BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-165H24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 10,429,146 - 10,576,422
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo16
Upstream geneTmem28, Lig4, Abhd13, Tnfsf13b
Downstream geneLOC100040008, LOC384782, LOC100040507, LOC665306, Irs2, Col4a1, Col4a2, Rab20, 0710008K08Rik, Cars2, Ing1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-165H24.bB6Ng01-165H24.g
ACCDH957542DH957543
length1,154943
definitionDH957542|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165H24, 5' end.DH957543|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165H24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,575,278 - 10,576,422)(10,429,146 - 10,430,086)
sequence
gaattcttgggtatttggagagagaaactatggtaatttgtgagatgaat
gtcaaaccacaaccaatgtctaggcattgaacaagtttccaaatactata
ggggacaaagagctctgtcctttgaatgggtcaatttggctactgatcaa
tttataaaacgccaaagaacatttcttagtgtaactgactaaagtatgag
gtttccaaacatcggagaattagaaacactcaaagtcgcagccacctctc
ccaagtacagataccttcgtttgatgcagggaagtcatgaagttagtgaa
aggactccttcttgttagagacatactatacctgtgggtatggggacagc
cacaggtctgttgagagaagaactgttgcccagttcctcttggaacttag
ttgtaagtggcgaccagctttctttgaggatacctatctcatctctccaa
aagacttcctcatttggacactgaggaaagtgtagtgttaatgcaagatg
gttccagaatgcaagggaacaatgctttctgtgcctaagagggaaacttc
tgtgtgaagggaggctgtggatgggtgcaggtcatagagaagattcatac
agcagtgaactgtgtgctgtctacagccttagaaatattcatgagccttg
gagctacctttcacaggcaccaaggagcatgcagacacccaagtacatca
ccacagagagcggcatctgggtggaaggaaaccagagcagccacggacaa
gacagcacaagatctatccatgggcaagaggccggggagatgcctcctat
tatttgaggtcaagatttgcatgaggcagactaattccgtgtggtgccaa
ctcattttgaatgtatcggattaacaacaataacattggaatttccgctt
caatttcacaccaccagtggagagtagcacttgcagacaaggagcatgag
taagcagacaccaatcctgctggtcagtcaaggaagcgggcgccatcttg
cttctcattgctaagcagtgtctaagggtaaagcattgtacctgtccaca
gaaagcatcaacgctttgtaaaatgatgaatcaagaataccgccgcctgc
ccttattttcctgcgtagaacacaagatggaaatgggggaactctggttg
ggag
gaattctcatccaataccctcctcctttgtccaagacagaatttctctgt
gtagctttgacaatcctggaattctccatgtagactaggctggtctcaaa
cgttgagacccacctatcaatgctgagattaaaggaatgagccaccatgc
ccacctcccatccaacttactcctaagccccaaggacattgcctcttggt
gtccaggagggaacggaagcagaatgggacatttctacctggatttgaaa
actgaactttgttgttcatttgtgactgtgagttgttgtcttcgtgaaag
tcgatgaaagtttgctggtttgtaaagcatcgttggtttgaggctttagc
tgtagatcatggtgagatgagtaagaagatgatagcaaaaggcaccatgg
gactggggagatgtctccagagtccagaggtccaagaatctactcaagtt
tatcactaaggaaacatttgatgttccacacttaaagactgaagatgatt
ttgacatttaatgtgcacctgagtttagtcacaaattttgctcattattt
tgttaacgttttaatggctgtgattgacaaagaagattatcaaataacat
cctaaagaagagcgacctggcactcaatctgtaattctaaatgcccattg
ccatgctcccctctgctcccctctccttccccctcccctttcctttcccc
tcccctgttctctagtctgtcctaaggtagaagtccttctcacctgaaag
ctcactctatgtccagagacaaattattgggagtgttctttgttattaag
gtgtccttcatcattctatgaggtcatttttgtgaatgtaggcgggaata
tagctgagtgggcctaaacatcttagacaaagaaagcaatatgttactag
ctccacctggacttggtagtcccctcagtgagctttggtttaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_10575278_10576422
seq2: B6Ng01-165H24.b_46_1199 (reverse)

seq1  CTCCCAACAAGA-TTCCCC--ATTCCATCTTGTCT--TACGCAGGAAAAT  45
      |||||||| ||| ||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||
seq2  CTCCCAACCAGAGTTCCCCCATTTCCATCTTGTGTTCTACGCAGGAAAAT  50

seq1  AAAGGCA-GCGGCGGTA-TCTTGATTCAACATTTTACAAAGCGTTGATGC  93
      || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCAGGCGGCGGTATTCTTGATTCATCATTTTACAAAGCGTTGATGC  100

seq1  -TTCTGT-GACAGGTACAATGCTGTACCC-TAGACACTGCTTAGCAATGA  140
       |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTGGACAGGTACAATGCTTTACCCTTAGACACTGCTTAGCAATGA  150

seq1  GAAGCAAGATGGCGCCCGCTTCC-TGGCTGACCAGCAGGATTGGTGTCTG  189
      ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAAGATGGCGCCCGCTTCCTTGACTGACCAGCAGGATTGGTGTCTG  200

seq1  CTTACTCATGCTCCTTGTCTGCAAGTGCCTACTCTCCACTGGTGGTGTGA  239
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTCATGCTCCTTGTCTGCAAGTG-CTACTCTCCACTGGTGGTGTGA  249

seq1  AATTTGAAGCGGAAATTCCAATGTTATTGTTGTTTAATCCGATACATTC-  288
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  AA-TTGAAGCGGAAATTCCAATGTTATTGTTG-TTAATCCGATACATTCA  297

seq1  AAATGAGTTGGCACCACACGGAATTAGTCTGCCTCATGCAAATCTTGACC  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGTTGGCACCACACGGAATTAGTCTGCCTCATGCAAATCTTGACC  347

seq1  TCAAATAATAGGAGGCATCTCCCCGGCCTCTTGCCCATGGATAGATCTTG  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATAATAGGAGGCATCTCCCCGGCCTCTTGCCCATGGATAGATCTTG  397

seq1  TGCTGTCTTGTCCGTGGCTGCTCTGGTTTCCTTCCACCCAGATGCCGCTC  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCTTGTCCGTGGCTGCTCTGGTTTCCTTCCACCCAGATGCCGCTC  447

seq1  TCTGTGGTGATGTACTTGGGTGTCTGCATGCTCCTTGGTGCCTGTGAAAG  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGTGATGTACTTGGGTGTCTGCATGCTCCTTGGTGCCTGTGAAAG  497

seq1  GTAGCTCCAAGGCTCATGAATATTTCTAAGGCTGTAGACAGCACACAGTT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCCAAGGCTCATGAATATTTCTAAGGCTGTAGACAGCACACAGTT  547

seq1  CACTGCTGTATGAATCTTCTCTATGACCTGCACCCATCCACAGCCTCCCT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTGTATGAATCTTCTCTATGACCTGCACCCATCCACAGCCTCCCT  597

seq1  TCACACAGAAGTTTCCCTCTTAGGCACAGAAAGCATTGTTCCCTTGCATT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACAGAAGTTTCCCTCTTAGGCACAGAAAGCATTGTTCCCTTGCATT  647

seq1  CTGGAACCATCTTGCATTAACACTACACTTTCCTCAGTGTCCAAATGAGG  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACCATCTTGCATTAACACTACACTTTCCTCAGTGTCCAAATGAGG  697

seq1  AAGTCTTTTGGAGAGATGAGATAGGTATCCTCAAAGAAAGCTGGTCGCCA  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTTTTGGAGAGATGAGATAGGTATCCTCAAAGAAAGCTGGTCGCCA  747

seq1  CTTACAACTAAGTTCCAAGAGGAACTGGGCAACAGTTCTTCTCTCAACAG  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAACTAAGTTCCAAGAGGAACTGGGCAACAGTTCTTCTCTCAACAG  797

seq1  ACCTGTGGCTGTCCCCATACCCACAGGTATAGTATGTCTCTAACAAGAAG  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGGCTGTCCCCATACCCACAGGTATAGTATGTCTCTAACAAGAAG  847

seq1  GAGTCCTTTCACTAACTTCATGACTTCCCTGCATCAAACGAAGGTATCTG  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCTTTCACTAACTTCATGACTTCCCTGCATCAAACGAAGGTATCTG  897

seq1  TACTTGGGAGAGGTGGCTGCGACTTTGAGTGTTTCTAATTCTCCGATGTT  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGGAGAGGTGGCTGCGACTTTGAGTGTTTCTAATTCTCCGATGTT  947

seq1  TGGAAACCTCATACTTTAGTCAGTTACACTAAGAAATGTTCTTTGGCGTT  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAACCTCATACTTTAGTCAGTTACACTAAGAAATGTTCTTTGGCGTT  997

seq1  TTATAAATTGATCAGTAGCCAAATTGACCCATTCAAAGGACAGAGCTCTT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAATTGATCAGTAGCCAAATTGACCCATTCAAAGGACAGAGCTCTT  1047

seq1  TGTCCCCTATAGTATTTGGAAACTTGTTCAATGCCTAGACATTGGTTGTG  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCTATAGTATTTGGAAACTTGTTCAATGCCTAGACATTGGTTGTG  1097

