BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-191C10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 50,434,342 - 50,601,604
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930555F03Rik
Upstream geneOdz3, 2900073C17Rik, LOC100039866
Downstream geneLOC100039919, EG667495, LOC100039954
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-191C10.bB6Ng01-191C10.g
ACCGA014720GA014721
length1,1671,169
definitionB6Ng01-191C10.b B6Ng01-191C10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,434,342 - 50,435,499)(50,600,447 - 50,601,604)
sequence
gaattctccaaattggcttagaagcatttcctagctaccactgcctccta
actcgttgacctgaaatagactcctactacaaatgccacagctgcagaca
tcagcaactcataggaagttaaaatcgacactgtcggggagcaaaattgc
cctctggtcaccagctgatgggctcacaccccctaactccctcttcctgc
agtaatcaagcccgggatgattatgtctgctgatgtgtttcatctcccaa
gaaactctttaagtcttctttggaagttcttgctgctctatctgttggaa
gtgcttctgagagggcctggctaattgcttgctagctctatgagtcagcc
agagagcgacgatcggcctgaaattggagcaagccatcgatgttgataaa
ttggctctggactcaacccacacggcctttgagaactcataagggccaca
ggctgtcacagtgtagatggctcagataaggagcctactccaagcagaag
tgtcaaaatgtaagccagtgtctgccgtccttggttttgtaggtgatacc
ctgacccagatggttctgtgtctgtagagtaaggctgcatactgatgggt
atcttcaagttcagtccatactgtgtatttcttaggcctctgctcagctt
gcaactgcctctgctattcacagaactatcaaacaatcgaagtcttattt
ccctgctccatcaaataagcaatatatggtcttatcaaatccttctcgga
ggcgacacgggctttcctattggtgtcagtagcaggtttaattgacacag
gatggttgaggagattcgcaaataacccgtaaggtatgaggtgaactgat
atgcagtaattagtgttaccatgcatagaggcactgtatttccagtcaat
cttgacgagttaattgacaaccacatgacttccaactttatacctcccaa
aggctcccattataaataagccaaatctccaccataagaaaaaaaaaaac
ctcacatcttagtgctttgcaatacaccacatcttctactgttccctcca
gcttttgctgcttgctgctgtggttcccttagtgcatgaaattatgatgg
tgacccccccccaattcccctcggcctagtcctcacattcaaatctatgt
gaaagttggaaatagta
gaattctgtgacattctccaggtgtcccctagctacatccaggtggcaca
tcaatttaaacctgcccccagatcttccagccccaaatatttctctgctt
aacatctcgagagtcaccagccaaccttatctaatgatatcgacagggcc
tgacacagaacctaggtcagcatgaagccacaataagcaaaattgattta
caaatcacaaaacgtctgatgcattatttctggaaataaatgggtttttt
tttttcctcctcaaaatgtggagacaagtctgcagcagaatgatggcttg
cttttctaagctgatcaaggaaagcaaagactcttattcttctcattctc
agtcatctttctggcactttggactaggaagttggaaaatcaggaatcat
aatgatcagcctcagaaatgggaaaggcttctcatggctcccacatggca
cctgccgagcagaggccttcacttctaatataagaaaaggatctttgaat
aacattaggcagaggtttgcaacacgttgatcccatgcaaacatctttaa
aaggcccggcattttaaagtttaataattggattattatttaaatgaatc
actttctaaggtgccatgcctaatgggaaccttctgagcaaaaattccac
ctttaaaaatggtacttgagtgaagtgataagtagttacttgcatatagc
atagattttcatcagttctaatctaaccgaaggaagcattaggagatgaa
agacaatgtaattagtttattcttggaaaacgtatgcatgaagtttctta
aactccacaaaagctcataggtatgaaattaatgggcttaatttattaat
acacacacacacacacacacacacacacacatgtgtatatatgcatatac
acatatgcatttatgcatttattatagaacatctggtcttaagaaggaaa
ttaaataaatgagatttttaagaatgcaagcaatttcccagcaatagtaa
caatgttgtttttaataacaggtacagaaaatggaaaaagcaatgagttt
tcactatacatcctcttgttattgaaaggcattgaatataccacacagca
tacctcatttgctaggagattcccttatggttctgaagtgttatattttg
gaaaaaagaacttgagcga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_50434342_50435499
seq2: B6Ng01-191C10.b_44_1210

seq1  GAATTCTCCAAATTGGCTTAGAAGCATTTCCTAGCTACCACTGCCTCCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAAATTGGCTTAGAAGCATTTCCTAGCTACCACTGCCTCCTA  50

seq1  ACTCGTTGACCTGAAATAGACTCCTACTACAAATGCCACAGCTGCAGACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGTTGACCTGAAATAGACTCCTACTACAAATGCCACAGCTGCAGACA  100

seq1  TCAGCAACTCATAGGAAGTTAAAATCGACACTGTCGGGGAGCAAAATTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAACTCATAGGAAGTTAAAATCGACACTGTCGGGGAGCAAAATTGC  150

seq1  CCTCTGGTCACCAGCTGATGGGCTCACACCCCCTAACTCCCTCTTCCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGTCACCAGCTGATGGGCTCACACCCCCTAACTCCCTCTTCCTGC  200

seq1  AGTAATCAAGCCCGGGATGATTATGTCTGCTGATGTGTTTCATCTCCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATCAAGCCCGGGATGATTATGTCTGCTGATGTGTTTCATCTCCCAA  250

seq1  GAAACTCTTTAAGTCTTCTTTGGAAGTTCTTGCTGCTCTATCTGTTGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTCTTTAAGTCTTCTTTGGAAGTTCTTGCTGCTCTATCTGTTGGAA  300

seq1  GTGCTTCTGAGAGGGCCTGGCTAATTGCTTGCTAGCTCTATGAGTCAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCTGAGAGGGCCTGGCTAATTGCTTGCTAGCTCTATGAGTCAGCC  350

seq1  AGAGAGCGACGATCGGCCTGAAATTGGAGCAAGCCATCGATGTTGATAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCGACGATCGGCCTGAAATTGGAGCAAGCCATCGATGTTGATAAA  400

seq1  TTGGCTCTGGACTCAACCCACACGGCCTTTGAGAACTCATAAGGGCCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTCTGGACTCAACCCACACGGCCTTTGAGAACTCATAAGGGCCACA  450

seq1  GGCTGTCACAGTGTAGATGGCTCAGATAAGGAGCCTACTCCAAGCAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCACAGTGTAGATGGCTCAGATAAGGAGCCTACTCCAAGCAGAAG  500

seq1  TGTCAAAATGTAAGCCAGTGTCTGCCGTCCTTGGTTTTGTAGGTGATACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAAATGTAAGCCAGTGTCTGCCGTCCTTGGTTTTGTAGGTGATACC  550

seq1  CTGACCCAGATGGTTCTGTGTCTGTAGAGTAAGGCTGCATACTGATGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCAGATGGTTCTGTGTCTGTAGAGTAAGGCTGCATACTGATGGGT  600

seq1  ATCTTCAAGTTCAGTCCATACTGTGTATTTCTTAGGCCTCTGCTCAGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCAAGTTCAGTCCATACTGTGTATTTCTTAGGCCTCTGCTCAGCTT  650

seq1  GCAACTGCCTCTGCTATTCACAGAACTATCAAACAATCGAAGTCTTATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTGCCTCTGCTATTCACAGAACTATCAAACAATCGAAGTCTTATTT  700

seq1  CCCTGCTCCATCAAATAAGCAATATATGGTCTTATCAAATCCTTCTCGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCTCCATCAAATAAGCAATATATGGTCTTATCAAATCCTTCTCGGA  750

seq1  GGCGACACGGGCTTTCCTATTGGTGTCAGTAGCAGGTTTAATTGACACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGACACGGGCTTTCCTATTGGTGTCAGTAGCAGGTTTAATTGACACAG  800

seq1  GATGGTTGAGGAGATTCGCAAATAACCCGTAAGGTATGAGGTGAACTGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTGAGGAGATTCGCAAATAACCCGTAAGGTATGAGGTGAACTGAT  850

seq1  ATGCAGTAATTAGTGTTACCATGCATAGAGGCACTGTATTTCCAGTCATT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATGCAGTAATTAGTGTTACCATGCATAGAGGCACTGTATTTCCAGTCAAT  900

seq1  CTTGACGAGTTAATTGACAACCACATGAC-TCCAACTTTATACCTCCCAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACGAGTTAATTGACAACCACATGACTTCCAACTTTATACCTCCCAA  950

seq1  AGGCTCCCATTATAAATAAGCCAAATCTTCAACATAAG-AAAAAAAAAAC  998
      |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||
seq2  AGGCTCCCATTATAAATAAGCCAAATCTCCACCATAAGAAAAAAAAAAAC  1000

seq1  CTCACATC-TAGTGGCTTTGC-ATACA-CACATCTTCTACTG-TCCCTCC  1044
      |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  CTCACATCTTAGT-GCTTTGCAATACACCACATCTTCTACTGTTCCCTCC  1049

seq1  AGCTTTTGCTGCTTGCTGCTGTG--TCCCTTAGTGCATGACA-TATGATG  1091
      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||
seq2  AGCTTTTGCTGCTTGCTGCTGTGGTTCCCTTAGTGCATGAAATTATGATG  1099

seq1  GTGACCCCCCCCC-ATTCCCCTCGGCCTAGT-CTCACATTCCAATCTATG  1139
      ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  GTGACCCCCCCCCAATTCCCCTCGGCCTAGTCCTCACATTCAAATCTATG  1149

seq1  TGAAAGTGGGAAAATAGTA  1158
      ||||||| || ||||||||
seq2  TGAAAGTTGG-AAATAGTA  1167

seq1: chr8_50600447_50601604
seq2: B6Ng01-191C10.g_65_1233 (reverse)

seq1  TCGCTCAGTGTCTTTTTTTCCAAATATACAACTTCAGAA-CACTAGGGAA  49
      |||||||   |||||||| | |||||||  ||||||||| ||  ||||||
seq2  TCGCTCAAGTTCTTTTTTCCAAAATATAACACTTCAGAACCATAAGGGAA  50

seq1  TCT-CTAGCAAATGGAGGTATGCCTTGTGTGGTAT-TCAAATGCCTTTTC  97
      ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| |  |||||| ||||
seq2  TCTCCTAGCAAAT-GAGGTATGC--TGTGTGGTATATTCAATGCC-TTTC  96

seq1  AATA--CAGA-GATGTATAGTG-AAACTCATTGCCTTTTCCCTTTTCTGT  143
      ||||   ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  AATAACAAGAGGATGTATAGTGAAAACTCATTGCTTTTTCCATTTTCTGT  146

seq1  A-CTGTTA-TAAAAAC-ACATTGTTACTATTGCTGG--AAATGCTTGCAT  188
      | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||
seq2  ACCTGTTATTAAAAACAACATTGTTACTATTGCTGGGAAATTGCTTGCAT  196

seq1  TC-TAAAAATCTCATTTATTTAATTTCCTTCTTAAGACCAGATG-TCTAT  236
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCTTAAAAATCTCATTTATTTAATTTCCTTCTTAAGACCAGATGTTCTAT  246

seq1  -ATAAATGCATAAATGCATATGTGTATATGCATATATACACATGTGTGTG  285
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATGCATAAATGCATATGTGTATATGCATATATACACATGTGTGTG  296

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTAATAAATTAAGCCCATTAATTTCA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTAATAAATTAAGCCCATTAATTTCA  346

seq1  TACCTATGAGCTTTTGTGGAGTTTAAGAAACTTCATGCATACGTTTTCCA  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATGAGCTTTTGTGGAGTTTAAGAAACTTCATGCATACGTTTTCCA  396

seq1  AGAATAAACTAATTACATTGTCTTTCATCTCCTAATGCTTCCTTCGGTTA  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAAACTAATTACATTGTCTTTCATCTCCTAATGCTTCCTTCGGTTA  446

seq1  GATTAGAACTGATGAAAATCTATGCTATATGCAAGTAACTACTTATCACT  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGAACTGATGAAAATCTATGCTATATGCAAGTAACTACTTATCACT  496

seq1  TCACTCAAGTACCATTTTTAAAGGTGGAATTTTTGCTCAGAAGGTTCCCA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCAAGTACCATTTTTAAAGGTGGAATTTTTGCTCAGAAGGTTCCCA  546

seq1  TTAGGCATGGCACCTTAGAAAGTGATTCATTTAAATAATAATCCAATTAT  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCATGGCACCTTAGAAAGTGATTCATTTAAATAATAATCCAATTAT  596

seq1  TAAACTTTAAAATGCCGGGCCTTTTAAAGATGTTTGCATGGGATCAACGT  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTTTAAAATGCCGGGCCTTTTAAAGATGTTTGCATGGGATCAACGT  646

seq1  GTTGCAAACCTCTGCCTAATGTTATTCAAAGATCCTTTTCTTATATTAGA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAAACCTCTGCCTAATGTTATTCAAAGATCCTTTTCTTATATTAGA  696

seq1  AGTGAAGGCCTCTGCTCGGCAGGTGCCATGTGGGAGCCATGAGAAGCCTT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAGGCCTCTGCTCGGCAGGTGCCATGTGGGAGCCATGAGAAGCCTT  746

seq1  TCCCATTTCTGAGGCTGATCATTATGATTCCTGATTTTCCAACTTCCTAG  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTTCTGAGGCTGATCATTATGATTCCTGATTTTCCAACTTCCTAG  796

seq1  TCCAAAGTGCCAGAAAGATGACTGAGAATGAGAAGAATAAGAGTCTTTGC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGTGCCAGAAAGATGACTGAGAATGAGAAGAATAAGAGTCTTTGC  846

seq1  TTTCCTTGATCAGCTTAGAAAAGCAAGCCATCATTCTGCTGCAGACTTGT  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTGATCAGCTTAGAAAAGCAAGCCATCATTCTGCTGCAGACTTGT  896

seq1  CTCCACATTTTGAGGAGGAAAAAAAAAAACCCATTTATTTCCAGAAATAA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCACATTTTGAGGAGGAAAAAAAAAAACCCATTTATTTCCAGAAATAA  946

seq1  TGCATCAGACGTTTTGTGATTTGTAAATCAATTTTGCTTATTGTGGCTTC  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCAGACGTTTTGTGATTTGTAAATCAATTTTGCTTATTGTGGCTTC  996

seq1  ATGCTGACCTAGGTTCTGTGTCAGGCCCTGTCGATATCATTAGATAAGGT  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGACCTAGGTTCTGTGTCAGGCCCTGTCGATATCATTAGATAAGGT  1046

seq1  TGGCTGGTGACTCTCGAGATGTTAAGCAGAGAAATATTTGGGGCTGGAAG  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGTGACTCTCGAGATGTTAAGCAGAGAAATATTTGGGGCTGGAAG  1096

seq1  ATCTGGGGGCAGGTTTAAATTGATGTGCCACCTGGATGTAGCTAGGGGAC  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGGGCAGGTTTAAATTGATGTGCCACCTGGATGTAGCTAGGGGAC  1146

seq1  ACCTGGAGAATGTCACAGAATTC  1158
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGAGAATGTCACAGAATTC  1169