BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302D14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 117,890,329 - 118,076,297
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAI427515, Clec3a, Wwox
Downstream geneMaf, LOC384868, LOC668233, Dynlrb2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302D14.bB6Ng01-302D14.g
ACCGA096332GA096333
length5081,126
definitionB6Ng01-302D14.b B6Ng01-302D14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,890,329 - 117,890,840)(118,075,174 - 118,076,297)
sequence
cccgtctcctatcatgaaacagggctggtggctcccagctttggatcacc
caacaaagaaccagcttccaaggccatcagccaccaatgttaccctgtgc
ccaagccagtccggacacatgtgggtaggatcattcatcagccccattct
ctttatgatcttggcttgaaacttaacgagcagtgggataagagcagaca
gaggagcaagaaccttgctagatatgttctcttacctgtccagcactcat
caggaaacaggcccttccctcagggtatcattagtccaaggaagataagt
gcaccgtataggaaactcaaaccagagcccgaagccaactccatctggac
cggttgacactcaggcgacaggcagaggcatgagccattataacaagggc
tgaaatcagtattgcctttttgaggtggttcgatacacagcttaatttga
ccagtacacgcgttatatgggaagccttttggcttgcctccgataatcct
ctaaacaa

gaattccacctagggaaatccagagaagtgagtgacagctgagtgtagtg
acagagatggaaaagaatccttctgtgtgagaaataaacaaattacaagt
gaaaagaggatgagagagagagttatcttgtgtcattggttccccaggcc
cccgggagtcacagcaaagcagcactgggaggttgatattcatgctccca
tgcacacctagtgggtgcacacctactgggtgcattgcaaggggcaagaa
gattagtgtctgactcttttctgggaagtgttggtgaagtagaagggact
gctttcttaagtgtcacggcattggccttgaaatggagaaagcatcaact
ttaagtccatgaccatgtaggaatctgtgtgtatgtgtgtgtgtatgtac
ttgtgcatacatgtgggtatacgtgcatgcagtacagacaagcttaaatg
tgtgctcatgtgtgcacacgtggggtggcttgccactgtgcatgtgtgtg
catctgtagctatgaatgttctggattcctgtgtgagtgcatcctcactg
aaacaggctcagaggtcaaggcattgctggtcaaacatagagctaccttc
cttattttttaatttaactccatgtttcatattatttatttgtttactta
gttatgagatagactctcatgtacttcgagcttgtctatagctccctatg
taaccatcgacgaccttgaactttgggtcctctgacctttacttcctgag
tggtgatggaactgtaggcatgccccatgatgcctggtttatacaaccct
ggggatagttcctcgctgcatgccaagcaagcccttctaccaaacaggtc
ctcagccccagagggcggaatctccaaagcccttcgcttcattcactgct
gctctagtctccactgggaacccagcagagatccagcccatcagataagc
agcggatctgggctgctacagctcattacccagcaacagatcattaacag
tcattgcttggctgggaaatctgttctgctaaccactaagtcacccaaga
tccggatctgggtttcttcttcagatttctgatcctgaaggctgtgcctt
tgtgacaggtaaagtggtctcctctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_117890329_117890840
seq2: B6Ng01-302D14.b_47_560

seq1  GAATTCCCCGTCTCCTATCATGAAACAGGGCTGGTGGCTCCCAGCTTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCGTCTCCTATCATGAAACAGGGCTGGTGGCTCCCAGCTTTGG  50

seq1  ATCACCCAACAAAGAACCAGCTTCCAAGGCCATCAGCCACCAATGTTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCCAACAAAGAACCAGCTTCCAAGGCCATCAGCCACCAATGTTACC  100

seq1  CTGTGCCCAAGCCAGTCCGGACACATGTGGGTAGGATCATTCATCAGCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCCAAGCCAGTCCGGACACATGTGGGTAGGATCATTCATCAGCCC  150

seq1  CATTCTCTTTATGATCTTGGCTTGAAACTTAACGAGCAGTGGGATAAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCTTTATGATCTTGGCTTGAAACTTAACGAGCAGTGGGATAAGAG  200

seq1  CAGACAGAGGAGCAAGAACCTTGCTAGATATGTTCTCTTACCTGTCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACAGAGGAGCAAGAACCTTGCTAGATATGTTCTCTTACCTGTCCAGC  250

seq1  ACTCATCAGGAAACAGGCCCTTCCCTCAGGGTATCATTAGTCCAAGGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATCAGGAAACAGGCCCTTCCCTCAGGGTATCATTAGTCCAAGGAAG  300

seq1  ATAAGTGCACCGTAGAGGAAACTCAAACCAGAGCCCGAAGCCAACTCCAT  350
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTGCACCGTATAGGAAACTCAAACCAGAGCCCGAAGCCAACTCCAT  350

seq1  CTGGACCGGTTGACACTCAGTCGACAGGCAGAGGCATGAGCCATTATAAC  400
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACCGGTTGACACTCAGGCGACAGGCAGAGGCATGAGCCATTATAAC  400

seq1  AAGGGCTGAAAGCAGTATTGCC-TTTTGAGGTGGTTTGATACACAGCTAA  449
      ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
seq2  AAGGGCTGAAATCAGTATTGCCTTTTTGAGGTGGTTCGATACACAGCTTA  450

seq1  ATCTAACCAGTACACGTGTTATATGGGAAGCC-TTTGGCTTGCCTCCGAT  498
      || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ATTTGACCAGTACACGCGTTATATGGGAAGCCTTTTGGCTTGCCTCCGAT  500

seq1  AATCCTCAAAACAA  512
      ||||||| ||||||
seq2  AATCCTCTAAACAA  514


seq1: chr8_118075174_118076297
seq2: B6Ng01-302D14.g_65_1190 (reverse)

seq1  GAGAGGGAGACCCACTTTTCCTGTCCACAAAAGCACAGCTTTCAGGAATC  50
      |||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||
seq2  GAGA-GGAGA-CCACTTTACCTGT-CACAAAGGCACAGCCTTCAGG-ATC  46

seq1  AG-AATCTG-AGAAGAAAACCAGATCCGGATCCTGGGTGACTTAGTGG-T  97
      || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2  AGAAATCTGAAGAAGAAACCCAGATCCGGATCTTGGGTGACTTAGTGGTT  96

seq1  AGCAGAACAGATT--CCAGCCAAGCAATGACTTGTTAATGATCTG-TGCT  144
      |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  AGCAGAACAGATTTCCCAGCCAAGCAATGAC-TGTTAATGATCTGTTGCT  145

seq1  GGGTAATGAGCTGTAGCAGCCCAGATCCGCTGCTTATCTGATGGGCTGGA  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAATGAGCTGTAGCAGCCCAGATCCGCTGCTTATCTGATGGGCTGGA  195

seq1  TCTCTGCTGGGTT-CCAGTGGAGACTAGAGCAGCAGTGAATGAAGCGAAG  243
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCTGGGTTCCCAGTGGAGACTAGAGCAGCAGTGAATGAAGCGAAG  245

seq1  GGCTTTGGAGATTCCGCCCTCTGGGGCTGAGGACCTGTTTGGTAGAAGGG  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTGGAGATTCCGCCCTCTGGGGCTGAGGACCTGTTTGGTAGAAGGG  295

seq1  CTTGCTTGGCATGCAGCGAGGAACTATCCCCAGGGTTGTATAAACCAGGC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTGGCATGCAGCGAGGAACTATCCCCAGGGTTGTATAAACCAGGC  345

seq1  ATCATGGGGCATGCCTACAGTTCCATCACCACTCAGGAAGTAAAGGTCAG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGGGCATGCCTACAGTTCCATCACCACTCAGGAAGTAAAGGTCAG  395

seq1  AGGACCCAAAGTTCAAGGTCGTCGATGGTTACATAGGGAGCTATAGACAA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCCAAAGTTCAAGGTCGTCGATGGTTACATAGGGAGCTATAGACAA  445

seq1  GCTCGAAGTACATGAGAGTCTATCTCATAACTAAGTAAACAAATAAATAA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGAAGTACATGAGAGTCTATCTCATAACTAAGTAAACAAATAAATAA  495

seq1  TATGAAACATGGAGTTAAATTAAAAAATAAGGAAGGTAGCTCTATGTTTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAACATGGAGTTAAATTAAAAAATAAGGAAGGTAGCTCTATGTTTG  545

seq1  ACCAGCAATGCCTTGACCTCTGAGCCTGTTTCAGTGAGGATGCACTCACA  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCAATGCCTTGACCTCTGAGCCTGTTTCAGTGAGGATGCACTCACA  595

seq1  CAGGAATCCAGAACATTCATAGCTACAGATGCACACACATGCACAGTGGC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATCCAGAACATTCATAGCTACAGATGCACACACATGCACAGTGGC  645

seq1  AAGCCACCCCACGTGTGCACACATGAGCACACATTTAAGCTTGTCTGTAC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCACCCCACGTGTGCACACATGAGCACACATTTAAGCTTGTCTGTAC  695

seq1  TGCATGCACGTATACCCACATGTATGCACAAGTACATACACACACACATA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCACGTATACCCACATGTATGCACAAGTACATACACACACACATA  745

seq1  CACACAGATTCCTACATGGTCATGGACTTAAAGTTGATGCTTTCTCCATT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGATTCCTACATGGTCATGGACTTAAAGTTGATGCTTTCTCCATT  795

seq1  TCAAGGCCAATGCCGTGACACTTAAGAAAGCAGTCCCTTCTACTTCACCA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGCCAATGCCGTGACACTTAAGAAAGCAGTCCCTTCTACTTCACCA  845

seq1  ACACTTCCCAGAAAAGAGTCAGACACTAATCTTCTTGCCCCTTGCAATGC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTCCCAGAAAAGAGTCAGACACTAATCTTCTTGCCCCTTGCAATGC  895

seq1  ACCCAGTAGGTGTGCACCCACTAGGTGTGCATGGGAGCATGAATATCAAC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGTAGGTGTGCACCCACTAGGTGTGCATGGGAGCATGAATATCAAC  945

seq1  CTCCCAGTGCTGCTTTGCTGTGACTCCCGGGGGCCTGGGGAACCAATGAC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGTGCTGCTTTGCTGTGACTCCCGGGGGCCTGGGGAACCAATGAC  995

seq1  ACAAGATAACTCTCTCTCTCATCCTCTTTTCACTTGTAATTTGTTTATTT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGATAACTCTCTCTCTCATCCTCTTTTCACTTGTAATTTGTTTATTT  1045

seq1  CTCACACAGAAGGATTCTTTTCCATCTCTGTCACTACACTCAGCTGTCAC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACAGAAGGATTCTTTTCCATCTCTGTCACTACACTCAGCTGTCAC  1095

seq1  TCACTTCTCTGGATTTCCCTAGGTGGAATTC  1124
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTCTCTGGATTTCCCTAGGTGGAATTC  1126


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |