BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-314P02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,839,282 - 14,976,829
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2, Cln8, Arhgef10
Upstream geneD8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140, C030037F17Rik
Downstream gene2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097, EG665619, LOC634008, Csmd1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-314P02.bB6Ng01-314P02.g
ACCGA105723GA105724
length1,1071,159
definitionB6Ng01-314P02.b B6Ng01-314P02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,975,722 - 14,976,829)(14,839,282 - 14,840,434)
sequence
gaattctatataagttctatagagaaggatctctatgtgggtcttcctgc
ctgcctgcttacctacctacccataatccttctgtctatatatatccttt
ggtctatatatatctgtgtacctaactacctatcacctgacaatctatct
acctactatatatcatctacctaccaaccttttgtctatctaccttatta
tggattatctatcgatttgccaacttacctatcatttctcgtctacctac
ctatcatccatctacatttctttctttctatctaactacctatctatcta
tctattcatttatccatccatccatccacttacctaccgatctacctaca
caggctaaaaagatacatgaaccagcaaacatctatccatgtctagccaa
aggaaaaccacaggactgatgtttcaagctgggagccctgagtgacaaga
taagatacactacactccctgtcacaggaggggctgaacacggaggctgg
gatgctctgtcctttccactccttgataacttccccatgccggggtttca
ggctccggaccagggcttcagccccagggacccactcttgtgctcaatag
tcacaatatacaagaatttcataccacaatagaagccactgatgcattct
tcagaccctgagttataatacaaccttgtaacgtttccacttaacgctat
gcttccaggtcacgggaggttttctctctaccctggtttcaccctctcag
gtgtatgcataatcaaacgacctctctgatgtccctgaaacagccctttc
ttcatggagcatggccagtccgcttaaaccctgtgtcttaccaagggcca
gcttggccatctgcaggctgctgacccaggactccttgatggctggtgta
agcgtattgaacacagcagtgaagaacgtgggccgcccgggacctgccgg
agaagaggggcgctcccttttacagccctgcacgatacacatacagtcag
tctgcacgtacacatacagtcagctgcacggtacacatacagtcagtctg
cacgtacacccatgtatgagctacgagtcagaaaaacacatctgaccgag
aacgttc
gaattcactgagatggcgggtaccaatgcgtttttttctccaaatcgagg
agttgccattggagtcagtggtgtcttctggagtcccaactcaagggact
cacctgaacatcaaagctaaataaactcaggaccccaaaataaggagatt
ctgtagtgtccatcaccataagaagctaaatcatccctagtacccagtac
taagaccctcttagctaacacttggttgtcgttgtgtattctcacaagct
gggaaggaatgggaacatcagctgatggatgcgtttagcatggtccacac
taagctccaaccccagcgagaaagcatggacggcagttctgatccctgct
cactggacgcccggcgttcttgctttgttatgactgactgagtcttcgtc
ttccctgtgtctcccagttctaggaaagatcaggagtgctgtaggaagtg
ctcagctgctcatgtcccagaagttccagcagttttactggctttgtcag
cagaacatggtaagtggcgtggtagcctcgatcccatagacgccaagatg
tgtgcggccttcgtggtcacagaacctttctgttacttttcagttgctat
gacttttcaaaacaccgtgaccgacacaacttataaaagaacaagtttct
taggaacagacagtttcagtgggtgttttcatgatcattgtagtgcgggg
catggcagcaggcaggcaagcaggcatggcactggggcagtagctaaaat
cttactgagacacaacccccaggaagagaaagggttaaccgtgaatggta
atggatggtgtgggcttttaaaacatcagaactgtatcccagtgacacac
ctctgccaacaaggccgtacctttctttatcctctcccaacaattcaatc
aagtgtggaccaagaattcaaaccctatgagccaatgaggagtatttctc
attcagaccaccacactcctcattgtcagagagctccagtgcagggatgg
ggaggagaattataggccaggcctggaccacattccagccttggagaccc
cacacatttgtcctgataagtcatacgtcagtctagggaccttacactcc
acaattcagtgggcacttatacttagcctaagaaacattcccttaaggtt
ccaggaagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14975722_14976829
seq2: B6Ng01-314P02.b_48_1154 (reverse)

seq1  GAACGGTTCTCTGTCAGATGTG-TTTTCTGGCTCGGTAGCTCATTACAT-  48
      |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| 
seq2  GAAC-GTTCTCGGTCAGATGTGTTTTTCTGACTC-GTAGCTCA-TACATG  47

seq1  GGTGTACCGTGCAGACTGACTGTATGTGTACCGTGCAGGCTGACTGTATG  98
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGTGTA-CGTGCAGACTGACTGTATGTGTACCGTGCA-GCTGACTGTATG  95

seq1  TGTACCGTGCAGACTGACTGTATGTGTATCGTGCA-GGCTGT-AAAGGGA  146
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  TGTA-CGTGCAGACTGACTGTATGTGTATCGTGCAGGGCTGTAAAAGGGA  144

seq1  GCGCCCCTCTTCTCCGGCAGGT-CCGGGCGGCCCACGTTCTTCACTGCTG  195
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCCCCTCTTCTCCGGCAGGTCCCGGGCGGCCCACGTTCTTCACTGCTG  194

seq1  TGTTCAATACGCTTACACCAGCCATCAAGGAGTCCTGGGTCAGCAGCCTG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAATACGCTTACACCAGCCATCAAGGAGTCCTGGGTCAGCAGCCTG  244

seq1  CAGATGGCCAAGCTGGCCCTTGGTAAGACACAGGGTTTAAGCGGACTGGC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGGCCAAGCTGGCCCTTGGTAAGACACAGGGTTTAAGCGGACTGGC  294

seq1  CATGCTCCATGAAGAAAGGGCTGTTTCAGGGACATCAGAGAGGTCGTTTG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCCATGAAGAAAGGGCTGTTTCAGGGACATCAGAGAGGTCGTTTG  344

seq1  ATTATGCATACACCTGAGAGGGTGAAACCAGGGTAGAGAGAAAACCTCCC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGCATACACCTGAGAGGGTGAAACCAGGGTAGAGAGAAAACCTCCC  394

seq1  GTGACCTGGAAGCATAGCGTTAAGTGGAAACGTTACAAGGTTGTATTATA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCTGGAAGCATAGCGTTAAGTGGAAACGTTACAAGGTTGTATTATA  444

seq1  ACTCAGGGTCTGAAGAATGCATCAGTGGCTTCTATTGTGGTATGAAATTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGGGTCTGAAGAATGCATCAGTGGCTTCTATTGTGGTATGAAATTC  494

seq1  TTGTATATTGTGACTATTGAGCACAAGAGTGGGTCCCTGGGGCTGAAGCC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATTGTGACTATTGAGCACAAGAGTGGGTCCCTGGGGCTGAAGCC  544

seq1  CTGGTCCGGAGCCTGAAACCCCGGCATGGGGAAGTTATCAAGGAGTGGAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCCGGAGCCTGAAACCCCGGCATGGGGAAGTTATCAAGGAGTGGAA  594

seq1  AGGACAGAGCATCCCAGCCTCCGTGTTCAGCCCCTCCTGTGACAGGGAGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGAGCATCCCAGCCTCCGTGTTCAGCCCCTCCTGTGACAGGGAGT  644

seq1  GTAGTGTATCTTATCTTGTCACTCAGGGCTCCCAGCTTGAAACATCAGTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTGTATCTTATCTTGTCACTCAGGGCTCCCAGCTTGAAACATCAGTC  694

seq1  CTGTGGTTTTCCTTTGGCTAGACATGGATAGATGTTTGCTGGTTCATGTA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGTTTTCCTTTGGCTAGACATGGATAGATGTTTGCTGGTTCATGTA  744

seq1  TCTTTTTAGCCTGTGTAGGTAGATCGGTAGGTAAGTGGATGGATGGATGG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTAGCCTGTGTAGGTAGATCGGTAGGTAAGTGGATGGATGGATGG  794

seq1  ATAAATGAATAGATAGATAGATAGGTAGTTAGATAGAAAGAAAGAAATGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGAATAGATAGATAGATAGGTAGTTAGATAGAAAGAAAGAAATGT  844

seq1  AGATGGATGATAGGTAGGTAGACGAGAAATGATAGGTAAGTTGGCAAATC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGATGATAGGTAGGTAGACGAGAAATGATAGGTAAGTTGGCAAATC  894

seq1  GATAGATAATCCATAATAAGGTAGATAGACAAAAGGTTGGTAGGTAGATG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAATCCATAATAAGGTAGATAGACAAAAGGTTGGTAGGTAGATG  944

seq1  ATATATAGTAGGTAGATAGATTGTCAGGTGATAGGTAGTTAGGTACACAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAGTAGGTAGATAGATTGTCAGGTGATAGGTAGTTAGGTACACAG  994

seq1  ATATATATAGACCAAAGGATATATATAGACAGAAGGATTATGGGTAGGTA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATAGACCAAAGGATATATATAGACAGAAGGATTATGGGTAGGTA  1044

seq1  GGTAAGCAGGCAGGCAGGAAGACCCACATAGAGATCCTTCTCTATAGAAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGCAGGCAGGCAGGAAGACCCACATAGAGATCCTTCTCTATAGAAC  1094

seq1  TTATATAGAATTC  1108
      |||||||||||||
seq2  TTATATAGAATTC  1107

seq1: chr8_14839282_14840434
seq2: B6Ng01-314P02.g_70_1228

seq1  GAATTCACTGAGATGGCGGGTACCAATGCGTTTTTTTCTCCAAATCGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGAGATGGCGGGTACCAATGCGTTTTTTTCTCCAAATCGAGG  50

seq1  AGTTGCCATTGGAGTCAGTGGTGTCTTCTGGAGTCCCAACTCAAGGGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCATTGGAGTCAGTGGTGTCTTCTGGAGTCCCAACTCAAGGGACT  100

seq1  CACCTGAACATCAAAGCTAAATAAACTCAGGACCCCAAAATAAGGAGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGAACATCAAAGCTAAATAAACTCAGGACCCCAAAATAAGGAGATT  150

seq1  CTGTAGTGTCCATCACCATAAGAAGCTAAATCATCCCTAGTACCCAGTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGTGTCCATCACCATAAGAAGCTAAATCATCCCTAGTACCCAGTAC  200

seq1  TAAGACCCTCTTAGCTAACACTTGGTTGTCGTTGTGTATTCTCACAAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACCCTCTTAGCTAACACTTGGTTGTCGTTGTGTATTCTCACAAGCT  250

seq1  GGGAAGGAATGGGAACATCAGCTGATGGATGCGTTTAGCATGGTCCACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGAATGGGAACATCAGCTGATGGATGCGTTTAGCATGGTCCACAC  300

seq1  TAAGCTCCAACCCCAGCGAGAAAGCATGGACGGCAGTTCTGATCCCTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTCCAACCCCAGCGAGAAAGCATGGACGGCAGTTCTGATCCCTGCT  350

seq1  CACTGGACGCCCGGCGTTCTTGCTTTGTTATGACTGACTGAGTCTTCGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGACGCCCGGCGTTCTTGCTTTGTTATGACTGACTGAGTCTTCGTC  400

seq1  TTCCCTGTGTCTCCCAGTTCTAGGAAAGATCAGGAGTGCTGTAGGAAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGTGTCTCCCAGTTCTAGGAAAGATCAGGAGTGCTGTAGGAAGTG  450

seq1  CTCAGCTGCTCATGTCCCAGAAGTTCCAGCAGTTTTACTGGCTTTGTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTGCTCATGTCCCAGAAGTTCCAGCAGTTTTACTGGCTTTGTCAG  500

seq1  CAGAACATGGTAAGTGGCGTGGTAGCCTCGATCCCATAGACGCCAAGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACATGGTAAGTGGCGTGGTAGCCTCGATCCCATAGACGCCAAGATG  550

seq1  TGTGCGGCCTTCGTGGTCACAGAACCTTTCTGTTACTTTTCAGTTGCTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGGCCTTCGTGGTCACAGAACCTTTCTGTTACTTTTCAGTTGCTAT  600

seq1  GACTTTTCAAAACACCGTGACCGACACAACTTATAAAAGAACAAGTTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTCAAAACACCGTGACCGACACAACTTATAAAAGAACAAGTTTCT  650

seq1  TAGGAACAGACAGTTTCAGTGGGTGTTTTCATGATCATTGTAGTGCGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAACAGACAGTTTCAGTGGGTGTTTTCATGATCATTGTAGTGCGGGG  700

seq1  CATGGCAGCAGGCAGGCAAGCAGGCATGGCACTGGGGCAGTAGCTAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAGCAGGCAGGCAAGCAGGCATGGCACTGGGGCAGTAGCTAAAAT  750

seq1  CTTACTGAGACACAACCCCCAGGAAGAGAAAGGGTTAACCGTGAATGGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTGAGACACAACCCCCAGGAAGAGAAAGGGTTAACCGTGAATGGTA  800

seq1  ATGGATGGTGTGGGCTTTTAAAACATCAGAACTGTATCCCAGTGACACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGGTGTGGGCTTTTAAAACATCAGAACTGTATCCCAGTGACACAC  850

seq1  CTCTGCCAACAAGGCCGTACCTT--CTTATCCTCTCCCAAACAATTCAAT  898
      |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||
seq2  CTCTGCCAACAAGGCCGTACCTTTCTTTATCCTCTCCC-AACAATTCAAT  899

seq1  CAAGTGTGGACCAAGAATTCAAA-CCTATGAGCCAATGAGGAGTA-TTCT  946
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CAAGTGTGGACCAAGAATTCAAACCCTATGAGCCAATGAGGAGTATTTCT  949

seq1  CATTCAGACCACCACACTCCTCATTGGTCAGAGAGCTCCAGTGCAGGGAT  996
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAGACCACCACACTCCTCATT-GTCAGAGAGCTCCAGTGCAGGGAT  998

seq1  GGG--AGAGAA-TATAGCCCA-GCCTGGACCCACATCCCAAGCCTGGAGA  1042
      |||   ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||  | ||||||
seq2  GGGGAGGAGAATTATAGGCCAGGCCTGGA-CCACATTCCAGCCTTGGAGA  1047

seq1  -CCCACACATTGTCCCTGATAAGCCATACCTCAGTCTTAGGGACC-TACA  1090
       ||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||
seq2  CCCCACACATTTGTCCTGATAAGTCATACGTCAGTC-TAGGGACCTTACA  1096

seq1  CCCCACA--TCAGTGGGGCACTTATACCTTTTATGGCCCTAGAAACAT--  1136
      | |||||  ||||| ||||||||||||   |||  |||  ||||||||  
seq2  CTCCACAATTCAGT-GGGCACTTATAC---TTA--GCCTAAGAAACATTC  1140

seq1  CCCTAAGG-TCCA-GAAGC  1153
      || ||||| |||| |||||
seq2  CCTTAAGGTTCCAGGAAGC  1159