BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170P19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 117,426,354 - 117,604,846
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWwox
Upstream geneNudt7, AI427515, Clec3a
Downstream geneMaf
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170P19.bB6Ng01-170P19.g
ACCDH961565DH961566
length1,0551,162
definitionDH961565|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170P19, 5' end.DH961566|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170P19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,603,797 - 117,604,846)(117,426,354 - 117,427,520)
sequence
gaattcacatcaaaactctttctgcagaacacacattctgcagccagttt
gactccatgaagttgcttacgattgcccttgcatattcaaactctctgac
cctctgcctctgtacaaacttttgttttcttgccaagctgtttcttccag
tctgtttcctcacatcctgaggctctttctgtcctgtctggggaaacggg
gcatggcgattttgaagatggagcctgagtgccagcctgaaggggaaagg
tgtccgtgcacaggagctatgggatgtgagcacactccagagagaaggga
tgtctcaggacctagaggagcaggtcaccctgcagaaggcattcctcaga
acctggtgctcactgaaaccggggtacccttctagaaagatcagcagcac
tgggctccttgctaaaggaacagagtggagctgcaccattgcaattgcgc
atccccctccccccaagccccaggtacaggccattctttttcgagacagg
gtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcactctgtagaccaggc
tggcctcgaactcagaaatccgcctgcctctgcctcccgagtgctgggat
tagaggcatgagccacccccgcccggcaaggccattgtttacaaacagaa
atgcttctggttaaaagcctaactttgagcgtcccacagatgagtgaagc
tggaaaggaagtatctggggatccaatgctcatagattcccttaccacaa
aaggaagaccagcgctcatcaaccatctcacctgaagaggagcccatcca
taaagccactgaagagaagagacaggtgggagaaccatctgtttggattc
catagtgttgctgtggatcagctagtcacagataaccaacctgcaggcca
caggttgtccccctctatcccttggataggaaattctatttgggacatat
cataagagcaggagaatttattttttttctttttgagagcttagggggtg
gattcttcgattatgtctggctaaaacatgtgtggttggtgcatatgtaa
gtcct
gaattcatggatgaacctgtcagatttacgctcctgatggagtgacgggt
ttcttatgacatcatctctagaccgacccggttgatatgtttacccaaag
tcttacctaatgttttcacggggacttctttttggtggaagataacaact
gagagtgttttaaataataaacgaaggctgctgaagaggaggctatgcat
gcatcccatgccttcattgtgtggtactgaagagctcacgtgagcactct
ccctgtgtctcggcaactcctgccataccaagtctgtttgcacatcctct
gaggcatggggaattgctaagcccttagtgcttgagtgttctgcttcctg
catgcctctcctcatcctgctctggctcctccctctgctctctcacctag
cactttgctctggtcttatccaaagttcttcctaagcaaactagccatca
ggacgccctatattaaccagtacatcgttccctctgttttctctaattgc
tttgggcctccacttagtgcttcaaggtcaagttctatgaggtagcacaa
catcagacagtaaggaataatgttacaattttctatcccttcctctaacc
atcagttcatcatatattttctctgatatatctagggttgtactggctag
ttttgtgtcaacttgacacagctggagttatcacagagaaaggagcttca
gttgaggaaatgcctccatgagatccaactgtaaggcattttctcaatta
gtgatcaagggggaaaggccccttgtgggtgggaccatctctgggctggt
agtcttggttctataagaaagcaggctgagcaagccaggtgaggcaagcc
agtaaagaacatccccccatggcctctgcatcagctcctgcttcctgacc
tgcttgagttccagtcctgacttccttggtgatgaacagcagtatggaag
tgtaaggccgaataaacccttttctcccaacttgctcttggtcatgatgt
ttggtgcaagaatagaaaccctgactagaacagggttataccttacatca
ttatattctgcttgaactaggcactcaaacccttagtatggatcgagcct
gccaggttattataggcccatgggtaagatacataccttctcagtatcag
agatggggagcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_117603797_117604846
seq2: B6Ng01-170P19.b_48_1102 (reverse)

seq1  AGGACATACATATGCA-CAAACACACATGTTTTAGCAAAACAATATTCGA  49
      ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||| ||||
seq2  AGGACTTACATATGCACCAACCACACATGTTTTAGCCAGAC-ATAATCGA  49

seq1  AGA--TCACCCC--TAGCTCTC-AAAAGAAAAAAAATAAATTCT-CTGCT  93
      |||   ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| 
seq2  AGAATCCACCCCCTAAGCTCTCAAAAAGAAAAAAAATAAATTCTCCTGC-  98

seq1  TCTTATGGTATGTTCCCAATAGAATTTCCTATCCAAGGGATAGAGGGGGA  143
      ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATGATATGTCCCAAATAGAATTTCCTATCCAAGGGATAGAGGGGGA  148

seq1  CAACCTGTGGCCTGCAGGTTGGTTATCTGTGACTAGCTGATCCACAGCAA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTGTGGCCTGCAGGTTGGTTATCTGTGACTAGCTGATCCACAGCAA  198

seq1  CACTATGGAATCC-AACAGATGGTTCTCCCACCTGTCTCTTCTCTTCAGT  242
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGGAATCCAAACAGATGGTTCTCCCACCTGTCTCTTCTCTTCAGT  248

seq1  GGCTTTATGGATGGGCTCCTCTTCAGGTGAGATGGTTGATGAGCGCTGGT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTATGGATGGGCTCCTCTTCAGGTGAGATGGTTGATGAGCGCTGGT  298

seq1  CTTCCTTTTGTGGTAAGGGAATCTATGAGCATTGGATCCCCAGATACTTC  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTTTGTGGTAAGGGAATCTATGAGCATTGGATCCCCAGATACTTC  348

seq1  CTTTCCAGCTTCACTCATCTGTGGGACGCTCAAAGTTAGGCTTTTAACCA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAGCTTCACTCATCTGTGGGACGCTCAAAGTTAGGCTTTTAACCA  398

seq1  GAAGCATTTCTGTTTGTAAACAATGGCCTTGCCGGGCGGGGGTGGCTCAT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCATTTCTGTTTGTAAACAATGGCCTTGCCGGGCGGGGGTGGCTCAT  448

seq1  GCCTCTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTC  498

seq1  GAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACA  548

seq1  GAGAAACCCTGTCTCGAAAAAGAATGGCCTGTACCTGGGGCTTGGGGGGG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAGAAACCCTGTCTCGAAAAAGAATGGCCTGTACCTGGGGCTT-GGGGGG  597

seq1  AGGGGGATGCGCAATTGCAATGGTGCAGCTCCACTCTGTTCCTTTAGCAA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGATGCGCAATTGCAATGGTGCAGCTCCACTCTGTTCCTTTAGCAA  647

seq1  GGAGCCCAGTGCTGCTGATCTTTCTAGAAGGGTACCCCGGTTTCAGTGAG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCCAGTGCTGCTGATCTTTCTAGAAGGGTACCCCGGTTTCAGTGAG  697

seq1  CACCAGGTTCTGAGGAATGCCTTCTGCAGGGTGACCTGCTCCTCTAGGTC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGTTCTGAGGAATGCCTTCTGCAGGGTGACCTGCTCCTCTAGGTC  747

seq1  CTGAGACATCCCTTCTCTCTGGAGTGTGCTCACATCCCATAGCTCCTGTG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACATCCCTTCTCTCTGGAGTGTGCTCACATCCCATAGCTCCTGTG  797

seq1  CACGGACACCTTTCCCCTTCAGGCTGGCACTCAGGCTCCATCTTCAAAAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGACACCTTTCCCCTTCAGGCTGGCACTCAGGCTCCATCTTCAAAAT  847

seq1  CGCCATGCCCCGTTTCCCCAGACAGGACAGAAAGAGCCTCAGGATGTGAG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCATGCCCCGTTTCCCCAGACAGGACAGAAAGAGCCTCAGGATGTGAG  897

seq1  GAAACAGACTGGAAGAAACAGCTTGGCAAGAAAACAAAAGTTTGTACAGA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAGACTGGAAGAAACAGCTTGGCAAGAAAACAAAAGTTTGTACAGA  947

seq1  GGCAGAGGGTCAGAGAGTTTGAATATGCAAGGGCAATCGTAAGCAACTTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGGGTCAGAGAGTTTGAATATGCAAGGGCAATCGTAAGCAACTTC  997

seq1  ATGGAGTCAAACTGGCTGCAGAATGTGTGTTCTGCAGAAAGAGTTTTGAT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGTCAAACTGGCTGCAGAATGTGTGTTCTGCAGAAAGAGTTTTGAT  1047

seq1  GTGAATTC  1050
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1055

seq1: chr8_117426354_117427520
seq2: B6Ng01-170P19.g_68_1229

seq1  GAATTCATGGATGAACCTGTCAGATTTACGCTCCTGATGGAGTGACGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGATGAACCTGTCAGATTTACGCTCCTGATGGAGTGACGGGT  50

