BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274K06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 125,608,399 - 125,789,520
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpg7, Rpl13, Cpne7, Sult5a1, LOC100043251, Dpep1, Chmp1a, 4732415M23Rik, Cdk10, Spata2L, 1300018I17Rik, Zfp276
Upstream geneGm22, Zfpm1, Trhr2, 5830416A07Rik, Il17c, Cyba, Mvd, Snai3, Rnf166, 2310061F22Rik, Cdt1, Aprt, Galns, Trappc2l, Pabpnl1, Cbfa2t3h, C230057M02Rik, A530010L16Rik, BC021611, LOC100043225, Cdh15, Ankrd11
Downstream geneFanca, Spire2, Tcf25, Mc1r, Tubb3, Def8, Afg3l1, Dbndd1, Gas8, Rn5s-ps1, Rhou, LOC100042484, LOC100042490, Rab4a, 1700054N08Rik, LOC100043296, Acta1, Nup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535, Galnt2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274K06.bB6Ng01-274K06.g
ACCGA075890GA075891
length1,0831,155
definitionB6Ng01-274K06.b B6Ng01-274K06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,788,442 - 125,789,520)(125,608,399 - 125,609,570)
sequence
gaattcaacagagaggactccagtttgtgtgggtccagaatcacagtgtg
acacagacgcacccgatactaagctctgtgagctacgtgggcactgcctg
cttctaggtaggctgtgtccctctagcagggcacctgggagccactgaca
gcccagcccagctcagaaggcacagcctgggacaggtacctgtgtggatg
agcttcacgtgtcgctgaaggtatcggtcgatcatgaataccttgttgca
gccagggtgtgggcagggcctttcccggacctcctcatggtgctccttaa
tgtgcttctgggggaagcagggacgagagacgctgctgtttcatctgaac
acatccttcctcccgggagaccctttgtagtgatctgagcagttgacaac
tgactactggaaagacagctacttcctaccctataccactggctccttat
ttaagcaaggggccgactccacatccactagcatccggggagcctttggg
aagcctgcacatggctccacaggaatacctggtgcctccagcacgctcac
cttcatgccatcagcgccacggtatacagctgtgcagccctggtaaggac
acttgtagatggtgggcagctcctccctgtaaggcagagcatatgtggag
gcgctgacacaacatgcaaatgccccacgctgcagcctgctcacctctca
cagcgaagctttttcttccatccgggcttgggcccaggcttctttctgat
cttgggctcttcaggcctcttggcttctctgccttcgctcttcttaccag
agaccctaagtggagaacaatttagtgatgctttttattattattatttt
aaatcttagcttgcagttgactcttgcctcttcctgcatctacagttttt
cttttttttttttgggtttttcgagacagggtttctctgtagtcctgggc
tgtcctggaacttcactttgtagaccaggcttggccttgaactcagaaat
cggcctgtctctgcctcccaagtgctgggataaagcgtgcgcaaccaccg
cccgggctgcatctcagttttcttacgcatttc
gaattcaaggagagcctcatcatggcttttgttgcatctaggcagcatct
tcatggtagcactgagaatattttgcacagctgtgccctggcaggataca
tttcctcataactgtgagacacagcctgggactcagctgttgtcataccc
taccagcaaagagtcctctaacctctgagactgctagcacccttaagtgg
ggtcactatgggccaaggcctgggtgatgccagacttgaagcttactgac
agatagcaacactggccttgctaagagccatgttcacatgtagccacagc
taatggacattcccccaccccagactaaggttaaacgtgagcacccaagt
gagcctccactcttgtgtggggacggctctttattggtgctatgtgttaa
taaatgttctgttcctccatgtcgacgttgtcagggtatgaccagcttct
ctttactactgggattcattccccatgtctctgttgttgcatttcctaac
cacccacctcttgggtctattctgcatccatccaccacacaaaccttccg
gccggcctagatggcttaagagctttgggggattcttctgcctccactcc
ctgccttcccaggagcactgggattagagagcttgggctgtgcatctgcc
tcttgcaggagtgctgagaattcaagctcaggcctcacgcttgcaaaatc
aagtgtgggtgtttgtccccctaagtgagctctctccagctctggtctat
ctcttgtttagttttatttacttgtttggttttttctttgtggggcacgg
tctcactctgtagccttgcctggcctggaactcacaggtctacctgcctc
tgcctccaaaatgcagttgatgcctggcccatgtgttgagacacggtctc
atacagtctaggctggctttgaaccccttatgtaactcaggttgattttt
gaacttctggtcctcttacgtcatcctctaagtgatgggggtgcaaatgt
gtgctgtcatacctggctccttgttatgttattttgagacaactgactgg
ttgccagatgctggacttggccatccctctgcatcagcctcctattaatc
atctgggcacttgatgctgcctgtagttctgtataattggtatgctattc
tgtat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_125788442_125789520
seq2: B6Ng01-274K06.b_47_1129 (reverse)

seq1  GAAA-GCGTGAAGAAAACTGTAGATGCAG-CCGGGCGGTGGTGGCGCACG  48
      |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  GAAATGCGT-AAGAAAACTG-AGATGCAGCCCGGGCGGTGGTTGCGCACG  48

seq1  CCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGACAGGCGGATTTCTGAGTTCA  98
      |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  C--TTTATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGACAGGCCGATTTCTGAGTTCA  96

seq1  AGGCC-AGCCTGGTCTACAAAGTG-AGTTCCAGGACAG-CCAGGACTACA  145
      ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGGCCAAGCCTGGTCTACAAAGTGAAGTTCCAGGACAGCCCAGGACTACA  146

seq1  GAGAAACCCTGTCTCGAAAAACC--AAAAAAAAAAAG-AAAACTGTAGAT  192
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGAAACCCTGTCTCGAAAAACCCAAAAAAAAAAAAGAAAAACTGTAGAT  196

seq1  GCAGGAAGAGGCAAGAGTCAACTGCAAGCTAAGATTTAAAATAATAATAA  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAAGAGGCAAGAGTCAACTGCAAGCTAAGATTTAAAATAATAATAA  246

seq1  TAAAAAGCATCACTAAATTGTTCTCCACTTAGGGTCTCTGGTAAGAAGAG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGCATCACTAAATTGTTCTCCACTTAGGGTCTCTGGTAAGAAGAG  296

seq1  CGAAGGCAGAGAAGCCAAGAGGCCTGAAGAGCCCAAGATCAGAAAGAAGC  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGGCAGAGAAGCCAAGAGGCCTGAAGAGCCCAAGATCAGAAAGAAGC  346

seq1  CTGGGCCCAAGCCCGGATGGAAGAAAAAGCTTCGCTGTGAGAGGTGAGCA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCCCAAGCCCGGATGGAAGAAAAAGCTTCGCTGTGAGAGGTGAGCA  396

seq1  GGCTGCAGCGTGGGGCATTTGCATGTTGTGTCAGCGCCTCCACATATGCT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCAGCGTGGGGCATTTGCATGTTGTGTCAGCGCCTCCACATATGCT  446

seq1  CTGCCTTACAGGGAGGAGCTGCCCACCATCTACAAGTGTCCTTACCAGGG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTACAGGGAGGAGCTGCCCACCATCTACAAGTGTCCTTACCAGGG  496

seq1  CTGCACAGCTGTATACCGTGGCGCTGATGGCATGAAGGTGAGCGTGCTGG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACAGCTGTATACCGTGGCGCTGATGGCATGAAGGTGAGCGTGCTGG  546

seq1  AGGCACCAGGTATTCCTGTGGAGCCATGTGCAGGCTTCCCAAAGGCTCCC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACCAGGTATTCCTGTGGAGCCATGTGCAGGCTTCCCAAAGGCTCCC  596

seq1  CGGATGCTAGTGGATGTGGAGTCGGCCCCTTGCTTAAATAAGGAGCCAGT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATGCTAGTGGATGTGGAGTCGGCCCCTTGCTTAAATAAGGAGCCAGT  646

seq1  GGTATAGGGTAGGAAGTAGCTGTCTTTCCAGTAGTCAGTTGTCAACTGCT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAGGGTAGGAAGTAGCTGTCTTTCCAGTAGTCAGTTGTCAACTGCT  696

seq1  CAGATCACTACAAAGGGTCTCCCGGGAGGAAGGATGTGTTCAGATGAAAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCACTACAAAGGGTCTCCCGGGAGGAAGGATGTGTTCAGATGAAAC  746

seq1  AGCAGCGTCTCTCGTCCCTGCTTCCCCCAGAAGCACATTAAGGAGCACCA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCGTCTCTCGTCCCTGCTTCCCCCAGAAGCACATTAAGGAGCACCA  796

seq1  TGAGGAGGTCCGGGAAAGGCCCTGCCCACACCCTGGCTGCAACAAGGTAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAGGTCCGGGAAAGGCCCTGCCCACACCCTGGCTGCAACAAGGTAT  846

seq1  TCATGATCGACCGATACCTTCAGCGACACGTGAAGCTCATCCACACAGGT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGATCGACCGATACCTTCAGCGACACGTGAAGCTCATCCACACAGGT  896

seq1  ACCTGTCCCAGGCTGTGCCTTCTGAGCTGGGCTGGGCTGTCAGTGGCTCC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCCCAGGCTGTGCCTTCTGAGCTGGGCTGGGCTGTCAGTGGCTCC  946

seq1  CAGGTGCCCTGCTAGAGGGACACAGCCTACCTAGAAGCAGGCAGTGCCCA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGCCCTGCTAGAGGGACACAGCCTACCTAGAAGCAGGCAGTGCCCA  996

seq1  CGTAGCTCACAGAGCTTAGTATCGGGTGCGTCTGTGTCACACTGTGATTC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGCTCACAGAGCTTAGTATCGGGTGCGTCTGTGTCACACTGTGATTC  1046

seq1  TGGACCCACACAAACTGGAGTCCTCTCTGTTGAATTC  1079
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCCACACAAACTGGAGTCCTCTCTGTTGAATTC  1083

seq1: chr8_125608399_125609570
seq2: B6Ng01-274K06.g_66_1220

seq1  GAATTCAAGGAGAGCCTCATCATGGCTTTTGTTGCATCTAGGCAGCATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAGAGCCTCATCATGGCTTTTGTTGCATCTAGGCAGCATCT  50

seq1  TCATGGTAGCACTGAGAATATTTTGCACAGCTGTGCCCTGGCAGGATACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGTAGCACTGAGAATATTTTGCACAGCTGTGCCCTGGCAGGATACA  100

seq1  TTTCCTCATAACTGTGAGACACAGCCTGGGACTCAGCTGTTGTCATACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCATAACTGTGAGACACAGCCTGGGACTCAGCTGTTGTCATACCC  150

seq1  TACCAGCAAAGAGTCCTCTAACCTCTGAGACTGCTAGCACCCTTAAGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGCAAAGAGTCCTCTAACCTCTGAGACTGCTAGCACCCTTAAGTGG  200

seq1  GGTCACTATGGGCCAAGGCCTGGGTGATGCCAGACTTGAAGCTTACTGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACTATGGGCCAAGGCCTGGGTGATGCCAGACTTGAAGCTTACTGAC  250

seq1  AGATAGCAACACTGGCCTTGCTAAGAGCCATGTTCACATGTAGCCACAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCAACACTGGCCTTGCTAAGAGCCATGTTCACATGTAGCCACAGC  300

seq1  TAATGGACATTCCCCCACCCCAGACTAAGGTTAAACGTGAGCACCCAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGACATTCCCCCACCCCAGACTAAGGTTAAACGTGAGCACCCAAGT  350

seq1  GAGCCTCCACTCTTGTGTGGGGACGGCTCTTTATTGGTGCTATGTGTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTCCACTCTTGTGTGGGGACGGCTCTTTATTGGTGCTATGTGTTAA  400

seq1  TAAATGTTCTGTTCCTCCATGTCGACGTTGTCAGGGTATGACCAGCTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGTTCTGTTCCTCCATGTCGACGTTGTCAGGGTATGACCAGCTTCT  450

seq1  CTTTACTACTGGGATTCATTCCCCATGTCTCTGTTGTTGCATTTCCTAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACTACTGGGATTCATTCCCCATGTCTCTGTTGTTGCATTTCCTAAC  500

seq1  CACCCACCTCTTGGGTCTATTCTGCATCCATCCACCACACAAACCTTCCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACCTCTTGGGTCTATTCTGCATCCATCCACCACACAAACCTTCCG  550

seq1  GCCGGCCTAGATGGCTTAAGAGCTTTGGGGGATTCTTCTGCCTCCACTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGCCTAGATGGCTTAAGAGCTTTGGGGGATTCTTCTGCCTCCACTCC  600

seq1  CTGCCTTCCCAGGAGCACTGGGATTAGAGAGCTTGGGCTGTGCATCTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTCCCAGGAGCACTGGGATTAGAGAGCTTGGGCTGTGCATCTGCC  650

seq1  TCTTGCAGGAGTGCTGAGAATTCAAGCTCAGGCCTCACGCTTGCAAAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAGGAGTGCTGAGAATTCAAGCTCAGGCCTCACGCTTGCAAAATC  700

seq1  AAGTGTGGGTGTTTGTCCCCCTAAGTGAGCTCTCTCCAGCTCTGGTCTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGGGTGTTTGTCCCCCTAAGTGAGCTCTCTCCAGCTCTGGTCTAT  750

seq1  CTCTTGTTTAGTTTTATTTACTTGTTTGGTTTTTTCTTTGTGGGGCACGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTTTAGTTTTATTTACTTGTTTGGTTTTTTCTTTGTGGGGCACGG  800

seq1  TCTCACTCTGTAGCCTTGCCTGGCCTGGAACTCACAGGTCTACCTGCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACTCTGTAGCCTTGCCTGGCCTGGAACTCACAGGTCTACCTGCCTC  850

seq1  TGCCTCCAAAATGCAGGTTGATGCCTGGCCCATGTGTTTGAGACACGGTC  900
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCCTCCAAAATGCA-GTTGATGCCTGGCCCATGTG-TTGAGACACGGTC  898

seq1  TCATACAGTCTAGGCTGGCTTTGAACCCCTTATGTAACTCAGGGTGA-TT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  TCATACAGTCTAGGCTGGCTTTGAACCCCTTATGTAACTCAGGTTGATTT  948

seq1  TTGAACTTCTGGTCCTCTTACGTCATCCTCTAAGTGATGGGGGTGCAAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTTCTGGTCCTCTTACGTCATCCTCTAAGTGATGGGGGTGCAAAT  998

seq1  GTGTGCTGTCATACCTGGCTCCTTTGTTTATGTTTTATTTTGAGACAAAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||
seq2  GTGTGCTGTCATACCTGGCTCCTT--GTTATG--TTATTTTGAGAC-AAC  1043

seq1  TGACTGGTTGCCCAGGATGGCCTTGAACTTGCCATCCTCCTGCATCAGCC  1099
      ||||||||||||   ||||  || ||  | |||||||  |||||||||||
seq2  TGACTGGTTGCC--AGATG--CTGGACTTGGCCATCCCTCTGCATCAGCC  1089

seq1  TTCTATATATCATCTGGTGCACTTTTGTATGTTGTCTGTATGTTCTTATA  1149
      | ||||  ||||||||| ||||||    ||| || ||||| |||| | ||
seq2  TCCTATTAATCATCTGG-GCACTT---GATGCTGCCTGTA-GTTC-TGTA  1133

seq1  TTATTGTGTATGTTATTCTGTAT  1172
      | |||| ||||| ||||||||||
seq2  TAATTG-GTATGCTATTCTGTAT  1155