BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291A14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 128,958,667 - 129,066,585
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG619653
Upstream geneSipa1l2, 4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1, Slc35f3, LOC668434, 1810063B05Rik
Downstream geneIrf2bp2, Tomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1, Pard3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291A14.bB6Ng01-291A14.g
ACCGA088029GA088030
length1,0621,059
definitionB6Ng01-291A14.b B6Ng01-291A14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,065,532 - 129,066,585)(128,958,667 - 128,959,717)
sequence
gaattctgcctcagaaggcaaagcagaatggggagtgtggctcagtttat
tgggtgtttgctcagcatgcgcagaaccctgggtttgacccatgtaaacc
aggcatggtagttcatgcctgtaaccccaggttcagacgttcaaggcgag
cattggaaagatggctctggggttgagagcgcctgcctgctgctctgtca
gaggaagtgcaaggtcgtccctccacggcatagctaatctgagggcaacc
ttggctacgtgagatcttatttttaaaaattcaaacagaactctgtccaa
gaaaagcatcttcctttctcagcaacagcaggaagggaggcaaaagctat
gaatgaaaccagaagcccaaggagaggctgtgttcctgttttccacagaa
gtgtaggactcggtcttctgcttgctatctagtgcgtgagtcttgagggc
tgtggctcatgcctgctggaggatgatcagcatgcggcagtgtgtcctct
cagctgccctagcaccaggagctgactgcctggctctcctttcccactca
gtgctgctgcttgcagtgcattcagatctggccttgggagcagagagctg
ccacctaagtgtctccaccaaagactgacaggcccttcaggattctgaag
tgagccaccatggaagatgctaacattttgactttgtgagagcagtgacc
agagttacaatgtggaaagtctgcccaaccagattgtccctgaggggagc
cgttttcccccacccccaatctcactccccagtgactcctccacacaccc
actcccctacccctaccctacaagcatcctaaagatttctcttaaaaaaa
agatttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat
atatatatgaatacacagatcatctgatcatcagatacacaaaaagaggg
gaatcagatccccattacagagggttggtgagtcaccatgctggttgctg
gaattggacttaggacctttaaaagagcaataagtgcttttaacttgcca
ggccaatctctc
gaattcttctcccaaacaattcaaaacttaccttttctggaatattctga
acaatgatgtccaaatgtgataaaacagataaaaatgtacaaatgcttgc
cttaattttttcttcaccctgacagaagatgagatagaaaaatcgttatt
tggggcttaactgtgagcagaggctcctggatgctggaccggcagaggta
ggaggcagcctctgctctcttcttccctgaagcagcttgagttcgccttg
tgtcggggccactccctgcagcccaaggtaatgcaggcaacgctgagaga
acagtcaagacagcactgaatggcctcactgtaccaagcccctgggccag
gcctaccggacaggagtggggactggggtgaggacatagaggaagctggt
aaaaagaacaagataaataaagacacagggcagcggaggtgagagtcaca
ctgacccttgggactgtgtcctgctgttgcatacacggtgacagccatgg
ggaagaaatgccatctggagccctagcccttgcagacacatatggctatc
aagactctcaggacgtagaaccaccaagaacagatgctgtgtacatgact
aggtaggtgttgagtatcctagcaacccaaacctgggtgacctgggtgtt
tatgctcaatcatagtaactgggatggggtccaggagggcaaagagccta
ctacggccaccaacactcatatcaaatgtgattttcacacagcatgagaa
caaggtgaggttagctgtttagacctagagtcacagaagggacaagactt
cgggcacacaggtgaggaatgatctagttaggttaactgagttgggggag
aaaatgaactgagcatcaccattcatcccttcctgcttcctgactacaga
tgtaacgtgaccttcacactcctgccgccatgccttacccgccatgacgg
tctgcaccctcaaactgtgaagccagaagtgaaccccttttccctcagtt
tgctttggttcaggaaattttatcagagcctaataaagaagtgatgttgg
ggaggggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_129065532_129066585
seq2: B6Ng01-291A14.b_47_1108 (reverse)

seq1  GAGAGA-TGGCCTGGC-AGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCTAGAGGTCC  48
      |||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||| || ||||||
seq2  GAGAGATTGGCCTGGCAAGTTAAAAGCACTTATTGCTCTTTTAAAGGTCC  50

seq1  TAAGTTCAATTCCAGCAACCA-CATGGTGACTCA-CAACCATCTGTAAT-  95
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| 
seq2  TAAGTCCAATTCCAGCAACCAGCATGGTGACTCACCAACCCTCTGTAATG  100

seq1  GGGATCTGATT-CCCTCTTTTTGGTGTGTCTGAAGA-CAG-TGA-CAGTG  141
      ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||| ||| | |||
seq2  GGGATCTGATTCCCCTCTTTTT-GTGTATCTGATGATCAGATGATCTGTG  149

