BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167B01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 129,219,963 - 129,372,359
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1, Slc35f3, LOC668434, 1810063B05Rik, EG619653, Irf2bp2
Downstream geneTomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1, Pard3, EG628847
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167B01.bB6Ng01-167B01.g
ACCDH958664DH958665
length656847
definitionDH958664|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167B01, 5' end.DH958665|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167B01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,219,963 - 129,220,652)(129,371,513 - 129,372,359)
sequence
gaattccctgggaacctgaggagatgggaaggtgagcaggtgtcaagacc
agcaggaacctgacatagagacacacacgtacacacacacacacacacac
acacacacacacacacactcaactgattaacaaatccttggggtggtaat
catagaatatgagaacatacaacatacttcaaaaagaaatctgggagaga
ggactcttgatattttcatcccaaagaaatgtctcctgattgaggacaca
aatacccatatctggatgtgagcaacacacaatatagacatgtattgagg
tgccatgggcactcataaatatgttaaagctttatgtgccaactatcaaa
tgcccaattttagcaaacacggtggcctgtgcctcattgaagccctctgg
atgctgagacctgaggactgtttccaatttgagcccagccttggtccgct
gtccatcccccatggcttacagggcagctgttccctctgtgacttccttt
aaaatcttggagacctgaaaatgggttatctctgtctgaggaaggaaatg
gcaggccactctgcatgactcttccagtgacacagttctgtctgtctgag
cactaagcctgagctacaagcacaggccactggggggaggggaaggagga
aatggc
gaattccttggagagtgctctttgcaaccaaacggaagaacaaaaggaca
attctcagaagcacaccaaaaacgaaaccaaataaaaaccccataaaaaa
tccctatggggtaaaggaaataccagtctgatgccttttgtgtcttgtgt
tgggtcataaagggcaggctctctaagaggtggtgtcaacagtggcaatg
tggcaatgtttggactccagagagaatgctctggaaaacaatagaaggtg
acacccacgtgtctatgtgactggcagccatcagggacagcctcatggcc
agggcatgtatggagcctgggagaggcactgggcaggaaggagctcaaag
tttgcacatggtcaccgagagctggcaactgggcttgtcccttctgggca
tgactgatgtcagaggatctctgacctccacttagtcactagataccagt
ctggaactctctttgaagatgaagtaaacactcacagtgctgataataac
agctgggtgatgtcacacggttatctgtagcttgaagagctgcacctggg
tgctggagtgactgacaggcatcagactttctgttccctcatgggccttc
tgcacgaggggccacagtttgggggcgtggttcagaggctgcttcaagga
tggagctgaggatgcggtgactttcactcttgtttcaggaggtgacaaca
tgccagggatggagctgtgctgtcaaccacagcagctgcgtgtggcctgt
ggctggcagctcggcctacatgggtacctgccatgaggcttgtgggagat
ttcggttttgctctgtggctttgagcagcagggaagccatggtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_129219963_129220652
seq2: B6Ng01-167B01.b_48_703

seq1  GAATTCCCTGGGAACCTGAGGAGATGGGAAGGTGAGCAGGTGTCAAGACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGGGAACCTGAGGAGATGGGAAGGTGAGCAGGTGTCAAGACC  50

seq1  AGCAGGAACCTGACATAGAGACACACACGTACACACACACACACACACAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGAACCTGACATAGAGACACACACGTACACACACACACACACACAC  100

seq1  ACACACACACACACACACTCAACTGATTAACAAATCCTTGGGGTGGTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACTCAACTGATTAACAAATCCTTGGGGTGGTAAT  150

seq1  CATAGAATATGAGAACATACAACATACTTCAAAAAGAAATCTGGGAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAATATGAGAACATACAACATACTTCAAAAAGAAATCTGGGAGAGA  200

seq1  GGACTCTTGATATTTTCATCCCAAAGAAATGTCTCCTGATTGAGGACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTTGATATTTTCATCCCAAAGAAATGTCTCCTGATTGAGGACACA  250

seq1  AATACCCATATCTGGATGTGAGCAACACACAATATAGACATGTATTGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCCATATCTGGATGTGAGCAACACACAATATAGACATGTATTGAGG  300

seq1  TGCCATGGGCACTCATAAATATGTTAAAGCTTTATGTGCCAACTATCAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGGGCACTCATAAATATGTTAAAGCTTTATGTGCCAACTATCAAA  350

seq1  TGCCCAATTTTAGCAAACACGGTGGCCTGTGCCTCATTGAAGCCCTCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAATTTTAGCAAACACGGTGGCCTGTGCCTCATTGAAGCCCTCTGG  400

seq1  ATGCTGAGACCTGAGGACTGTTTCCAATTTGAGCCCAGCCTTGGTCCGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGAGACCTGAGGACTGTTTCCAATTTGAGCCCAGCCTTGGTCCGCT  450

seq1  GTCCATCCCCCATGGCTTACAGGGCAGCTGTTCCCTCTGTGACTTCCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATCCCCCATGGCTTACAGGGCAGCTGTTCCCTCTGTGACTTCCTTT  500

seq1  AAAATCTTGGAGACCTGAAAATGGGTTATCTCTGTCTGAGGAAGGAAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTTGGAGACCTGAAAATGGGTTATCTCTGTCTGAGGAAGGAAATG  550

seq1  GCAGGCCACTCTGCATGACTCTTCCAGTGACACAGTTCTGTCTGTCTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCCACTCTGCATGACTCTTCCAGTGACACAGTTCTGTCTGTCTGAG  600

seq1  CACTAAGCCTGAGCTACAAGCACAGGCCACTGGGGGGAGGGGAAGGAGG-  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CACTAAGCCTGAGCTACAAGCACAGGCCACTGGGGGGAGGGGAAGGAGGA  650

seq1  AATGGCGGAGGGTGGGGATAAAGACGTCTTGAGTCAATGGC  690
      ||||||                                   
seq2  AATGGC-----------------------------------  656

seq1: chr8_129371513_129372359
seq2: B6Ng01-167B01.g_68_914 (reverse)

seq1  ACACACCATGGCTTCCCTGCTGCTCAAAGCCACAGAGCAGAACCGAAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACACACCATGGCTTCCCTGCTGCTCAAAGCCACAGAGCAAAACCGAAATC  50

seq1  TCCCACAAGCCTCATGGCAGGTACCCATGTAGGCCGAGCTGCCAGCCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACAAGCCTCATGGCAGGTACCCATGTAGGCCGAGCTGCCAGCCACA  100

seq1  GGCCACACGCAGCTGCTGTGGTTGACAGCACAGCTCCATCCCTGGCATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACACGCAGCTGCTGTGGTTGACAGCACAGCTCCATCCCTGGCATGT  150

seq1  TGTCACCTCCTGAAACAAGAGTGAAAGTCACCGCATCCTCAGCTCCATCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCTCCTGAAACAAGAGTGAAAGTCACCGCATCCTCAGCTCCATCC  200

seq1  TTGAAGCAGCCTCTGAACCACGCCCCCAAACTGTGGCCCCTCGTGCAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCAGCCTCTGAACCACGCCCCCAAACTGTGGCCCCTCGTGCAGAA  250

seq1  GGCCCATGAGGGAACAGAAAGTCTGATGCCTGTCAGTCACTCCAGCACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCATGAGGGAACAGAAAGTCTGATGCCTGTCAGTCACTCCAGCACCC  300

seq1  AGGTGCAGCTCTTCAAGCTACAGATAACCGTGTGACATCACCCAGCTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCAGCTCTTCAAGCTACAGATAACCGTGTGACATCACCCAGCTGTT  350

seq1  ATTATCAGCACTGTGAGTGTTTACTTCATCTTCAAAGAGAGTTCCAGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCAGCACTGTGAGTGTTTACTTCATCTTCAAAGAGAGTTCCAGACT  400

seq1  GGTATCTAGTGACTAAGTGGAGGTCAGAGATCCTCTGACATCAGTCATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATCTAGTGACTAAGTGGAGGTCAGAGATCCTCTGACATCAGTCATGC  450

seq1  CCAGAAGGGACAAGCCCAGTTGCCAGCTCTCGGTGACCATGTGCAAACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGGGACAAGCCCAGTTGCCAGCTCTCGGTGACCATGTGCAAACTT  500

seq1  TGAGCTCCTTCCTGCCCAGTGCCTCTCCCAGGCTCCATACATGCCCTGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCTTCCTGCCCAGTGCCTCTCCCAGGCTCCATACATGCCCTGGC  550

seq1  CATGAGGCTGTCCCTGATGGCTGCCAGTCACATAGACACGTGGGTGTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGGCTGTCCCTGATGGCTGCCAGTCACATAGACACGTGGGTGTCAC  600

seq1  CTTCTATTGTTTTCCAGAGCATTCTCTCTGGAGTCCAAACATTGCCACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTATTGTTTTCCAGAGCATTCTCTCTGGAGTCCAAACATTGCCACAT  650

seq1  TGCCACTGTTGACACCACCTCTTAGAGAGCCTGCCCTTTATGACCCAACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTGTTGACACCACCTCTTAGAGAGCCTGCCCTTTATGACCCAACA  700

seq1  CAAGACACAAAAGGCATCAGACTGGTATTTCCTTTACCCCATAGGGATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACACAAAAGGCATCAGACTGGTATTTCCTTTACCCCATAGGGATTT  750

seq1  TTTATGGGGTTTTTATTTGGTTTCGTTTTTGGTGTGCTTCTGAGAATTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGGGGTTTTTATTTGGTTTCGTTTTTGGTGTGCTTCTGAGAATTGT  800

seq1  CCTTTTGTTCTTCCGTTTGGTTGCAAAGAGCACTCTCCAAGGAATTC  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTTCTTCCGTTTGGTTGCAAAGAGCACTCTCCAAGGAATTC  847