BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257D16
Chromosome8 (Build37)
Map Location 127,424,048 - 127,541,997
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm505, Egln1, Tsnax
Upstream geneNup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535, Galnt2, Pgbd5, Cog2, Agt, Capn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67, 2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8
Downstream geneDisc1, Sipa1l2, 4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257D16.bB6Ng01-257D16.g
ACCGA062982GA062983
length1,1791,124
definitionB6Ng01-257D16.b B6Ng01-257D16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,540,807 - 127,541,997)(127,424,048 - 127,425,171)
sequence
gaattcagctacagtgtactcatataagtaaataaatcttaaaaaaaaaa
aagagaaccaagacctatcattaaacataaataatcttataagcaccccc
actggctgtcataaattgccagaattgattttttaaatgcaagagaaaca
agaaatccagcttaaaagtagatatagcattgttctgctttgtttttaaa
ggaagctgatgtggttttatgtctctaatcacaggacttagaaggtggac
acaggattataagatcctgtctcaaaaaagaaaatcaatgaacaatggag
ccaatggccagaaatgaaattgtagttaaaataagatagtacttgccagt
atgtgcaaggtcctgggtccaatcaccacgcaaaaaaaaaatcaaagaat
tttaagttattggaacggaatgcttcaaaaatattttgaatagtaaaaat
gcaatgaattacatctgttcttcactaaacaaagatacatccacctccct
agaggcgcctggccttcatcctggggagctggaggcagacaaaggctgaa
gcagacactctctgccccacacaggatagagaagcagaaagagtgcggag
atgaaaagctctgcaggctgagcatccctgagtcctcagggctccaaccc
actgcctgctctgctctgctctgctctgctctgctctgcagttcttccag
cccagacaccagaggaaacctccccagaaaaccaagagagtccccctgga
gagagaaaacgaaaagcaagaaatgccacggctcaaagagaagctgttaa
agagctgagcagcggcagcacagcacactgtaagaatgcaaaagcagaca
cactatcttacaacaggaacaagaaccagaaacacacaggtatgcaatga
gtcgaaaactgaatgagaaattaaccatagtttcacatctaatttataaa
tcatctgatcctttaatgtaataggctctaaaacataatccaaaatttag
catattttttcagactatcctatacatatcatgtagtatacataaatgca
ctatatatatatatatatatatataatatataaataatgatccaaactac
aggtatgaggtcgtagtaagataaaagaagacttccctcctattttaaat
attgcttggaacttgaagaacggctcagc
gaattccttttatctttagacatgccctagaaaattaatacgctggtttt
ctgtttcagactcttttgcatgaaatgatacatgcctacttatttgtcac
taataatgataaagaccgggaaggacacggcccagagttctgtaaacata
tgcatcgaatcaaccaactgacaggagccaacataacggtatactgagcc
acacaggtgtggggagcaagcaagatcagggttttactgtctagcccagt
ctggcctcaaactcacaattctaactcagcccaagtggtgggattatggg
tatgtgctaccaaacccagtagccattcagtaaaagtgaactaggtagaa
acggatatttttagccttgagcaaaagccctatcatctaggctctaggtg
gagtggctaaggagccagcaagcctctttgctggggcttccattaactgc
aggtcagcatctcaggcatacattatcctcctctgaccttcaggggcagc
tccagctcatcctaaattctccctcatcgtcccgacagtgacaatgttgg
aggagatatcacagccagggctgaggtgtgctgtcccctacactaggggt
catgcctatatccagaactgtctgttgctatgcaatgatgtaacagcagt
tttgagctcttgaccgtaaggatgtacagtgtctcagcaccctgagcact
gactaaatgttgttaattatggggattttctttgtttccttgggaaggat
ttggccctttagcagtttttatcatttctaggaacttaagcaaatatgtg
tgctttctaacatttccctttttacttagttttattttctatgtgcattg
atgctttgcttgcatgtgtgtctatgggagttacagacagctgtgagctt
gtattgtgggtgctggcaactgaaccagagtcctctggaagaagtagcca
gagcttcttaaccgatgagccatcttctccagtcccatggtcttttctcc
ctgttggcagttttattaaggtgctgtggtaaccttctcgggtctagctt
ttaggtggtgatggtgtcatctctgcaacgttactttcatgagtgtttcg
ggttgggagttttcccccaccaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_127540807_127541997
seq2: B6Ng01-257D16.b_49_1227 (reverse)

seq1  GCTGAGCCGTCTCTCAAGTTCCCAAAAGCAATATTTTAAAAATAGGAGGG  50
      ||||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||
seq2  GCTGAGCCGTTCTTCAAGTTCC---AAGCAATATTT--AAAATAGGAGGG  45

seq1  AAAATTCTTTCTTTTATCTTACCTAAGGACTTCATA-CTGT-GTTTGGAT  98
        || || ||||||||||||||   | ||| ||||| |||| ||||||||
seq2  --AAGTC-TTCTTTTATCTTAC--TACGACCTCATACCTGTAGTTTGGAT  90

seq1  CATTTATTTATATATAATATAATATAATATATATATATATAGTGCATTTA  148
      || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CA-TTATTTATATATTATAT-ATAT-ATATATATATATATAGTGCATTTA  137

seq1  TGTATACTACATGATATGTATAAGGATAGTCTGAAAAAATATGCTAAATT  198
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATACTACATGATATGTAT-AGGATAGTCTGAAAAAATATGCTAAATT  186

seq1  TTGGATTATGTTTTAGAGCCTATTACATTAAAGGATCAGATGATTTATAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATTATGTTTTAGAGCCTATTACATTAAAGGATCAGATGATTTATAA  236

seq1  ATTAGATGTGAAACTATGGTTAATTTCTCATTCAGTTTTCGACTCATTGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGATGTGAAACTATGGTTAATTTCTCATTCAGTTTTCGACTCATTGC  286

seq1  ATACCTGTGTGTTTCTGGTTCTTGTTCCTGTTGTAAGATAGTGTGTCTGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTGTGTGTTTCTGGTTCTTGTTCCTGTTGTAAGATAGTGTGTCTGC  336

seq1  TTTTGCATTCTTACAGTGTGCTGTGCTGCCGCTGCTCAGCTCTTTAACAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCATTCTTACAGTGTGCTGTGCTGCCGCTGCTCAGCTCTTTAACAG  386

seq1  CTTCTCTTTGAGCCGTGGCATTTCTTGCTTTTCGTTTTCTCTCTCCAGGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTTTGAGCCGTGGCATTTCTTGCTTTTCGTTTTCTCTCTCCAGGG  436

seq1  GGACTCTCTTGGTTTTCTGGGGAGGTTTCCTCTGGTGTCTGGGCTGGAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTCTTGGTTTTCTGGGGAGGTTTCCTCTGGTGTCTGGGCTGGAAG  486

seq1  AACTGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGGCAGTGGGTTGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGAGCAGGCAGTGGGTTGG  536

seq1  AGCCCTGAGGACTCAGGGATGCTCAGCCTGCAGAGCTTTTCATCTCCGCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGAGGACTCAGGGATGCTCAGCCTGCAGAGCTTTTCATCTCCGCA  586

seq1  CTCTTTCTGCTTCTCTATCCTGTGTGGGGCAGAGAGTGTCTGCTTCAGCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCTGCTTCTCTATCCTGTGTGGGGCAGAGAGTGTCTGCTTCAGCC  636

seq1  TTTGTCTGCCTCCAGCTCCCCAGGATGAAGGCCAGGCGCCTCTAGGGAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTGCCTCCAGCTCCCCAGGATGAAGGCCAGGCGCCTCTAGGGAGG  686

seq1  TGGATGTATCTTTGTTTAGTGAAGAACAGATGTAATTCATTGCATTTTTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTATCTTTGTTTAGTGAAGAACAGATGTAATTCATTGCATTTTTA  736

seq1  CTATTCAAAATATTTTTGAAGCATTCCGTTCCAATAACTTAAAATTCTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCAAAATATTTTTGAAGCATTCCGTTCCAATAACTTAAAATTCTTT  786

seq1  GATTTTTTTTTTGCGTGGTGATTGGACCCAGGACCTTGCACATACTGGCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTTTTTTGCGTGGTGATTGGACCCAGGACCTTGCACATACTGGCA  836

seq1  AGTACTATCTTATTTTAACTACAATTTCATTTCTGGCCATTGGCTCCATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTATCTTATTTTAACTACAATTTCATTTCTGGCCATTGGCTCCATT  886

seq1  GTTCATTGATTTTCTTTTTTGAGACAGGATCTTATAATCCTGTGTCCACC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATTGATTTTCTTTTTTGAGACAGGATCTTATAATCCTGTGTCCACC  936

seq1  TTCTAAGTCCTGTGATTAGAGACATAAAACCACATCAGCTTCCTTTAAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGTCCTGTGATTAGAGACATAAAACCACATCAGCTTCCTTTAAAA  986

seq1  ACAAAGCAGAACAATGCTATATCTACTTTTAAGCTGGATTTCTTGTTTCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCAGAACAATGCTATATCTACTTTTAAGCTGGATTTCTTGTTTCT  1036

seq1  CTTGCATTTAAAAAATCAATTCTGGCAATTTATGACAGCCAGTGGGGGTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATTTAAAAAATCAATTCTGGCAATTTATGACAGCCAGTGGGGGTG  1086

seq1  CTTATAAGATTATTTATGTTTAATGATAGGTCTTGGTTCTCTTTTTTTTT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAAGATTATTTATGTTTAATGATAGGTCTTGGTTCTCTTTTTTTTT  1136

seq1  TTTAAGATTTATTTACTTATATGAGTACACTGTAGCTGAATTC  1191
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGATTTATTTACTTATATGAGTACACTGTAGCTGAATTC  1179

seq1: chr8_127424048_127425171
seq2: B6Ng01-257D16.g_64_1187

seq1  GAATTCCTTTTATCTTTAGACATGCCCTAGAAAATTAATACGCTGGTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTTATCTTTAGACATGCCCTAGAAAATTAATACGCTGGTTTT  50

seq1  CTGTTTCAGACTCTTTTGCATGAAATGATACATGCCTACTTATTTGTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCAGACTCTTTTGCATGAAATGATACATGCCTACTTATTTGTCAC  100

seq1  TAATAATGATAAAGACCGGGAAGGACACGGCCCAGAGTTCTGTAAACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATGATAAAGACCGGGAAGGACACGGCCCAGAGTTCTGTAAACATA  150

seq1  TGCATCGAATCAACCAACTGACAGGAGCCAACATAACGGTATACTGAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCGAATCAACCAACTGACAGGAGCCAACATAACGGTATACTGAGCC  200

seq1  ACACAGGTGTGGGGAGCAAGCAAGATCAGGGTTTTACTGTCTAGCCCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGGTGTGGGGAGCAAGCAAGATCAGGGTTTTACTGTCTAGCCCAGT  250

seq1  CTGGCCTCAAACTCACAATTCTAACTCAGCCCAAGTGGTGGGATTATGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTCAAACTCACAATTCTAACTCAGCCCAAGTGGTGGGATTATGGG  300

seq1  TATGTGCTACCAAACCCAGTAGCCATTCAGTAAAAGTGAACTAGGTAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCTACCAAACCCAGTAGCCATTCAGTAAAAGTGAACTAGGTAGAA  350

seq1  ACGGATATTTTTAGCCTTGAGCAAAAGCCCTATCATCTAGGCTCTAGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGATATTTTTAGCCTTGAGCAAAAGCCCTATCATCTAGGCTCTAGGTG  400

seq1  GAGTGGCTAAGGAGCCAGCAAGCCTCTTTGCTGGGGCTTCCATTAACTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGCTAAGGAGCCAGCAAGCCTCTTTGCTGGGGCTTCCATTAACTGC  450

seq1  AGGTCAGCATCTCAGGCATACATTATCCTCCTCTGACCTTCAGGGGCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCAGCATCTCAGGCATACATTATCCTCCTCTGACCTTCAGGGGCAGC  500

seq1  TCCAGCTCATCCTAAATTCTCCCTCATCGTCCCGACAGTGACAATGTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTCATCCTAAATTCTCCCTCATCGTCCCGACAGTGACAATGTTGG  550

seq1  AGGAGATATCACAGCCAGGGCTGAGGTGTGCTGTCCCCTACACTAGGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATATCACAGCCAGGGCTGAGGTGTGCTGTCCCCTACACTAGGGGT  600

seq1  CATGCCTATATCCAGAACTGTCTGTTGCTATGCAATGATGTAACAGCAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCTATATCCAGAACTGTCTGTTGCTATGCAATGATGTAACAGCAGT  650

seq1  TTTGAGCTCTTGACCGTAAGGATGTACAGTGTCTCAGCACCCTGAGCACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGCTCTTGACCGTAAGGATGTACAGTGTCTCAGCACCCTGAGCACT  700

seq1  GACTAAATGTTGTTAATTATGGGGATTTTCTTTGTTTCCTTGGGAAGGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAATGTTGTTAATTATGGGGATTTTCTTTGTTTCCTTGGGAAGGAT  750

seq1  TTGGCCCTTTAGCAGTTTTTATCATTTCTAGGAACTTAAGCAAATATGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCCTTTAGCAGTTTTTATCATTTCTAGGAACTTAAGCAAATATGTG  800

seq1  TGCTTTCTAACATTTCCCTTTTTACTTAGTTTTATTTTCTATGTGCATTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCTAACATTTCCCTTTTTACTTAGTTTTATTTTCTATGTGCATTG  850

seq1  ATGCTTTGCTTGCATGTGTGTCTATGGGAGTTACAGACAGCTGTGAGC-T  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATGCTTTGCTTGCATGTGTGTCTATGGGAGTTACAGACAGCTGTGAGCTT  900

seq1  GTATTGTGGGTGCTGGCAACTGAACCAGAGTCCTCTGGAAG-AGTAGCCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTATTGTGGGTGCTGGCAACTGAACCAGAGTCCTCTGGAAGAAGTAGCCA  950

seq1  GAGC-TCTTAACCGATGAGCCATC-TCTCCAGTCCCATGGTC-TTTCTCC  995
      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAGCTTCTTAACCGATGAGCCATCTTCTCCAGTCCCATGGTCTTTTCTCC  1000

seq1  CTGTTGGCAG-TTTATTAAGGTGCTGTGGTAAACCTCTTCGGGTCTAGCT  1044
      |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||
seq2  CTGTTGGCAGTTTTATTAAGGTGCTGTGGT-AACCTTCTCGGGTCTAGCT  1049

seq1  TTTA-GTGGTGGTGGTGTTCATTCTCTGCAACGTTTACTTTCATGGAGGT  1093
      |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   ||
seq2  TTTAGGTGGTGATGGTG-TCA-TCTCTGCAACG-TTACTTTCATG--AGT  1094

seq1  GTTTTCTGGTTGTGAGTTTTCCCCCACCAAA  1124
      | |||| ||||| ||||||||||||||||||
seq2  G-TTTCGGGTTGGGAGTTTTCCCCCACCAAA  1124