BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-298B14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 91,674,483 - 91,820,536
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG625801, EG384862
Upstream geneHeatr3, Papd5, Adcy7, Brd7, LOC100040369, Nkd1, 9130017C17Rik, Nod2, Cyld, LOC675985, Sall1, LOC100041089
Downstream geneTox3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-298B14.bB6Ng01-298B14.g
ACCGA093297GA093298
length9571,112
definitionB6Ng01-298B14.b B6Ng01-298B14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,819,582 - 91,820,536)(91,674,483 - 91,675,602)
sequence
gaattcacaggctctcaggatcccagcagggagagcttggagccctgttg
ttggaaatagctcccaacctgcatctcaggcaggtatttttaggttctgt
cttgaagacacagaaactttcgtacatttcagcttctttgtctggagcca
gtgcaaccccagacatgtcattgaaagggggtataattgtggtctcctcc
acccagcaatctgagcttgtctgaaaggagcttcctgctgtgcagcaggg
gggttagagagccttttctggcaagggaaagtcaaaatggattttttaaa
ataataatatgttgatcaagaagaggggaaaaatctcgaggagagggggc
tgtgcagtgggctgatctggagaggaggttacctattgttttgaaacctg
gtctcagttcttcgtggtaagctacagaattcaagcttggaggagataaa
ctctcacattagaggttggggaataaaagatgcttggaagcatcagtgtt
agatcaatgctgttattaatatgaggctttcctgggagcaattatgactg
tcagtcactgggcatagccggacattgaaagaagaaattaaaaacctaaa
acgatacagggcaggtataggattgacaggggcaggccaatggtatgcca
gagctggaagaagggatgtttaagttcaaaggtcatgagaaccatcttta
gacaggtcaacagaggtaacgtggcactgttcctgggactccgttaaaaa
caaatcctaagggcttaactttagagtgcttgatcctgaataactgaaag
gaccccagatgccttcagctcatgtgagcatgaaaagctacattcatcaa
gtagcccacaggatggccacggccattgtcagtgtactttgaaatcatac
agcaaagcaatgttcactgaaggggaatggtattgcaatggtggtgggtg
ggattgg
gaattctttgagtggtcttcagtagcatatggttggcagagaccctgggc
cactttctgttttccttctggtcatgactgaagtctttcaggttctagca
cagtctgctttctagaaaggagtacatgggcctctataccactcactgta
gggggtttcagtctctgatgtacttgcagagacttttgggagcatgactt
tctattaggaaacacaggctggcacgttccaatctcatcagtgacttcta
acctttctccatgaacaagggtaagataaatgccttctctattgtttgat
ttccctgtctgcaaagtggacatagtgccagtagctactttgttgggtta
tcttagtctgttttttttttctgttataaaatttcagagactgagtaatt
tatgaaaagcagaagtatctgtgacttatgtttctgtagattgttggtaa
gtctgaaggcagggcactgatgtctgataggcatctggtgagggcatgtc
cttgcatcagcacatggccttatcacttgtcagacacacctggatcgttt
tcttataaagctactcatgctgtcacaggaacccctcccatgacctcatc
tcatcctcatcacttcccaaagaccctgaatgatagaactaggcagcaag
gcctcacagaaacgcaacatgcagcaggtctcaagtgggaggtttactag
acaagaatagaggcagcctctgggagagggaggaaagaagaagggagact
gggtcaggagaatgtgacttttattggggctgtggcacatgtgcaaagga
gagacacctttgcctcttgggcctctagagattgtgtgtttcatagctgg
gtggcttgaaagctgaccgtaaagatgtctgatggtcgtggagtcacttc
tagctgtccatggatgtgcctgatccgccaactcctaatagcatctaaac
atgagtctgagttaaatgtgtgtgttgtgatgatgatgatgacgactatg
acatgttttcagacaggctggttctggacctcactattgtagatatgcag
cttttaacctgtgacaatcctctgcttcagttctcacaatacaaacattg
taatcatcgtca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_91819582_91820536
seq2: B6Ng01-298B14.b_48_1004 (reverse)

seq1  CCAATCCCA-CCACCACCATTGCAATACCATTCCCC-TCAGTGAACATTG  48
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCAATCCCACCCACCACCATTGCAATACCATTCCCCTTCAGTGAACATTG  50

seq1  CTTTGCTGTATGATTTCAAAGTACACTGACAATGGCCGTGGCCATCCTGT  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTGTATGATTTCAAAGTACACTGACAATGGCCGTGGCCATCCTGT  100

seq1  GGGCTACTTGATGAATGTAGCTTTTCATGCTCACATGAGCTGAAGGCATC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTACTTGATGAATGTAGCTTTTCATGCTCACATGAGCTGAAGGCATC  150

seq1  TGGGGTCCTTTCAGTTATTCAGGATCAAGCACTCTAAAGTTAAGCCCTTA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTCCTTTCAGTTATTCAGGATCAAGCACTCTAAAGTTAAGCCCTTA  200

seq1  GGATTTGTTTTTAACGGAGTCCCAGGAACAGTGCCACGTTACCTCTGTTG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGTTTTTAACGGAGTCCCAGGAACAGTGCCACGTTACCTCTGTTG  250

seq1  ACCTGTCTAAAGATGGTTCTCATGACCTTTGAACTTAAACATCCCTTCTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCTAAAGATGGTTCTCATGACCTTTGAACTTAAACATCCCTTCTT  300

seq1  CCAGCTCTGGCATACCATTGGCCTGCCCCTGTCAATCCTATACCTGCCCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTCTGGCATACCATTGGCCTGCCCCTGTCAATCCTATACCTGCCCT  350

seq1  GTATCGTTTTAGGTTTTTAATTTCTTCTTTCAATGTCCGGCTATGCCCAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCGTTTTAGGTTTTTAATTTCTTCTTTCAATGTCCGGCTATGCCCAG  400

seq1  TGACTGACAGTCATAATTGCTCCCAGGAAAGCCTCATATTAATAACAGCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGACAGTCATAATTGCTCCCAGGAAAGCCTCATATTAATAACAGCA  450

seq1  TTGATCTAACACTGATGCTTCCAAGCATCTTTTATTCCCCAACCTCTAAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTAACACTGATGCTTCCAAGCATCTTTTATTCCCCAACCTCTAAT  500

seq1  GTGAGAGTTTATCTCCTCCAAGCTTGAATTCTGTAGCTTACCACGAAGAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAGTTTATCTCCTCCAAGCTTGAATTCTGTAGCTTACCACGAAGAA  550

seq1  CTGAGACCAGGTTTCAAAACAATAGGTAACCTCCTCTCCAGATCAGCCCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACCAGGTTTCAAAACAATAGGTAACCTCCTCTCCAGATCAGCCCA  600

seq1  CTGCACAGCCCCCTCTCCTCGAGATTTTTCCCCTCTTCTTGATCAACATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACAGCCCCCTCTCCTCGAGATTTTTCCCCTCTTCTTGATCAACATA  650

seq1  TTATTATTTTAAAAAATCCATTTTGACTTTCCCTTGCCAGAAAAGGCTCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTATTTTAAAAAATCCATTTTGACTTTCCCTTGCCAGAAAAGGCTCT  700

seq1  CTAACCCCCCTGCTGCACAGCAGGAAGCTCCTTTCAGACAAGCTCAGATT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCCCCCTGCTGCACAGCAGGAAGCTCCTTTCAGACAAGCTCAGATT  750

seq1  GCTGGGTGGAGGAGACCACAATTATACCCCCTTTCAATGACATGTCTGGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTGGAGGAGACCACAATTATACCCCCTTTCAATGACATGTCTGGG  800

seq1  GTTGCACTGGCTCCAGACAAAGAAGCTGAAATGTACGAAAGTTTCTGTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCACTGGCTCCAGACAAAGAAGCTGAAATGTACGAAAGTTTCTGTGT  850

seq1  CTTCAAGACAGAACCTAAAAATACCTGCCTGAGATGCAGGTTGGGAGCTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAGACAGAACCTAAAAATACCTGCCTGAGATGCAGGTTGGGAGCTA  900

seq1  TTTCCAACAACAGGGCTCCAAGCTCTCCCTGCTGGGATCCTGAGAGCCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAACAACAGGGCTCCAAGCTCTCCCTGCTGGGATCCTGAGAGCCTG  950

seq1  TGAATTC  955
      |||||||
seq2  TGAATTC  957

seq1: chr8_91674483_91675602
seq2: B6Ng01-298B14.g_68_1179

seq1  GAATTCTTTGAGTGGTCTTCAGTAGCATATGGTTGGCAGAGACCCTGGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGAGTGGTCTTCAGTAGCATATGGTTGGCAGAGACCCTGGGC  50

seq1  CACTTTCTGTTTTCCTTCTGGTCATGACTGAAGTCTTTCAGGTTCTAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCTGTTTTCCTTCTGGTCATGACTGAAGTCTTTCAGGTTCTAGCA  100

seq1  CAGTCTGCTTTCTAGAAAGGAGTACATGGGCCTCTATACCACTCACTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGCTTTCTAGAAAGGAGTACATGGGCCTCTATACCACTCACTGTA  150

seq1  GGGGGTTTCAGTCTCTGATGTACTTGCAGAGACTTTTGGGAGCATGACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTTTCAGTCTCTGATGTACTTGCAGAGACTTTTGGGAGCATGACTT  200

seq1  TCTATTAGGAAACACAGGCTGGCACGTTCCAATCTCATCAGTGACTTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTAGGAAACACAGGCTGGCACGTTCCAATCTCATCAGTGACTTCTA  250

seq1  ACCTTTCTCCATGAACAAGGGTAAGATAAATGCCTTCTCTATTGTTTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCTCCATGAACAAGGGTAAGATAAATGCCTTCTCTATTGTTTGAT  300

seq1  TTCCCTGTCTGCAAAGTGGACATAGTGCCAGTAGCTACTTTGTTGGGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGTCTGCAAAGTGGACATAGTGCCAGTAGCTACTTTGTTGGGTTA  350

seq1  TCTTAGTCTGTTTTTTTTTTCTGTTATAAAATTTCAGAGACTGAGTAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGTCTGTTTTTTTTTTCTGTTATAAAATTTCAGAGACTGAGTAATT  400

seq1  TATGAAAAGCAGAAGTATCTGTGACTTATGTTTCTGTAGATTGTTGGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAAAGCAGAAGTATCTGTGACTTATGTTTCTGTAGATTGTTGGTAA  450

seq1  GTCTGAAGGCAGGGCACTGATGTCTGATAGGCATCTGGTGAGGGCATGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGAAGGCAGGGCACTGATGTCTGATAGGCATCTGGTGAGGGCATGTC  500

seq1  CTTGCATCAGCACATGGCCTTATCACTTGTCAGACACACCTGGATCGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATCAGCACATGGCCTTATCACTTGTCAGACACACCTGGATCGTTT  550

seq1  TCTTATAAAGCTACTCATGCTGTCACAGGAACCCCTCCCATGACCTCATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATAAAGCTACTCATGCTGTCACAGGAACCCCTCCCATGACCTCATC  600

seq1  TCATCCTCATCACTTCCCAAAGACCCTGAATGATAGAACTAGGCAGCAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTCATCACTTCCCAAAGACCCTGAATGATAGAACTAGGCAGCAAG  650

seq1  GCCTCACAGAAACGCAACATGCAGCAGGTCTCAAGTGGGAGGTTTACTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCACAGAAACGCAACATGCAGCAGGTCTCAAGTGGGAGGTTTACTAG  700

seq1  ACAAGAATAGAGGCAGCCTCTGGGAGAGGGAGGAAAGAAGAAGGGAGACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAATAGAGGCAGCCTCTGGGAGAGGGAGGAAAGAAGAAGGGAGACT  750

seq1  GGGTCAGGGAGAATGTGACTTTTATTGGGGCTGTGGCACATGTGCAAAGG  800
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCA-GGAGAATGTGACTTTTATTGGGGCTGTGGCACATGTGCAAAGG  799

seq1  AGAGACACCTTTGCCTCTTGGGCCTCTAGAGATTGTGTGTTTCATAGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACACCTTTGCCTCTTGGGCCTCTAGAGATTGTGTGTTTCATAGCTG  849

seq1  GGTGGCTTGAAAGCTGACCGTAAAGATGTCTGATGGTCGTGGAGTCACTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTTGAAAGCTGACCGTAAAGATGTCTGATGGTCGTGGAGTCACTT  899

seq1  CTAGCTGTCCATGGATGTGCCTGAT-CGCCAACTCCTAATAGCATCTAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGTCCATGGATGTGCCTGATCCGCCAACTCCTAATAGCATCTAAA  949

seq1  CATGAGTCTGAGTTAAAATGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATGACG  999
      |||||||||||||||||    |||   ||||| |||||||||||||||||
seq2  CATGAGTCTGAGTTAAA----TGTGTGTGTTG-TGATGATGATGATGACG  994

seq1  ACTATGACAATGTTTCAGGACAGGCTGG-TCTGGGACTCACTA-TGTAGA  1047
      |||||||| ||||||   |||||||||| |||||  ||||||| ||||| 
seq2  ACTATGAC-ATGTTTTCAGACAGGCTGGTTCTGGACCTCACTATTGTAG-  1042

seq1  ATATGCCAGCTTTTAAACTGTGGCCATCTTCCTGCCTCAGTCCTCCACAA  1097
      ||||| |||||||||| ||||| | ||| | |||| ||||| || |||||
seq2  ATATG-CAGCTTTTAACCTGTGACAATCCT-CTGCTTCAGTTCT-CACAA  1089

seq1  TTACAAACA-TGTAATCATCGTCA  1120
       |||||||| ||||||||||||||
seq2  -TACAAACATTGTAATCATCGTCA  1112