BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257C19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 32,986,306 - 33,157,260
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNrg1
Upstream geneLOC547008, Dusp26, Rnf122, BC019943, Rbm13, Fut10, LOC666330, LOC666568, 7420700N18Rik, LOC100041329, EG330731, LOC100041340
Downstream gene2010007E15Rik, EG666589, EG546052, LOC100042715, LOC628408
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257C19.bB6Ng01-257C19.g
ACCGA062940GA062941
length1,164862
definitionB6Ng01-257C19.b B6Ng01-257C19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,986,306 - 32,987,464)(33,156,411 - 33,157,260)
sequence
gaattcacctttggtttctagccccaacattaaaggatgtccacatgtga
ttaagttcaaagatggtctatacacccagacaactgtcactgttctatta
aatcagattcggttccctccaactgcattcatcactaagtcaggcaagct
gcttaactaattagcatctgggccccagaactgcactaattcactgattc
aatttttgtgtcactgcaggcaaaccgaacccctcaatcactgtcagcta
cagactaggaggaagtcaagaagtttcatttttaatgattacttaatttg
agttatagctgtatggcagtcttatgcacgcaatattgtccatccatgat
ttcaactggttgaacacaaaaccaaggcagatcagacaaacacagcacaa
gctcactgccagcatacagagaacgcataccacccctaaaggcagaataa
ttacgggtcagtttttggttctgtgtcactggaagcatctatggtaactg
tagagttccttcctgggaaggtttctgctttatctgtgagtggagaaggt
gtatgttgtatttccttatgggcttctctttggaggtaggggctagactc
tgtgcttctagaagtcgccacttgcctaagatgttactgttgtatgtaaa
actcaaaacccagttaactttatggaggtactattgtctcatgtctatga
catacgtgatcccaaaattatacagatcataaatctcacagactggcttt
gtgccctggagtaggcatggagaatttcagctatttttctagctagacca
ttaaacctctacgttgccattcttcattcctaagcattgtcaaatctcct
ttatgtgtaccttattaatagtggtttctaccttttgtaatctcaaatgt
tttcccttccctgtaatcaaagatgggtatagcagctacataatacttta
tcactgaggtgtgtgtcttagatgccctttgctagatttggcatttcaga
agtacaaagcaatcccttaatagctagaagaatcgtcctcagccctcata
agtctgtcgcatgaacattaccctacagtggcttcactaactatattttg
gcgatgttttgtttctacctccttctctctttccgaatgtttccttggct
gttaatataaaaga
gaattccttatgaagactaggctggcctctaacagagattcacctgcctc
aatttcccaagtactgagattacaggtacatgctacatcatctggctctt
aagggaattgtttaggatttatgctatactttcccatctttcaatttgat
cttcccataggtaccaattggacagttaaagacagggagaactgaaagtc
atttcaaatcaaacctaagatatcacctgccatctgatggtcattaagct
tgttatgcctcaaaacaaataatggcttttatggggatatgagagagatc
tcttcaaagaggatgtggaatgtccaatcctgtgatccaaagtcattccc
aaagctagatagaggttcagcaactgggaggccgaagcagggctattcca
tgtttaaagcctaggttgaactgtatagtaagacattgcctcaagacaga
gtggcagaaagagagaaggaagggaaggaaggggaacaggaggaaaggag
aggcagcagtgaccctctttgtatgagtagtaggaactgcctggctggtg
ggagtgcgggggaatggggaggggataatccactactggcaggtgataat
tttgggggtcttgctgagtagtaacaatgcaataaccacagagacatcaa
aaggctcatgcagatattaagttttacctcaaaagttttacttcttcccc
catccaccttgagactagagattaaacaacatgtgtcctttcagcaagaa
taggcacagggacagaaatggctccctgtcacataagaaaagcttctaca
acttccttccatgggatatttgattctctatttctagggaggaatgaagt
atctacgagttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_32986306_32987464
seq2: B6Ng01-257C19.b_45_1208

seq1  GAATTCACCTTTGGTTTCTAGCCCCAACATTAAAGGATGTCCACATGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTTGGTTTCTAGCCCCAACATTAAAGGATGTCCACATGTGA  50

seq1  TTAAGTTCAAAGATGGTCTATACACCCAGACAACTGTCACTGTTCTATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTCAAAGATGGTCTATACACCCAGACAACTGTCACTGTTCTATTA  100

seq1  AATCAGATTCGGTTCCCTCCAACTGCATTCATCACTAAGTCAGGCAAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAGATTCGGTTCCCTCCAACTGCATTCATCACTAAGTCAGGCAAGCT  150

seq1  GCTTAACTAATTAGCATCTGGGCCCCAGAACTGCACTAATTCACTGATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAACTAATTAGCATCTGGGCCCCAGAACTGCACTAATTCACTGATTC  200

seq1  AATTTTTGTGTCACTGCAGGCAAACCGAACCCCTCAATCACTGTCAGCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTGTGTCACTGCAGGCAAACCGAACCCCTCAATCACTGTCAGCTA  250

seq1  CAGACTAGGAGGAAGTCAAGAAGTTTCATTTTTAATGATTACTTAATTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTAGGAGGAAGTCAAGAAGTTTCATTTTTAATGATTACTTAATTTG  300

seq1  AGTTATAGCTGTATGGCAGTCTTATGCACGCAATATTGTCCATCCATGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGCTGTATGGCAGTCTTATGCACGCAATATTGTCCATCCATGAT  350

seq1  TTCAACTGGTTGAACACAAAACCAAGGCAGATCAGACAAACACAGCACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTGGTTGAACACAAAACCAAGGCAGATCAGACAAACACAGCACAA  400

seq1  GCTCACTGCCAGCATACAGAGAACGCATACCACCCCTAAAGGCAGAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACTGCCAGCATACAGAGAACGCATACCACCCCTAAAGGCAGAATAA  450

seq1  TTACGGGTCAGTTTTTGGTTCTGTGTCACTGGAAGCATCTATGGTAACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGGGTCAGTTTTTGGTTCTGTGTCACTGGAAGCATCTATGGTAACTG  500

seq1  TAGAGTTCCTTCCTGGGAAGGTTTCTGCTTTATCTGTGAGTGGAGAAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTTCCTTCCTGGGAAGGTTTCTGCTTTATCTGTGAGTGGAGAAGGT  550

seq1  GTATGTTGTATTTCCTTATGGGCTTCTCTTTGGAGGTAGGGGCTAGACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTTGTATTTCCTTATGGGCTTCTCTTTGGAGGTAGGGGCTAGACTC  600

seq1  TGTGCTTCTAGAAGTCGCCACTTGCCTAAGATGTTACTGTTGTATGTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTCTAGAAGTCGCCACTTGCCTAAGATGTTACTGTTGTATGTAAA  650

seq1  ACTCAAAACCCAGTTAACTTTATGGAGGTACTATTGTCTCATGTCTATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAAACCCAGTTAACTTTATGGAGGTACTATTGTCTCATGTCTATGA  700

seq1  CATACGTGATCCCAAAATTATACAGATCATAAATCTCACAGACTGGCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGTGATCCCAAAATTATACAGATCATAAATCTCACAGACTGGCTTT  750

seq1  GTGCCCTGGAGTAGGCATGGAGAATTTCAGCTATTTTTCTAGCTAGACCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCTGGAGTAGGCATGGAGAATTTCAGCTATTTTTCTAGCTAGACCA  800

seq1  TTAAACCTCTACGTTGCCATTCTTCATTCCTAAGCATTGTCAAATCTCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACCTCTACGTTGCCATTCTTCATTCCTAAGCATTGTCAAATCTCCT  850

seq1  TTATGTGTACCTTATTAATAGTGGTTTCTACCTTTTGTAATCTCAAATGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTGTACCTTATTAATAGTGGTTTCTACCTTTTGTAATCTCAAATGT  900

seq1  TTTCCCTTCCCTGTAATCAAAGATGGGTATAGCAGCTACATAATACTTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTCCCTGTAATCAAAGATGGGTATAGCAGCTACATAATACTTTA  950

seq1  TCACTGAGGGTGTGTGTCTTAGGATGCCC-TTGCTAGATTTGGCATTTCA  999
      ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGA-GGTGTGTGTCTTA-GATGCCCTTTGCTAGATTTGGCATTTCA  998

seq1  GAAGTACAAAGCAATCCCTTAATAGCTAGAAG-ATCGT-CTCAGCCCTCA  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
seq2  GAAGTACAAAGCAATCCCTTAATAGCTAGAAGAATCGTCCTCAGCCCTCA  1048

seq1  TAAGTCTGTCGCAATGACATTA-CCTACAGTGGTATCACTAACTTATA-T  1095
      |||||||||||||   |||||| ||||||||||  |||||||| |||| |
seq2  TAAGTCTGTCGCATGAACATTACCCTACAGTGGCTTCACTAAC-TATATT  1097

seq1  TTGGCGATGTTTTG-TTCTACACTCCTTCTCTC-TTCCAGATG-TTCCTT  1142
      |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||
seq2  TTGGCGATGTTTTGTTTCTAC-CTCCTTCTCTCTTTCCGAATGTTTCCTT  1146

seq1  GGCTGTT-ATATAAAAGA  1159
      ||||||| ||||||||||
seq2  GGCTGTTAATATAAAAGA  1164

seq1: chr8_33156411_33157260
seq2: B6Ng01-257C19.g_67_928 (reverse)

seq1  CAACTCGTGGATACTTCATTCCTCCCTAG-AATAGGGAATAAAATAT-CC  48
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||
seq2  CAACTCGTAGATACTTCATTCCTCCCTAGAAATAGAGAATCAAATATCCC  50

seq1  ATGGAAGG-AGTTGT-GGAGCTTGTCTTATGTGACA-GGAGCCATTTCTG  95
      |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATGGAAGGAAGTTGTAGAAGCTTTTCTTATGTGACAGGGAGCCATTTCTG  100

seq1  TCCCTGTGCCTATTCTTGCTG-AAGGACACATGTTGCTT-ATCTCTAGTC  143
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||
seq2  TCCCTGTGCCTATTCTTGCTGAAAGGACACATGTTGTTTAATCTCTAGTC  150

seq1  TCAAGGTGGCT-GGGGAAGAAGTAAAACTTCTGAGGTAAAACTTAATATC  192
      ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGTGGATGGGGGAAGAAGTAAAACTTTTGAGGTAAAACTTAATATC  200

seq1  TGCATGAGCC-TTTGATGTCTCTGT-GTTATTGCATTGTTACTACTCAGC  240
      |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGAGCCTTTTGATGTCTCTGTGGTTATTGCATTGTTACTACTCAGC  250

seq1  AAGACCCC--AAATTATCACCTGCCAGTAGTGGATTATCCCCTCCCCATT  288
      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCCCCAAAATTATCACCTGCCAGTAGTGGATTATCCCCTCCCCATT  300

seq1  CCCCCGCACTCCCACCAGCCAGGCAGTTCCTACTACTCATACAAAGAGGG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCGCACTCCCACCAGCCAGGCAGTTCCTACTACTCATACAAAGAGGG  350

seq1  TCACTGCTGCCTCTCCTTTCCTCCTGTTCCCCTTCCTTCCCTTCCTTCTC  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCTGCCTCTCCTTTCCTCCTGTTCCCCTTCCTTCCCTTCCTTCTC  400

seq1  TCTTTCTGCCACTCTGTCTTGAGGCAATGTCTTACTATACAGTTCAACCT  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTGCCACTCTGTCTTGAGGCAATGTCTTACTATACAGTTCAACCT  450

seq1  AGGCTTTAAACATGGAATAGCCCTGCTTCGGCCTCCCAGTTGCTGAACCT  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTTAAACATGGAATAGCCCTGCTTCGGCCTCCCAGTTGCTGAACCT  500

seq1  CTATCTAGCTTTGGGAATGACTTTGGATCACAGGATTGGACATTCCACAT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTAGCTTTGGGAATGACTTTGGATCACAGGATTGGACATTCCACAT  550

seq1  CCTCTTTGAAGAGATCTCTCTCATATCCCCATAAAAGCCATTATTTGTTT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTTGAAGAGATCTCTCTCATATCCCCATAAAAGCCATTATTTGTTT  600

seq1  TGAGGCATAACAAGCTTAATGACCATCAGATGGCAGGTGATATCTTAGGT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCATAACAAGCTTAATGACCATCAGATGGCAGGTGATATCTTAGGT  650

seq1  TTGATTTGAAATGACTTTCAGTTCTCCCTGTCTTTAACTGTCCAATTGGT  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTGAAATGACTTTCAGTTCTCCCTGTCTTTAACTGTCCAATTGGT  700

seq1  ACCTATGGGAAGATCAAATTGAAAGATGGGAAAGTATAGCATAAATCCTA  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATGGGAAGATCAAATTGAAAGATGGGAAAGTATAGCATAAATCCTA  750

seq1  AACAATTCCCTTAAGAGCCAGATGATGTAGCATGTACCTGTAATCTCAGT  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTCCCTTAAGAGCCAGATGATGTAGCATGTACCTGTAATCTCAGT  800

seq1  ACTTGGGAAATTGAGGCAGGTGAATCTCTGTTAGAGGCCAGCCTAGTCTT  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGAAATTGAGGCAGGTGAATCTCTGTTAGAGGCCAGCCTAGTCTT  850

seq1  CATAAGGAATTC  850
      ||||||||||||
seq2  CATAAGGAATTC  862