BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-173N05
Chromosome8 (Build37)
Map Location 130,226,621 - 130,382,151
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1, Pard3, EG628847
Downstream geneNrp1, LOC668494, Itgb1, LOC100042659
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-173N05.bB6Ng01-173N05.g
ACCGA002071GA002072
length1,148137
definitionB6Ng01-173N05.b B6Ng01-173N05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,226,621 - 130,227,772)(130,382,015 - 130,382,151)
sequence
gaattctccttcaggaacataagaaccaagatgatggctatcgtgaggat
taggaaaatcattgctacctgctaacaaggggcagtataaaagtggttaa
ttatgtcagaggctggctctctgtaagggacctcactatgcctggaatcc
tgtatcctgttgctccatatctctgccatttctaatgtcattgatcactt
ccaagttggtgcctaccagctgcatagcagctctcaggaggggtacagag
gaagagcaggtgtgccttgctttttgggtagagcctggtaggtgactaag
ccatatctgccatatctcagtacaccgaatgtagtcacatggccactcat
aacagcaaggagtctgggcaatgtcttcttcattctgtaatggtcagact
agctaaaatcagacattccatgatgaaaaagggaatgttggggggaaatc
tgcaatctctgttgcagtacctttgctataggttggatatcgagtatttc
ccaaggtccacacatttgtcttacactacagagttgccctgttgagaagt
tgatgaacttataagcgataaggtatggcaagaggcctcgggtcatgggg
aatatgcccttgcagtgagtaaagacttctttgctttctgatcctgagac
catgttttattatggactcccaccatattgtacaacttccaggcccaaag
gtcaggatcaaggcctgaaattctaaactgtgatccaagatcatcagcca
tttccatacataagtgaatcatctctggtatttatcctgtgagggtccac
taacatgcaatcctgaatcatgtactcatattcacaagcatccttcttcc
tttacagaccagcctagctctttcaaagggaaattttctgatgccctact
gggtcattacacttaacccattgtcttagatctctgtcatctctgtggcg
gctcttctgcacactaaataagtcatctttcctgttcccacccaaagtag
cttcagtcagcaggcttcttcccagacagggatgcacataccaggtcctg
tcagtagaattacagatacttgggtaaaaaaatgggtccagtcaccttac
tctgggttacactgaggtgtctttggtaattctgctcctgctggagag
ttttaatcagagaaggagacgtcaggaaaacatattgcatgttcatatgt
gttcttgcagctgagctagtgggggtgtgtaaacacacacaaaggaggga
aggagggaaggaaggagggaaggaggaaaggaggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_130226621_130227772
seq2: B6Ng01-173N05.b_46_1193

seq1  GAATTCTCCTTCAGGAACATAAGAACCAAGATGATGGCTATCGTGAGGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTCAGGAACATAAGAACCAAGATGATGGCTATCGTGAGGAT  50

seq1  TAGGAAAATCATTGCTACCTGCTAACAAGGGGCAGTATAAAAGTGGTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAATCATTGCTACCTGCTAACAAGGGGCAGTATAAAAGTGGTTAA  100

seq1  TTATGTCAGAGGCTGGCTCTCTGTAAGGGACCTCACTATGCCTGGAATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTCAGAGGCTGGCTCTCTGTAAGGGACCTCACTATGCCTGGAATCC  150

seq1  TGTATCCTGTTGCTCCATATCTCTGCCATTTCTAATGTCATTGATCACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCCTGTTGCTCCATATCTCTGCCATTTCTAATGTCATTGATCACTT  200

seq1  CCAAGTTGGTGCCTACCAGCTGCATAGCAGCTCTCAGGAGGGGTACAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTGGTGCCTACCAGCTGCATAGCAGCTCTCAGGAGGGGTACAGAG  250

seq1  GAAGAGCAGGTGTGCCTTGCTTTTTGGGTAGAGCCTGGTAGGTGACTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCAGGTGTGCCTTGCTTTTTGGGTAGAGCCTGGTAGGTGACTAAG  300

seq1  CCATATCTGCCATATCTCAGTACACCGAATGTAGTCACATGGCCACTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATCTGCCATATCTCAGTACACCGAATGTAGTCACATGGCCACTCAT  350

seq1  AACAGCAAGGAGTCTGGGCAATGTCTTCTTCATTCTGTAATGGTCAGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCAAGGAGTCTGGGCAATGTCTTCTTCATTCTGTAATGGTCAGACT  400

seq1  AGCTAAAATCAGACATTCCATGATGAAAAAGGGAATGTTGGGGGGAAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAAAATCAGACATTCCATGATGAAAAAGGGAATGTTGGGGGGAAATC  450

seq1  TGCAATCTCTGTTGCAGTACCTTTGCTATAGGTTGGATATCGAGTATTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATCTCTGTTGCAGTACCTTTGCTATAGGTTGGATATCGAGTATTTC  500

seq1  CCAAGGTCCACACATTTGTCTTACACTACAGAGTTGCCCTGTTGAGAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTCCACACATTTGTCTTACACTACAGAGTTGCCCTGTTGAGAAGT  550

seq1  TGATGAACTTATAAGCGATAAGGTATGGCAAGAGGCCTCGGGTCATGGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACTTATAAGCGATAAGGTATGGCAAGAGGCCTCGGGTCATGGGG  600

seq1  AATATGCCCTTGCAGTGAGTAAAGACTTCTTTGCTTTCTGATCCTGAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCCCTTGCAGTGAGTAAAGACTTCTTTGCTTTCTGATCCTGAGAC  650

seq1  CATGTTTTATTATGGACTCCCACCATATTGTACAACTTCCAGGCCCAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTTATTATGGACTCCCACCATATTGTACAACTTCCAGGCCCAAAG  700

seq1  GTCAGGATCAAGGCCTGAAATTCTAAACTGTGATCCAAGATCATCAGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGATCAAGGCCTGAAATTCTAAACTGTGATCCAAGATCATCAGCCA  750

seq1  TTTCCATACATAAGTGAATCATCTCTGGTATTTATCCTGTGAGGGTCCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATACATAAGTGAATCATCTCTGGTATTTATCCTGTGAGGGTCCAC  800

seq1  TAACATGCAATCCTGAATCATGTACTCATATTCACAAGCATCCTTCTTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATGCAATCCTGAATCATGTACTCATATTCACAAGCATCCTTCTTCC  850

seq1  TTTACAGACCAAGCCTAGCTCTTTCAAAGGGAAATTTTCTGATGCCCTAC  900
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGACC-AGCCTAGCTCTTTCAAAGGGAAATTTTCTGATGCCCTAC  899

seq1  TGGGTCATTACACTTAACCCATTGTCTTAGATCTCTGTCATCTCTGTGGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGGGTCATTACACTTAACCCATTGTCTTAGATCTCTGTCATCTCTGT-GG  948

seq1  CGGCTCTTCTGCACACTAAATAAGTCATCTTTCCTGTTCCCACCCAAAGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTCTTCTGCACACTAAATAAGTCATCTTTCCTGTTCCCACCCAAAGT  998

seq1  AGCTTCAGTCAGCAGGCTTCTTCCCAGACAAGGGATGCACATACCAGTTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  AGCTTCAGTCAGCAGGCTTCTTCCCAGAC-AGGGATGCACATACCAGGTC  1047

seq1  CTGTCAGTAAGAATTACAGATACCTGGGTAAAAAAATGGTTCCAGTCA-C  1099
      |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CTGTCAGT-AGAATTACAGATACTTGGGTAAAAAAATGGGTCCAGTCACC  1096

seq1  TTACTCTGGG-TACACTGAGGTGTCCTTGGAAATTTCCTGCTCCCTGCT-  1147
      |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||| 
seq2  TTACTCTGGGTTACACTGAGGTGTCTTTGGTAATT--CTGCT-CCTGCTG  1143

seq1  GAGAG  1152
      |||||
seq2  GAGAG  1148

seq1: chr8_130382015_130382151
seq2: B6Ng01-173N05.g_71_207 (reverse)

seq1  CCTCCTCCTTTCCTCCTTCCCTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTCCTTTCCTCCTTCCCTCCTTCCTTCCCTCCTTCCCTCCTTTGTG  50

seq1  TGTGTTTACACACCCCCACTAGCTCAGCTGCAAGAACACATATGAACATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTACACACCCCCACTAGCTCAGCTGCAAGAACACATATGAACATG  100

seq1  CAATATGTTTTCCTGACGTCTCCTTCTCTGATTAAAA  137
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATGTTTTCCTGACGTCTCCTTCTCTGATTAAAA  137