BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-327H22
Chromosome8 (Build37)
Map Location 30,818,333 - 30,923,873
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneUnc5d, LOC100041237
Downstream geneEG628189
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-327H22.bB6Ng01-327H22.g
ACCGA115027GA115028
length1,132973
definitionB6Ng01-327H22.b B6Ng01-327H22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,922,758 - 30,923,873)(30,818,333 - 30,819,306)
sequence
gaattctaatctagccaatgaatgtacctgatttgtggctctcagtctca
agtacctcagaggcacaatgaacaggcatgaaactgaggcagcctggaaa
tatcacattcatcactatttctcttgccttgtaatttcctcccctcttcc
tctaacccaaagtctcagttatgtccacatttcttaaaatactatacaac
aacataactcaagactccatacactatgccaggttaggaagtaccttgtc
aataaactatatctacctctaatgacagttgcatgtatgaagggagaaac
taggaaacctaagatttggatagatatagaatatctggatatatagtaga
accttggccacaaaaaagagaaagaacatcagttcatgatggtatgggat
aggcaggatgatggataggttgagatccaatagacacatggcagggtata
tagatgaggtacagtgagaacatatgcagatgcatccaaacataaatcta
tgttgcactaaaatgagatttccctaaggctttcaacttcctagtattgg
acttatggagaattgtatttataatgtcttacacagtgtttggcgtgcta
taggctctggatgcctttcaaatagattaatggagtttttggcatgtcgt
taacatgctattttggagatgaagggcatcttagagactttctaccagca
cttttttcttttaaggtaatcgaaaactggtctgagaaaaaaaatgacat
aatctctctaatattgtccagcaatactgaacaaaaaaccataaataaga
atagactccagagatgtctatactaataagtagctactgaatgaatgtgg
caggagtgattgcaaaagggcatttttaaggtttttgccataaattacat
tttatttatttgtttatatattttgtatgtacatcgtggcactcatctgg
agatcagagaaaaactttgggcaatttgaattcttttattctaccatgtg
cactttggaagacggaaccatacctcctctggcttggacacaaaaaacct
tctacctgatgagcaattggcagggcctaaatttaggtattagaaattga
aggtatgcccggaatagccttaggatctgact
gaattctactgaaatgatttctaactttatatttgtcaagagacaggtag
gcagcaatagctgtactctaccacatccttgaagtaagcatggctctgca
ataattgctgctgttgccttgcttgttggttgcacaaaatcctgttcata
gaaattctaaggcagacctggaactcctagtttaattcactgagaaacac
tcattaatgttaggacctaaattatgaaggttcttttaaagccttgcctg
tctgtgtgtcctctccccacttagcgtttctgatctgtgagacacagcat
ccctgggagttgtaccttcttcttcgtaaaatacttggcctccacatgaa
tcttgaaaacccaaacctgactttttaataggagtcttactttattttta
cctatggttatatgtaaatctgtgagcagtatccgaacagaccaaaccat
aattctgtcccctgtaagaaatgcttcagaggtcagagagatggttcagt
gggtaaaattgcttgctgcacaaggatgacaactgtcttagtcagggttt
gtattccttcacaaaacaccatgaccaagaagcaaggtgggaaggaaagg
gtttattaaacttatacttcaaattgctcttcatcactgaatgaagtcag
gacaggaacttacagggcaggaacttggcggcaggagctgatgcagaggc
catggaggggtgtacttactggcttgcctcccctggcttgctcttcttgc
tttcttatagaacccaatactactagccaaatgatggcaccacctacaat
gggctaggccctccccccttgctcagtaattgagaaaatgccttacagtt
gcatctcatgaagacattacctcagttgagactcctatctctgtgatacc
tccagcttttgccaaattgacacacaaaccagccagtaccacaacctacg
tttgatccttcgagctcatgtaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_30922758_30923873
seq2: B6Ng01-327H22.b_44_1175 (reverse)

seq1  AGTCAGAT-CTA--GCTAT--CCGGCATAC--TC-ATTTCTAATACCTAA  42
      |||||||| |||  |||||  | |||||||  || |||||||||||||||
seq2  AGTCAGATCCTAAGGCTATTCCGGGCATACCTTCAATTTCTAATACCTAA  50

seq1  ATTTAGG-CCTGCAAATTGCTCATCAGGTAGAA-GTTTTTTGTGT-CAAG  89
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  ATTTAGGCCCTGCCAATTGCTCATCAGGTAGAAGGTTTTTTGTGTCCAAG  100

seq1  CCAGAGGA-GTATGGTTCCGTCTT-CAAAGTGCACATGGTAGAATAAAAG  137
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGGAGGTATGGTTCCGTCTTCCAAAGTGCACATGGTAGAATAAAAG  150

seq1  AA-TCAAATTG-CCAAAGTTTTTCTCTGATCTCCAGATGAGTGCCACGAT  185
      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAAATTGCCCAAAGTTTTTCTCTGATCTCCAGATGAGTGCCACGAT  200

seq1  GTACATACAAAATATATAAACAAATAAAT-AAATGTAATTTATGGCAAAA  234
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTACATACAAAATATATAAACAAATAAATAAAATGTAATTTATGGCAAAA  250

seq1  ACCTTAAAAATGCCCTTTTGCAATCACTCCTGCCACATTCATTCAGTAGC  284
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAAAAATGCCCTTTTGCAATCACTCCTGCCACATTCATTCAGTAGC  300

seq1  TACTTATTAGTATAGACATCTCTGGAGTCTATTCTTATTTATGGTTTTTT  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTATTAGTATAGACATCTCTGGAGTCTATTCTTATTTATGGTTTTTT  350

seq1  GTTCAGTATTGCTGGACAATATTAGAGAGATTATGTCATTTTTTTTCTCA  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGTATTGCTGGACAATATTAGAGAGATTATGTCATTTTTTTTCTCA  400

seq1  GACCAGTTTTCGATTACCTTAAAAGAAAAAAGTGCTGGTAGAAAGTCTCT  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGTTTTCGATTACCTTAAAAGAAAAAAGTGCTGGTAGAAAGTCTCT  450

seq1  AAGATGCCCTTCATCTCCAAAATAGCATGTTAACGACATGCCAAAAACTC  484
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCCCTTCATCTCCAAAATAGCATGTTAACGACATGCCAAAAACTC  500

seq1  CATTAATCTATTTGAAAGGCATCCAGAGCCTATAGCACGCCAAACACTGT  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATCTATTTGAAAGGCATCCAGAGCCTATAGCACGCCAAACACTGT  550

seq1  GTAAGACATTATAAATACAATTCTCCATAAGTCCAATACTAGGAAGTTGA  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGACATTATAAATACAATTCTCCATAAGTCCAATACTAGGAAGTTGA  600

seq1  AAGCCTTAGGGAAATCTCATTTTAGTGCAACATAGATTTATGTTTGGATG  634
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTAGGGAAATCTCATTTTAGTGCAACATAGATTTATGTTTGGATG  650

seq1  CATCTGCATATGTTCTCACTGTACCTCATCTATATACCCTGCCATGTGTC  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCATATGTTCTCACTGTACCTCATCTATATACCCTGCCATGTGTC  700

seq1  TATTGGATCTCAACCTATCCATCATCCTGCCTATCCCATACCATCATGAA  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGATCTCAACCTATCCATCATCCTGCCTATCCCATACCATCATGAA  750

seq1  CTGATGTTCTTTCTCTTTTTTGTGGCCAAGGTTCTACTATATATCCAGAT  784
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGTTCTTTCTCTTTTTTGTGGCCAAGGTTCTACTATATATCCAGAT  800

seq1  ATTCTATATCTATCCAAATCTTAGGTTTCCTAGTTTCTCCCTTCATACAT  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATATCTATCCAAATCTTAGGTTTCCTAGTTTCTCCCTTCATACAT  850

seq1  GCAACTGTCATTAGAGGTAGATATAGTTTATTGACAAGGTACTTCCTAAC  884
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACTGTCATTAGAGGTAGATATAGTTTATTGACAAGGTACTTCCTAAC  900

seq1  CTGGCATAGTGTATGGAGTCTTGAGTTATGTTGTTGTATAGTATTTTAAG  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCATAGTGTATGGAGTCTTGAGTTATGTTGTTGTATAGTATTTTAAG  950

seq1  AAATGTGGACATAACTGAGACTTTGGGTTAGAGGAAGAGGGGAGGAAATT  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGGACATAACTGAGACTTTGGGTTAGAGGAAGAGGGGAGGAAATT  1000

seq1  ACAAGGCAAGAGAAATAGTGATGAATGTGATATTTCCAGGCTGCCTCAGT  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGCAAGAGAAATAGTGATGAATGTGATATTTCCAGGCTGCCTCAGT  1050

seq1  TTCATGCCTGTTCATTGTGCCTCTGAGGTACTTGAGACTGAGAGCCACAA  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGCCTGTTCATTGTGCCTCTGAGGTACTTGAGACTGAGAGCCACAA  1100

seq1  ATCAGGTACATTCATTGGCTAGATTAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGTACATTCATTGGCTAGATTAGAATTC  1132

seq1: chr8_30818333_30819306
seq2: B6Ng01-327H22.g_68_1040

seq1  GAATTCTACTGAAATGATTTCTAACTTTATATTTGTCAAGAGACAGGTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGAAATGATTTCTAACTTTATATTTGTCAAGAGACAGGTAG  50

seq1  GCAGCAATAGCTGTACTCTACCACATCCTTGAAGTAAGCATGGCTCTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAATAGCTGTACTCTACCACATCCTTGAAGTAAGCATGGCTCTGCA  100

seq1  ATAATTGCTGCTGTTGCCTTGCTTGTTGGTTGCACAAAATCCTGTTCATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGCTGCTGTTGCCTTGCTTGTTGGTTGCACAAAATCCTGTTCATA  150

seq1  GAAATTCTAAGGCAGACCTGGAACTCCTAGTTTAATTCACTGAGAAACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTCTAAGGCAGACCTGGAACTCCTAGTTTAATTCACTGAGAAACAC  200

seq1  TCATTAATGTTAGGACCTAAATTATGAAGGTTCTTTTAAAGCCTTGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAATGTTAGGACCTAAATTATGAAGGTTCTTTTAAAGCCTTGCCTG  250

seq1  TCTGTGTGTCCTCTCCCCACTTAGCGTTTCTGATCTGTGAGACACAGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTGTCCTCTCCCCACTTAGCGTTTCTGATCTGTGAGACACAGCAT  300

seq1  CCCTGGGAGTTGTACCTTCTTCTTCGTAAAATACTTGGCCTCCACATGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGAGTTGTACCTTCTTCTTCGTAAAATACTTGGCCTCCACATGAA  350

seq1  TCTTGAAAACCCAAACCTGACTTTTTAATAGGAGTCTTACTTTATTTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAAAACCCAAACCTGACTTTTTAATAGGAGTCTTACTTTATTTTTA  400

seq1  CCTATGGTTATATGTAAATCTGTGAGCAGTATCCGAACAGACCAAACCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGGTTATATGTAAATCTGTGAGCAGTATCCGAACAGACCAAACCAT  450

seq1  AATTCTGTCCCCTGTAAGAAATGCTTCAGAGGTCAGAGAGATGGTTCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTGTCCCCTGTAAGAAATGCTTCAGAGGTCAGAGAGATGGTTCAGT  500

seq1  GGGTAAAATTGCTTGCTGCACAAGGATGACAACTGTCTTAGTCAGGGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAAAATTGCTTGCTGCACAAGGATGACAACTGTCTTAGTCAGGGTTT  550

seq1  GTATTCCTTCACAAAACACCATGACCAAGAAGCAAGGTGGGAAGGAAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCCTTCACAAAACACCATGACCAAGAAGCAAGGTGGGAAGGAAAGG  600

seq1  GTTTATTAAACTTATACTTCAAATTGCTCTTCATCACTGAATGAAGTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATTAAACTTATACTTCAAATTGCTCTTCATCACTGAATGAAGTCAG  650

seq1  GACAGGAACTTACAGGGCAGGAACTTGGCGGCAGGAGCTGATGCAGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGAACTTACAGGGCAGGAACTTGGCGGCAGGAGCTGATGCAGAGGC  700

seq1  CATGGAGGGGTGTACTTACTGGCTTGCCTCCCCTGGCTTGCTCTTCTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAGGGGTGTACTTACTGGCTTGCCTCCCCTGGCTTGCTCTTCTTGC  750

seq1  TTTCTTATAGAACCCAATACTACTAGCCAAATGATGGCACCACCTACAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTATAGAACCCAATACTACTAGCCAAATGATGGCACCACCTACAAT  800

seq1  GGGCTAGGCCCTCCCCCCTTGCTCAGTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTAGGCCCTCCCCCCTTGCTCAGTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTT  850

seq1  GCATCTCATGAAGACATTACCTCAGTTGAGACTCCTATCTCTGTGATACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTCATGAAGACATTACCTCAGTTGAGACTCCTATCTCTGTGATACC  900

seq1  TCCAGCTTTTGCCAAATTGACACACAAAACCAGCCAGTACCACAACCTAC  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTTTTGCCAAATTGACACAC-AAACCAGCCAGTACCACAACCTAC  949

seq1  GTTTGATCCTTCGAGCTCATGTAA  974
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGATCCTTCGAGCTCATGTAA  973