BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-164M08
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,812,287 - 14,920,566
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2, Cln8, Arhgef10
Upstream geneAF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140, C030037F17Rik
Downstream gene2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097, EG665619, LOC634008, Csmd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-164M08.bB6Ng01-164M08.g
ACCDH957007DH957008
length1,1511,223
definitionDH957007|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164M08, 5' end.DH957008|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-164M08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,919,385 - 14,920,566)(14,812,287 - 14,813,516)
sequence
gaattcagcagtgtgcattctgcacacggtccccgaggccccctgacaga
ggtacaagtcaaaagggggaggcatgcaggctaggtcccactgcacttgg
agatcagcataccaggacggtgctttaccgttaaacagtacttttccttg
gagccagcctggcggtctgggatgccctggtgtatgcccaaattgtgacc
acaattgacacaaaccaacaatgtctcaaagactcatgtcatctaaacaa
aacacaaactgtatactgttatctaaacatctgtgcagctctaactgcat
gttgactgggcaatgcctttgctagtgttgttcaggagactggtcattat
gttaaaaaaaaaatacaaaacaaaacaaaacggcagaattcgtcattcag
agggtagcagtcgccagacgggctctggccatctaaacggacagcctatg
cccatgaaggcttcttgggcagcctctgcagacaagcctttccctggcat
tcttgagggtcccttagaagagtatgccagcccttggttgcccgtggcct
gtaagaacagccatgtaagcctagaacttagacttgctggactagtccaa
ggaggtacagaacagaaataagaagttcattacctcagcagggaacaagc
cggattcaaagcaaaccatcccaacaggctagtgagggccggaagggacc
agaggagagaaagagctccctcggttgctgctgaccatgggaatgcacag
tgatcccacacatacaattcttcaaactcctgaaaatatccggagctgtg
gttctatgcctgcacttatgtactaaggagccagcaaggaggagagggtg
tcctggtggccaaatgcttggagacctcatatctggctggaggacagcat
ccggtccaccagaccagtaagacttccttaatggaaggagagacgacgag
tacaggtagcagcgctgcccaagatgggaaccaagaggagctgctcagca
tggtgggagagatgcacactgagaagctggagaatctaggggatgatgtg
ctgctgctgaactcgaagtagtcactggagtctgttcacgcatgtgtgtc
attagaacaggaacatgaatgatagacagttcctcttggatctggagggg
g
gaattcctaagaaggcacccccccctttgtcaaatggcatgggaggatgc
ctgctttgcaagacaaataccagctgtagaaagggttctgtggttatccc
ccgtctggagtggcactcatgaggaaagtaaacatattatgtaagaaagc
caaaggatgggatgctgtccagagtatgcctggtgcagagctagcaccac
gtctggccagatgtttgttagtccctaaacttcatgaggaacataactct
ttataaatccatgacacagagccaacgtggctacacagctcatggtgcaa
agccatctgctcaataattaattcccatcgtgcctcgagaactgggtgga
tttcctcatcaggtctttattggcaagtggctttgaaactgggaagtcca
tgtgtctttcttcctttaataatcctattattaatttgggactgactgga
cagtaagtcagaccctcacttatcagggaagccagcaaggtcccacatgc
ccggtgcctgccaaaggttcgatgcagtagcatctggactctccagtgta
tcctgagatggacaattcactagcccactttattaaccatctctcttctc
tactagaataagagcattgtaaggcagagatgtttcttgcagctgaactt
gcagtcactggaattattatatattgtacataggaaacagagtatcaagt
atatattgtatagagatgtgctaagtttttgtagatttgtttaatgaaat
ggtgaatcaatgaatatatgattgaatgaataaaggaatgaatggtgagt
caatgaattgtgattgaatgaatgaatgaatgaatgcattggatttctct
gtctctgggtggacttgcataacctgcaggtcctacgggttttataaatg
agttttctgagtgaggagaataggagatgagagaaagagaagaaaaagag
agacatcacgtcttatcctgtcttgtagcacccagcaccaagtagctgcc
cttgtatgttaggacttgtgcactgataggtgctcctgtgtgtgggcctc
tgtaaaattcttattagtcattatgaaagggtggtctttgtttcctgatc
cctgggagtcacagccgaatttccttaataaagaatagacattgcaacat
accaagagccactgctctaatagaccgaatcttggatataccagaaaatt
ggccacattggacccactacatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14919385_14920566
seq2: B6Ng01-164M08.b_50_1200 (reverse)

seq1  CCCCCTCCCAGATCCCAGGAGGAACTTGCTCCTATACCATTCATGGGTCC  50
      |||||| |||||| ||| ||||||||      | || |||||||  || |
seq2  CCCCCT-CCAGAT-CCAAGAGGAACT-----GTCTATCATTCAT--GTTC  41

seq1  CTTTGTTCTAAATGGCCCACCATGCCGTGAACAGGAACTCCAGGTTGACT  100
      |  |||||| |||| | || |||| |||||||||  |||||||  |||||
seq2  C--TGTTCT-AATGACACA-CATG-CGTGAACAG--ACTCCAG--TGACT  82

seq1  ACTTCCGAGTTCCAGCCGCCAGGCACCATCATCCCCCTAGA-TCTCCAGC  149
      |||| |||||| |||| ||   ||| |||||| |||||||| ||||||| 
seq2  ACTT-CGAGTT-CAGCAGC--AGCA-CATCAT-CCCCTAGATTCTCCAG-  125

seq1  CTTCTCAGTGTGGCAATCTCCTTCCCACCATGCTGGGCAGCTCCCTTCTT  199
      ||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||
seq2  CTTCTCAGTGTG--CATCTC--TCCCACCATGCTGAGCAGCTCC--TCTT  169

seq1  GGTTCCCATCTTGGGCAGCGCTGCCTACCTGTACTCGTCGTCTCTCCTTC  249
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCATCTTGGGCAGCGCTG-CTACCTGTACTCGTCGTCTCTCCTTC  218

seq1  CATTAAGGAAGTCTTACTGGTCTGGTGGACCGGATGCTGTCCTCCAGCCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAGGAAGTCTTACTGGTCTGGTGGACCGGATGCTGTCCTCCAGCCA  268

seq1  GATATGAGGTCTCCAAGCATTTGGCCACCAGGACACCCTCTCCTCCTTGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAGGTCTCCAAGCATTTGGCCACCAGGACACCCTCTCCTCCTTGC  318

seq1  TGGCTCCTTAGTACATAAGTGCAGGCATAGAACCACAGCTCCGGATATTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCTTAGTACATAAGTGCAGGCATAGAACCACAGCTCCGGATATTT  368

seq1  TCAGGAGTTTGAAGAATTGTATGTGTGGGATCACTGTGCATTCCCATGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAGTTTGAAGAATTGTATGTGTGGGATCACTGTGCATTCCCATGGT  418

seq1  CAGCAGCAACCGAGGGAGCTCTTTCTCTCCTCTGGTCCCTTCCGGCCCTC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCAACCGAGGGAGCTCTTTCTCTCCTCTGGTCCCTTCCGGCCCTC  468

seq1  ACTAGCCTGTTGGGATGGTTTGCTTTGAATCCGGCTTGTTCCCTGCTGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGCCTGTTGGGATGGTTTGCTTTGAATCCGGCTTGTTCCCTGCTGAG  518

seq1  GTAATGAACTTCTTATTTCTGTTCTGTACCTCCTTGGACTAGTCCAGCAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGAACTTCTTATTTCTGTTCTGTACCTCCTTGGACTAGTCCAGCAA  568

seq1  GTCTAAGTTCTAGGCTTACATGGCTGTTCTTACAGGCCACGGGCAACCAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAGTTCTAGGCTTACATGGCTGTTCTTACAGGCCACGGGCAACCAA  618

seq1  GGGCTGGCATACTCTTCTAAGGGACCCTCAAGAATGCCAGGGAAAGGCTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGCATACTCTTCTAAGGGACCCTCAAGAATGCCAGGGAAAGGCTT  668

