BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-290A21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 3,223,801 - 3,395,421
singlet/doubletdoublet
Overlap geneInsr, A430078G23Rik, Arhgef18
Upstream geneEG664801, EG209786, D630014A15Rik
Downstream genePex11c, 1700019B03Rik, Zfp358, Mcoln1, Pnpla6, C330021F23Rik, 2310057J16Rik, Xab2, Pcp2, Stxbp2, Retn, 1810033B17Rik, LOC664858, Trappc5, Fcer2a, Clec4g, Cd209a, LOC664870, Cd209e, Cd209d, Cd209b, Cd209c, LOC664888, EG384770, EG664905, LOC664915, LOC664922, LOC631071, Cd209f, Cd209g, B130050I23Rik, BC068157, Lrrc8e, Map2k7, LOC100039590, Snapc2, Ctxn1, Timm44, Elavl1, Ccl25, LOC664977
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-290A21.bB6Ng01-290A21.g
ACCGA087290GA087291
length893734
definitionB6Ng01-290A21.b B6Ng01-290A21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(3,223,801 - 3,224,695)(3,394,689 - 3,395,421)
sequence
tctgtctccacctacaatattggcattatagacaagtccacagatgtctt
tttacagaagcctctctgcgggcacaagccagctgaggttagggacagga
agcaagatacaaagacactttcctagctgctaaacagtgtcctgaactgc
cactaacaaagtgaaattggccaccagacctcatagtgacaaagatggca
taagtttcagtttatttcctgattggttcattcccaacggtaggaagcct
aagtgtgtatgctatgtatttgtgcatgtgtttatacgcatatgtattac
gtgtgcaatgtgcgccatgtgtgtatatgtgttttgtatgtgtgcacatg
tgttatatgtgttatctatatttgtgcatatatatgtgcacacatgtgta
ttgtatgtgaaatagacatgaccagaaaatagattcctcagagatctgta
gccattattttttctccttactgtttcatcacgtatgtactataggaggt
gtacatgtatgggtatagagtccaaaggtgaatgttggttaggcttaggc
actgaactggttaatgcacaagtctgaggagtgatcatgggtctcccaca
tccacattaaaagccaggtgcagcaatacatgtctgttaccactgttctg
ggtagacagagatgggagaattcctgaagcatactggtcaactagccaag
ctgaatctcgggaatccaggtctcaaaatataatgatacagtggggagcc
atcaaaaagggcacctgagacatgccttcctgcctccacatgcactggag
gtgagcacacaaaagcaagcacatacaggcaagcacacagagacagtcaa
agggaaagtcagtgaaacctgtgtcccaacctactcttcagaa
gaattcagtttactcccaacttgatttgaatgagaaagaaacagatccca
ggagagacagatggcagcaggaactgaccagcaccgtgctctcagggagg
acgttgttttaaagttttcctccctcagctagctagctgcattcctcctt
taaaaataaattcctccagtccctccagagctaccccctgaactgtcttg
cacctggcgagggagtttttcacaaggtagccatctccccttcccgttca
gcagggaaagtgtttgctttaacaagacagaaagaaacaagaggggtggg
tcttcgacaggatttggggctttaaagaatttaaagcagctggaggtgaa
aattgctgaaaagtcacatagggagttgaaagaaatggaaacatgaccca
ggacgggagaaatgaaggagacctctacaagatcagaactatgttaaatc
agaactatgttaatctcgcagtagataaacacagggagactcagctgctt
accacagccagggtgcctggggtggtaagcagtgcaagtggccaaattgc
tcctgtgtgacaagaatgcaaattacacccagctatgcaacaaagttgcc
gtgggccactccaacagagaaagtctgggcattcaccaaggaacttacaa
gagaaatcacagaacctctggatctccctaacccgtgacattgaaaaagg
ggcccagcccttgagaagtggagggggggagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_3223801_3224695
seq2: B6Ng01-290A21.b_49_941

seq1  TCTGTCTCCACCTACAATATTGGCATTATAGACAAGTCCACAGATGTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTCCACCTACAATATTGGCATTATAGACAAGTCCACAGATGTCTT  50

seq1  TTTACAGAAGCCTCTCTGCGGGCACAAGCCAGCTGAGGTTAGGGACAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGAAGCCTCTCTGCGGGCACAAGCCAGCTGAGGTTAGGGACAGGA  100

seq1  AGCAAGATACAAAGACACTTTCCTAGCTGCTAAACAGTGTCCTGAACTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGATACAAAGACACTTTCCTAGCTGCTAAACAGTGTCCTGAACTGC  150

seq1  CACTAACAAAGTGAAATTGGCCACCAGACCTCATAGTGACAAAGATGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAACAAAGTGAAATTGGCCACCAGACCTCATAGTGACAAAGATGGCA  200

seq1  TAAGTTTCAGTTTATTTCCTGATTGGTTCATTCCCAACGGTAGGAAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTCAGTTTATTTCCTGATTGGTTCATTCCCAACGGTAGGAAGCCT  250

seq1  AAGTGTGTATGCTATGTATTTGTGCATGTGTTTATACGCATATGTATTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGTATGCTATGTATTTGTGCATGTGTTTATACGCATATGTATTAC  300

seq1  GTGTGCAATGTGCGCCATGTGTGTATATGTGTTTTGTATGTGTGCACATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCAATGTGCGCCATGTGTGTATATGTGTTTTGTATGTGTGCACATG  350

seq1  TGTTATATGTGTTATCTATATTTGTGCATATATATGTGCACACATGTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATATGTGTTATCTATATTTGTGCATATATATGTGCACACATGTGTA  400

seq1  TTGTATGTGAAATAGACATGACCAGAAAATAGATTCCTCAGAGATCTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATGTGAAATAGACATGACCAGAAAATAGATTCCTCAGAGATCTGTA  450

seq1  GCCATTATTTTTTCTCCTTACTGTTTCATCACGTATGTACTATAGGAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTATTTTTTCTCCTTACTGTTTCATCACGTATGTACTATAGGAGGT  500

seq1  GTACATGTATGGGTATAGAGTCCAAAGGTGAATGTTGGTTAGGCTTAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGTATGGGTATAGAGTCCAAAGGTGAATGTTGGTTAGGCTTAGGC  550

seq1  ACTGAACTGGTTAATGCACAAGTCTGAGGAGTGATCATGGGTCTCCCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAACTGGTTAATGCACAAGTCTGAGGAGTGATCATGGGTCTCCCACA  600

seq1  TCCACATTAAAAGCCAGGTGCAGCAATACATGTCTGTTACCACTGTTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACATTAAAAGCCAGGTGCAGCAATACATGTCTGTTACCACTGTTCTG  650

seq1  GGTAGACAGAGATGGGAGAATTCCTGAAGCATACTGGTCAACTAGCCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGACAGAGATGGGAGAATTCCTGAAGCATACTGGTCAACTAGCCAAG  700

seq1  CTGAATCTCGGGAATCCAGGTCTCAAAATATAATGATACAGTGGGGAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATCTCGGGAATCCAGGTCTCAAAATATAATGATACAGTGGGGAGCC  750

seq1  ATCAAAAAGGGCACCTGAGACATGCCTTCCTGCCTCCACATGCACTGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAAGGGCACCTGAGACATGCCTTCCTGCCTCCACATGCACTGGAG  800

seq1  GTGAGCACACAAAAGCAAGCACATACAGGCAAGCACACAGAGACAGTCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCACACAAAAGCAAGCACATACAGGCAAGCACACAGAGACAGTCAA  850

seq1  AGGGAAAGTCAGTGAAACCTGTTGTCCCCACCCTACTCTTCAGAA  895
      ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  AGGGAAAGTCAGTGAAACCTG-TGT-CCCAACCTACTCTTCAGAA  893

seq1: chr8_3394689_3395421
seq2: B6Ng01-290A21.g_66_799 (reverse)

seq1  CCCCT-CCCCCCTCCACTTCTCAAGGGCTGGGCCCCTTTTTCAATGTCAC  49
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCCCCCCCTCCACTTCTCAAGGGCTGGGCCCCTTTTTCAATGTCAC  50

seq1  GGGTTAGGGAGATCCAGAGGTTCTGTGATTTCTCTTGTAAGTTCCTTGGT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAGGGAGATCCAGAGGTTCTGTGATTTCTCTTGTAAGTTCCTTGGT  100

seq1  GAATGCCCAGACTTTCTCTGTTGGAGTGGCCCACGGCAACTTTGTTGCAT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCCCAGACTTTCTCTGTTGGAGTGGCCCACGGCAACTTTGTTGCAT  150

seq1  AGCTGGGTGTAATTTGCATTCTTGTCACACAGGAGCAATTTGGCCACTTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGTGTAATTTGCATTCTTGTCACACAGGAGCAATTTGGCCACTTG  200

seq1  CACTGCTTACCACCCCAGGCACCCTGGCTGTGGTAAGCAGCTGAGTCTCC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTTACCACCCCAGGCACCCTGGCTGTGGTAAGCAGCTGAGTCTCC  250

seq1  CTGTGTTTATCTACTGCGAGATTAACATAGTTCTGATTTAACATAGTTCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTTATCTACTGCGAGATTAACATAGTTCTGATTTAACATAGTTCT  300

seq1  GATCTTGTAGAGGTCTCCTTCATTTCTCCCGTCCTGGGTCATGTTTCCAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTGTAGAGGTCTCCTTCATTTCTCCCGTCCTGGGTCATGTTTCCAT  350

seq1  TTCTTTCAACTCCCTATGTGACTTTTCAGCAATTTTCACCTCCAGCTGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCAACTCCCTATGTGACTTTTCAGCAATTTTCACCTCCAGCTGCT  400

seq1  TTAAATTCTTTAAAGCCCCAAATCCTGTCGAAGACCCACCCCTCTTGTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTCTTTAAAGCCCCAAATCCTGTCGAAGACCCACCCCTCTTGTTT  450

seq1  CTTTCTGTCTTGTTAAAGCAAACACTTTCCCTGCTGAACGGGAAGGGGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGTCTTGTTAAAGCAAACACTTTCCCTGCTGAACGGGAAGGGGAG  500

seq1  ATGGCTACCTTGTGAAAAACTCCCTCGCCAGGTGCAAGACAGTTCAGGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTACCTTGTGAAAAACTCCCTCGCCAGGTGCAAGACAGTTCAGGGG  550

seq1  GTAGCTCTGGAGGGACTGGAGGAATTTATTTTTAAAGGAGGAATGCAGCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCTGGAGGGACTGGAGGAATTTATTTTTAAAGGAGGAATGCAGCT  600

seq1  AGCTAGCTGAGGGAGGAAAACTTTAAAACAACGTCCTCCCTGAGAGCACG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGCTGAGGGAGGAAAACTTTAAAACAACGTCCTCCCTGAGAGCACG  650

seq1  GTGCTGGTCAGTTCCTGCTGCCATCTGTCTCTCCTGGGATCTGTTTCTTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGTCAGTTCCTGCTGCCATCTGTCTCTCCTGGGATCTGTTTCTTT  700

seq1  CTCATTCAAATCAAGTTGGGAGTAAACTGAATTC  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTCAAATCAAGTTGGGAGTAAACTGAATTC  734