seq1  GTTTGACATTCATCTCACAAATTACCATAGTTTCTCTCTCCAAATACCCA  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGACATTCATCTCACAAATTACCATAGTTTCTCTCTCCAAATACCCA  1147

seq1  AGAATTC  1145
      |||||||
seq2  AGAATTC  1154

seq1: chr8_10429146_10430086
seq2: B6Ng01-165H24.g_68_1010

seq1  GAATTCTCATCCAATACCCTCCTCCTTTGTCCAAGACAGAATTTCTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATCCAATACCCTCCTCCTTTGTCCAAGACAGAATTTCTCTGT  50

seq1  GTAGCTTTGACAATCCTGGAATTCTCCATGTAGACTAGGCTGGTCTCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTTTGACAATCCTGGAATTCTCCATGTAGACTAGGCTGGTCTCAAA  100

seq1  CGTTGAGACCCACCTATCAATGCTGAGATTAAAGGAATGAGCCACCATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTGAGACCCACCTATCAATGCTGAGATTAAAGGAATGAGCCACCATGC  150

seq1  CCACCTCCCATCCAACTTACTCCTAAGCCCCAAGGACATTGCCTCTTGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTCCCATCCAACTTACTCCTAAGCCCCAAGGACATTGCCTCTTGGT  200

seq1  GTCCAGGAGGGAACGGAAGCAGAATGGGACATTTCTACCTGGATTTGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGAGGGAACGGAAGCAGAATGGGACATTTCTACCTGGATTTGAAA  250

seq1  ACTGAACTTTGTTGTTCATTTGTGACTGTGAGTTGTTGTCTTCGTGAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACTTTGTTGTTCATTTGTGACTGTGAGTTGTTGTCTTCGTGAAAG  300

seq1  TCGATGAAAGTTTGCTGGTTTGTAAAGCATCGTTGGTTTGAGGCTTTAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATGAAAGTTTGCTGGTTTGTAAAGCATCGTTGGTTTGAGGCTTTAGC  350

seq1  TGTAGATCATGGTGAGATGAGTAAGAAGATGATAGCAAAAGGCACCATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATCATGGTGAGATGAGTAAGAAGATGATAGCAAAAGGCACCATGG  400

seq1  GACTGGGGAGATGTCTCCAGAGTCCAGAGGTCCAAGAATCTACTCAAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGGGAGATGTCTCCAGAGTCCAGAGGTCCAAGAATCTACTCAAGTT  450

seq1  TATCACTAAGGAAACATTTGATGTTCCACACTTAAAGACTGAAGATGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACTAAGGAAACATTTGATGTTCCACACTTAAAGACTGAAGATGATT  500

seq1  TTGACATTTAATGTGCACCTGAGTTTAGTCACAAATTTTGCTCATTATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACATTTAATGTGCACCTGAGTTTAGTCACAAATTTTGCTCATTATTT  550

seq1  TGTTAACGTTTTAATGGCTGTGATTGACAAAGAAGATTATCAAATAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAACGTTTTAATGGCTGTGATTGACAAAGAAGATTATCAAATAACAT  600

seq1  CCTAAAGAAGAGCGACCTGGCACTCAATCTGTAATTCTAAATGCCCATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAAGAAGAGCGACCTGGCACTCAATCTGTAATTCTAAATGCCCATTG  650

seq1  CCATGCTCCCCTCTGCTCCCCTCTCCTTCCCCCTCCCCTT--CCTTCCCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||
seq2  CCATGCTCCCCTCTGCTCCCCTCTCCTTCCCCCTCCCCTTTCCTTTCCCC  700

seq1  TCCCCTGTTCTCTAGTCTGTCCTAAGGTAGAAGTCCTTCTCACCTGAAAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTGTTCTCTAGTCTGTCCTAAGGTAGAAGTCCTTCTCACCTGAAAG  750

seq1  CTCACTCTATGTCCAGAGACAAATTATTGGGAGTGTTCTTTGTTATTAAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTCTATGTCCAGAGACAAATTATTGGGAGTGTTCTTTGTTATTAAG  800

seq1  GTGTCCTTCATCATTCTATGAGGGCA-TTTTGTGAATGTAGGCGGGAATA  847
      ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCTTCATCATTCTATGAGGTCATTTTTGTGAATGTAGGCGGGAATA  850

seq1  TAGCTGAGTGGGTCTAAACATCTTAGAACAAAGAAAGCAATATGTTACTA  897
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGAGTGGGCCTAAACATCTTAG-ACAAAGAAAGCAATATGTTACTA  899

seq1  GCTTCACCCTGGACTT-GTAGTCCCCTCAGTGAGCTTTGGTTTAA  941
      ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCA-CCTGGACTTGGTAGTCCCCTCAGTGAGCTTTGGTTTAA  943