seq1  GTCTGCAGAGGCTGCCCAAGAAGCCTTCATGGGCATAGGCTGTCCGTTTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAGAGGCTGCCCAAGAAGCCTTCATGGGCATAGGCTGTCCGTTTA  718

seq1  GATGGCCAGAGCCCGTCTGGCGACTGCTACCCTCTGAATGACGAATTCTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCCAGAGCCCGTCTGGCGACTGCTACCCTCTGAATGACGAATTCTG  768

seq1  CCGTTTTGTTTTGTTTTGTATTTTTTTTTTAACATAATGACCAGTCTCCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTTTGTTTTGTTTTGTATTTTTTTTTTAACATAATGACCAGTCTCCT  818

seq1  GAACAACACTAGCAAAGGCATTGCCCAGTCAACATGCAGTTAGAGCTGCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAACACTAGCAAAGGCATTGCCCAGTCAACATGCAGTTAGAGCTGCA  868

seq1  CAGATGTTTAGATAACAGTATACAGTTTGTGTTTTGTTTAGATGACATGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGTTTAGATAACAGTATACAGTTTGTGTTTTGTTTAGATGACATGA  918

seq1  GTCTTTGAGACATTGTTGGTTTGTGTCAATTGTGGTCACAATTTGGGCAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTGAGACATTGTTGGTTTGTGTCAATTGTGGTCACAATTTGGGCAT  968

seq1  ACACCAGGGCATCCCAGACCGCCAGGCTGGCTCCAAGGAAAAGTACTGTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAGGGCATCCCAGACCGCCAGGCTGGCTCCAAGGAAAAGTACTGTT  1018

seq1  TAACGGTAAAGCACCGTCCTGGTATGCTGATCTCCAAGTGCAGTGGGACC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACGGTAAAGCACCGTCCTGGTATGCTGATCTCCAAGTGCAGTGGGACC  1068

seq1  TAGCCTGCATGCCTCCCCCTTTTGACTTGTACCTCTGTCAGGGGGCCTCG  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTGCATGCCTCCCCCTTTTGACTTGTACCTCTGTCAGGGGGCCTCG  1118

seq1  GGGACCGTGTGCAGAATGCACACTGCTGAATTC  1182
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCGTGTGCAGAATGCACACTGCTGAATTC  1151

seq1: chr8_14812287_14813516
seq2: B6Ng01-164M08.g_67_1289

seq1  GAATTCCTAAGAAGGCACCCCCCCCTTTGTCAAATGGCATGGGAGGATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAGAAGGCACCCCCCCCTTTGTCAAATGGCATGGGAGGATGC  50

seq1  CTGCTTTGCAAGACAAATACCAGCTGTAGAAAGGGTTCTGTGGTTATCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTTGCAAGACAAATACCAGCTGTAGAAAGGGTTCTGTGGTTATCCC  100

seq1  CCGTCTGGAGTGGCACTCATGAGGAAAGTAAACATATTATGTAAGAAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTCTGGAGTGGCACTCATGAGGAAAGTAAACATATTATGTAAGAAAGC  150

seq1  CAAAGGATGGGATGCTGTCCAGAGTATGCCTGGTGCAGAGCTAGCACCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGATGGGATGCTGTCCAGAGTATGCCTGGTGCAGAGCTAGCACCAC  200

seq1  GTCTGGCCAGATGTTTGTTAGTCCCTAAACTTCATGAGGAACATAACTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGGCCAGATGTTTGTTAGTCCCTAAACTTCATGAGGAACATAACTCT  250

seq1  TTATAAATCCATGACACAGAGCCAACGTGGCTACACAGCTCATGGTGCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAATCCATGACACAGAGCCAACGTGGCTACACAGCTCATGGTGCAA  300

seq1  AGCCATCTGCTCAATAATTAATTCCCATCGTGCCTCGAGAACTGGGTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATCTGCTCAATAATTAATTCCCATCGTGCCTCGAGAACTGGGTGGA  350

seq1  TTTCCTCATCAGGTCTTTATTGGCAAGTGGCTTTGAAACTGGGAAGTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCATCAGGTCTTTATTGGCAAGTGGCTTTGAAACTGGGAAGTCCA  400

seq1  TGTGTCTTTCTTCCTTTAATAATCCTATTATTAATTTGGGACTGACTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTTTCTTCCTTTAATAATCCTATTATTAATTTGGGACTGACTGGA  450

seq1  CAGTAAGTCAGACCCTCACTTATCAGGGAAGCCAGCAAGGTCCCACATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGTCAGACCCTCACTTATCAGGGAAGCCAGCAAGGTCCCACATGC  500

seq1  CCGGTGCCTGCCAAAGGTTCGATGCAGTAGCATCTGGACTCTCCAGTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTGCCTGCCAAAGGTTCGATGCAGTAGCATCTGGACTCTCCAGTGTA  550

seq1  TCCTGAGATGGACAATTCACTAGCCCACTTTATTAACCATCTCTCTTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGATGGACAATTCACTAGCCCACTTTATTAACCATCTCTCTTCTC  600

seq1  TACTAGAATAAGAGCATTGTAAGGCAGAGATGTTTCTTGCAGCTGAACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGAATAAGAGCATTGTAAGGCAGAGATGTTTCTTGCAGCTGAACTT  650

seq1  GCAGTCACTGGAATTATTATATATTGTACATAGGAAACAGAGTATCAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCACTGGAATTATTATATATTGTACATAGGAAACAGAGTATCAAGT  700

seq1  ATATATTGTATAGAGATGTGCTAAGTTTTTGTAGATTTGTTTAATGAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTGTATAGAGATGTGCTAAGTTTTTGTAGATTTGTTTAATGAAAT  750

seq1  GGTGAATCAATGAATATATGATTGAATGAATAAAGGAATGAATGGTGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAATCAATGAATATATGATTGAATGAATAAAGGAATGAATGGTGAGT  800

seq1  CAATGAATTGTGATTGAATGAATGAATGAATGAATGCATTGGATTTCTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAATTGTGATTGAATGAATGAATGAATGAATGCATTGGATTTCTCT  850

seq1  GTCTCTGGGTGGACTTGCATAACCTGCAGGTCCTACGGGTTTTATAAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGGGTGGACTTGCATAACCTGCAGGTCCTACGGGTTTTATAAATG  900

seq1  AGTTTTCTGAGTGAGGAGAATAGGAGATGAGAGAAAAGAGAAGGAAAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
seq2  AGTTTTCTGAGTGAGGAGAATAGGAGATGAGAG-AAAGAGAA-GAAAAAG  948

seq1  AGAGGACAATCACGTCTTATCCTGTC-TGTAGCACCCAGCACCCAGTAGG  999
      ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
seq2  AGA-GAC-ATCACGTCTTATCCTGTCTTGTAGCACCCAGCACCAAGTA-G  995

seq1  CTGCCCTTGTATGTTAGGACTTGTGCACTGATAGGGTGCTCCTGTGTGTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTTGTATGTTAGGACTTGTGCACTGATA-GGTGCTCCTGTGTGTG  1044

seq1  GGCTTCTGTAAAAATTCTTAGTAGTTCATTATGAAATGTGTGTCTTTGTT  1099
      ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||
seq2  GGCCTCTGT-AAAATTCTTATTAG-TCATTATGAAAGGGTGGTCTTTGTT  1092

seq1  TCTGTATCCCCTGGAGTCACAAGCAGATTTCCTTAAATAAAG-ATAGCAT  1148
      ||   |||||  |||||||||  |  |||||||| ||||||| ||||   
seq2  TCCTGATCCCTGGGAGTCACAGCCGAATTTCCTT-AATAAAGAATAGACA  1141

seq1  TTGCAACATACCAAGAGCCAGCTGCT-AAATAGCACCGAAGCCCTCTGAT  1197
      |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||   ||  |||
seq2  TTGCAACATACCAAGAGCCA-CTGCTCTAATAG-ACCGAA--TCTTGGAT  1187

seq1  -TACACAGAAAATT-GCCACATTGG-CCCA-TACATC  1230
       ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||
seq2  ATAC-CAGAAAATTGGCCACATTGGACCCACTACATC  1223