BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169P24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 55,921,728 - 56,090,751
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGpm6a
Upstream geneVegfc, Spcs3, Asb5, Spata4, Wdr17
Downstream geneLOC667624, LOC100040156, LOC100040382, LOC100040392, EG546212
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169P24.bB6Ng01-169P24.g
ACCDH960826DH960827
length1,1241,096
definitionDH960826|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169P24, 5' end.DH960827|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,089,625 - 56,090,751)(55,921,728 - 55,922,822)
sequence
gaattcagtgtatctgtttgaactcttgtgatcattgtatctcatgtata
tattttattacaaattaatatgtcatggcttttaaagaaaattcaacata
tgtatgttatttttacaatataaattgattctcctggaaattatactcac
aacagtattttttaatataatttatctgagttgtttacaaaactttgatt
cagaataagctgcaataaagggatccaaactcttgaaaaattcatacttt
tatgacttcctgaatgttatgcatttttcttactttatctagagtagtcc
tttaggactcctcttttcaatttaaaattttaagtgcacataaccctctg
aagcccaagaaatcctaacccgcaggagatctaaggaacatacttttgtt
taaagacaagctcacaacttggtaaagattagtaaatagttttaatagaa
atgcagttacaaaaccaattgttcatattttcgagaactgtcctttaggc
atgggagagagtatcaatgttaaagaaagtgtttgatgattacaccacac
tggactgggatggtatatatgaaaagatctgcgatgacaactaacaatgg
actcacttatggggactttattatgaaatagctgtcagaaggatgcatta
gaaaaaaatgtatgccaaaattaaaatgacattctacttaaatatagaaa
caatagagttgaattgttaacatttatcacttttccttaaatgtttaaat
gaacaatttaacagggcttacaatatgatattatgctctatgtttaatca
gaggaagagttatctccatgtcgattattatttaaagtataaggatcaac
acactgatatatttttaaattatttgctatatatttcaaagctaaatata
aacgtacatgtttcaaagcaatgtagagttaaattatagaacatatactt
gctgtatttagttttctatactccaaactctcattaagtactttaatcct
atttattgctacttattttaatgtattttatccataaaccacattaccaa
gtatgtatacaaagtcatgatttgtgaatacaatctacaatctatatcag
gctaaataaggaatcattccctat
gaattctttgcttaaatttcttgctctgtcattttcttccttcagccttt
tgaaagcctgcatatttataagcgtgctcccttgatcataattctaaaga
actccatgctctctaaatgtaataacaattcagatttgctcagtctgcta
gtctgtgtgaatgcgttgaaggaacaatatattataatctattatcaatg
tatggtaggggattataataaaatggttaggcagtttatagatcattctg
tttataacagactttttaaaataaatagatttttaaaaaaatagctcatc
attgatttattcaggctttttccttttgcactaatccttcctttcacttg
ttaccatagttactggtttaatcatgatgcacagaaccatttctaattac
agtaggtgccagcacaaaaaattaattcattgcatatcttaggccacaaa
cagcttgtagcttgttttttggttctttagtcacacatattctgaaaaag
acatgtgtacataattttaaacatgttattatctgctgtttgttattaaa
atgaaaatctttaatgtggctggagttagaataaccaataaaacaaattc
taagggataaagatgattggaagtgagatattgtccttaatgtgccaacc
gcaatgcattggatcctttctcctcagctgttaacctctagaagtcaaaa
gtactagatgattgtaactaagcgtttgaggcaggattcactatttaagc
actaaaactgattcccagaatatggatgtttctttccttttggtttttaa
agcatcttgtatatcacttagcacactctggtttatttactggatttaaa
ctcttactggagtcaagagacttttccagtgtcattcaatgatatggtgg
atgaggaacaatgagacctcatagcatttatttcttagaacttgagtaca
gatataggtcaaacagccctaaaatgtagactttcctattcatttcctta
tccactttggtaagtgaccaactattatgtaatacaaaattcaaccatag
atggtagattacattatttactctgcctctttattttaccgggttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_56089625_56090751
seq2: B6Ng01-169P24.b_47_1170 (reverse)

seq1  ATAGGG-ATGAATACTTAATTAGGCTGATATAGATTGTAGATTGTATTCA  49
      |||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGAATGATTCCTTATTTAGCCTGATATAGATTGTAGATTGTATTCA  50

seq1  CAAATCATGACTTTGTATACATACTTGGTTAATGTTGGTTTATGGATAAA  99
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  CAAATCATGACTTTGTATACATACTTGG-TAATG-TGGTTTATGGATAAA  98

seq1  ATACATTAAAATAAGTAGCAATAAATAGGAATAAAGTACTAAATGAAGAA  149
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |
seq2  ATACATTAAAATAAGTAGCAATAAATAGGATTAAAGTACTTAATGA--GA  146

