BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214I05
Chromosome8 (Build37)
Map Location 11,002,531 - 11,100,598
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIrs2
Upstream geneTnfsf13b, Myo16, LOC100040008, LOC384782, LOC100040507, LOC665306
Downstream geneCol4a1, Col4a2, Rab20, 0710008K08Rik, Cars2, Ing1, Ankrd10, 1700016D06Rik, EG665271, LOC665363, LOC624710, LOC665373, Arhgef7, 1700018L24Rik, LOC100040155
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214I05.bB6Ng01-214I05.g
ACCGA031741GA031742
length990232
definitionB6Ng01-214I05.b B6Ng01-214I05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,002,531 - 11,003,512)(11,100,365 - 11,100,598)
sequence
gaattcagaataacagttaacctaattgctcccatgtctgcttgtatgga
gagccatttagatttcacacgtgttaaccccaaagactggtaggaactct
atccgtgtgggaaaccttaagcaggagtagatgagccaggtgtctaaaca
aactgactcctgcaggtcagcattctttctgatgtgccagggaatccctt
ttctgaaggtagtgactataacacaggcctcgaacttcacagtgtggact
tcagactgcgttcccatagtaggagaccacccacccagcctcaactggac
atgtttactcctctaccagggacatggaagttgctaagtgtgtgggtgag
gcagacagaaagaattcccccattcagtcacacactactgtgtttatatg
gcctgtggcgtagctatcctcaacttcctagcactagaaatctgtactgt
ttagtaagaccttgacaaagcgaccttcggctgagagattcaccacagaa
gggacgcattctgccaacttcccgttgatttaattagctgttgaagtgct
gtattgctgctggtaattcctagatactcctcttcctctgctccagtcgt
aattataataataagaattagcttttcatctattaccccacaatttgcca
ggatttgtcccaagctgtaaacctggatccaatgagttgatggcctcaaa
tatacacacagccttcaatgtagatagcattcaactggcctgctttactt
aagaaccaaaagtatacaggtcccttttgagacctcagaccacaacactg
gctccactatggcacacagtctgtctgtcctgctagcaacccccatgtag
aaaacacagacaggaacagaattgagcactccagctcccttgtcccccct
gcatacccagtcatgtctgagatacaggaagttttaccagctgcctgtgc
tcatggatatttgataaggggagagccgggggtggggggg
acttcttagagggcttcggaatttctgtattagaggaagtgcttgctgaa
atcctttccacttactaagtgctactttggaattgcacaatgtattgaag
aaatgagttagccctggctgtgtttgggcacacaggaggaggaggaggga
cacaagtgggaggtggaggtggtcatggtggtggtggtggggaactaact
cctcttgaggggtacagagctagataagcaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_11002531_11003512
seq2: B6Ng01-214I05.b_48_1037

seq1  GAATTCAGAATAACAG-TAACCTAATTGCTCCCATGTCTGCTTGTATGGA  49
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAATAACAGTTAACCTAATTGCTCCCATGTCTGCTTGTATGGA  50

seq1  GAGCCATTTAGATTTCACACGTGTTAACCCCAAAGACTGGTAGGAACTCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATTTAGATTTCACACGTGTTAACCCCAAAGACTGGTAGGAACTCT  100

seq1  ATCCGTGTGGGAAACCTTAAGCAGGAGTAGATGAGCCAGGTGTCTAAACA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGTGTGGGAAACCTTAAGCAGGAGTAGATGAGCCAGGTGTCTAAACA  150

seq1  AACTGACTCCTGCAGGTCAGCATTCTTTCTGATGTGCCAGGGAATCCCTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGACTCCTGCAGGTCAGCATTCTTTCTGATGTGCCAGGGAATCCCTT  200

seq1  TTCTGAAGGTAGTGACTATAACACAGGCCTCGAACTTCACAGTGTGGACT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAGGTAGTGACTATAACACAGGCCTCGAACTTCACAGTGTGGACT  250

seq1  TCAGACTGCGTTCCCATAGTAGGAGACCACCCACCCAGCCTCAACTGGAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACTGCGTTCCCATAGTAGGAGACCACCCACCCAGCCTCAACTGGAC  300

seq1  ATGTTTACTCCTCTACCAGGGACATGGAAGTTGCTAAGTGTGTGGGTGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTACTCCTCTACCAGGGACATGGAAGTTGCTAAGTGTGTGGGTGAG  350

