BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155A20
Chromosome8 (Build37)
Map Location 90,682,707 - 90,850,928
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHeatr3, Papd5, Adcy7
Upstream geneCbln1, LOC100040294, 4933402J07Rik, Zfp423, LOC100040328, 5033428A16Rik
Downstream geneBrd7, LOC100040369, Nkd1, 9130017C17Rik, Nod2, Cyld, LOC675985, Sall1, LOC100041089, EG625801, EG384862
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155A20.bB6Ng01-155A20.g
ACCDH949934DH949935
length1,1321,156
definitionDH949934|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155A20, 5' end.DH949935|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155A20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,682,707 - 90,683,863)(90,849,776 - 90,850,928)
sequence
gaattcaaggcgcagcatccctgtcctgctcaagagactttctcttgaca
gtgctcttgatcctcaggcttttccagttttccttctccctcctctgatg
ttccctgagccttcagtgtgggggctgtccttttggggctgagcacccaa
gggtcactcaaggtctccgctggtttctgcctactgtagagagaagcttg
gaagtgagaggtctgcacttatttatgcagataaggatttccaggcagtt
ggaaactattgctttggtagtatgttagtgataaggtcacctgtggggcc
atgacctctccagacatggctcttggcaggtttacagtactagctatgac
ttccctccagttgatgagacttggttcccctaggatgcgtgtgccactgt
tgtcttattcaggaggttttgttgtttttgagacagtgtctttgtgtata
gccttggttatcctgcagctcactgtgtggaccaggcacatggaaacttt
tgaataataatagtaatatcttcacatcaattgtggagcctctgttgcac
accaggctttagcagataggggagaaactgtagtaagaccatcgtttagc
ttgtgcttctctttatgttttatttattttatgtatataagtgctctatc
tacatatagagtctgcatgccaggagagggcatcagatcccatcacagat
ggctgtgagccaccatgtggttgctggaattgaactaggaccaaaatgaa
ctggcacagatcacatgttgtgcaggagtttgtccaaggtgtgtctgatc
tcgtactgtgctaattacaggaactctcttctttggtacatacagtatct
aaaatgaaaagctcagaagataaaagaagatgagttgcatctttgtactc
ttagtgcttgtgaggctgagacaggagaattgatagtttgagaccagcat
ggactataggaagaccctgtgtaagaaaattgtgagccaggcagtgtggc
acacacctttaatcccagcacttgggaggccgaggcagaagatctcttga
gtttgaggccagcctggtctacagagttccaggaaggccaaaaacagaga
aaatcctggtccaaagggaagagtagaaggga
gaattcctagaacccacaaggtggaaagagaaccaactcctgtaagttgt
tctctgacctcgacatgtgcactgtgtatatcacaccaaataaatgtagt
tttaaattgtttgataaagagaggttgggaggtagctcagtttgtcacac
aaaaatgaggacctgggttggatccctaatactccatgtaaagatgtgat
gatgtgagcattggggatgtggacacaggcagatctcttgggctcaatgg
cctgccagcctaatctcatagcaagccccaagttccagagacacggtcaa
gaaataagatagtcagctcctaaggttgccctctggccctcgtatataca
tgcacccacacatacatacacactcccaaaggtaactacttgagatatgc
aagggaagtcagcgtttacagtaacaccagagggtctgccgaaacctcat
agcagagggagggcagggacaccctccaaccaagagggtgtgggcaaggc
tgagcgtccatttgtggccctcaccgactcggaggcggaaggagttgaag
gagtgcctgttgatcccatccagcttgctcatcagggccatgctaaattc
taccaagactccgatgtgcacgtgcttccgctccaggtcctgcgggacat
ggggttgcataacctactccatgcagccttgactgagggcgcacactgtg
ggcaaggggtttctgtccccaccagggtctccaggctatgccacaaaagg
cctctgcccctaacgcctttagaaggtgataggactggggatggcctata
ggatttactttgacacaggcctggagtacctggttctcatgtcctgaggg
gcactgagccctgctgccgccatgtaggtgctgccaatggtcttgatctt
ctcacaccactaaacttgggcttcagcaggagctgcaaacaaccaggagc
tgcagtaagtatccctgatgctgagagaggaagagggcccttcctccact
tccatacacagtacagacacatgcatgcacggtcttgtccttcggagtca
tggctgcaggtgtacaacatggcactcatcgtcctccatctctttccttc
tctggattctgatatccttcctcagagcaccttactccagcatcatttta
tactta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_90682707_90683863
seq2: B6Ng01-155A20.b_42_1173

seq1  GAATTCAAGGCGCAGCATCCCTGTCCTGCTCAAGAGACTTTCTCTTGACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCGCAGCATCCCTGTCCTGCTCAAGAGACTTTCTCTTGACA  50

seq1  GTGCTCTTGATCCTCAGGCTTTTCCAGTTTTCCTTCTCCCTCCTCTGATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTTGATCCTCAGGCTTTTCCAGTTTTCCTTCTCCCTCCTCTGATG  100

seq1  TTCCCTGAGCCTTCAGTGTGGGGGCTGTCCTTTTGGGGCTGAGCACCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGAGCCTTCAGTGTGGGGGCTGTCCTTTTGGGGCTGAGCACCCAA  150

seq1  GGGTCACTCAAGGTCTCCGCTGGTTTCTGCCTACTGTAGAGAGAAGCTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCACTCAAGGTCTCCGCTGGTTTCTGCCTACTGTAGAGAGAAGCTTG  200

seq1  GAAGTGAGAGGTCTGCACTTATTTATGCAGATAAGGATTTCCAGGCAGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGAGAGGTCTGCACTTATTTATGCAGATAAGGATTTCCAGGCAGTT  250

seq1  GGAAACTATTGCTTTGGTAGTATGTTAGTGATAAGGTCACCTGTGGGGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACTATTGCTTTGGTAGTATGTTAGTGATAAGGTCACCTGTGGGGCC  300

seq1  ATGACCTCTCCAGACATGGCTCTTGGCAGGTTTACAGTACTAGCTATGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTCTCCAGACATGGCTCTTGGCAGGTTTACAGTACTAGCTATGAC  350

seq1  TTCCCTCCAGTTGATGAGACTTGGTTCCCCTAGGATGCGTGTGCCACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCCAGTTGATGAGACTTGGTTCCCCTAGGATGCGTGTGCCACTGT  400

seq1  TGTCTTATTCAGGAGGTTTTGTTGTTTTTGAGACAGTGTCTTTGTGTATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTATTCAGGAGGTTTTGTTGTTTTTGAGACAGTGTCTTTGTGTATA  450

seq1  GCCTTGGTTATCCTGCAGCTCACTGTGTGGACCAGGCACATGGAAACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGTTATCCTGCAGCTCACTGTGTGGACCAGGCACATGGAAACTTT  500

seq1  TGAATAATAATAGTAATATCTTCACATCAATTGTGGAGCCTCTGTTGCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAATAATAGTAATATCTTCACATCAATTGTGGAGCCTCTGTTGCAC  550

seq1  ACCAGGCTTTAGCAGATAGGGGAGAAACTGTAGTAAGACCATCGTTTAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGCTTTAGCAGATAGGGGAGAAACTGTAGTAAGACCATCGTTTAGC  600

seq1  TTGTGCTTCTCTTTATGTTTTATTTATTTTATGTATATAAGTGCTCTATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCTTCTCTTTATGTTTTATTTATTTTATGTATATAAGTGCTCTATC  650

seq1  TACATATAGAGTCTGCATGCCAGGAGAGGGCATCAGATCCCATCACAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATATAGAGTCTGCATGCCAGGAGAGGGCATCAGATCCCATCACAGAT  700

