BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-265H14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 127,355,411 - 127,469,573
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8, Gm505, Egln1
Upstream geneRab4a, 1700054N08Rik, LOC100043296, Acta1, Nup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535, Galnt2, Pgbd5, Cog2, Agt, Capn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67
Downstream geneTsnax, Disc1, Sipa1l2, 4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-265H14.bB6Ng01-265H14.g
ACCGA069113GA069114
length1,1001,167
definitionB6Ng01-265H14.b B6Ng01-265H14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,468,475 - 127,469,573)(127,355,411 - 127,356,585)
sequence
gaattcatagccctgcctctgcctcccaagggctgggtttaaaggcacgt
ggcactttctagttttgatagttatctctgttgatggtgaggggacatga
cattggcgctctgggtctggctctgcaaacgtttttgacggtacaatctt
tacttcacatactcaaaagcagctgtgtgtttagtcactaagctgtgctg
ttttaagtctgtctctctaaggggttccccaaaggaggccattatggttg
gttgtcttggggagtgttatctctcgtccttgtcttgttagagctgtttc
ctaccagtgtgtattgctcacttcagctactggagcggtagccgttgtca
gtgcctggttcccgcctcagagttagaagagcttgaggggaccacctctc
tcactcgaagttctgtaagacaccaggagtaccttttatttatttattta
ttttaaattgtgtgcacaggtgttttgtctgcatgtctgtctgtctgtgc
cccacacatgtacagtacccaatgcaggccagacgaggacatggatccct
ctggactggaattatagatactcgctagctgtggtggtgttggggctggg
aattgaaccgaggtcctctagaagtgctcttaaccactgagccattgctt
caacccccaaatacggggatttaagtcgggtcttccagccaagttccgag
ttttctgtcacatcttctatgtatacatgaggacatggtcatcaagttgt
gagacttcacaggttgcccttccccagtgtctgcctcagactctggcaac
tgcttgtcctccctcttaaaaagaggaccccccccccccccccaccaagg
gaaggtgaagtaacacgggagaagaccagaaacgtgattgttgtgggctg
ctgtacccacctccactctctaccctctcagggatccttctcaccctttt
tcttgcccttaagctgcctttgacctcttagcccttcctcacatcctcct
ttcatctggttgctcacggtgaacatcagtgcaggagcacagtctttcca
tgtacgagcatgtctgaccactgtcagagggcactaggcctctggtagct

gaattcactatacagctcaggctagccttgaactcacagcaatcctcctg
cctcagcctcctgagtactgggattacagaggtgagcaccacatccaact
cagatgacctctttaaggaggttccctggggttgaacacagcagagccag
ctccccgccccccacaggagtatgagtgggcggggctagctgtctccctt
tgctcactggagcccagaagcaatatgctggtgccagggacagcccaggc
agccctgcacagccacctctcccctgccttctgcacagggcgcctttcag
ggacaagaacgcatggaggagagtagggtaagacggggtctcatgattcg
ggtttgaggcaactggaaaagtggcaaggccctgggatcatggggttcta
tcccatggagtccttagcagctggcactgaggttccgctgctgtatatga
gtgataccagcataaggccttcctttgtgagccactgagaaggacctcgg
ggtaagtctgtcaaatgtccgcgagaaggaaattcagctcctgagcctgt
tctctgggtgagtcaatgaacgtcaattccttttgaatgagtgtccttga
taagtacccactggcacccactctacacacagcacctcttccctctcagc
aggacagcagtgcccacagagcaggtttttccttctctgtcctgtctggg
aacacagccccagttttaggagacaggcaccaaccttggcagtctcacac
cgtgtgtggtccaggctgtacccttcagatctttatgtggttccaaaatg
tccttagctgccctgtggcctgaaggaatccagagccagggagcaatatg
ctgatagcagggtgggccctgaacatggacaagctctgtgagagaagggg
taggggtgaccactttactgagccctgtcttctgtgaaaggtaccctaac
ccctcttcaggtcagtgaccatgggcacgttacctttcccaggggcatca
tgtcagcctttcattcttgagtgaaggcttgccccctgagtctgagacat
gattcatgctgctgcccgggattgcttcatcctatgactgttgccagagg
tgaggggtgattaatccattgggggtcctagaacactccaggactgtggg
gtgaacccagggactct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_127468475_127469573
seq2: B6Ng01-265H14.b_46_1145 (reverse)

seq1  AGCTA-CAGA-GCCT-GTGCCCTCTGACAGTGCTCAGACATTGCTCTGTA  47
      ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||
seq2  AGCTACCAGAGGCCTAGTGCCCTCTGACAGTGGTCAGACA-TGCTC-GTA  48

seq1  CAAGGGAAGACTGTGGCTCCCTGCCACTGATG-TCACCGTGAGCCAACCA  96
      || || |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||
seq2  CATGGAAAGACTGT-GCT-CCTG-CACTGATGTTCACCGTGAG-CAACCA  94

seq1  GATGGAAGGAAGGATGTGA-GAAAGGCTAAGAGGTCAAAGGGCAGCTTAA  145
      |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GATGAAAGG-AGGATGTGAGGAAGGGCTAAGAGGTCAAA-GGCAGCTTAA  142

seq1  GGGCAAG-AAAAGGGTGAG-AGGATCCCTGAGAGGGTAGAGAGTGGAGGT  193
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGAAAAAGGGTGAGAAGGATCCCTGAGAGGGTAGAGAGTGGAGGT  192

seq1  GGGTACAGCAG-CCACAACAATCACGTTTCTGGTCTTCTCCCGTGTTACT  242
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACAGCAGCCCACAACAATCACGTTTCTGGTCTTCTCCCGTGTTACT  242

seq1  TCACCTTCCCTTGGT-GGGGGGGGGGGGGGGTCCTCTTTTTAAGAGGGAG  291
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTCCCTTGGTGGGGGGGGGGGGGGGGTCCTCTTTTTAAGAGGGAG  292

seq1  GACAAGCAGTTGCCAGAGTCTGAGGCAGACACTGGGGAAGGGCAACCTGT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGCAGTTGCCAGAGTCTGAGGCAGACACTGGGGAAGGGCAACCTGT  342

seq1  GAAGTCTCACAACTTGATGACCATGTCCTCATGTATACATAGAAGATGTG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTCACAACTTGATGACCATGTCCTCATGTATACATAGAAGATGTG  392

seq1  ACAGAAAACTCGGAACTTGGCTGGAAGACCCGACTTAAATCCCCGTATTT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAACTCGGAACTTGGCTGGAAGACCCGACTTAAATCCCCGTATTT  442

seq1  GGGGGTTGAAGCAATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTTCTAGAGGACCTCG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTTGAAGCAATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTTCTAGAGGACCTCG  492

seq1  GTTCAATTCCCAGCCCCAACACCACCACAGCTAGCGAGTATCTATAATTC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAATTCCCAGCCCCAACACCACCACAGCTAGCGAGTATCTATAATTC  542

seq1  CAGTCCAGAGGGATCCATGTCCTCGTCTGGCCTGCATTGGGTACTGTACA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCAGAGGGATCCATGTCCTCGTCTGGCCTGCATTGGGTACTGTACA  592

seq1  TGTGTGGGGCACAGACAGACAGACATGCAGACAAAACACCTGTGCACACA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGGGCACAGACAGACAGACATGCAGACAAAACACCTGTGCACACA  642

seq1  ATTTAAAATAAATAAATAAATAAAAGGTACTCCTGGTGTCTTACAGAACT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAATAAATAAATAAATAAAAGGTACTCCTGGTGTCTTACAGAACT  692

seq1  TCGAGTGAGAGAGGTGGTCCCCTCAAGCTCTTCTAACTCTGAGGCGGGAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAGTGAGAGAGGTGGTCCCCTCAAGCTCTTCTAACTCTGAGGCGGGAA  742

seq1  CCAGGCACTGACAACGGCTACCGCTCCAGTAGCTGAAGTGAGCAATACAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCACTGACAACGGCTACCGCTCCAGTAGCTGAAGTGAGCAATACAC  792

seq1  ACTGGTAGGAAACAGCTCTAACAAGACAAGGACGAGAGATAACACTCCCC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTAGGAAACAGCTCTAACAAGACAAGGACGAGAGATAACACTCCCC  842

seq1  AAGACAACCAACCATAATGGCCTCCTTTGGGGAACCCCTTAGAGAGACAG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAACCAACCATAATGGCCTCCTTTGGGGAACCCCTTAGAGAGACAG  892

seq1  ACTTAAAACAGCACAGCTTAGTGACTAAACACACAGCTGCTTTTGAGTAT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAAACAGCACAGCTTAGTGACTAAACACACAGCTGCTTTTGAGTAT  942

seq1  GTGAAGTAAAGATTGTACCGTCAAAAACGTTTGCAGAGCCAGACCCAGAG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGTAAAGATTGTACCGTCAAAAACGTTTGCAGAGCCAGACCCAGAG  992

seq1  CGCCAATGTCATGTCCCCTCACCATCAACAGAGATAACTATCAAAACTAG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCAATGTCATGTCCCCTCACCATCAACAGAGATAACTATCAAAACTAG  1042

seq1  AAAGTGCCACGTGCCTTTAAACCCAGCCCTTGGGAGGCAGAGGCAGGGCT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGCCACGTGCCTTTAAACCCAGCCCTTGGGAGGCAGAGGCAGGGCT  1092

seq1  ATGAATTC  1099
      ||||||||
seq2  ATGAATTC  1100

seq1: chr8_127355411_127356585
seq2: B6Ng01-265H14.g_65_1231

seq1  GAATTCACTATACAGCTCAGGCTAGCCTTGAACTCACAGCAATCCTCCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATACAGCTCAGGCTAGCCTTGAACTCACAGCAATCCTCCTG  50

seq1  CCTCAGCCTCCTGAGTACTGGGATTACAGAGGTGAGCACCACATCCAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGCCTCCTGAGTACTGGGATTACAGAGGTGAGCACCACATCCAACT  100

seq1  CAGATGACCTCTTTAAGGAGGTTCCCTGGGGTTGAACACAGCAGAGCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGACCTCTTTAAGGAGGTTCCCTGGGGTTGAACACAGCAGAGCCAG  150

seq1  CTCCCCGCCCCCCACAGGAGTATGAGTGGGCGGGGCTAGCTGTCTCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCGCCCCCCACAGGAGTATGAGTGGGCGGGGCTAGCTGTCTCCCTT  200

seq1  TGCTCACTGGAGCCCAGAAGCAATATGCTGGTGCCAGGGACAGCCCAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACTGGAGCCCAGAAGCAATATGCTGGTGCCAGGGACAGCCCAGGC  250

seq1  AGCCCTGCACAGCCACCTCTCCCCTGCCTTCTGCACAGGGCGCCTTTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGCACAGCCACCTCTCCCCTGCCTTCTGCACAGGGCGCCTTTCAG  300

seq1  GGACAAGAACGCATGGAGGAGAGTAGGGTAAGACGGGGTCTCATGATTCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAGAACGCATGGAGGAGAGTAGGGTAAGACGGGGTCTCATGATTCG  350

seq1  GGTTTGAGGCAACTGGAAAAGTGGCAAGGCCCTGGGATCATGGGGTTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGAGGCAACTGGAAAAGTGGCAAGGCCCTGGGATCATGGGGTTCTA  400

seq1  TCCCATGGAGTCCTTAGCAGCTGGCACTGAGGTTCCGCTGCTGTATATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGGAGTCCTTAGCAGCTGGCACTGAGGTTCCGCTGCTGTATATGA  450

seq1  GTGATACCAGCATAAGGCCTTCCTTTGTGAGCCACTGAGAAGGACCTCGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATACCAGCATAAGGCCTTCCTTTGTGAGCCACTGAGAAGGACCTCGG  500

seq1  GGTAAGTCTGTCAAATGTCCGCGAGAAGGAAATTCAGCTCCTGAGCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGTCTGTCAAATGTCCGCGAGAAGGAAATTCAGCTCCTGAGCCTGT  550

seq1  TCTCTGGGTGAGTCAATGAACGTCAATTCCTTTTGAATGAGTGTCCTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGGTGAGTCAATGAACGTCAATTCCTTTTGAATGAGTGTCCTTGA  600

seq1  TAAGTACCCACTGGCACCCACTCTACACACAGCACCTCTTCCCTCTCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTACCCACTGGCACCCACTCTACACACAGCACCTCTTCCCTCTCAGC  650

seq1  AGGACAGCAGTGCCCACAGAGCAGGTTTTTCCTTCTCTGTCCTGTCTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGCAGTGCCCACAGAGCAGGTTTTTCCTTCTCTGTCCTGTCTGGG  700

seq1  AACACAGCCCCAGTTTTAGGAGACAGGCACCAACCTTGGCAGTCTCACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGCCCCAGTTTTAGGAGACAGGCACCAACCTTGGCAGTCTCACAC  750

seq1  CGTGTGTGGTCCAGGCTGTA-CCTTCAGATCTTTATGTGGTTCCAAAATG  799
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGTGGTCCAGGCTGTACCCTTCAGATCTTTATGTGGTTCCAAAATG  800

seq1  TCCTTAGCTGCCCTGTGGCCTGAAGGAATCCAGAGCCAGGGAGCAATATG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAGCTGCCCTGTGGCCTGAAGGAATCCAGAGCCAGGGAGCAATATG  850

seq1  CTGATAGCAGGGTGGGCCCTGAAACATGGACAAGCTCTGTGAGAGAAGGG  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAGCAGGGTGGGCCCTG-AACATGGACAAGCTCTGTGAGAGAAGGG  899

seq1  GTAGGGGTGACCACTTTACTGAGCCCTGTCTTCTGTGAAAGGTACCCTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGGTGACCACTTTACTGAGCCCTGTCTTCTGTGAAAGGTACCCTAA  949

seq1  CCCCTC-TCAGGTCAGTGACCATGGGCACG-TACC-TTCCCAGGGGCATC  996
      |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  CCCCTCTTCAGGTCAGTGACCATGGGCACGTTACCTTTCCCAGGGGCATC  999

seq1  ATGTCAGCC-TTCATTCTTTGAGTGAAAGGCTTGCCCCTTGAGTCTGAGA  1045
      ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  ATGTCAGCCTTTCATTC-TTGAGTG-AAGGCTTGCCCCCTGAGTCTGAGA  1047

seq1  CATGATTCAGTGCTGCTGCCCGGGTTTGCCTTTCATCCTGTGGCCTGTTG  1095
      ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| | | ||||||
seq2  CATGATTCA-TGCTGCTGCCCGGGATTGC--TTCATCCTAT-GACTGTTG  1093

seq1  -CAGAGGTGAAGGGGGTGGATAAAACCATTTGGGGGTCCTAAGAACACAT  1144
       |||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| |
seq2  CCAGAGGTGA--GGGGT-GATTAATCCA-TTGGGGGTCCT-AGAACAC-T  1137

seq1  CACAGGACTGTGGGGGTGAACCCAGGG-CTCT  1175
      | ||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  C-CAGGACTGT-GGGGTGAACCCAGGGACTCT  1167