BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267L12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 120,950,896 - 121,069,969
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCdh13
Upstream gene4933407C03Rik, Plcg2, 4632417N05Rik, Hsd17b2, Mphosph6
Downstream geneHsbp1, Mlycd, Osgin1, Efcbp2, Gm587, Mbtps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267L12.bB6Ng01-267L12.g
ACCGA070766GA070767
length1,0971,127
definitionB6Ng01-267L12.b B6Ng01-267L12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(121,068,870 - 121,069,969)(120,950,896 - 120,952,038)
sequence
gaattcatcaggagtgtgctgagccgtggcactgccaggcacaatcagag
ggcttcctaattgcttgtcagagaccagtgcatcttggcaaaatgttcct
caactaatgctcagagaccttcccccaccccccaaccttaacctggcttc
atttatcatgattagaaaacaagtcaaaattgatttctgtttattttatg
tggcaaacccccagggagcttttcttctcgggaggtttgacaatcttgag
ctgggtagggaaactcccctccgagagtaaagaacccacttcagcattgc
ttcaagcaggtgtgtgaagtccttgggtcttacagaacctgccagtctct
taaagcttttccaagtcacctcccacgcatgtgcgcgagtgaacctttta
ggcagcgctttcctactttataatgagcacattaagggcgatttgctagg
gaagtggctctaaggtttggaatccgacctgtgtttgattttcttagctc
tgccacctcatagccctgtgaccttggagagtcactaaaagagttctctg
agggggaaagagagagttcctgtctgattgcctgagacccttagaagtct
tgggcaaaagatgttgacatgggagccctgctcccccagtaggaatgtgg
gctacatggctgtgtgagctccaagatcccatcctggcttcagagttgca
tgaggcagcactgacagacacacgctcggctttgatttacaactggcgct
cagcagagtctgtcatagagtcggtgtccacctggaccactcaggacaca
tgatgcacctagcacacactgagctgcgtcatatgtgtttatcagatacc
agtttgtgtgattcagtgtgttgggctacctgtcatctgttcctcaaggg
aaaatacacaaagcatatgtctcatcccgagcagtgtgcctcctgctgca
gagacgcacccatgcattctccaactaaacccgctatcctcagctgaggc
agaggattcaggggcagccagtctgcgttatattgggagatcctagtcac
ctgctattttctgtcatagtacatgtgtgaccatgctcagacctgca
gaattctctcccagaaagaggagtcaggggcaacccctcctcccagccat
gtgtatacaagtctgttttaattgactatctcctggggggggggcaaaag
gatgtctgggctgtgtaagggagctccaactacattcctatgaagaatcc
accatccatgctgggtaaatgttttccgttcccggtgatttgaggttacc
catgctcccatataatgctgtacccattccctgtaagaaagcggatagac
acattggttctcagagtgaactggtagaattgtactttggtttgccatga
gaggtgagggtagacattgttcacagatcatcaaaggaaggaacttccac
aacattgagttagttagttttccttggagtttcctgtctctccctcttga
gtgctgtggttacagaaggtccccacatgcatccagcttttacgtaggtt
ctatgatccaaagtctggccatcatgcttgcttggtatgcttttttaaaa
aaaatctatttagcgatatccctagcccccatagtgtgttcacagtatac
aaggctattgggccccagttattcgcagatagaaggtggctagcaaggca
ccagcaccaccgccatccaaacttggatgcctgagccccgggagctgaag
tacccttgctcctctgattgtaaaggttttcaacacaaatgtaagtctga
gaagagagtgaccaggagtgagccctggaggctgctgtgtgtatcgatct
atctcagaaggacaggcttggatcctagaaagagaagaaaatggtcagaa
tttctaagaggcaggagaatcatgaagccaaaattagaaaggattagaag
aagatgcatcagtccatcagacaagaggcagcatccagctctcatggttg
cctatcttccttatgcaatgtggttgacgtgtgaaatggcatttataatg
tactaagcacttggaaaattcagtccctttaaaaggagttctatctccca
gtttatagacagatactcagctcggaacaacacgtgtctaagtcacctca
gtcagcagtgacagacagtttgctctcatgactagacccaggagacggcc
tgggaattctggataacccaagatgac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_121068870_121069969
seq2: B6Ng01-267L12.b_46_1142 (reverse)

seq1  TGCAGGTCTGAGGATGGTCACAACATGTAACTATGACAG-AAATAGCAGG  49
      |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  TGCAGGTCTGAGCATGGTCAC-ACATGT-ACTATGACAGAAAATAGCAGG  48

seq1  TGACTAGGATCTCCCAATATAACGCAGACTGGCTGCCCCTGAATCCTCCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGACTAGGATCTCCCAATATAACGCAGACTGGCTGCCCCTGAATCCT-CT  97

seq1  GCCTCAGCTGAGGATAGCGGGTTTAGTTGGAGAATGCATGGGTGCGTCTT  149
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GCCTCAGCTGAGGATAGCGGGTTTAGTTGGAGAATGCATGGGTGCGTC-T  146

seq1  CTGCAGCAGGAGGCACACTGCTCGGGATGAGACATATGCTTTGTGTATTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGCAGGAGGCACACTGCTCGGGATGAGACATATGCTTTGTGTATTT  196

seq1  TCCCTTGAGGAACAGATGACAGGTAGCCCAACACACTGAATCACACAAAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGAGGAACAGATGACAGGTAGCCCAACACACTGAATCACACAAAC  246

seq1  TGGTATCTGATAAACACATATGACGCAGCTCAGTGTGTGCTAGGTGCATC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATCTGATAAACACATATGACGCAGCTCAGTGTGTGCTAGGTGCATC  296

seq1  ATGTGTCCTGAGTGGTCCAGGTGGACACCGACTCTATGACAGACTCTGCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCCTGAGTGGTCCAGGTGGACACCGACTCTATGACAGACTCTGCT  346

seq1  GAGCGCCAGTTGTAAATCAAAGCCGAGCGTGTGTCTGTCAGTGCTGCCTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGCCAGTTGTAAATCAAAGCCGAGCGTGTGTCTGTCAGTGCTGCCTC  396

seq1  ATGCAACTCTGAAGCCAGGATGGGATCTTGGAGCTCACACAGCCATGTAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAACTCTGAAGCCAGGATGGGATCTTGGAGCTCACACAGCCATGTAG  446

seq1  CCCACATTCCTACTGGGGGAGCAGGGCTCCCATGTCAACATCTTTTGCCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATTCCTACTGGGGGAGCAGGGCTCCCATGTCAACATCTTTTGCCC  496

seq1  AAGACTTCTAAGGGTCTCAGGCAATCAGACAGGAACTCTCTCTTTCCCCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTCTAAGGGTCTCAGGCAATCAGACAGGAACTCTCTCTTTCCCCC  546

seq1  TCAGAGAACTCTTTTAGTGACTCTCCAAGGTCACAGGGCTATGAGGTGGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAACTCTTTTAGTGACTCTCCAAGGTCACAGGGCTATGAGGTGGC  596

seq1  AGAGCTAAGAAAATCAAACACAGGTCGGATTCCAAACCTTAGAGCCACTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTAAGAAAATCAAACACAGGTCGGATTCCAAACCTTAGAGCCACTT  646

seq1  CCCTAGCAAATCGCCCTTAATGTGCTCATTATAAAGTAGGAAAGCGCTGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGCAAATCGCCCTTAATGTGCTCATTATAAAGTAGGAAAGCGCTGC  696

seq1  CTAAAAGGTTCACTCGCGCACATGCGTGGGAGGTGACTTGGAAAAGCTTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGGTTCACTCGCGCACATGCGTGGGAGGTGACTTGGAAAAGCTTT  746

seq1  AAGAGACTGGCAGGTTCTGTAAGACCCAAGGACTTCACACACCTGCTTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGACTGGCAGGTTCTGTAAGACCCAAGGACTTCACACACCTGCTTGA  796

seq1  AGCAATGCTGAAGTGGGTTCTTTACTCTCGGAGGGGAGTTTCCCTACCCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATGCTGAAGTGGGTTCTTTACTCTCGGAGGGGAGTTTCCCTACCCA  846

seq1  GCTCAAGATTGTCAAACCTCCCGAGAAGAAAAGCTCCCTGGGGGTTTGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGATTGTCAAACCTCCCGAGAAGAAAAGCTCCCTGGGGGTTTGCC  896

seq1  ACATAAAATAAACAGAAATCAATTTTGACTTGTTTTCTAATCATGATAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAATAAACAGAAATCAATTTTGACTTGTTTTCTAATCATGATAAA  946

seq1  TGAAGCCAGGTTAAGGTTGGGGGGTGGGGGAAGGTCTCTGAGCATTAGTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCAGGTTAAGGTTGGGGGGTGGGGGAAGGTCTCTGAGCATTAGTT  996

seq1  GAGGAACATTTTGCCAAGATGCACTGGTCTCTGACAAGCAATTAGGAAGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACATTTTGCCAAGATGCACTGGTCTCTGACAAGCAATTAGGAAGC  1046

seq1  CCTCTGATTGTGCCTGGCAGTGCCACGGCTCAGCACACTCCTGATGAATT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGATTGTGCCTGGCAGTGCCACGGCTCAGCACACTCCTGATGAATT  1096

seq1  C  1100
      |
seq2  C  1097

seq1: chr8_120950896_120952038
seq2: B6Ng01-267L12.g_68_1194

seq1  GAATTCTCTCCCAGAAAGAGGAGTCAGGGGCAACCCCTCCTCCCAGCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCCCAGAAAGAGGAGTCAGGGGCAACCCCTCCTCCCAGCCAT  50

seq1  GTGTATACAAGTCTGTTTTAATTGACTATCTCCTGGGGGGGGGGCAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATACAAGTCTGTTTTAATTGACTATCTCCTGGGGGGGGGGCAAAAG  100

