BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148A16
Chromosome8 (Build37)
Map Location 55,665,053 - 55,777,737
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAsb5, Spata4, Wdr17
Upstream geneNeil3, LOC100040107, Vegfc, Spcs3
Downstream geneGpm6a, LOC667624, LOC100040156, LOC100040382, LOC100040392, EG546212
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148A16.bB6Ng01-148A16.g
ACCDH944754DH944755
length1,1151,100
definitionDH944754|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148A16, 5' end.DH944755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148A16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(55,665,053 - 55,666,173)(55,776,635 - 55,777,737)
sequence
gaattctctaaaagatggaaataatgaaatcacttctaaaatacagcatt
cttctggacttatggctctaataattttatgatttatttagaaagcgttt
cataaaacttgcatttttatgaacagtcaagtgactttataacaacttgt
gtggtaaaaccaatcaaaacctgtaaaattattaccctatcttatgaaat
taacagtagaagagaagcagacaagaagatagatattagtagtcataacc
atactattttatgaacattttctctttagtcaatgttgcttttatgtctt
aaaatgtatctgaataggtgttttctggcagtcctagtctgtttttaatc
actttaaagccctttaaagtaatcacactgatctataatattatagatat
tatctataatatccaggaaattaaaccaacagaggcaggcctgggctctt
ttaattgcaggaaaaatacccagaataaattttaactgctcaagtgacca
cagggaaagagaggtaggagcacttgatgtgtctcttcgaagaggaggag
aagaaagttcacgcaagaagactgctttacctagtgggtggggcataaga
gtcacttgagaagggggaattatggagcattacatcatggcataggttgg
gagctaagtgccctgacccacccacaccaaatacatggagaatgatgctc
taccagtgagcctttgacaatagtagcaccatttcaaaaatagctgcccc
tgtacccctctgattactctttctagaaccccctgaggctatactatgtt
tcagacttcaggttagctacttgaccatcttagcaatattttacagctca
cccacatcaggaccaggacagtgtgaggcctgtgattaggaggaataaca
ggacaggcttagagtgtggagacatgagtctggctgtgagcactgctaaa
aatacagtaaatacattattctggttatgtatggcaagtttccaaagatc
ggaacagtactgggtcaccttgttaaatgctgactgtgtccaatttatat
gttattagaactgatgagccgaatagagttaacattgaacccacgatttc
tttgttgttcttctg
gaattctttaattttaaccgtaacatacgtaatatataattaatatatat
aataaatgtataattaatatatagttaagtaattgtttatgataaatatc
ataatcccctttatttttcagtaccaatgatagttcagtgattgtttata
attatgtaatatatttctaaatatgatgtccatattcagtttttttaaag
tcataaatagttttgagatagaaaactgagacacaactattgaagtagct
taattttgttcaaaatgtctttactatattctaacatataattgcaatat
tggtaactcaagcacattcaacctatgttttctgtgacagtcatgtcctt
tttaatgtttagacatatttaacacatttagtatgatgccttttcaattt
agatctttaaaaagtttaaaagattagtgaaaggaactaatattattatt
caatggtgtttttaagttaattcccaaattagagtattttgcaactgtaa
aaagtacattttactaattcatgtaatctgtttgtaatcgcttagcctaa
ccagttattagtgagtaaagtttgcacccagcctttgagaaagatattta
taacataagccatttaatgaactattcatatagttgattggtctttggat
ttttagcatatcactgagaaaataaaatccacattacttctggcagtgag
cattgtgatgtaaaaacagctatttgtggcttccactagaaggtttcata
tatctccatattttctgataatctgttagtcaaaaggcctataagtatta
tttatataaattacaatgcatatacctgatactttatggtttttgtaggt
agccttagataacttaaaaactctacttgaagttaagtttacattatgtg
ataaagaaattgaagatgtgcaatgcattgctctctaaagtcacagcaca
gacactgtactagctaatgggtggaaatgaaaattttagctaggcgtgat
gtgaacgcctttaatcccagcctggggagggagaaggcaagtgcatcctc
tgtgaatttgagccagcctggtctaatatggagtcaggaaggccatagct