seq1  GTTTGGAGTATAGAAAACTAAATACAGCAAGTATATGTTCTATAATTTAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGAGTATAGAAAACTAAATACAGCAAGTATATGTTCTATAATTTAA  196

seq1  CTCTACATTGCTTTGAAACATGTACGTTTATATTTAGCTTTGAAATATAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACATTGCTTTGAAACATGTACGTTTATATTTAGCTTTGAAATATAT  246

seq1  AGCAAATAATTTAAAAATATATCAGTGTGTTGATCCTTATACTTTAAATA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAATAATTTAAAAATATATCAGTGTGTTGATCCTTATACTTTAAATA  296

seq1  ATAATCGACATGGAGATAACTCTTCCTCTGATTAAACATAGAGCATAATA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCGACATGGAGATAACTCTTCCTCTGATTAAACATAGAGCATAATA  346

seq1  TCATATTGTAAGCCCTGTTAAATTGTTCATTTAAACATTTAAGGAAAAGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTGTAAGCCCTGTTAAATTGTTCATTTAAACATTTAAGGAAAAGT  396

seq1  GATAAATGTTAACAATTCAACTCTATTGTTTCTATATTTAAGTAGAATGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATGTTAACAATTCAACTCTATTGTTTCTATATTTAAGTAGAATGT  446

seq1  CATTTTAATTTTGGCATACATTTTTTTCTAATGCATCCTTCTGACAGCTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAATTTTGGCATACATTTTTTTCTAATGCATCCTTCTGACAGCTA  496

seq1  TTTCATAATAAAGTCCCCATAAGTGAGTCCATTGTTAGTTGTCATCGCAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAATAAAGTCCCCATAAGTGAGTCCATTGTTAGTTGTCATCGCAG  546

seq1  ATCTTTTCATATATACCATCCCAGTCCAGTGTGGTGTAATCATCAAACAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTCATATATACCATCCCAGTCCAGTGTGGTGTAATCATCAAACAC  596

seq1  TTTCTTTAACATTGATACTCTCTCCCATGCCTAAAGGACAGTTCTCGAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTAACATTGATACTCTCTCCCATGCCTAAAGGACAGTTCTCGAAA  646

seq1  ATATGAACAATTGGTTTTGTAACTGCATTTCTATTAAAACTATTTACTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAACAATTGGTTTTGTAACTGCATTTCTATTAAAACTATTTACTAA  696

seq1  TCTTTACCAAGTTGTGAGCTTGTCTTTAAACAAAAGTATGTTCCTTAGAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACCAAGTTGTGAGCTTGTCTTTAAACAAAAGTATGTTCCTTAGAT  746

seq1  CTCCTGCGGGTTAGGATTTCTTGGGCTTCAGAGGGTTATGTGCACTTAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCGGGTTAGGATTTCTTGGGCTTCAGAGGGTTATGTGCACTTAAA  796

seq1  ATTTTAAATTGAAAAGAGGAGTCCTAAAGGACTACTCTAGATAAAGTAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAATTGAAAAGAGGAGTCCTAAAGGACTACTCTAGATAAAGTAAG  846

seq1  AAAAATGCATAACATTCAGGAAGTCATAAAAGTATGAATTTTTCAAGAGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATGCATAACATTCAGGAAGTCATAAAAGTATGAATTTTTCAAGAGT  896

seq1  TTGGATCCCTTTATTGCAGCTTATTCTGAATCAAAGTTTTGTAAACAACT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATCCCTTTATTGCAGCTTATTCTGAATCAAAGTTTTGTAAACAACT  946

seq1  CAGATAAATTATATTAAAAAATACTGTTGTGAGTATAATTTCCAGGAGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATAAATTATATTAAAAAATACTGTTGTGAGTATAATTTCCAGGAGAA  996

seq1  TCAATTTATATTGTAAAAATAACATACATATGTTGAATTTTCTTTAAAAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTATATTGTAAAAATAACATACATATGTTGAATTTTCTTTAAAAG  1046

seq1  CCATGACATATTAATTTGTAATAAAATATATACATGAGATACAATGATCA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGACATATTAATTTGTAATAAAATATATACATGAGATACAATGATCA  1096

seq1  CAAGAGTTCAAACAGATACACTGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTTCAAACAGATACACTGAATTC  1124

seq1: chr8_55921728_55922822
seq2: B6Ng01-169P24.g_70_1165

seq1  GAATTCTTTGCTTAAATTTCTTGCTCTGTCATTTTCTTCCTTCAGCCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCTTAAATTTCTTGCTCTGTCATTTTCTTCCTTCAGCCTTT  50

seq1  TGAAAGCCTGCATATTTATAAGCGTGCTCCCTTGATCATAATTCTAAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGCCTGCATATTTATAAGCGTGCTCCCTTGATCATAATTCTAAAGA  100

seq1  ACTCCATGCTCTCTAAATGTAATAACAATTCAGATTTGCTCAGTCTGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCATGCTCTCTAAATGTAATAACAATTCAGATTTGCTCAGTCTGCTA  150

seq1  GTCTGTGTGAATGCGTTGAAGGAACAATATATTATAATCTATTATCAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTGAATGCGTTGAAGGAACAATATATTATAATCTATTATCAATG  200

seq1  TATGGTAGGGGATTATAATAAAATGGTTAGGCAGTTTATAGATCATTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTAGGGGATTATAATAAAATGGTTAGGCAGTTTATAGATCATTCTG  250

seq1  TTTATAACAGACTTTTTAAAATAAATAGATTTTTAAAAAAATAGCTCATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAACAGACTTTTTAAAATAAATAGATTTTTAAAAAAATAGCTCATC  300

seq1  ATTGATTTATTCAGGCTTTTTCCTTTTGCACTAATCCTTCCTTTCACTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTTATTCAGGCTTTTTCCTTTTGCACTAATCCTTCCTTTCACTTG  350

seq1  TTACCATAGTTACTGGTTTAATCATGATGCACAGAACCATTTCTAATTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCATAGTTACTGGTTTAATCATGATGCACAGAACCATTTCTAATTAC  400

seq1  AGTAGGTGCCAGCACAAAAAATTAATTCATTGCATATCTTAGGCCACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGTGCCAGCACAAAAAATTAATTCATTGCATATCTTAGGCCACAAA  450

seq1  CAGCTTGTAGCTTGTTTTTTGGTTCTTTAGTCACACATATTCTGAAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTGTAGCTTGTTTTTTGGTTCTTTAGTCACACATATTCTGAAAAAG  500

seq1  ACATGTGTACATAATTTTAAACATGTTATTATCTGCTGTTTGTTATTAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGTACATAATTTTAAACATGTTATTATCTGCTGTTTGTTATTAAA  550

seq1  ATGAAAATCTTTAATGTGGCTGGAGTTAGAATAACCAATAAAACAAATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAATCTTTAATGTGGCTGGAGTTAGAATAACCAATAAAACAAATTC  600

seq1  TAAGGGATAAAGATGATTGGAAGTGAGATATTGTCCTTAATGTGCCAACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGGATAAAGATGATTGGAAGTGAGATATTGTCCTTAATGTGCCAACC  650

seq1  GCAATGCATTGGATCCTTTCTCCTCAGCTGTTAACCTCTAGAAGTCAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGCATTGGATCCTTTCTCCTCAGCTGTTAACCTCTAGAAGTCAAAA  700

seq1  GTACTAGATGATTGTAACTAAGCGTTTGAGGCAGGATTCACTATTTAAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTAGATGATTGTAACTAAGCGTTTGAGGCAGGATTCACTATTTAAGC  750

seq1  ACTAAAACTGATTCCCAGAATATGGATGTTTCTTTCCTTTTGGTTTTTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAACTGATTCCCAGAATATGGATGTTTCTTTCCTTTTGGTTTTTAA  800

seq1  AGCATCTTGTATATCACTTAGCACACTCTGGTTTATTTACTGGATTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTTGTATATCACTTAGCACACTCTGGTTTATTTACTGGATTTAAA  850

seq1  CTCTTACTGGAGTCAAGAGACTTTTCCAGTGTCATTCAATGATATGGTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTACTGGAGTCAAGAGACTTTTCCAGTGTCATTCAATGATATGGTGG  900

seq1  ATGAGGAACAATGAGACCTCATAGCATTTATTCTATAAGAACTTGGAGTA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||
seq2  ATGAGGAACAATGAGACCTCATAGCATTTATT-TCTTAGAACTT-GAGTA  948

seq1  CAGATATAGTCAAAACAGCCATAAAATGTAGACATTCCTATTCATTTCCT  1000
      |||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CAGATATAGGTCAAACAGCCCTAAAATGTAGACTTTCCTATTCATTTCCT  998

seq1  TAT-CACTTT-GTAAGTGAACAACTATTATGTAATACAAAAATCAACAAA  1048
      ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |
seq2  TATCCACTTTGGTAAGTGACCAACTATTATGTAATACAAAATTCAAC-CA  1047

seq1  TAGATGGTAGATTACAATTATTTAC-CTGCATC-TTATTTTACAGGTTT-  1095
      ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || || 
seq2  TAGATGGTAGATTAC-ATTATTTACTCTGCCTCTTTATTTTACCGGGTTT  1096