seq1  GCAGACAGAAAGAATTCCCCCATTCAGTCACACACTACTGTGTTTATATG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGACAGAAAGAATTCCCCCATTCAGTCACACACTACTGTGTTTATATG  400

seq1  GCCTGTGGCGTAGCTATCCTCAACTTCCTAGCACTAGAAATCTGTACTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGGCGTAGCTATCCTCAACTTCCTAGCACTAGAAATCTGTACTGT  450

seq1  TTAGTAAGACCTTGACAAAGCGACCTTCGGCTGAGAGATTCACCACAGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAAGACCTTGACAAAGCGACCTTCGGCTGAGAGATTCACCACAGAA  500

seq1  GGGACGCATTCTGCCAACTTCCCGTTGATTTAATTAGCTGTTGAAGTGCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACGCATTCTGCCAACTTCCCGTTGATTTAATTAGCTGTTGAAGTGCT  550

seq1  GTATTGCTGCTGGTAATTCCTAGATACTCCTCTTCCTCTGCTCCAGTCGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGCTGCTGGTAATTCCTAGATACTCCTCTTCCTCTGCTCCAGTCGT  600

seq1  AATTATAATAATAAGAATTAGCTTTTCATCTATTACCCCACAATTTGCCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATAATAATAAGAATTAGCTTTTCATCTATTACCCCACAATTTGCCA  650

seq1  GGATTTGTCCCAAGCTGTAAACCTGGATCCAATGAGTTGATGGCCTCAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGTCCCAAGCTGTAAACCTGGATCCAATGAGTTGATGGCCTCAAA  700

seq1  TATACACACAGCC-TCAATGTAGATAGCATTCAACTGGCCTGC-TTACTT  747
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATACACACAGCCTTCAATGTAGATAGCATTCAACTGGCCTGCTTTACTT  750

seq1  AAGAACCAAAAGTATACAGGTCCC-TTTGAGACC-CAGACCACAACACTG  795
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAGAACCAAAAGTATACAGGTCCCTTTTGAGACCTCAGACCACAACACTG  800

seq1  GCTCCACTATGGCACACAGTCTGTCTGTCCTGCTAGCAA-CCCCATGTAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCTCCACTATGGCACACAGTCTGTCTGTCCTGCTAGCAACCCCCATGTAG  850

seq1  -AAACACAGACAGGAACAGAATTGAGCACTCCAGCTCCCTTGTCCCCCCT  893
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACAGACAGGAACAGAATTGAGCACTCCAGCTCCCTTGTCCCCCCT  900

seq1  GCATACCCAGCCATGTCTGAGATACAGGAAGTTTTACCAGCTGCCTGTGC  943
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACCCAGTCATGTCTGAGATACAGGAAGTTTTACCAGCTGCCTGTGC  950

seq1  TCATGGATATTTGATAAGGGGAGAG-CGGGGGTGGGGGGG  982
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCATGGATATTTGATAAGGGGAGAGCCGGGGGTGGGGGGG  990

seq1: chr8_11100365_11100598
seq2: B6Ng01-214I05.g_71_302 (reverse)

seq1  ATTGCTTATCATGCTCTGTACCCCTCAAGAGGAGTTAGTTACCACCACCA  50
      ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||
seq2  ATTGCTTATCTAGCTCTGTACCCCTCAAGAGGAGTTAGTT--CCCCACCA  48

seq1  CCACCACCATGACCACCTCCACCTCCCACTTGTGTCCCTCCTCCTCCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACCATGACCACCTCCACCTCCCACTTGTGTCCCTCCTCCTCCTCC  98

seq1  TGTGTGCCCAAACACAGCCAGGGCTAACTCATTTCTTCAATACATTGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCCCAAACACAGCCAGGGCTAACTCATTTCTTCAATACATTGTGC  148

seq1  AATTCCAAAGTAGCACTTAGTAAGTGGAAAGGATTTCAGCAAGCACTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAAAGTAGCACTTAGTAAGTGGAAAGGATTTCAGCAAGCACTTCC  198

seq1  TCTAATACAGAAATTCCGAAGCCCTCTAAGAAGT  234
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATACAGAAATTCCGAAGCCCTCTAAGAAGT  232