seq1  GGCTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGAATTGAACTAGGACCAAAATGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGAATTGAACTAGGACCAAAATGAA  750

seq1  CTGGCACAGATCACATGTTGTGCAGGAGTTTGTCCAAGGTGTGTCTGATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCACAGATCACATGTTGTGCAGGAGTTTGTCCAAGGTGTGTCTGATC  800

seq1  CCGTACTGTGCTAATTACAGGAACTCCCTTCTTTGGTACATACAGTATCT  850
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTACTGTGCTAATTACAGGAACTCTCTTCTTTGGTACATACAGTATCT  850

seq1  AAAATGAAAAGCCCAGAAGATAAAAGAAGATGAGTTGCATCTTTGTACTC  900
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAAAAGCTCAGAAGATAAAAGAAGATGAGTTGCATCTTTGTACTC  900

seq1  TTAGTGCTTGTGAGGCTGAGACAGGAGAATTGATAGTTTGAGACCAGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGCTTGTGAGGCTGAGACAGGAGAATTGATAGTTTGAGACCAGCAT  950

seq1  GGACTATAGGAAGACCCTGTGTTAAGAAAATTGTGAGCCAGGCAGTTGTG  1000
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGACTATAGGAAGACCCTGTG-TAAGAAAATTGTGAGCCAGGCAG-TGTG  998

seq1  GCACACACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGAGGATCTC-  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| 
seq2  GCACACACCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCCGAGGCA-GAAGATCTCT  1047

seq1  TGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTTCCAGGACAGCCAGAGACAG  1099
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||
seq2  TGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTTCCAGGAAGGCCAAAAACAG  1097

seq1  AG-AAATCCTG--TCAAAAGGAAGGGAGGAAGGGAAGAGGGAGAAAGGAA  1146
      || ||||||||   |||| ||||| |  |||||||               
seq2  AGAAAATCCTGGTCCAAAGGGAAGAGTAGAAGGGA---------------  1132

seq1  GGAAGAAGGGA  1157
                 
seq2  -----------  1132

seq1: chr8_90849776_90850928
seq2: B6Ng01-155A20.g_63_1218 (reverse)

seq1  TAAGT---AAATGATGCTGG-GTAAGTTGCTCTGA-GAAGG--ATCAGAA  43
      |||||   |||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||
seq2  TAAGTATAAAATGATGCTGGAGTAAGGTGCTCTGAGGAAGGATATCAGAA  50

seq1  TCCAGAGAAGGGAAGAGAT-GAGGACGATGGGTGCCATGTTGT-CACCTG  91
      ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  TCCAGAGAAGGAAAGAGATGGAGGACGATGAGTGCCATGTTGTACACCTG  100

seq1  CAGCCATGAACTCGGATGGACAAGGCCGTGCATGCCATGTGTCTGTACTG  141
      |||||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  CAGCCATG-ACTCCGAAGGACAAGACCGTGCATG-CATGTGTCTGTACTG  148

seq1  TGTATGGGAGTGGGGGAAGGGCCCTCTTCCTCTTCTCAGCATCAGGGATA  191
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTATGGAAGTGGAGGAAGGGCCCTCTTCCTC-TCTCAGCATCAGGGATA  197

seq1  CTTACTGCAGCTCCTGGTTGTTTTGCAGCTCCTGCTGAAGCCCAAGTTTA  241
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTGCAGCTCCTGGTTG-TTTGCAGCTCCTGCTGAAGCCCAAGTTTA  246

seq1  GTGGTGTGGAGAAGATCAAGACCATTGGCAGCACCTACATGGCGGCAGCA  291
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGT-GAGAAGATCAAGACCATTGGCAGCACCTACATGGCGGCAGCA  295

seq1  GGGCTCAGTGCCCCCTCAGGACATGAGAACCAGGTACTCCAGGCCTGTGT  341
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCAGTG-CCCCTCAGGACATGAGAACCAGGTACTCCAGGCCTGTGT  344