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_55665053_55666173
seq2: B6Ng01-148A16.b_44_1158

seq1  GAATTCTCTAAAAGATGGAAATAATGAAATCACTTCTAAAATACAGCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTAAAAGATGGAAATAATGAAATCACTTCTAAAATACAGCATT  50

seq1  CTTCTGGACTTATGGCTCTAATAATTTTATGATTTATTTAGAAAGCGTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGACTTATGGCTCTAATAATTTTATGATTTATTTAGAAAGCGTTT  100

seq1  CATAAAACTTGCATTTTTATGAACAGTCAAGTGACTTTATAACAACTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACTTGCATTTTTATGAACAGTCAAGTGACTTTATAACAACTTGT  150

seq1  GTGGTAAAACCAATCAAAACCTGTAAAATTATTACCCTATCTTATGAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTAAAACCAATCAAAACCTGTAAAATTATTACCCTATCTTATGAAAT  200

seq1  TAACAGTAGAAGAGAAGCAGACAAGAAGATAGATATTAGTAGTCATAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGTAGAAGAGAAGCAGACAAGAAGATAGATATTAGTAGTCATAACC  250

seq1  ATACTATTTTATGAACATTTTCTCTTTAGTCAATGTTGCTTTTATGTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTATTTTATGAACATTTTCTCTTTAGTCAATGTTGCTTTTATGTCTT  300

seq1  AAAATGTATCTGAATAGGTGTTTTCTGGCAGTCCTAGTCTGTTTTTAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTATCTGAATAGGTGTTTTCTGGCAGTCCTAGTCTGTTTTTAATC  350

seq1  ACTTTAAAGCCCTTTAAAGTAATCACACTGATCTATAATATTATAGATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAAAGCCCTTTAAAGTAATCACACTGATCTATAATATTATAGATAT  400

seq1  TATCTATAATATCCAGGAAATTAAACCAACAGAGGCAGGCCTGGGCTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATAATATCCAGGAAATTAAACCAACAGAGGCAGGCCTGGGCTCTT  450

seq1  TTAATTGCAGGAAAAATACCCAGAATAAATTTTAACTGCTCAAGTGACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTGCAGGAAAAATACCCAGAATAAATTTTAACTGCTCAAGTGACCA  500

seq1  CAGGGAAAGAGAGGTAGGAGCACTTGATGTGTCTCTTCGAAGAGGAGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAAAGAGAGGTAGGAGCACTTGATGTGTCTCTTCGAAGAGGAGGAG  550

seq1  AAGAAAGTTCACGCAAGAAGACTGCTTTACCTAGTGGGTGGGGCATAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGTTCACGCAAGAAGACTGCTTTACCTAGTGGGTGGGGCATAAGA  600

seq1  GTCACTTGAGAAGGGGGAATTATGGAGCATTACATCATGGCATAGGTTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTGAGAAGGGGGAATTATGGAGCATTACATCATGGCATAGGTTGG  650

seq1  GAGCTAAGTGCCCTGACCCACCCACACCAAATACATGGAGAATGATGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAAGTGCCCTGACCCACCCACACCAAATACATGGAGAATGATGCTC  700

seq1  TACCAGTGAGCCTTTGACAATAGTAGCACCATTTCAAAAATAGCTGCCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGTGAGCCTTTGACAATAGTAGCACCATTTCAAAAATAGCTGCCCC  750

seq1  TGTACCCCTCTGATTACTCTTTCTAGAACCCCCTGAGGCTATACTATGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCCCTCTGATTACTCTTTCTAGAACCCCCTGAGGCTATACTATGTT  800

seq1  TCAGACTTCAGGATTAGCTACTTGACCATCTTAGCAATATTTTACAGCTC  850
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTTCAGG-TTAGCTACTTGACCATCTTAGCAATATTTTACAGCTC  849

seq1  ACCCACATCAGGACCAGGACAGTGTGAGGCCTGTGATTAGGAGGAATAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACATCAGGACCAGGACAGTGTGAGGCCTGTGATTAGGAGGAATAAC  899

seq1  AGGACAGGCTTAGAGTGTGGAGACATGAGTCTGGCTGTGAGCACTGCTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGGCTTAGAGTGTGGAGACATGAGTCTGGCTGTGAGCACTGCTAA  949

seq1  AAATACAGTAAATACATTTATTTCTGGTTATGTATGGGCAAGTTTCCAAA  1000
      ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAATACAGTAAATACATT--ATTCTGGTTATGTAT-GGCAAGTTTCCAAA  996

seq1  GATCGGAACAGTAACTGGGTCACCTTGTTAAATGCTGACTGTGTCCAATT  1050
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCGGAACAGT-ACTGGGTCACCTTGTTAAATGCTGACTGTGTCCAATT  1045

seq1  TATATGTTATTAGAACTGATGGAGCCGAATAGAGTTTACATTGACCCCAC  1100
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  TATATGTTATTAGAACTGAT-GAGCCGAATAGAGTTAACATTGAACCCAC  1094

seq1  GATTTCTTTGTTGTTCTTCTG  1121
      |||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTTGTTGTTCTTCTG  1115

seq1: chr8_55776635_55777737
seq2: B6Ng01-148A16.g_69_1168 (reverse)

seq1  AGCTATGGCTGTCCTGAACTCATTATGTAGACCAGGCTGGCCTCAAATTC  50
      |||||||||  ||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||
seq2  AGCTATGGCCTTCCTG-ACTCCATAT-TAGACCAGGCTGG-CTCAAATTC  47

seq1  ACAGA-GATGCACCTGCC-TCTCCCTCCCAAGGCTGGGATTAAAGGCGTT  98
      ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGATGCACTTGCCTTCTCCCTCCCCAGGCTGGGATTAAAGGCGTT  97

seq1  CACCATCACGCCTAGCCTAAATTTTCATTTCCACCCATTAGCTAGTACAG  148
      || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CA-CATCACGCCTAGCTAAAATTTTCATTTCCACCCATTAGCTAGTACAG  146

seq1  TGTCTGTGCTGTGACTTTAAGAGAGCAATGCATTGCACATCTTCAATTTC  198
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTGCTGTGACTTT-AGAGAGCAATGCATTGCACATCTTCAATTTC  195

seq1  TTTATCACATAATGTAAACTTAACTTCAAGTAGAGTTTTTAAGTTATCTA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCACATAATGTAAACTTAACTTCAAGTAGAGTTTTTAAGTTATCTA  245

seq1  AGGCTACCTACAAAAACCATAAAGTATCAGGTATATGCATTGTAATTTAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTACCTACAAAAACCATAAAGTATCAGGTATATGCATTGTAATTTAT  295

seq1  ATAAATAATACTTATAGGCCTTTTGACTAACAGATTATCAGAAAATATGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAATACTTATAGGCCTTTTGACTAACAGATTATCAGAAAATATGG  345

seq1  AGATATATGAAACCTTCTAGTGGAAGCCACAAATAGCTGTTTTTACATCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATATGAAACCTTCTAGTGGAAGCCACAAATAGCTGTTTTTACATCA  395

seq1  CAATGCTCACTGCCAGAAGTAATGTGGATTTTATTTTCTCAGTGATATGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCTCACTGCCAGAAGTAATGTGGATTTTATTTTCTCAGTGATATGC  445

seq1  TAAAAATCCAAAGACCAATCAACTATATGAATAGTTCATTAAATGGCTTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATCCAAAGACCAATCAACTATATGAATAGTTCATTAAATGGCTTA  495

seq1  TGTTATAAATATCTTTCTCAAAGGCTGGGTGCAAACTTTACTCACTAATA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATAAATATCTTTCTCAAAGGCTGGGTGCAAACTTTACTCACTAATA  545

seq1  ACTGGTTAGGCTAAGCGATTACAAACAGATTACATGAATTAGTAAAATGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTTAGGCTAAGCGATTACAAACAGATTACATGAATTAGTAAAATGT  595

seq1  ACTTTTTACAGTTGCAAAATACTCTAATTTGGGAATTAACTTAAAAACAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTACAGTTGCAAAATACTCTAATTTGGGAATTAACTTAAAAACAC  645

seq1  CATTGAATAATAATATTAGTTCCTTTCACTAATCTTTTAAACTTTTTAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAATAATAATATTAGTTCCTTTCACTAATCTTTTAAACTTTTTAAA  695

seq1  GATCTAAATTGAAAAGGCATCATACTAAATGTGTTAAATATGTCTAAACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAAATTGAAAAGGCATCATACTAAATGTGTTAAATATGTCTAAACA  745

seq1  TTAAAAAGGACATGACTGTCACAGAAAACATAGGTTGAATGTGCTTGAGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGGACATGACTGTCACAGAAAACATAGGTTGAATGTGCTTGAGT  795

seq1  TACCAATATTGCAATTATATGTTAGAATATAGTAAAGACATTTTGAACAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAATATTGCAATTATATGTTAGAATATAGTAAAGACATTTTGAACAA  845

seq1  AATTAAGCTACTTCAATAGTTGTGTCTCAGTTTTCTATCTCAAAACTATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAGCTACTTCAATAGTTGTGTCTCAGTTTTCTATCTCAAAACTATT  895

seq1  TATGACTTTAAAAAAACTGAATATGGACATCATATTTAGAAATATATTAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACTTTAAAAAAACTGAATATGGACATCATATTTAGAAATATATTAC  945

seq1  ATAATTATAAACAATCACTGAACTATCATTGGTACTGAAAAATAAAGGGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTATAAACAATCACTGAACTATCATTGGTACTGAAAAATAAAGGGG  995

seq1  ATTATGATATTTATCATAAACAATTACTTAACTATATATTAATTATACAT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGATATTTATCATAAACAATTACTTAACTATATATTAATTATACAT  1045

seq1  TTATTATATATATTAATTATATATTACGTATGTTACGGTTAAAATTAAAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATATATATTAATTATATATTACGTATGTTACGGTTAAAATTAAAG  1095

seq1  AATTC  1103
      |||||
seq2  AATTC  1100