seq1  GATGTCTGGGCTGTGTAAGGGAGCTCCAACTACATTCCTATGAAGAATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTGGGCTGTGTAAGGGAGCTCCAACTACATTCCTATGAAGAATCC  150

seq1  ACCATCCATGCTGGGTAAATGTTTTCCGTTCCCGGTGATTTGAGGTTACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATCCATGCTGGGTAAATGTTTTCCGTTCCCGGTGATTTGAGGTTACC  200

seq1  CATGCTCCCATATAATGCTGTACCCATTCCCTGTAAGAAAGCGGATAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCCCATATAATGCTGTACCCATTCCCTGTAAGAAAGCGGATAGAC  250

seq1  ACATTGGTTCTCAGAGTGAACTGGTAGAATTGTACTTTGGTTTGCCATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGTTCTCAGAGTGAACTGGTAGAATTGTACTTTGGTTTGCCATGA  300

seq1  GAGGTGAGGGTAGACATTGTTCACAGATCATCAAAGGAAGGAACTTCCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGAGGGTAGACATTGTTCACAGATCATCAAAGGAAGGAACTTCCAC  350

seq1  AACATTGAGTTAGTTAGTTTTCCTTGGAGTTTCCTGTCTCTCCCTCTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTGAGTTAGTTAGTTTTCCTTGGAGTTTCCTGTCTCTCCCTCTTGA  400

seq1  GTGCTGTGGTTACAGAAGGTCCCCACATGCATCCAGCTTTTACGTAGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTGGTTACAGAAGGTCCCCACATGCATCCAGCTTTTACGTAGGTT  450

seq1  CTATGATCCAAAGTCTGGCCATCATGCTTGCTTGGTATGCTTTTTTAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGATCCAAAGTCTGGCCATCATGCTTGCTTGGTATGCTTTTTTAAAA  500

seq1  AAAATCTATTTAGCGATATCCCTAGCCCCCATAGTGTGTTCACAGTATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTATTTAGCGATATCCCTAGCCCCCATAGTGTGTTCACAGTATAC  550

seq1  AAGGCTATTGGGCCCCAGTTATTCGCAGATAGAAGGTGGCTAGCAAGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTATTGGGCCCCAGTTATTCGCAGATAGAAGGTGGCTAGCAAGGCA  600

seq1  CCAGCACCACCGCCATCCAAACTTGGATGCCTGAGCCCCGGGAGCTGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCACCGCCATCCAAACTTGGATGCCTGAGCCCCGGGAGCTGAAG  650

seq1  TACCCTTGCTCCTCTGATTGTAAAGGTTTTCAACACAAATGTAAGTCTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTTGCTCCTCTGATTGTAAAGGTTTTCAACACAAATGTAAGTCTGA  700

seq1  GAAGAGAGTGACCAGGAGTGAGCCCTGGAGGCTGCTGTGTGTATCGATCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGAGTGACCAGGAGTGAGCCCTGGAGGCTGCTGTGTGTATCGATCT  750

seq1  ATCTCAGAAGGACAGGCTTGGATCCTAGAAAGAGAAGAAAATGGTCAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGAAGGACAGGCTTGGATCCTAGAAAGAGAAGAAAATGGTCAGAA  800

seq1  TTTCTAAGAGGCAGGAGAATCATGAAGCCAAAATTAGAAAGGATTAGAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAAGAGGCAGGAGAATCATGAAGCCAAAATTAGAAAGGATTAGAAG  850

seq1  AAGATGCATCAGTCCATCAGACAAGAGGCAGCATCCAGCTCTCATGGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCATCAGTCCATCAGACAAGAGGCAGCATCCAGCTCTCATGGTTG  900

seq1  CCTATCTTCCTTATGCAATGTGGTTGACGTGTGAAATGGCATTTATAATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCTTCCTTATGCAATGTGGTTGACGTGTGAAATGGCATTTATAATG  950

seq1  TACTAAGCACTTGGAAAATTCAGTCCC-TTAAAAGGAGGTTCTATCTCCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||
seq2  TACTAAGCACTTGGAAAATTCAGTCCCTTTAAAAGGA-GTTCTATCT-CC  998

seq1  CAGTTTTATAGACAAGGATACTCAGGCTCGGACAAACACGTGTCTAAGGT  1049
      ||| ||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||
seq2  CAG-TTTATAGACA--GATACTCA-GCTCGGAACAACACGTGTCTAA-GT  1043

seq1  CA-CTCAGTCAGCAGGTGACAGACAGTTTGCTCTCATGGAACTAAGAACC  1098
      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   |||
seq2  CACCTCAGTCAGCA-GTGACAGACAGTTTGCTCTCATG--ACTA--GACC  1088

seq1  CAGGAGACAGCCCTGGGGGAATTCTTGTATAACCACAAGGATGAC  1143
      |||||||| |||    |||||||| || |||||| ||| ||||||
seq2  CAGGAGACGGCC---TGGGAATTC-TGGATAACC-CAA-GATGAC  1127