacggttatgtctcaaaatgcactcatgccgct
tttttaagtgcgtccatgggtgaattcgtgcctatgtgcatgccttagtc
actttccctttattactgttcagttttgtgcatgttcattctgccagtgt
ttccctgcatgcctgactgtatctgcacatgtgctggttcccaggtacat
actaaagtcatggtagactgccttttagtctttttatgtccttggtaaca
tttttactttttacattagatgcatgctaagtaggtagaccctaatctct
cttctataggaataattagacttagatttaccataatgttaagatgcatc
ccacttagtctagcgattttgaaggtttaggcatggccagtggttcatta
atcctgtatttccctgactaagatgggaatttcttttgttggctggtgtg
ttttggttggccaagacccctgtgcctgatgaagcatatatgacatattt
ccatccttctctgtgctctggaagacattaccagttgcctacctacccag
tacccactctcttttttccattatggagtaaatcctcgttttactcagat
cggtaagtgacggactcaacatttcggtttcttagattaagtgtgactca
tgtgacagttataactactaaacatcgtaagcatccgggcaggtgggact
tcctgtagagctagtttttttttttttcccctgatttgggagtcgggagg
atggagaatcctgtgatggaggctctctctagcacatctgaattataagg
ttcttgggtttgctcttagtggttcccccacccccacccccaccagatct
agctaggtgctctagtgggctttacttgtaaggctgaaggaaaaagtcac
gtgaggtgtttcagtcatacttgccagctggctctgttgagtgaaagtca
gtctgtgttaagttgctttgagatctattcagcacctg
ttcagtctcttgtgggggccgtgggctttgttcctgcaatatcctcctca
ttcagttgctcctgcccaagagctaagggtagagcttgctataaaacata
aatcagaaaagaaaaatggatcatttgtagctgaatgtagtttgtgcatg
tggtgcgtgtatgtgtgagtatacacatggttggtatgtgctgtgtatgt
gtgtgtaatatgtgtgtggtattatgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_130002254_130003368
seq2: B6Ng01-145O18.b_46_1133

seq1  GAATTCATTGCTCAAAACAATTTGATAGATCTCATAGCCAGAGGTGTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGCTCAAAACAATTTGATAGATCTCATAGCCAGAGGTGTAGA  50

seq1  TGCAACATAGGAAATATATTAAAAGTGTCACAATTGGGAACACTTTCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACATAGGAAATATATTAAAAGTGTCACAATTGGGAACACTTTCCCA  100

seq1  GCTCTTTGTATTGTATGTACGGTTATGTCTCAAAATGCACTCATGCCGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTTGTATTGTATGTACGGTTATGTCTCAAAATGCACTCATGCCGCT  150

seq1  TTTTTAAGTGCGTCCATGGGTGAATTCGTGCCTATGTGCATGCCTTAGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAGTGCGTCCATGGGTGAATTCGTGCCTATGTGCATGCCTTAGTC  200

seq1  ACTTTCCCTTTATTACTGTTCAGTTTTGTGCATGTTCATTCTGCCAGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCCCTTTATTACTGTTCAGTTTTGTGCATGTTCATTCTGCCAGTGT  250

seq1  TTCCCTGCATGCCTGACTGTATCTGCACATGTGCTGGTTCCCAGGTACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGCATGCCTGACTGTATCTGCACATGTGCTGGTTCCCAGGTACAT  300

seq1  ACTAAAGTCATGGTAGACTGCCTTTTAGTCTTTTTATGTCCTTGGTAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGTCATGGTAGACTGCCTTTTAGTCTTTTTATGTCCTTGGTAACA  350

seq1  TTTTTACTTTTTACATTAGATGCATGCTAAGTAGGTAGACCCTAATCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTACTTTTTACATTAGATGCATGCTAAGTAGGTAGACCCTAATCTCT  400

seq1  CTTCTATAGGAATAATTAGACTTAGATTTACCATAATGTTAAGATGCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTATAGGAATAATTAGACTTAGATTTACCATAATGTTAAGATGCATC  450

seq1  CCACTTAGTCTAGCGATTTTGAAGGTTTAGGCATGGCCAGTGGTTCATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTAGTCTAGCGATTTTGAAGGTTTAGGCATGGCCAGTGGTTCATTA  500

seq1  ATCCTGTATTTCCCTGACTAAGATGGGAATTTCTTTTGTTGGCTGGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTATTTCCCTGACTAAGATGGGAATTTCTTTTGTTGGCTGGTGTG  550

seq1  TTTTGGTTGGCCAAGACCCCTGTGCCTGATGAAGCATATATGACATATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGTTGGCCAAGACCCCTGTGCCTGATGAAGCATATATGACATATTT  600

seq1  CCATCCTTCTCTGTGCTCTGGAAGACATTACCAGTTGCCTACCTACCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTTCTCTGTGCTCTGGAAGACATTACCAGTTGCCTACCTACCCAG  650

seq1  TACCCACTCTCTTTTTTCCATTATGGAGTAAATCCTCGTTTTACTCAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCACTCTCTTTTTTCCATTATGGAGTAAATCCTCGTTTTACTCAGAT  700

seq1  CGGTAAGTGACGGACTCAACATTTCGGTTTCTTAGATTAAGTGTGACTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTAAGTGACGGACTCAACATTTCGGTTTCTTAGATTAAGTGTGACTCA  750

seq1  TGTGACAGTTATAACTACTAAACATCGTAAGCATCCGGGCAGGTGGGACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAGTTATAACTACTAAACATCGTAAGCATCCGGGCAGGTGGGACT  800

seq1  TCCTGTAGAGCTAGTTTTTTTTTTTTTCCCCTGATTTGGGAGTCGGGAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTAGAGCTAGTTTTTTTTTTTTTCCCCTGATTTGGGAGTCGGGAGG  850

seq1  ATGGAGAATCCTGTGATGGAGGCTCTCTCTAGCACATCTGAATTATAAGG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATGGAGAATCCTGTGATGGAGGCTCTCTCTAGCACATCTGAATTATAA-G  899

seq1  GTTCTTGGGTTTGCTCTTTAGTGGTTCCCCCACCCCCACCCCCACCAGAT  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGGGTTTGCTC-TTAGTGGTTCCCCCACCCCCACCCCCACCAGAT  948

seq1  CTTAGCTAGGTGCTCTAGGTTGGGCTTTACTTGTAAAGCCTGAAGGGAAA  1000
      | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||
seq2  C-TAGCTAGGTGCTCTAG--TGGGCTTTACTTGT-AAGGCTGAA-GGAAA  993

seq1  AAGTCACGTGGAAGTGTTTCCAGTCATAACTTGCCCAGCCTGGCTCCTTG  1050
      ||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||
seq2  AAGTCACGT-GAGGTGTTT-CAGTCAT-ACTTG-CCAG-CTGGCTC--TG  1036

seq1  TTGAGTTGGAAAAAGTCAGTCTGTTGTTTAAGTTGCTATTTTGAGATTTC  1100
      ||||||     |||||||||||||   |||||||||   |||||||| | 
seq2  TTGAGT----GAAAGTCAGTCTGT--GTTAAGTTGC---TTTGAGATCTA  1077

seq1  TTTTTCAAGCACCTG  1115
      ||     ||||||||
seq2  TT----CAGCACCTG  1088

seq1: chr8_130137994_130138222
seq2: B6Ng01-145O18.g_75_303 (reverse)

seq1  ACACATAATACCACACACATATTACACACACATACACAGCACATACCAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATAATACCACACACATATTACACACACATACACAGCACATACCAAC  50

seq1  CATGTGTATACTCACACATACACGCACCACATGCACAAACTACATTCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTATACTCACACATACACGCACCACATGCACAAACTACATTCAGC  100

seq1  TACAAATGATCCATTTTTCTTTTCTGATTTATGTTTTATAGCAAGCTCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAATGATCCATTTTTCTTTTCTGATTTATGTTTTATAGCAAGCTCTA  150

seq1  CCCTTAGCTCTTGGGCAGGAGCAACTGAATGAGGAGGATATTGCAGGAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTAGCTCTTGGGCAGGAGCAACTGAATGAGGAGGATATTGCAGGAAC  200

seq1  AAAGCCCACGGCCCCCACAAGAGACTGAA  229
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCCACGGCCCCCACAAGAGACTGAA  229