BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282A15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 3,045,497 - 3,178,553
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG664801, EG209786, D630014A15Rik, Insr
Upstream genenone
Downstream geneA430078G23Rik, Arhgef18, Pex11c, 1700019B03Rik, Zfp358, Mcoln1, Pnpla6, C330021F23Rik, 2310057J16Rik, Xab2, Pcp2, Stxbp2, Retn, 1810033B17Rik, LOC664858, Trappc5, Fcer2a, Clec4g, Cd209a, LOC664870, Cd209e, Cd209d, Cd209b, Cd209c, LOC664888, EG384770, EG664905, LOC664915, LOC664922, LOC631071, Cd209f, Cd209g, B130050I23Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282A15.bB6Ng01-282A15.g
ACCGA081360GA081361
length9771,047
definitionB6Ng01-282A15.b B6Ng01-282A15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,178,011 - 3,178,553)(3,045,497 - 3,046,521)
sequence
gaattcttcagtgttagttgtgaggtttgagtatccctgttatttttgtc
agatcgtttttgactatacagaaattatctcaatcccactaaaatggatc
caactgagacttactaagctgttttctttttcagttaagaaggccattgt
acaaaaatgagggctaaaaggataatagccacaggctttaatttgtggcg
ttatatccaagtatcttaaataagaggctgaggtagaaggattgctggga
gttcaaggccagcacattgtgaattgctgcaaaacctgggctacagagtg
agactgtttccaaacagcaaacagagaaaaagaagcaaccaaaaccaaat
gtctgaatgactctagatccatagttttaatctctcaggaacaatgtaag
gtttgcaaccaggaaggagactgggaagtcatgagaaagtatgatgagga
caggaagtgatttttctggagaattacagaacccagcaggcaaacagagc
ttcctgaagcactgtaaagagctacaaggtgtgcagtctagggatactat
gtttttgtttatatatttgcatttattctttgagaatttcattcttttgc
atgatgtactttgattatatcacctcctacaacccttcaacacctccaga
ctcatcccaccacatctgctccccaaatctcttcttttgttaacccattt
acataatctactgagttgtccaaatagaaaagtccatctacccatgagtg
tggggatatccgcaggggtgtggatgccaggagtcacatcctcaaaaaga
aaggtaactcttctcccctgttggtagctcctcagctaagctccatgccc
ttcctctgttcacggtgtgtttgaccagcttgatcctgtacagatcagtc
taggcagcagtaggtgctgtgagttaatgagtgccacagccatgtcatgt
ctggaggctggccattcacagcacttc
gaattcagtcttatccatgcaggactgtgtatagaagtcccttaagattg
tcataaccattagaaattgaccagagaatgcaataggagcaagggccttt
ggagctttgagataagtcaaaagtgtaagcttgatgtgctgttcccatag
tgtagaaagctgtgggcacaatctcccaaggggtgagtgaacctacccga
ttccctgaacaggaccttagcatgactttgctactctctgtttagtccta
tatttaaaaatattgcaccatcttgtggaagaactgagggttttttttaa
ggtgctaggagtagatccagcaaacccctgtgtgtaatgtatccaaagga
cttgacagaggagataattgcacacctatgttccaagcagcctatttcca
cagaagccaacacccacgggcagtctgtgttcatccctggattatgggtg
ggaattaatgtgtttaaatactatacagccttgaaaaggatgagctgata
catagcctaatagagacttactctaagtaaacgggcaattcctaaatgat
acatgctgattccacacgtgaggtttccagaggaaaatcagaggaaaggt
agttgccagggttgagaggagaggaaagtaggtgttgtggtggagtctac
agagtttcaagttttgtgagatgaaatggttatacagatcggctcccagg
tagtaacattggctcttaggcttagtattgagcactaagttaaaatggtc
caaagaggaagtcagcgctttcctgtactataattaacaatgtgtgtatc
aggtattctggggactactggccctcacttgctggtctccctgtgacttt
aaaccatcatcactttcctgtgggtctggctcaagatagcctggcacaac
acctcctgtacctataatacctgcctttcatttcaatcttgctgacacca
ggttgggctgggacaagtcctgccttttactatttggactttttcaagct
gcagactccagacacctcttggggaacaggatattataggcatatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_3178011_3178553
seq2: B6Ng01-282A15.b_43_585 (reverse)

seq1  CCCTAGACTGCACACCTTGTAGCTCTTTACAGTGCTTCAGGAAGCTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGACTGCACACCTTGTAGCTCTTTACAGTGCTTCAGGAAGCTCTGT  50

seq1  TTGCCTGCTGGGTTCTGTAATTCTCCAGAAAAATCACTTCCTGTCCTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTGCTGGGTTCTGTAATTCTCCAGAAAAATCACTTCCTGTCCTCAT  100

seq1  CATACTTTCTCATGACTTCCCAGTCTCCTTCCTGGTTGCAAACCTTACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTTTCTCATGACTTCCCAGTCTCCTTCCTGGTTGCAAACCTTACAT  150

seq1  TGTTCCTGAGAGATTAAAACTATGGATCTAGAGTCATTCAGACATTTGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTGAGAGATTAAAACTATGGATCTAGAGTCATTCAGACATTTGGT  200

seq1  TTTGGTTGCTTCTTTTTCTCTGTTTGCTGTTTGGAAACAGTCTCACTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTGCTTCTTTTTCTCTGTTTGCTGTTTGGAAACAGTCTCACTCTG  250

seq1  TAGCCCAGGTTTTGCAGCAATTCACAATGTGCTGGCCTTGAACTCCCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCAGGTTTTGCAGCAATTCACAATGTGCTGGCCTTGAACTCCCAGC  300

seq1  AATCCTTCTACCTCAGCCTCTTATTTAAGATACTTGGATATAACGCCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTCTACCTCAGCCTCTTATTTAAGATACTTGGATATAACGCCACA  350

seq1  AATTAAAGCCTGTGGCTATTATCCTTTTAGCCCTCATTTTTGTACAATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAGCCTGTGGCTATTATCCTTTTAGCCCTCATTTTTGTACAATGG  400

seq1  CCTTCTTAACTGAAAAAGAAAACAGCTTAGTAAGTCTCAGTTGGATCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTAACTGAAAAAGAAAACAGCTTAGTAAGTCTCAGTTGGATCCAT  450

seq1  TTTAGTGGGATTGAGATAATTTCTGTATAGTCAAAAACGATCTGACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTGGGATTGAGATAATTTCTGTATAGTCAAAAACGATCTGACAAAA  500

seq1  ATAACAGGGATACTCAAACCTCACAACTAACACTGAAGAATTC  543
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAGGGATACTCAAACCTCACAACTAACACTGAAGAATTC  543

seq1: chr8_3045497_3046521
seq2: B6Ng01-282A15.g_70_1116

seq1  GAATTCAGTCTTATCCATGCAGGACTGTGTATAGAAGTCCCTTAAGATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCTTATCCATGCAGGACTGTGTATAGAAGTCCCTTAAGATTG  50

seq1  TCATAACCATTAGAAATTGACCAGAGAATGCAATAGGAGCAAGGGCCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAACCATTAGAAATTGACCAGAGAATGCAATAGGAGCAAGGGCCTTT  100

seq1  GGAGCTTTGAGATAAGTCAAAAGTGTAAGCTTGATGTGCTGTTCCCATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTGAGATAAGTCAAAAGTGTAAGCTTGATGTGCTGTTCCCATAG  150

seq1  TGTAGAAAGCTGTGGGCACAATCTCCCAAGGGGTGAGTGAACCTACCCGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAAAGCTGTGGGCACAATCTCCCAAGGGGTGAGTGAACCTACCCGA  200

seq1  TTCCCTGAACAGGACCTTAGCATGACTTTGCTACTCTCTGTTTAGTCCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGAACAGGACCTTAGCATGACTTTGCTACTCTCTGTTTAGTCCTA  250

seq1  TATTTAAAAATATTGCACCATCTTGTGGAAGAACTGAGGGTTTTTTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAAAATATTGCACCATCTTGTGGAAGAACTGAGGGTTTTTTTTAA  300

seq1  GGTGCTAGGAGTAGATCCAGCAAACCCCTGTGTGTAATGTATCCAAAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTAGGAGTAGATCCAGCAAACCCCTGTGTGTAATGTATCCAAAGGA  350

seq1  CTTGACAGAGGAGATAATTGCACACCTATGTTCCAAGCAGCCTATTTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACAGAGGAGATAATTGCACACCTATGTTCCAAGCAGCCTATTTCCA  400

seq1  CAGAAGCCAACACCCACGGGCAGTCTGTGTTCATCCCTGGATTATGGGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCCAACACCCACGGGCAGTCTGTGTTCATCCCTGGATTATGGGTG  450

seq1  GGAATTAATGTGTTTAAATACTATACAGCCTTGAAAAGGATGAGCTGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTAATGTGTTTAAATACTATACAGCCTTGAAAAGGATGAGCTGATA  500

seq1  CATAGCCTAATAGAGACTTACTCTAAGTAAACGGGCAATTCCTAAATGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCCTAATAGAGACTTACTCTAAGTAAACGGGCAATTCCTAAATGAT  550

seq1  ACATGCTGATTCCACACGTGAGGTTTCCAGAGGAAAATCAGAGGAAAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCTGATTCCACACGTGAGGTTTCCAGAGGAAAATCAGAGGAAAGGT  600

seq1  AGTTGCCAGGGTTGAGAGGAGAGGAAAGTAGGTGTTGTGGTGGAGTCTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCAGGGTTGAGAGGAGAGGAAAGTAGGTGTTGTGGTGGAGTCTAC  650

seq1  AGAGTTTCAAGTTTTGTGAGATGAAATGGTTATACAGATCGGCTCCCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTCAAGTTTTGTGAGATGAAATGGTTATACAGATCGGCTCCCAGG  700

seq1  TAGTAACATTGGCTCTTAGGCTTAGTATTGAGCACTAAGTTAAAATGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAACATTGGCTCTTAGGCTTAGTATTGAGCACTAAGTTAAAATGGTC  750

seq1  CAAAGAGGAAGTCAGCGCTTTCCTGTACTATAATTAACAATGTGTGTATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGGAAGTCAGCGCTTTCCTGTACTATAATTAACAATGTGTGTATC  800

seq1  A-GTATTCT-GGGACTACTGGCCCTCAC-TGCTGGTCTCCCTGTGACTT-  846
      | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  AGGTATTCTGGGGACTACTGGCCCTCACTTGCTGGTCTCCCTGTGACTTT  850

seq1  -AACCATCATCAC-TTCCTGT-GGTCTGGCTC-AGATAGCCT-GCACCAC  891
       |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||
seq2  AAACCATCATCACTTTCCTGTGGGTCTGGCTCAAGATAGCCTGGCACAAC  900

seq1  ACCTCCTGTACCCATAATACCTGCC-TTCA-TTCAATC-TGCTGCCACCA  938
      |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||
seq2  ACCTCCTGTACCTATAATACCTGCCTTTCATTTCAATCTTGCTGACACCA  950

seq1  GGTT-GGCT-GGACAAGTCCTGC--TTTAC-ATTT-GACATTTTCAA-CT  981
      |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||| ||
seq2  GGTTGGGCTGGGACAAGTCCTGCCTTTTACTATTTGGACTTTTTCAAGCT  1000

seq1  GCAGACTCCAGACA-CTCTTTGGGAACAAGATATTAT--GCATATGT  1025
      |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||
seq2  GCAGACTCCAGACACCTCTTGGGGAACAGGATATTATAGGCATATGT  1047