seq1  CAAAGTAAATCCTATAGGCCATCCCCAGTCCTATCACCTTCTAAAGGCGT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTAAATCCTATAGGCCATCCCCAGTCCTATCACCTTCTAAAGGCGT  394

seq1  TAGGGGCAGAGGCCTTTTGTGGCATAGCCTGGAGACCCTGGTGGGGACAG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGCAGAGGCCTTTTGTGGCATAGCCTGGAGACCCTGGTGGGGACAG  444

seq1  AAACCCCTTGCCCACAGTGTGCGCCCTCAGTCAAGGCTGCATGGAGTAGG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCCTTGCCCACAGTGTGCGCCCTCAGTCAAGGCTGCATGGAGTAGG  494

seq1  TTATGCAACCCCATGTCCCGCAGGACCTGGAGCGGAAGCACGTGCACATC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCAACCCCATGTCCCGCAGGACCTGGAGCGGAAGCACGTGCACATC  544

seq1  GGAGTCTTGGTAGAATTTAGCATGGCCCTGATGAGCAAGCTGGATGGGAT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCTTGGTAGAATTTAGCATGGCCCTGATGAGCAAGCTGGATGGGAT  594

seq1  CAACAGGCACTCCTTCAACTCCTTCCGCCTCCGAGTCGGTGAGGGCCACA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGCACTCCTTCAACTCCTTCCGCCTCCGAGTCGGTGAGGGCCACA  644

seq1  AATGGACGCTCAGCCTTGCCCACACCCTCTTGGTTGGAGGGTGTCCCTGC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGACGCTCAGCCTTGCCCACACCCTCTTGGTTGGAGGGTGTCCCTGC  694

seq1  CCTCCCTCTGCTATGAGGTTTCGGCAGACCCTCTGGTGTTACTGTAAACG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTCTGCTATGAGGTTTCGGCAGACCCTCTGGTGTTACTGTAAACG  744

seq1  CTGACTTCCCTTGCATATCTCAAGTAGTTACCTTTGGGAGTGTGTATGTA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTCCCTTGCATATCTCAAGTAGTTACCTTTGGGAGTGTGTATGTA  794

seq1  TGTGTGGGTGCATGTATATACGAGGGCCAGAGGGCAACCTTAGGAGCTGA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGGTGCATGTATATACGAGGGCCAGAGGGCAACCTTAGGAGCTGA  844

seq1  CTATCTTATTTCTTGACCGTGTCTCTGGAACTTGGGGCTTGCTATGAGAT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTATTTCTTGACCGTGTCTCTGGAACTTGGGGCTTGCTATGAGAT  894

seq1  TAGGCTGGCAGGCCATTGAGCCCAAGAGATCTGCCTGTGTCCACATCCCC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTGGCAGGCCATTGAGCCCAAGAGATCTGCCTGTGTCCACATCCCC  944

seq1  AATGCTCACATCATCACATCTTTACATGGAGTATTAGGGATCCAACCCAG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTCACATCATCACATCTTTACATGGAGTATTAGGGATCCAACCCAG  994

seq1  GTCCTCATTTTTGTGTGACAAACTGAGCTACCTCCCAACCTCTCTTTATC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCATTTTTGTGTGACAAACTGAGCTACCTCCCAACCTCTCTTTATC  1044

seq1  AAACAATTTAAAACTACATTTATTTGGTGTGATATACACAGTGCACATGT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATTTAAAACTACATTTATTTGGTGTGATATACACAGTGCACATGT  1094

seq1  CGAGGTCAGAGAACAACTTACAGGAGTTGGTTCTCTTTCCACCTTGTGGG  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGTCAGAGAACAACTTACAGGAGTTGGTTCTCTTTCCACCTTGTGGG  1144

seq1  TTCTAGGAATTC  1153
      ||||||||||||
seq2  TTCTAGGAATTC  1156