BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166E18
Chromosome8 (Build37)
Map Location 124,697,000 - 124,816,512
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm22, Zfpm1
Upstream gene1700018B08Rik, Fbxo31, Map1lc3b, Zcchc14, Jph3, Klhdc4, Slc7a5, BC048644, Car5a, Banp
Downstream geneTrhr2, 5830416A07Rik, Il17c, Cyba, Mvd, Snai3, Rnf166, 2310061F22Rik, Cdt1, Aprt, Galns, Trappc2l, Pabpnl1, Cbfa2t3h, C230057M02Rik, A530010L16Rik, BC021611, LOC100043225, Cdh15, Ankrd11, Spg7, Rpl13, Cpne7, Sult5a1, LOC100043251, Dpep1, Chmp1a, 4732415M23Rik, Cdk10, Spata2L, 1300018I17Rik, Zfp276, Fanca
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166E18.bB6Ng01-166E18.g
ACCDH958115DH958116
length1,088848
definitionDH958115|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166E18, 5' end.DH958116|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166E18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,815,418 - 124,816,512)(124,697,000 - 124,697,848)
sequence
gaattcaaggctctgcagactagactgcactgatccgtgggtaggactgg
gaaatcctgagcgtttgcccactctgtgcccaggccttcactttaaagcg
gagagaccaggtccctttatagaggtggggggttatatctgcaaacacct
cagaacatctaggtagctggaggctcaggtctggacagagcctctaggtc
agagtgcctcctgtgctgtgtgactttgagtcatcagaagagaagtgagg
gacaatgggaggacacggcgagaagcaggacaggcccaagggtacatcca
ccactcagtcaagacagctcccctcagcagggccagcactggggtcatca
tacctggggagacccaggatcccagggaaagttcctgccctcctcaggcc
ttcccttcccatctctgggattcctgagtttcagttctcaggaatgattt
catatacacaggactgggaaaagagctgaatgcccccacccccactgggc
ccaggagggcttgagaaggggttcctgccagtgtggccaggccaccatgc
caaggggtgtctggggctgacagaccctggtttctcttctcacacagcag
gtgcctcactcccccctggctgccttacctgtccctcagcaggaggatta
gcctggcgcagccctaatctcggcgcatcacaccatcagtgagaatctcg
gatcagctgaaggaggcagctttatccagacaagctcgcaatggcaccgg
agtcccatctgggtgccgcctgtcatgagaggcagctgggctgagctggg
agacacaatggctgtggacaggcttggggccccctgggcttccgagtgct
gcagggccctcacagctggtgggcgtggctttgctggggcacagtgacac
tgaactacctatggtctaaccaggcactgcagggcagcagacactcagta
aagctgcctggcaaggctgcagaggcaccatgtctgctgcgcaaacaggc
catgtgttacacagatctgcccaaggtgtgtgggtactgggagacgccat
cagttctggaagctgacctatggtctgggagttcctgt
gaattctttctccaatagaggtctgacaaggatgttctgagagcctcctt
atagcccccgcatgctcagagcaatggactctgtcttgtggtggacaggt
ggcacctggtgggaacctcagaccttgcattcggccagcccagaggcacg
gtggcgtcttgagaagccatagcgctctgcgcacaggacgcatctaactt
tgagaggaagacggctccagcagggtctggttttgatgagtctcagcccc
aggctgtctacttcacagagaaggccccttcctgcgtggatcttcccttg
cgacagcaatttcccttctactgcagctctggaaaccctgatgaggctag
ccagcctggaggctgccggtaatctcctgccagccactccagaccccaga
gaccccagatgctgagtgggagtatcctggcttcgcaggcacacgttcca
accatgggcgctgatggtcatgtacatacatactcaatgggaaggaaagg
gatgcttcacacagacaggaaaatggtgactatggtgtggctcattgttt
ggggccgtttatagcaagggtcatgtcagatgggttgaagtgactaagat
taacccgagcggtatgtatgctatgatcctgaacaccgcacagcttcaga
aggaccatgccaggccaaacagttccacatgaggtttattgggagagaga
ggggcaaggtggtggcagaaagagaagggaggaagagagagagagattag
gggggagcctttctttatttctgggtaatgatgtaacacagtaaaggtgg
gaggaggtagccaagtggatcctgggaatatggtggctggttgccttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_124815418_124816512
seq2: B6Ng01-166E18.b_46_1133 (reverse)

seq1  ACAGGGACTCCCAGACCATAGGGTCCAGCCTCCAGAACTGATGGCGTCTC  50
      ||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAACTCCCAGACCATAGG--TCAGCTTCCAGAACTGATGGCGTCTC  48

seq1  CCAGTACCCACACCACCTTGGGCAGATCTGTGTAACAACATGGCCTTGTT  100
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  CCAGTACCCACA-CACCTTGGGCAGATCTGTGTAAC-ACATGGCC-TGTT  95

seq1  TGCGCAGCAGACATGGTGCCTCTGCAGCCTTGCCAGGCAGCTTTACCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGCGCAGCAGACATGGTGCCTCTGCAGCCTTGCCAGGCAGCTTTA-CTGA  144

seq1  GTGTCCTGCTGCCCTGCAGTGCCTGGTTAGACCATAGGTAGTTCAGTGTC  200
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGT-CTGCTGCCCTGCAGTGCCTGGTTAGACCATAGGTAGTTCAGTGTC  193

seq1  ACTGTGCCCCAGCAAAGCCACGCCCACCAGCTGTGAGGGCCCTGCAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGCCCCAGCAAAGCCACGCCCACCAGCTGTGAGGGCCCTGCAGCAC  243

seq1  TCGGAAGCCCAGGGGGCCCCAAGCCTGTCCACAGCCATTGTGTCTCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGAAGCCCAGGGGGCCCCAAGCCTGTCCACAGCCATTGTGTCTCCCAG  293

seq1  CTCAGCCCAGCTGCCTCTCATGACAGGCGGCACCCAGATGGGACTCCGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCCAGCTGCCTCTCATGACAGGCGGCACCCAGATGGGACTCCGGT  343

seq1  GCCATTGCGAGCTTGTCTGGATAAAGCTGCCTCCTTCAGCTGATCCGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTGCGAGCTTGTCTGGATAAAGCTGCCTCCTTCAGCTGATCCGAGA  393

seq1  TTCTCACTGATGGTGTGATGCGCCGAGATTAGGGCTGCGCCAGGCTAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACTGATGGTGTGATGCGCCGAGATTAGGGCTGCGCCAGGCTAATC  443

seq1  CTCCTGCTGAGGGACAGGTAAGGCAGCCAGGGGGGAGTGAGGCACCTGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCTGAGGGACAGGTAAGGCAGCCAGGGGGGAGTGAGGCACCTGCT  493

seq1  GTGTGAGAAGAGAAACCAGGGTCTGTCAGCCCCAGACACCCCTTGGCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGAAGAGAAACCAGGGTCTGTCAGCCCCAGACACCCCTTGGCATG  543

seq1  GTGGCCTGGCCACACTGGCAGGAACCCCTTCTCAAGCCCTCCTGGGCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTGGCCACACTGGCAGGAACCCCTTCTCAAGCCCTCCTGGGCCCA  593

seq1  GTGGGGGTGGGGGCATTCAGCTCTTTTCCCAGTCCTGTGTATATGAAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGTGGGGGCATTCAGCTCTTTTCCCAGTCCTGTGTATATGAAATC  643

seq1  ATTCCTGAGAACTGAAACTCAGGAATCCCAGAGATGGGAAGGGAAGGCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTGAGAACTGAAACTCAGGAATCCCAGAGATGGGAAGGGAAGGCCT  693

seq1  GAGGAGGGCAGGAACTTTCCCTGGGATCCTGGGTCTCCCCAGGTATGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGGCAGGAACTTTCCCTGGGATCCTGGGTCTCCCCAGGTATGATG  743

seq1  ACCCCAGTGCTGGCCCTGCTGAGGGGAGCTGTCTTGACTGAGTGGTGGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAGTGCTGGCCCTGCTGAGGGGAGCTGTCTTGACTGAGTGGTGGAT  793

seq1  GTACCCTTGGGCCTGTCCTGCTTCTCGCCGTGTCCTCCCATTGTCCCTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCTTGGGCCTGTCCTGCTTCTCGCCGTGTCCTCCCATTGTCCCTCA  843

seq1  CTTCTCTTCTGATGACTCAAAGTCACACAGCACAGGAGGCACTCTGACCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTTCTGATGACTCAAAGTCACACAGCACAGGAGGCACTCTGACCT  893

seq1  AGAGGCTCTGTCCAGACCTGAGCCTCCAGCTACCTAGATGTTCTGAGGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTCTGTCCAGACCTGAGCCTCCAGCTACCTAGATGTTCTGAGGTG  943

seq1  TTTGCAGATATAACCCCCCACCTCTATAAAGGGACCTGGTCTCTCCGCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGATATAACCCCCCACCTCTATAAAGGGACCTGGTCTCTCCGCTT  993

seq1  TAAAGTGAAGGCCTGGGCACAGAGTGGGCAAACGCTCAGGATTTCCCAGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTGAAGGCCTGGGCACAGAGTGGGCAAACGCTCAGGATTTCCCAGT  1043

seq1  CCTACCCACGGATCAGTGCAGTCTAGTCTGCAGAGCCTTGAATTC  1095
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCCACGGATCAGTGCAGTCTAGTCTGCAGAGCCTTGAATTC  1088

seq1: chr8_124697000_124697848
seq2: B6Ng01-166E18.g_68_915

seq1  GAATTCTTTCTCCAATAGAGGTCTGACAAGGATGTTCTGAGAGCCTCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTCCAATAGAGGTCTGACAAGGATGTTCTGAGAGCCTCCTT  50

seq1  ATAGCCCCCGCATGCTCAGAGCAATGGACTCTGTCTTGTGGTGGACAGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCCCCGCATGCTCAGAGCAATGGACTCTGTCTTGTGGTGGACAGGT  100

seq1  GGCACCTGGTGGGAACCTCAGACCTTGCATTCGGCCAGCCCAGAGGCACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTGGTGGGAACCTCAGACCTTGCATTCGGCCAGCCCAGAGGCACG  150

seq1  GTGGCGTCTTGAGAAGCCATAGCGCTCTGCGCACAGGACGCATCTAACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCGTCTTGAGAAGCCATAGCGCTCTGCGCACAGGACGCATCTAACTT  200

seq1  TGAGAGGAAGACGGCTCCAGCAGGGTCTGGTTTTGATGAGTCTCAGCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGAAGACGGCTCCAGCAGGGTCTGGTTTTGATGAGTCTCAGCCCC  250

seq1  AGGCTGTCTACTTCACAGAGAAGGCCCCTTCCTGCGTGGATCTTCCCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTCTACTTCACAGAGAAGGCCCCTTCCTGCGTGGATCTTCCCTTG  300

seq1  CGACAGCAATTTCCCTTCTACTGCAGCTCTGGAAACCCTGATGAGGCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACAGCAATTTCCCTTCTACTGCAGCTCTGGAAACCCTGATGAGGCTAG  350

seq1  CCAGCCTGGAGGCTGCCGGTAATCTCCTGCCAGCCACTCCAGACCCCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTGGAGGCTGCCGGTAATCTCCTGCCAGCCACTCCAGACCCCAGA  400

seq1  GACCCCAGATGCTGAGTGGGAGTATCCTGGCTTCGCAGGCACACGTTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCAGATGCTGAGTGGGAGTATCCTGGCTTCGCAGGCACACGTTCCA  450

seq1  ACCATGGGCGCTGATGGTCATGTACATACATACTCAATGGGAAGGAAAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGGGCGCTGATGGTCATGTACATACATACTCAATGGGAAGGAAAGG  500

seq1  GATGCTTCACACAGACAGGAAAATGGTGACTATGGTGTGGCTCATTGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTCACACAGACAGGAAAATGGTGACTATGGTGTGGCTCATTGTTT  550

seq1  GGGGCCGTTTATAGCAAGGGTCATGTCAGATGGGTTGAAGTGACTAAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCGTTTATAGCAAGGGTCATGTCAGATGGGTTGAAGTGACTAAGAT  600

seq1  TAACCCGAGCGGTATGTATGCTATGATCCTGAACACCGCACAGCTTCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCGAGCGGTATGTATGCTATGATCCTGAACACCGCACAGCTTCAGA  650

seq1  AGGACCATGCCAGGCCAAACAGTTCCACATGAGGTTTATTGGGAGAGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCATGCCAGGCCAAACAGTTCCACATGAGGTTTATTGGGAGAGAGA  700

seq1  GGGGCAAGGTGGTGGCAGAAAGAGAAGGGAGGAAGAGAGAGAGAGATTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAAGGTGGTGGCAGAAAGAGAAGGGAGGAAGAGAGAGAGAGATTAG  750

seq1  GGGGGAGCCTTTCTTTATATCTGGGTAATGATGTAACACAGGTAAAGGTG  800
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGGGGAGCCTTTCTTTATTTCTGGGTAATGATGTAACACA-GTAAAGGTG  799

seq1  GGAGGAGGTAAGCCAAGTGGATTCTGGGAATATGGTGGCT-GTTGCCTTG  849
      ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGAGGAGGT-AGCCAAGTGGATCCTGGGAATATGGTGGCTGGTTGCCTTG  848