seq1  TTCTTATGACATCATCTCTAGACCGACCCGGTTGATATGTTTACCCAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATGACATCATCTCTAGACCGACCCGGTTGATATGTTTACCCAAAG  100

seq1  TCTTACCTAATGTTTTCACGGGGACTTCTTTTTGGTGGAAGATAACAACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCTAATGTTTTCACGGGGACTTCTTTTTGGTGGAAGATAACAACT  150

seq1  GAGAGTGTTTTAAATAATAAACGAAGGCTGCTGAAGAGGAGGCTATGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTGTTTTAAATAATAAACGAAGGCTGCTGAAGAGGAGGCTATGCAT  200

seq1  GCATCCCATGCCTTCATTGTGTGGTACTGAAGAGCTCACGTGAGCACTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCATGCCTTCATTGTGTGGTACTGAAGAGCTCACGTGAGCACTCT  250

seq1  CCCTGTGTCTCGGCAACTCCTGCCATACCAAGTCTGTTTGCACATCCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGTCTCGGCAACTCCTGCCATACCAAGTCTGTTTGCACATCCTCT  300

seq1  GAGGCATGGGGAATTGCTAAGCCCTTAGTGCTTGAGTGTTCTGCTTCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCATGGGGAATTGCTAAGCCCTTAGTGCTTGAGTGTTCTGCTTCCTG  350

seq1  CATGCCTCTCCTCATCCTGCTCTGGCTCCTCCCTCTGCTCTCTCACCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTCTCCTCATCCTGCTCTGGCTCCTCCCTCTGCTCTCTCACCTAG  400

seq1  CACTTTGCTCTGGTCTTATCCAAAGTTCTTCCTAAGCAAACTAGCCATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTGCTCTGGTCTTATCCAAAGTTCTTCCTAAGCAAACTAGCCATCA  450

seq1  GGACGCCCTATATTAACCAGTACATCGTTCCCTCTGTTTTCTCTAATTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACGCCCTATATTAACCAGTACATCGTTCCCTCTGTTTTCTCTAATTGC  500

seq1  TTTGGGCCTCCACTTAGTGCTTCAAGGTCAAGTTCTATGAGGTAGCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGCCTCCACTTAGTGCTTCAAGGTCAAGTTCTATGAGGTAGCACAA  550

seq1  CATCAGACAGTAAGGAATAATGTTACAATTTTCTATCCCTTCCTCTAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGACAGTAAGGAATAATGTTACAATTTTCTATCCCTTCCTCTAACC  600

seq1  ATCAGTTCATCATATATTTTCTCTGATATATCTAGGGTTGTACTGGCTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTTCATCATATATTTTCTCTGATATATCTAGGGTTGTACTGGCTAG  650

seq1  TTTTGTGTCAACTTGACACAGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTGTCAACTTGACACAGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCA  700

seq1  GTTGAGGAAATGCCTCCATGAGATCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGGAAATGCCTCCATGAGATCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTA  750

seq1  GTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGT  800

seq1  AGTCTTGGTTCTATAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCAGGTGAGGCAAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTGGTTCTATAAGAAAGCAGGCTGAGCAAGCCAGGTGAGGCAAGCC  850

seq1  AGTAAAGAACATCCCCCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAGAACATCCCCCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACC  900

seq1  TGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAGTATGGAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTTGGTGATGAACAGCAGTATGGAAG  950

seq1  TGTAA-GCCGAATAAACCCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCATGAT  999
      ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||
seq2  TGTAAGGCCGAATAAACCCTTTTCT-CCCAACTTGC-TCTTGGTCATGAT  998

seq1  GTTT-GTGCAAGAATAGAAACCCTGACTAAGACAAGGGTATAACCTTACA  1048
      |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||
seq2  GTTTGGTGCAAGAATAGAAACCCTGACTAGAACAGGGTTAT-ACCTTACA  1047

seq1  TCATTATATTCTTGCTCTGACCTAGGCACCAAAACCCTTAGTATGAATCA  1098
      ||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||| 
seq2  TCATTATATTC-TGCT-TGAACTAGGCACTCAAACCCTTAGTATGGATC-  1094

seq1  GAGCCCTGCAGGTTATATAAGGCCCATGGGTAATGACCACATCTTCACCA  1148
      |||||   ||||||||   ||||||||||||||    || | |||| |  
seq2  GAGCCTGCCAGGTTATTATAGGCCCATGGGTAAGATACATACCTTCTC--  1142

seq1  GGTACCAGAGAT-GGGAGCC  1167
       ||| ||||||| |||||||
seq2  AGTATCAGAGATGGGGAGCC  1162