BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-177D01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 119,362,189 - 119,506,964
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh
Upstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053
Downstream genePkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik, Plcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-177D01.bB6Ng01-177D01.g
ACCGA004528GA004529
length1,101853
definitionB6Ng01-177D01.b B6Ng01-177D01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,362,189 - 119,363,281)(119,506,115 - 119,506,964)
sequence
gaattcaaaagagacagcatgagaagttatccatgaccaaatgtgacaga
gagttaggaaagccagcagtcatcctcatcactgaccacagaagcagctt
taccctgtagaatctccttcaccgatgagtgtgccagctagcttccactg
tgtaacaaatttgcctcagacttagaacagctcatcactgttcatatgtc
tacacagcagcctgactttggctgatctaggctgagcttcactgaggcat
ctttgctctatacatccctcatccttctctttgaactacctggttctcct
ggtaatgttcttttcatggtgacagtagaatagaggagaaaaaaaaaaaa
aagaaagaaatgtagaagatccaatgtgtatcattgcgcccaaaggaaat
catctgctcacaggttcaattaaaaactcttctcccctaaggaggccttg
caaagatcatggggaaggaacaaatgaaggttctctcactaaggtaccag
caaggaagaaaggatccatgagggaaagtcaaccaagaaaattcacgaca
gtggtttgatcctctacaatgggaaactttgcctctcaccaactctgaag
acatgcatcgaagccttacctttaacatagctttactacgtggtaagaat
cgccctgactcagtctctctatggtgctcgaagtgataccttcttttgaa
catcagctctgtcctcttgttaactatcatcatggtgaagagatgactgc
aggcagatcaggagacacgcccccaaccatccaataaagattcgacgttg
ccttttagaaaggccaactaaaaggctggaaggacggaccagaaggagcc
aggtttaatgcccagcacccacatggaagctcacaattgactgtaactcc
agtgtcaagatgttctgaccacccctcttctggcacacatggttgcattg
gaccatgttgaatgcaaacagtcagatgcataaaaataaaaacagtttta
aatcagccacacaaacagcacctcaaattgcactaataccatattcccaa
catggcagccactatggactaggacaagagttctgtaggcaatacaagag
g
gaattccaggacagctgtttctatatagggatatttgagtgtgggggtct
ttagtggtcagaggaggacactgaattccctggagctagagttataggtt
gtaagtcacctgataccaatgctcaaaaccaaacttgggtcccgtgctac
agcggtatgctctcttaaaaacggagccatccttactccagcccactaaa
gtcttagagctaaatttattgaagaaagaatggatttatgttaggataac
aacatcacttaaatgagggcactgtattaattttgaatgaatttgacttt
aaaaggcaatgtgaactgaggttctgttttgggtacaggttggctgatca
agatgacactgagtgacccttcagagatggatgaattgatgagtgaagaa
gcatatgagaaatatgtgaagtccattgaggagtgaccatggcacccctc
tactcccagatcaaactggatgtgacgtgctccagcatgcttgtcttaaa
ctagtggagaatagaggacttgaaataacttagcaatactgatggaaaga
aactgttcttgacagtgctacttaagagccacccccaacttcctaaagga
tgcagataaacacagtgtacaggtttttgataattgccatactaagtatt
tagactaggggttaagccctggtgtttagaattctgaggatcgtctgctg
tgaaacgtggttatgaggctggttttggtgacggaccaccttcttattcc
cagcacgcaacaggcagatgttagttagttcaaggtcgtctaccacacca
gtttctagaaccagcacagctacattggcgagaaccctacctactgggta
taa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119362189_119363281
seq2: B6Ng01-177D01.b_44_1144

seq1  GAATTCAAAAGAGACAGCATGAGAAGTTATCCATGACCAAATGTGACAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAGAGACAGCATGAGAAGTTATCCATGACCAAATGTGACAGA  50

seq1  GAGTTAGGAAAGCCAGCAGTCATCCTCATCACTGACCACAGAAGCAGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTAGGAAAGCCAGCAGTCATCCTCATCACTGACCACAGAAGCAGCTT  100

seq1  TACCCTGTAGAATCTCCTTCACCGATGAGTGTGCCAGCTAGCTTCCACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTGTAGAATCTCCTTCACCGATGAGTGTGCCAGCTAGCTTCCACTG  150

seq1  TGTAACAAATTTGCCTCAGACTTAGAACAGCTCATCACTGTTCATATGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACAAATTTGCCTCAGACTTAGAACAGCTCATCACTGTTCATATGTC  200

seq1  TACACAGCAGCCTGACTTTGGCTGATCTAGGCTGAGCTTCACTGAGGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGCAGCCTGACTTTGGCTGATCTAGGCTGAGCTTCACTGAGGCAT  250

seq1  CTTTGCTCTATACATCCCTCATCCTTCTCTTTGAACTACCTGGTTCTCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTCTATACATCCCTCATCCTTCTCTTTGAACTACCTGGTTCTCCT  300

seq1  GGTAATGTTCTTTTCATGGTGACAGTAGAATAGAGGAGAAAAAAAAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATGTTCTTTTCATGGTGACAGTAGAATAGAGGAGAAAAAAAAAAAA  350

seq1  AAGAAAGAAATGTAGAAGATCCAATGTGTATCATTGCGCCCAAAGGAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGAAATGTAGAAGATCCAATGTGTATCATTGCGCCCAAAGGAAAT  400

seq1  CATCTGCTCACAGGTTCAATTAAAAACTCTTCTCCCCTAAGGAGGCCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCTCACAGGTTCAATTAAAAACTCTTCTCCCCTAAGGAGGCCTTG  450

seq1  CAAAGATCATGGGGAAGGAACAAATGAAGGTTCTCTCACTAAGGTACCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATCATGGGGAAGGAACAAATGAAGGTTCTCTCACTAAGGTACCAG  500

seq1  CAAGGAAGAAAGGATCCATGAGGGAAAGTCAACCAAGAAAATTCACGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAAGAAAGGATCCATGAGGGAAAGTCAACCAAGAAAATTCACGACA  550

seq1  GTGGTTTGATCCTCTACAATGGGAAACTTTGCCTCTCACCAACTCTGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTTGATCCTCTACAATGGGAAACTTTGCCTCTCACCAACTCTGAAG  600

seq1  ACATGCATCGAAGCCTTACCTTTAACATAGCTTTACTACGTGGTAAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATCGAAGCCTTACCTTTAACATAGCTTTACTACGTGGTAAGAAT  650

seq1  CGCCCTGACTCAGTCTCTCTATGGTGCTCGAAGTGATACCTTCTTTTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCTGACTCAGTCTCTCTATGGTGCTCGAAGTGATACCTTCTTTTGAA  700

seq1  CATCAGCTCTGTCCTCTTGTTAACTATCATCATGGTGAAGAGATGACTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCTCTGTCCTCTTGTTAACTATCATCATGGTGAAGAGATGACTGC  750

seq1  AGGCAGATCAGGAGACACGCCCCCAACCATCCAATAAAGATTCGACGTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGATCAGGAGACACGCCCCCAACCATCCAATAAAGATTCGACGTTG  800

seq1  CCTTTTAGAAAGGCCAACTAAAAGGCTGGAAGGACGGACCAGAAGGAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTAGAAAGGCCAACTAAAAGGCTGGAAGGACGGACCAGAAGGAGCC  850

seq1  AGGTTTAATGCCCAGCACCCACATGGAAGCTCACAATTGACTGTAACTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTAATGCCCAGCACCCACATGGAAGCTCACAATTGACTGTAACTCC  900

seq1  AGTGTCAAGATG-TCTGAC--ACCCTCTTCTGGCACACATGG-TGCA-TG  945
      |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||
seq2  AGTGTCAAGATGTTCTGACCACCCCTCTTCTGGCACACATGGTTGCATTG  950

seq1  GA-CATGTTTGAAGGCAAACAGTCAGATGCATAAAA--TAAAACAG-TTT  991
      || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||
seq2  GACCATG-TTGAATGCAAACAGTCAGATGCATAAAAATAAAAACAGTTTT  999

seq1  AAATCAGCCACACAAACAGCACCTCAAAATGCACT-ATACCATATTCCCA  1040
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  AAATCAGCCACACAAACAGCACCTCAAATTGCACTAATACCATATTCCCA  1049

seq1  ACAGTGCCAGCCACTAT-GACTAGGACAAGAGTTCCTGTTAGCCATACAA  1089
      ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||
seq2  ACA-TGGCAGCCACTATGGACTAGGACAAGAGTT-CTGTAGGCAATACAA  1097

seq1  GAGG  1093
      ||||
seq2  GAGG  1101

seq1: chr8_119506115_119506964
seq2: B6Ng01-177D01.g_63_915 (reverse)

seq1  TTATACCCAGTAGGTAGGG-TCTCGCC-ATGTAGCTGTGGCTGG-TCTAG  47
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||
seq2  TTATACCCAGTAGGTAGGGTTCTCGCCAATGTAGCTGT-GCTGGTTCTAG  49

seq1  AACTTGTTGT-GTAGACCGACCTTGAACTAACTAACATCTGCCTGTTGCG  96
      ||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGTGTGGTAGA-CGACCTTGAACTAACTAACATCTGCCTGTTGCG  98

seq1  TGCTGGG-ATTAGAAGGTGGTCCGTCACCAAAACCAGCCTCATAACCACG  145
      ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGAATAAGAAGGTGGTCCGTCACCAAAACCAGCCTCATAACCACG  148

seq1  TTTCACAGCAGACGATCCTCAGAATTCTAAACACCAGGGCTTAACCCCTA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACAGCAGACGATCCTCAGAATTCTAAACACCAGGGCTTAACCCCTA  198

seq1  GTCTAAATACTTAGTATGGCAATTATCAAAAACCTGTACACTGTGTTTAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAATACTTAGTATGGCAATTATCAAAAACCTGTACACTGTGTTTAT  248

seq1  CTGCATCCTTTAGGAAGTTGGGGGTGGCTCTTAAGTAGCACTGTCAAGAA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATCCTTTAGGAAGTTGGGGGTGGCTCTTAAGTAGCACTGTCAAGAA  298

seq1  CAGTTTCTTTCCATCAGTATTGCTAAGTTATTTCAAGTCCTCTATTCTCC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTCTTTCCATCAGTATTGCTAAGTTATTTCAAGTCCTCTATTCTCC  348

seq1  ACTAGTTTAAGACAAGCATGCTGGAGCACGTCACATCCAGTTTGATCTGG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGTTTAAGACAAGCATGCTGGAGCACGTCACATCCAGTTTGATCTGG  398

seq1  GAGTAGAGGGGTGCCATGGTCACTCCTCAATGGACTTCACATATTTCTCA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGAGGGGTGCCATGGTCACTCCTCAATGGACTTCACATATTTCTCA  448

seq1  TATGCTTCTTCACTCATCAATTCATCCATCTCTGAAGGGTCACTCAGTGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTTCTTCACTCATCAATTCATCCATCTCTGAAGGGTCACTCAGTGT  498

seq1  CATCTTGATCAGCCAACCTGTACCCAAAACAGAACCTCAGTTCACATTGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGATCAGCCAACCTGTACCCAAAACAGAACCTCAGTTCACATTGC  548

seq1  CTTTTAAAGTCAAATTCATTCAAAATTAATACAGTGCCCTCATTTAAGTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAGTCAAATTCATTCAAAATTAATACAGTGCCCTCATTTAAGTG  598

seq1  ATGTTGTTATCCTAACATAAATCCATTCTTTCTTCAATAAATTTAGCTCT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGTTATCCTAACATAAATCCATTCTTTCTTCAATAAATTTAGCTCT  648

seq1  AAGACTTTAGTGGGCTGGAGTAAGGATGGCTCCGTTTTTAAGAGAGCATA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTTAGTGGGCTGGAGTAAGGATGGCTCCGTTTTTAAGAGAGCATA  698

seq1  CCGCTGTAGCACGGGACCCAAGTTTGGTTTTGAGCATTGGTATCAGGTGA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTGTAGCACGGGACCCAAGTTTGGTTTTGAGCATTGGTATCAGGTGA  748

seq1  CTTACAACCTATAACTCTAGCTCCAGGGAATTCAGTGTCCTCCTCTGACC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAACCTATAACTCTAGCTCCAGGGAATTCAGTGTCCTCCTCTGACC  798

seq1  ACTAAAGACCCCCACACTCAAATATCCCTATATAGAAACAGCTGTCCTGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGACCCCCACACTCAAATATCCCTATATAGAAACAGCTGTCCTGG  848

seq1  AATTC  850
      |||||
seq2  AATTC  853