seq1  TAATCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  191
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  199

seq1  TATATATAAATCTTTTTTTTAAGAGAAATCTTTAGGATGCTTGTAGGGTA  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATAAATCTTTTTTTTAAGAGAAATCTTTAGGATGCTTGTAGGGTA  249

seq1  GGGGTAGGGGAGTGGGTGTGTGGAGGAGTCACTGGGGAGTGAGATTGGGG  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAGGGGAGTGGGTGTGTGGAGGAGTCACTGGGGAGTGAGATTGGGG  299

seq1  GTGGGGGAAAACGGCTCCCCTCAGGGACAATCTGGTTGGGCAGACTTTCC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGGAAAACGGCTCCCCTCAGGGACAATCTGGTTGGGCAGACTTTCC  349

seq1  ACATTGTAACTCTGGTCACTGCTCTCACAAAGTCAAAATGTTAGCATCTT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTAACTCTGGTCACTGCTCTCACAAAGTCAAAATGTTAGCATCTT  399

seq1  CCATGGTGGCTCACTTCAGAATCCTGAAGGGCCTGTCAGTCTTTGGTGGA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGTGGCTCACTTCAGAATCCTGAAGGGCCTGTCAGTCTTTGGTGGA  449

seq1  GACACTTAGGTGGCAGCTCTCTGCTCCCAAGGCCAGATCTGAATGCACTG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTTAGGTGGCAGCTCTCTGCTCCCAAGGCCAGATCTGAATGCACTG  499

seq1  CAAGCAGCAGCACTGAGTGGGAAAGGAGAGCCAGGCAGTCAGCTCCTGGT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAGCAGCACTGAGTGGGAAAGGAGAGCCAGGCAGTCAGCTCCTGGT  549

seq1  GCTAGGGCAGCTGAGAGGACACACTGCCGCATGCTGATCATCCTCCAGCA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGGCAGCTGAGAGGACACACTGCCGCATGCTGATCATCCTCCAGCA  599

seq1  GGCATGAGCCACAGCCCTCAAGACTCACGCACTAGATAGCAAGCAGAAGA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGAGCCACAGCCCTCAAGACTCACGCACTAGATAGCAAGCAGAAGA  649

seq1  CCGAGTCCTACACTTCTGTGGAAAACAGGAACACAGCCTCTCCTTGGGCT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAGTCCTACACTTCTGTGGAAAACAGGAACACAGCCTCTCCTTGGGCT  699

seq1  TCTGGTTTCATTCATAGCTTTTGCCTCCCTTCCTGCTGTTGCTGAGAAAG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTTTCATTCATAGCTTTTGCCTCCCTTCCTGCTGTTGCTGAGAAAG  749

seq1  GAAGATGCTTTTCTTGGACAGAGTTCTGTTTGAATTTTTAAAAATAAGAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGCTTTTCTTGGACAGAGTTCTGTTTGAATTTTTAAAAATAAGAT  799

seq1  CTCACGTAGCCAAGGTTGCCCTCAGATTAGCTATGCCGTGGAGGGACGAC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGTAGCCAAGGTTGCCCTCAGATTAGCTATGCCGTGGAGGGACGAC  849

seq1  CTTGCACTTCCTCTGACAGAGCAGCAGGCAGGCGCTCTCAACCCCAGAGC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCACTTCCTCTGACAGAGCAGCAGGCAGGCGCTCTCAACCCCAGAGC  899

seq1  CATCTTTCCAATGCTCGCCTTGAACGTCTGAACCTGGGGTTACAGGCATG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTCCAATGCTCGCCTTGAACGTCTGAACCTGGGGTTACAGGCATG  949

seq1  AACTACCATGCCTGGTTTACATGGGTCAAACCCAGGGTTCTGCGCATGCT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACCATGCCTGGTTTACATGGGTCAAACCCAGGGTTCTGCGCATGCT  999

seq1  GAGCAAACACCCAATAAACTGAGCCACACTCCCCATTCTGCTTTGCCTTC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAACACCCAATAAACTGAGCCACACTCCCCATTCTGCTTTGCCTTC  1049

seq1  TGAGGCAGAATTC  1054
      |||||||||||||
seq2  TGAGGCAGAATTC  1062

seq1: chr8_128958667_128959717
seq2: B6Ng01-291A14.g_69_1127

seq1  GAATTCTTCTCCCAAACAATTCAAAACTTACCTTTTCTGGAATATTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTCCCAAACAATTCAAAACTTACCTTTTCTGGAATATTCTGA  50

seq1  ACAATGATGTCCAAATGTGATAAAACAGATAAAAATGTACAAATGCTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGATGTCCAAATGTGATAAAACAGATAAAAATGTACAAATGCTTGC  100

seq1  CTTAATTTTTTCTTCACCCTGACAGAAGATGAGATAGAAAAATCGTTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATTTTTTCTTCACCCTGACAGAAGATGAGATAGAAAAATCGTTATT  150

seq1  TGGGGCTTAACTGTGAGCAGAGGCTCCTGGATGCTGGACCGGCAGAGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCTTAACTGTGAGCAGAGGCTCCTGGATGCTGGACCGGCAGAGGTA  200

seq1  GGAGGCAGCCTCTGCTCTCTTCTTCCCTGAAGCAGCTTGAGTTCGCCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCAGCCTCTGCTCTCTTCTTCCCTGAAGCAGCTTGAGTTCGCCTTG  250

seq1  TGTCGGGGCCACTCCCTGCAGCCCAAGGTAATGCAGGCAACGCTGAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCGGGGCCACTCCCTGCAGCCCAAGGTAATGCAGGCAACGCTGAGAGA  300

seq1  ACAGTCAAGACAGCACTGAATGGCCTCACTGTACCAAGCCCCTGGGCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCAAGACAGCACTGAATGGCCTCACTGTACCAAGCCCCTGGGCCAG  350

seq1  GCCTACCGGACAGGAGTGGGGACTGGGGTGAGGACATAGAGGAAGCTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTACCGGACAGGAGTGGGGACTGGGGTGAGGACATAGAGGAAGCTGGT  400

seq1  AAAAAGAACAAGATAAATAAAGACACAGGGCAGCGGAGGTGAGAGTCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGAACAAGATAAATAAAGACACAGGGCAGCGGAGGTGAGAGTCACA  450

seq1  CTGACCCTTGGGACTGTGTCCTGCTGTTGCATACACGGTGACAGCCATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCCTTGGGACTGTGTCCTGCTGTTGCATACACGGTGACAGCCATGG  500

seq1  GGAAGAAATGCCATCTGGAGCCCTAGCCCTTGCAGACACATATGGCTATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAATGCCATCTGGAGCCCTAGCCCTTGCAGACACATATGGCTATC  550

seq1  AAGACTCTCAGGACGTAGAACCACCAAGAACAGATGCTGTGTACATGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTCTCAGGACGTAGAACCACCAAGAACAGATGCTGTGTACATGACT  600

seq1  AGGTAGGTGTTGAGTATCCTAGCAACCCAAACCTGGGTGACCTGGGTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGTGTTGAGTATCCTAGCAACCCAAACCTGGGTGACCTGGGTGTT  650

seq1  TATGCTCAATCATAGTAACTGGGATGGGGTCCAGGAGGGCAAAGAGCCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTCAATCATAGTAACTGGGATGGGGTCCAGGAGGGCAAAGAGCCTA  700

seq1  CTACGGCCACCAACACTCATATCAAATGTGATTTTCACACAGCATGAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGGCCACCAACACTCATATCAAATGTGATTTTCACACAGCATGAGAA  750

seq1  CAAGGTGAGGTTAGCTGTTTAGACCTAGAGTCACAGAAGGGACAAGACTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGAGGTTAGCTGTTTAGACCTAGAGTCACAGAAGGGACAAGACTT  800

seq1  CGGGCACACAGGTGAGGAATGATCTAGGTTAGGTTAACTGAGTTGGGGGA  850
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGCACACAGGTGAGGAATGATCTA-GTTAGGTTAACTGAGTTGGGGGA  849

seq1  GAAAATGAACTGAGCATCACCATTCATCCCTTCCTGCTTCCTGACTACAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGAACTGAGCATCACCATTCATCCCTTCCTGCTTCCTGACTACAG  899

seq1  ATGTAACGTGACC-TCACACTCCTGCCGCCATGCCTTACCCGCCATGACG  949
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAACGTGACCTTCACACTCCTGCCGCCATGCCTTACCCGCCATGACG  949

seq1  GTCTGCACCCTCAAACTGTG-AGCCAG-AGTGAACCCCTTTTTCCTCAGG  997
      |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| 
seq2  GTCTGCACCCTCAAACTGTGAAGCCAGAAGTGAACCCCTTTTCCCTCAGT  999

seq1  TTGCTTTGG-TCAGG-AATTTTATCAGAG-CTA--TAAGGAGTGATG-TG  1041
      ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   ||| ||||||| ||
seq2  TTGCTTTGGTTCAGGAAATTTTATCAGAGCCTAATAAAGAAGTGATGTTG  1049

seq1  GGGAGGGGTG  1051
      ||||||||||
seq2  GGGAGGGGTG  1059