BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-173M03
Chromosome8 (Build37)
Map Location 61,794,427 - 62,004,468
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930431L04Rik, BC030500, LOC665116, LOC436042
Downstream geneAadat
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-173M03.bB6Ng01-173M03.g
ACCGA002021GA002022
length1,153619
definitionB6Ng01-173M03.b B6Ng01-173M03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,794,427 - 61,795,582)(62,003,855 - 62,004,468)
sequence
gaattcagtgcagatgaagctacacatttttaggataatctcagtttcat
tttcagtcatgacatttggagctgggcagggtgatggatataggtctatc
tttctgtatgtatgggtaaaggtgactccattgagtctattcacattaat
tgtttagcatgctagatttcagattcataaaatagttcaatggctcaaaa
ttctagcaaatatgacaactttgccttatcttttctggtgtgtccataga
agtcagtcaatgttacctctaataaatgactaaattaaaacatgtgttac
aaataatttcaagatcttactgtgaaatggtttatagaataggagatagc
ctgagctatattcatatattaaaattcataaaaaatatggcctttataag
ttgttatagaaatgattgaaggtatgcttcatgggtataacacatacatg
atcccctgacaatagtagataagtaactagaatatctttcttctaaataa
tatgcatgataataagtttctgcagatcacctaggacaatggagatacta
gaattctctgtgaagatgacatcatcttcagtgatcctgtatgtaggaga
aggctcagtagatgcaactcttgagaactgaagtcttaattcagacttga
gacagaaaatagattttaattgcaaaaatggaaaatgaagtacaaaatag
ttgtctttccattatggaagtggttataatgcacatatgcattctaatga
atataagaatctaaaacgaatctattatgtactagtttgtttttaatctt
tacaaagaccattgttcttaatgagaaattacaactgagtaatatttcca
ttccctaaaattttgtcttttagattataaaattatataattatgcttat
catatagggagcactaacattttatctcatcactattactgtattaacat
ctcagaagccctagtgagtacccagtagaagttacaagttagattaggtt
tatgtaatctaatttaaacaatgtagattcccttattacctaacaactgt
gtcacacattgaaggtttattgaaattacttacatttttagaatgatacc
tattttattgtaatcatccagtttccaatcagggaaatatgtagcggaat
cat
gaattctgttagtccatcagtctcaaagaaagactgaaagaactgaaggg
gtttccatccccataagaagaacaacaatatcaacaaaccaggccccaca
gagctcccagggactgaatcactaaccaaaaagtataaatggaaggaccc
atggctccagccacatatgtagcagaggatggtcttttcaggcatcaata
ggaggagagcccttcagtcctgtgaaggttcgatgtcccagtatagggga
atgccagggaggggaggcaggagtgggtgggtgagggagcacctacatat
aagcagggtgaggggtgggatagaggatttccaaaaggaaaccaggtaag
aagataacatttgaaatgtaaataaagaaaatatccaataaaaatagtct
gggagtattagatgcaataatagacccagtctaaactaaaatgccaagta
atgttgaccctttattttatacaaacacataaacttaacacacatgtact
ctacacatgcatacataaaaacaagaaaaatacagagtaaaacaataaaa
aacatttaaatttactttttattacttcattgtatataattctattttat
gtcttccacaaaatctaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_61794427_61795582
seq2: B6Ng01-173M03.b_32_1184

seq1  GAATTCAGTGCAGATGAAGCTACACATTTTTAGGATAATCTCAGTTTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGCAGATGAAGCTACACATTTTTAGGATAATCTCAGTTTCAT  50

seq1  TTTCAGTCATGACATTTGGAGCTGGGCAGGGTGATGGATATAGGTCTATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTCATGACATTTGGAGCTGGGCAGGGTGATGGATATAGGTCTATC  100

seq1  TTTCTGTATGTATGGGTAAAGGTGACTCCATTGAGTCTATTCACATTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTATGTATGGGTAAAGGTGACTCCATTGAGTCTATTCACATTAAT  150

seq1  TGTTTAGCATGCTAGATTTCAGATTCATAAAATAGTTCAATGGCTCAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGCATGCTAGATTTCAGATTCATAAAATAGTTCAATGGCTCAAAA  200

seq1  TTCTAGCAAATATGACAACTTTGCCTTATCTTTTCTGGTGTGTCCATAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGCAAATATGACAACTTTGCCTTATCTTTTCTGGTGTGTCCATAGA  250

seq1  AGTCAGTCAATGTTACCTCTAATAAATGACTAAATTAAAACATGTGTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTCAATGTTACCTCTAATAAATGACTAAATTAAAACATGTGTTAC  300

seq1  AAATAATTTCAAGATCTTACTGTGAAATGGTTTATAGAATAGGAGATAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATTTCAAGATCTTACTGTGAAATGGTTTATAGAATAGGAGATAGC  350

seq1  CTGAGCTATATTCATATATTAAAATTCATAAAAAATATGGCCTTTATAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTATATTCATATATTAAAATTCATAAAAAATATGGCCTTTATAAG  400

seq1  TTGTTATAGAAATGATTGAAGGTATGCTTCATGGGTATAACACATACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATAGAAATGATTGAAGGTATGCTTCATGGGTATAACACATACATG  450

seq1  ATCCCCTGACAATAGTAGATAAGTAACTAGAATATCTTTCTTCTAAATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCTGACAATAGTAGATAAGTAACTAGAATATCTTTCTTCTAAATAA  500

seq1  TATGCATGATAATAAGTTTCTGCAGATCACCTAGGACAATGGAGATACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATGATAATAAGTTTCTGCAGATCACCTAGGACAATGGAGATACTA  550

seq1  GAATTCTCTGTGAAGATGACATCATCTTCAGTGATCCTGTATGTAGGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTGAAGATGACATCATCTTCAGTGATCCTGTATGTAGGAGA  600

seq1  AGGCTCAGTAGATGCAACTCTTGAGAACTGAAGTCTTAATTCAGACTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCAGTAGATGCAACTCTTGAGAACTGAAGTCTTAATTCAGACTTGA  650

seq1  GACAGAAAATAGATTTTAATTGCAAAAATGGAAAATGAAGTACAAAATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAAAATAGATTTTAATTGCAAAAATGGAAAATGAAGTACAAAATAG  700

seq1  TTGTCTTTCCATTATGGAAGTGGTTATAATGCACATATGCATTCTAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTTTCCATTATGGAAGTGGTTATAATGCACATATGCATTCTAATGA  750

seq1  ATATAAGAATCTAAAACGAATCTATTATGTACTAGTTTGTTTTTAATCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAGAATCTAAAACGAATCTATTATGTACTAGTTTGTTTTTAATCTT  800

seq1  TACAAAGACCATTGTTCTTAATGAGAAATTACAACTGAGTAATATTTCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAGACCATTGTTCTTAATGAGAAATTACAACTGAGTAATATTTCCA  850

seq1  TTCCCTAAAATTTTGTCTTTTAGATTATAAAATTATATAATTATGCTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTAAAATTTTGTCTTTTAGATTATAAAATTATATAATTATGCTTAT  900

seq1  CATATAGGGAGCACTAACATTTTATCTCATCACTATTACTGTATT-ACAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CATATAGGGAGCACTAACATTTTATCTCATCACTATTACTGTATTAACAT  950

seq1  CTCAGAAGCCCTAGTGAGTACCCAGTAGAAGTTACAAGTTAGATTAGGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAAGCCCTAGTGAGTACCCAGTAGAAGTTACAAGTTAGATTAGGTT  1000

seq1  TATGTAATCTAATTTAAACAATGTAGATTCCCTTATTACCT-ACAACTGG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  TATGTAATCTAATTTAAACAATGTAGATTCCCTTATTACCTAACAACT-G  1049

seq1  TGTCCACACATTGAA-GTTTATGAAAATTACTTTACATTTTTTAGTATGG  1097
      ||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||| || |
seq2  TGT-CACACATTGAAGGTTTATTGAAATTAC-TTACA-TTTTTAGAAT-G  1095

seq1  ATA-CTATTTTATTGTTAATCATTCAGTTTCTAAATCAGTG-AATATGTA  1145
      ||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||||
seq2  ATACCTATTTTATTG-TAATCATCCAGTTTC-CAATCAGGGAAATATGTA  1143

seq1  GCAGAAATCAT  1156
      || | ||||||
seq2  GC-GGAATCAT  1153

seq1: chr8_62003855_62004468
seq2: B6Ng01-173M03.g_69_687 (reverse)

seq1  TCTAGA-TTTGTGG-AGAC-TAAAATAGAATTTATATACAATGAAGTAAT  47
      |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTAGATTTTGTGGAAGACATAAAATAGAA-TTATATACAATGAAGTAAT  49

seq1  -AAAAGTAAATTTAAATG-TTTTTATTG-TTTACTCTGTATTTTTCTTGT  94
       ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTAAATTTAAATGTTTTTTATTGTTTTACTCTGTATTTTTCTTGT  99

seq1  TTTTATGTATGCATGTGTAGAGTACATGTGTGTTAAGTTTATGTGTTTGT  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGTATGCATGTGTAGAGTACATGTGTGTTAAGTTTATGTGTTTGT  149

seq1  ATAAAATAAAGGGTCAACATTACTTGGCATTTTAGTTTAGACTGGGTCTA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAAAGGGTCAACATTACTTGGCATTTTAGTTTAGACTGGGTCTA  199

seq1  TTATTGCATCTAATACTCCCAGACTATTTTTATTGGATATTTTCTTTATT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGCATCTAATACTCCCAGACTATTTTTATTGGATATTTTCTTTATT  249

seq1  TACATTTCAAATGTTATCTTCTTACCTGGTTTCCTTTTGGAAATCCTCTA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTCAAATGTTATCTTCTTACCTGGTTTCCTTTTGGAAATCCTCTA  299

seq1  TCCCACCCCTCACCCTGCTTATATGTAGGTGCTCCCTCACCCACCCACTC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACCCCTCACCCTGCTTATATGTAGGTGCTCCCTCACCCACCCACTC  349

seq1  CTGCCTCCCCTCCCTGGCATTCCCCTATACTGGGACATCGAACCTTCACA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCCCTCCCTGGCATTCCCCTATACTGGGACATCGAACCTTCACA  399

seq1  GGACTGAAGGGCTCTCCTCCTATTGATGCCTGAAAAGACCATCCTCTGCT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGAAGGGCTCTCCTCCTATTGATGCCTGAAAAGACCATCCTCTGCT  449

seq1  ACATATGTGGCTGGAGCCATGGGTCCTTCCATTTATACTTTTTGGTTAGT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGTGGCTGGAGCCATGGGTCCTTCCATTTATACTTTTTGGTTAGT  499

seq1  GATTCAGTCCCTGGGAGCTCTGTGGGGCCTGGTTTGTTGATATTGTTGTT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGTCCCTGGGAGCTCTGTGGGGCCTGGTTTGTTGATATTGTTGTT  549

seq1  CTTCTTATGGGGATGGAAACCCCTTCAGTTCTTTCAGTCTTTCTTTGAGA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTATGGGGATGGAAACCCCTTCAGTTCTTTCAGTCTTTCTTTGAGA  599

seq1  CTGATGGACTAACAGAATTC  614
      ||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGACTAACAGAATTC  619