BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170E03
Chromosome8 (Build37)
Map Location 75,345,174 - 75,503,614
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLarge
Upstream geneLOC385024, LOC675190, Zfp709, LOC670453, Zfp617, BC049349, Cyp4f18, LOC666033, Olfr372, Olfr373, Olfr374, Tpm4, Rab8a, Hsh2d, Cib3, 2510049I19Rik, Ap1m1, LOC384840, LOC100042405, Klf2, Eps15l1, Calr3, LOC100042421, 1700030K09Rik, Cherp, Slc35e1, Crsp7, LOC100042439, 9130011J15Rik, Tmem38a, Nwd1, Sin3b, F2rl3
Downstream geneLOC100039001, LOC666134, Crry-ps, LOC666146
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170E03.bB6Ng01-170E03.g
ACCDH961017DH961018
length1,1411,107
definitionDH961017|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E03, 5' end.DH961018|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,345,174 - 75,346,327)(75,502,496 - 75,503,614)
sequence
gaattcaatacacacactcacaccacaacctaaagactgcctggggaacc
ttctgtctactgttgttccagcagacactgggtcacagggtctagccata
ccaggcaacctcaagctctgagcagtgtcttcaaacttgatatgtgccag
agcaatgtgaggaactagttttaacagcagggtttatggctcgggatgag
agctgagactatattgacaagaaggtcccagacaacttggccatacatac
tctgagcaccatgttcctggaggatgcagagaggtacagaagcttctcat
gccagacgtggtgaagaggaggtctctttggagagcaggtgacaaaagca
atttctcagagggaaagtctgtaacttagcacttggtatggtggtctgca
agctgctcgccagagcagtaatcatggatacagcaggcctagagatatgg
ccttgaaatgagctctcacatcacctggggtagcagaaagaacaccttgg
acatttgataggtatttggctactgagctatagtaactgtgggagactca
gatgaaagtttggcttcaaatctcgatttccagcactgatttgtgatttt
ttatgttttcaaacaagaattgatatgaaaatcaagggcttgtcagcagc
ccaatgctatttcagttaagaagacaggcttggtggttcctcaggttcta
ccactcatcagccatgtgtcactgagcagattatttcattactcacatta
gtgtttccactgcagaaaaaaaaatggaattcactttatgttgttgtcag
gattatgttcatcccaatgcttggttcatacaaagcatgcaatttatggg
aagtagaaagctttgggttggggagaggaattattctaggttcctttttc
agagtctaaacggaagatggaggctgaagacgcgctttgctccacagaca
ctctcaactcccataaaattataagatgcatgaacttgatgccatggaat
gatatcattacccataacagtttaaaaataccttcagagattttgtagta
tcctgtacaacccagctgtaagctttaaatacttgtgcccatttagctgt
acaatggcatttcttttactcgaaggggaggaggtcactat
gaattcaagtctcaccattgcacaagaagcactttacccactgagacatc
ttcccagacccccaaatctttggcactccatggatgaacatatagtgacc
agaaattccctgcccacatgtaaccattttttaaaacaaagcttcagttt
gttcttgttcataaatagtatattttatataactgaatatcacacatggc
cagccatcaagataccactgtagtgccctccgctttctagaatgtttcta
aacttgaaagtaaggtggagcaacaatagtaatgataagtgtatatggca
catgtcagaagtgttgtcgtaagaaacacaagccctgtgtgctgctttgt
tggtggaccctgtgttctctgctctgcaaagagagattctgaggcccaaa
agacactctgcccaaggaagacttaacagctcaggtgggactactggtgt
gcacttgagttttgacgagatgaggctctattgtttttgttttttttttt
tttcaaagtctctgtgaaaatatgtagttaacataaaataaaagagagaa
atggagacaagaatggaatatatctgagtttgttcagcagaagagactaa
aatggaatcattttgtggctccagtaggcatttctggagtcagagagctc
atgggaggactgccactgagatgccaggcttgtgggcattgaaatccaag
agtgtgttcttcatattcttggagagtgatggggataatgacaagttacc
tcctttatatttccatattttcaaatgagatctgttcttatgtgaccaga
tacactatgcatgaacctacatactgagtacctactgtttattagttatt
agctaagggaggggatcagctctggtcaggctaagagcagagaatttcag
attttcagaaaacaaggcaaaattgcatcattaagacacatgattttgac
agtaatagtcacaatgtctactgacagcaacatccacattcttggtggat
gtctgaacaacccaagcagaagggataggagaaggccctctggtctgtca
ggagaacactccttctcaagtaggacaaaatcatggtcatttcttaattc
ttatcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_75345174_75346327
seq2: B6Ng01-170E03.b_49_1189

seq1  GAATTCAATACACACACTCACACCACAACCTAAAGACTGCCTGGGGAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATACACACACTCACACCACAACCTAAAGACTGCCTGGGGAACC  50

seq1  TTCTGTCTACTGTTGTTCCAGCAGACACTGGGTCACAGGGTCTAGCCATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTACTGTTGTTCCAGCAGACACTGGGTCACAGGGTCTAGCCATA  100

seq1  CCAGGCAACCTCAAGCTCTGAGCAGTGTCTTCAAACTTGATATGTGCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAACCTCAAGCTCTGAGCAGTGTCTTCAAACTTGATATGTGCCAG  150

seq1  AGCAATGTGAGGAACTAGTTTTAACAGCAGGGTTTATGGCTCGGGATGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATGTGAGGAACTAGTTTTAACAGCAGGGTTTATGGCTCGGGATGAG  200

seq1  AGCTGAGACTATATTGACAAGAAGGTCCCAGACAACTTGGCCATACATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGACTATATTGACAAGAAGGTCCCAGACAACTTGGCCATACATAC  250

seq1  TCTGAGCACCATGTTCCTGGAGGATGCAGAGAGGTACAGAAGCTTCTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGCACCATGTTCCTGGAGGATGCAGAGAGGTACAGAAGCTTCTCAT  300

seq1  GCCAGACGTGGTGAAGAGGAGGTCTCTTTGGAGAGCAGGTGACAAAAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGACGTGGTGAAGAGGAGGTCTCTTTGGAGAGCAGGTGACAAAAGCA  350

seq1  ATTTCTCAGAGGGAAAGTCTGTAACTTAGCACTTGGTATGGTGGTCTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCAGAGGGAAAGTCTGTAACTTAGCACTTGGTATGGTGGTCTGCA  400

seq1  AGCTGCTCGCCAGAGCAGTAATCATGGATACAGCAGGCCTAGAGATATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCTCGCCAGAGCAGTAATCATGGATACAGCAGGCCTAGAGATATGG  450

seq1  CCTTGAAATGAGCTCTCACATCACCTGGGGTAGCAGAAAGAACACCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAAATGAGCTCTCACATCACCTGGGGTAGCAGAAAGAACACCTTGG  500

seq1  ACATTTGATAGGTATTTGGCTACTGAGCTATAGTAACTGTGGGAGACTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGATAGGTATTTGGCTACTGAGCTATAGTAACTGTGGGAGACTCA  550

seq1  GATGAAAGTTTGGCTTCAAATCTCGATTTCCAGCACTGATTTGTGATTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAAGTTTGGCTTCAAATCTCGATTTCCAGCACTGATTTGTGATTTT  600

seq1  TTATGTTTTCAAACAAGAATTGATATGAAAATCAAGGGCTTGTCAGCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTTTTCAAACAAGAATTGATATGAAAATCAAGGGCTTGTCAGCAGC  650

seq1  CCAATGCTATTTCAGTTAAGAAGACAGGCTTGGTGGTTCCTCAGGTTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGCTATTTCAGTTAAGAAGACAGGCTTGGTGGTTCCTCAGGTTCTA  700

seq1  CCACTCATCAGCCATGTGTCACTGAGCAGATTATTTCATTACTCACATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCATCAGCCATGTGTCACTGAGCAGATTATTTCATTACTCACATTA  750

seq1  GTGTTTCCACTGCAGAAAAAAAAATGGAATTCACTTTATGTTGTTGTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCCACTGCAGAAAAAAAAATGGAATTCACTTTATGTTGTTGTCAG  800

seq1  GATTATGTTCATCCCAATGCTTGGTTCATACAAAGCATGCAATTTATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTATGTTCATCCCAATGCTTGGTTCATACAAAGCATGCAATTTATGGG  850

seq1  AAGTAGAAAGCTTTGGGTTGGGGAGAGGAATTATTCTAGGTTCCTTTTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGAAAGCTTTGGGTTGGGGAGAGGAATTATTCTAGGTTCCTTTTTC  900

seq1  AGAGTCCTAAACGGAAGATGGAGGCTGAAGATTGAGTCCTTGCTCCACCA  950
      ||||| |||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| ||
seq2  AGAGT-CTAAACGGAAGATGGAGGCTGAAGA-CGCG-CTTTGCTCCA-CA  946

seq1  GACACTCTCAACTCCCCATAAAATATAAAGATGCATGAACTTGATGCCAT  1000
      ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTCTCAACT-CCCATAAAATTATAAGATGCATGAACTTGATGCCAT  995

seq1  GGAATGAATATCATTACCCATAAACAGTTTAAAAATACCTTTCAGAGGAT  1050
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |
seq2  GGAATG-ATATCATTACCCAT-AACAGTTTAAAAATACC-TTCAGAGATT  1042

seq1  TTGTAGTAT-CTGTACAACCCAGCTGTTATGCTTAAAATACTTGTGCCCA  1099
      ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| 
seq2  TTGTAGTATCCTGTACAACCCAGCTG-TAAGCTTTAAATACTTGTGCCC-  1090

seq1  ATTTAGGCTGTACAAAATTGCATTCTTTTTACTCAGAGGGAGGAGG-GGT  1148
      ||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||  |||  ||||| |||
seq2  ATTTA-GCTGTAC--AATGGCATTTCTTTTACTCGAAGG--GGAGGAGGT  1135

seq1  CACTAT  1154
      ||||||
seq2  CACTAT  1141

seq1: chr8_75502496_75503614
seq2: B6Ng01-170E03.g_70_1176 (reverse)

seq1  GTGATAAAGAATTAAGAAAATGACCCATGATTTTGTCCTAACTTTAGAAA  50
      ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| 
seq2  GTGAT-AAGAATTAAG-AAATGA-CCATGATTTTGTCCT-ACTTGAGAAG  46

seq1  GAGTTGTTCTTTCTTGACAGAGCAGATGTGCCTCTCCTATTCCATCCTGC  100
      ||| |||||  || ||||||| |||| |  | ||||||| ||| | ||||
seq2  GAG-TGTTC--TCCTGACAGACCAGAGGGCCTTCTCCTA-TCCCTTCTGC  92

seq1  TTTGTGTTTGTTCAGAACAT-CACCAAGAATGTGGATGTTGCTGTCAGTA  149
      ||   | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TT--GGGTTGTTCAG-ACATCCACCAAGAATGTGGATGTTGCTGTCAGTA  139

seq1  GACATTGTGACTATTACTGTCAAAATCATGTGTCCTTAATGATGCAATTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GACATTGTGACTATTACTGTCAAAATCATGTGT-CTTAATGATGCAATTT  188

seq1  TGCCTTGTTTTCTGAAATTCTGAAATTCTCCTGCTCTTAGCCTGACCAGA  249
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTGTTTTCTGAAAATCTGAAATTCT-CTGCTCTTAGCCTGACCAGA  237

seq1  GCTGATCCCCTCCCTTAGCTAATAACTAATAAACAGTAGGTACTCAGTAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATCCCCTCCCTTAGCTAATAACTAATAAACAGTAGGTACTCAGTAT  287

seq1  GTAGGTTCATGCATAGTGTATCTGGTCACATAAGAACAGATCTCATTTGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTTCATGCATAGTGTATCTGGTCACATAAGAACAGATCTCATTTGA  337

seq1  AAATATGGAAATATAAAGGAGGTAACTTGTCATTATCCCCATCACTCTCC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGGAAATATAAAGGAGGTAACTTGTCATTATCCCCATCACTCTCC  387

seq1  AAGAATATGAAGAACACACTCTTGGATTTCAATGCCCACAAGCCTGGCAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATATGAAGAACACACTCTTGGATTTCAATGCCCACAAGCCTGGCAT  437

seq1  CTCAGTGGCAGTCCTCCCATGAGCTCTCTGACTCCAGAAATGCCTACTGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGGCAGTCCTCCCATGAGCTCTCTGACTCCAGAAATGCCTACTGG  487

seq1  AGCCACAAAATGATTCCATTTTAGTCTCTTCTGCTGAACAAACTCAGATA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACAAAATGATTCCATTTTAGTCTCTTCTGCTGAACAAACTCAGATA  537

seq1  TATTCCATTCTTGTCTCCATTTCTCTCTTTTATTTTATGTTAACTACATA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCATTCTTGTCTCCATTTCTCTCTTTTATTTTATGTTAACTACATA  587

seq1  TTTTCACAGAGACTTTGAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAATAGAGCCTCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCACAGAGACTTTGAAAAAAAAAAAAAACAAAAACAATAGAGCCTCA  637

seq1  TCTCGTCAAAACTCAAGTGCACACCAGTAGTCCCACCTGAGCTGTTAAGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGTCAAAACTCAAGTGCACACCAGTAGTCCCACCTGAGCTGTTAAGT  687

seq1  CTTCCTTGGGCAGAGTGTCTTTTGGGCCTCAGAATCTCTCTTTGCAGAGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTGGGCAGAGTGTCTTTTGGGCCTCAGAATCTCTCTTTGCAGAGC  737

seq1  AGAGAACACAGGGTCCACCAACAAAGCAGCACACAGGGCTTGTGTTTCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACACAGGGTCCACCAACAAAGCAGCACACAGGGCTTGTGTTTCTT  787

seq1  ACGACAACACTTCTGACATGTGCCATATACACTTATCATTACTATTGTTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACAACACTTCTGACATGTGCCATATACACTTATCATTACTATTGTTG  837

seq1  CTCCACCTTACTTTCAAGTTTAGAAACATTCTAGAAAGCGGAGGGCACTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACCTTACTTTCAAGTTTAGAAACATTCTAGAAAGCGGAGGGCACTA  887

seq1  CAGTGGTATCTTGATGGCTGGCCATGTGTGATATTCAGTTATATAAAATA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTATCTTGATGGCTGGCCATGTGTGATATTCAGTTATATAAAATA  937

seq1  TACTATTTATGAACAAGAACAAACTGAAGCTTTGTTTTAAAAAATGGTTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATTTATGAACAAGAACAAACTGAAGCTTTGTTTTAAAAAATGGTTA  987

seq1  CATGTGGGCAGGGAATTTCTGGTCACTATATGTTCATCCATGGAGTGCCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGGCAGGGAATTTCTGGTCACTATATGTTCATCCATGGAGTGCCA  1037

seq1  AAGATTTGGGGGTCTGGGAAGATGTCTCAGTGGGTAAAGTGCTTCTTGTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTTGGGGGTCTGGGAAGATGTCTCAGTGGGTAAAGTGCTTCTTGTG  1087

seq1  CAATGGTGAGACTTGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGTGAGACTTGAATTC  1107