BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163I19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 116,417,744 - 116,542,764
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042061, Mon1b, 4930481F22Rik, Adamts18
Downstream geneNudt7, AI427515, Clec3a, Wwox
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163I19.bB6Ng01-163I19.g
ACCDH956106DH956107
length880658
definitionDH956106|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163I19, 5' end.DH956107|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163I19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,417,744 - 116,418,619)(116,542,107 - 116,542,764)
sequence
gaattcacaggttatacagacttcaatattgactcgctagaaaagtaacc
ccctcaggggaggttggtggatactggcagctggctcccaaccctgcagc
ttcaattgggatgatcatggagttggggtgagatagcagtgcacatccca
gatctctgatgtccaactctaataacaatgggaaggaaccattagccagc
cctgtttcctttagcatctccttctcttgacatgatcttttcttcttctc
ttcccttgccatactttcctgtcatgtccggggaaccttcactcagcttg
gatggaagctaaccttgaccattcttttgtttagaaatcctcagcttgga
gtgaatgaggatgtgctcatgggagcatctatacctctggagatgaacac
ttacctatgccagcgtttgattgtcccaccttcttcattaaactaggaga
tccagtgcgaactttaaaaaatgcctgcctcctttgcttttcacccctac
acctagattgtccagcaatggatcttcatcccatgttttgatttgggttt
gtttccattttccctgtatatgatctttaagtggtccccagtggtgcagg
aatgtgacttcatatcatgagaatggtgtggccatggccacgaggcatga
gactgtatcataaatcaaccacagtttgaagagacgatgacaagggtgat
ttatagactatctcagcacagatttccatatagctccttctctggtttca
ctcctatccccttgaggatttgagaagtgaaagaaagtgcagtgtgggtg
gtagatttccctccctagaaatccacagccgtcacaccatccatatagga
agaacagatattacgctttgcaatggatgg
gaattcattagccaatctacgagtagaatatcggcctgagaagctcagac
tttccgcttatcaagaaagaagccagcaacatttagcttagaatgtttag
tttggacagaatgttagactcataaatactcatttgcgagcagtcaccag
ggtctgtaggaataagtggattgaccttcggcaagtacacagctgagggg
ccagccaggctgccctgttgtcaggaaatccctggtgtaatagatttgac
acagtgagagaaacagatccactgtcctcactgcctgatgagattgtcct
ggtggcagctacatatgttctttggcacacagccatttccgcaaccccaa
accaacagcacttcagaggttgaagcccgtctgaggagtggttctgcaat
tctttggcaatctccccagagctagtgatatgaaggagctctgtgaagat
tgaggggaagatagagatgaggttagcaggtcacactgcgattgttagct
tttaagaagtcacagagggactagggactaggagtcacaaagggctcaat
ttggtaaagtgtctgtcatacaagcgtgaggacctgagtgttcagagctt
taaaaaatggtgtggccatgcggatctgtaactctagaggtgtgtgtggg
gggggtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_116417744_116418619
seq2: B6Ng01-163I19.b_43_922

seq1  GAATTCACAGGTTATACAGACTTCAATATTGACTCGCTAGAAAAGTAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGGTTATACAGACTTCAATATTGACTCGCTAGAAAAGTAACC  50

seq1  CCCTCAGGGGAGGTTGGTGGATACTGGCAGCTGGCTCCCAACCCTGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGGGGAGGTTGGTGGATACTGGCAGCTGGCTCCCAACCCTGCAGC  100

seq1  TTCAATTGGGATGATCATGGAGTTGGGGTGAGATAGCAGTGCACATCCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATTGGGATGATCATGGAGTTGGGGTGAGATAGCAGTGCACATCCCA  150

seq1  GATCTCTGATGTCCAACTCTAATAACAATGGGAAGGAACCATTAGCCAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGATGTCCAACTCTAATAACAATGGGAAGGAACCATTAGCCAGC  200

seq1  CCTGTTTCCTTTAGCATCTCCTTCTCTTGACATGATCTTTTCTTCTTCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTTCCTTTAGCATCTCCTTCTCTTGACATGATCTTTTCTTCTTCTC  250

seq1  TTCCCTTGCCATACTTTCCTGTCATGTCCGGGGAACCTTCACTCAGCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTGCCATACTTTCCTGTCATGTCCGGGGAACCTTCACTCAGCTTG  300

seq1  GATGGAAGCTAACCTTGACCATTCTTTTGTTTAGAAATCCTCAGCTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAAGCTAACCTTGACCATTCTTTTGTTTAGAAATCCTCAGCTTGGA  350

seq1  GTGAATGAGGATGTGCTCATGGGAGCATCTATACCTCTGGAGATGAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATGAGGATGTGCTCATGGGAGCATCTATACCTCTGGAGATGAACAC  400

seq1  TTACCTATGCCAGCGTTTGATTGTCCCACCTTCTTCATTAAACTAGGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTATGCCAGCGTTTGATTGTCCCACCTTCTTCATTAAACTAGGAGA  450

seq1  TCCAGTGCGAACTTTAAAAAATGCCTGCCTCCTTTGCTTTTCACCCCTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGCGAACTTTAAAAAATGCCTGCCTCCTTTGCTTTTCACCCCTAC  500

seq1  ACCTAGATTGTCCAGCAATGGATCTTCATCCCATGTTTTGATTTGGGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGATTGTCCAGCAATGGATCTTCATCCCATGTTTTGATTTGGGTTT  550

seq1  GTTTCCATTTTCCCTGTATATGATCTTTAAGTGGTCCCCAGTGGTGCAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCATTTTCCCTGTATATGATCTTTAAGTGGTCCCCAGTGGTGCAGG  600

seq1  AATGTGACTTCATATCATGAGAATGGTGTGGCCATGGCCACGAGGCATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGACTTCATATCATGAGAATGGTGTGGCCATGGCCACGAGGCATGA  650

seq1  GACTGTATCATAAATCAACCACAGTTTGAAGAGACGATGACAAGGGTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTATCATAAATCAACCACAGTTTGAAGAGACGATGACAAGGGTGAT  700

seq1  TTATAGACTATCTCAGCACAGATTTCCATATAGCTCC-TCTCTGG-TTCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  TTATAGACTATCTCAGCACAGATTTCCATATAGCTCCTTCTCTGGTTTCA  750

seq1  CTCCTATCCCCTTGAGGA-TTGAGAAGTGAAAGAAAGTGCAGTGTGGGTG  797
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTATCCCCTTGAGGATTTGAGAAGTGAAAGAAAGTGCAGTGTGGGTG  800

seq1  GTAGA-TTCCCTCCCTAGAAATCCACAGCCGTCACACCATCCATATAGG-  845
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GTAGATTTCCCTCCCTAGAAATCCACAGCCGTCACACCATCCATATAGGA  850

seq1  AGAACAGATATTTACGCTTTGCAATGGATGG  876
      |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGATA-TTACGCTTTGCAATGGATGG  880

seq1: chr8_116542107_116542764
seq2: B6Ng01-163I19.g_69_726 (reverse)

seq1  CCACCCCCCCCACACACACCTCTAGAGTTACAGATCCGCATGGCCACACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCCCCCACACACACCTCTAGAGTTACAGATCCGCATGGCCACACC  50

seq1  ATTTTTTAAAGCTCTGAACACTCAGGTCCTCACGCTTGTATGACAGACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTAAAGCTCTGAACACTCAGGTCCTCACGCTTGTATGACAGACAC  100

seq1  TTTACCAAATTGAGCCCTTTGTGACTCCTAGTCCCTAGTCCCTCTGTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCAAATTGAGCCCTTTGTGACTCCTAGTCCCTAGTCCCTCTGTGAC  150

seq1  TTCTTAAAAGCTAACAATCGCAGTGTGACCTGCTAACCTCATCTCTATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAAAAGCTAACAATCGCAGTGTGACCTGCTAACCTCATCTCTATCT  200

seq1  TCCCCTCAATCTTCACAGAGCTCCTTCATATCACTAGCTCTGGGGAGATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCAATCTTCACAGAGCTCCTTCATATCACTAGCTCTGGGGAGATT  250

seq1  GCCAAAGAATTGCAGAACCACTCCTCAGACGGGCTTCAACCTCTGAAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAGAATTGCAGAACCACTCCTCAGACGGGCTTCAACCTCTGAAGTG  300

seq1  CTGTTGGTTTGGGGTTGCGGAAATGGCTGTGTGCCAAAGAACATATGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGGTTTGGGGTTGCGGAAATGGCTGTGTGCCAAAGAACATATGTAG  350

seq1  CTGCCACCAGGACAATCTCATCAGGCAGTGAGGACAGTGGATCTGTTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACCAGGACAATCTCATCAGGCAGTGAGGACAGTGGATCTGTTTCT  400

seq1  CTCACTGTGTCAAATCTATTACACCAGGGATTTCCTGACAACAGGGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGTGTCAAATCTATTACACCAGGGATTTCCTGACAACAGGGCAGC  450

seq1  CTGGCTGGCCCCTCAGCTGTGTACTTGCCGAAGGTCAATCCACTTATTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGCCCCTCAGCTGTGTACTTGCCGAAGGTCAATCCACTTATTCC  500

seq1  TACAGACCCTGGTGACTGCTCGCAAATGAGTATTTATGAGTCTAACATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGACCCTGGTGACTGCTCGCAAATGAGTATTTATGAGTCTAACATTC  550

seq1  TGTCCAAACTAAACATTCTAAGCTAAATGTTGCTGGCTTCTTTCTTGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAAACTAAACATTCTAAGCTAAATGTTGCTGGCTTCTTTCTTGATA  600

seq1  AGCGGAAAGTCTGAGCTTCTCAGGCCGATATTCTACTCGTAGATTGGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGAAAGTCTGAGCTTCTCAGGCCGATATTCTACTCGTAGATTGGCTA  650

seq1  ATGAATTC  658
      ||||||||
seq2  ATGAATTC  658