BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-333D24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 129,221,151 - 129,372,359
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1, Slc35f3, LOC668434, 1810063B05Rik, EG619653, Irf2bp2
Downstream geneTomm20, Rbm34, LOC100043368, Gabarapl2-ps8_1688.1, Pard3, EG628847
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-333D24.bB6Ng01-333D24.g
ACCGA119116GA119117
length1,136850
definitionB6Ng01-333D24.b B6Ng01-333D24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,221,151 - 129,222,291)(129,371,511 - 129,372,359)
sequence
gaattctgggtcttcaatcatttaattggcgcagctctctacccagcctc
aagcagggaatctgttgaggtgtctcaactggaataagaagggacatagc
tgtcactgggtgagctgtatgcgtgacctgtctaggtggtgacttggtga
ttttgctgcctggccatggttgaaaggttgaagtcagctctatacttctc
agattgctcacaggggtggcacttgcagtatgcagggctcacaggagcac
caacatgtgtcccccagagaggatgtcaggtctagaaccagttgtcatac
atgctgtgactggggaatagacagatgtcatggctgaccttcgctgtcta
attcagtagactaggaaacacctaggacatctgtgcagtgaacctctaga
tgaagaagatgaggaagaccttaccctgagtgtgggtagtgccaccccat
gtctagggtccaggattgagcaaagggaagaagagaaagccagctgacca
ccagccttccactgtccctcttccttggcttgttgagatgtgaagagcca
gctgtgtactccacagctatggatcttgtcacacctgcagtcttctcagt
ccctgagccaacatggacccttcctcccatgagttgcttttgtcacaaaa
gtagctaatccaacagtgcacccagacacgaagcaggagcaaagactgaa
catagggccctgtgggttcatttaaccagagtcttagaagagaagaattc
cccactgggcttgagtctccttagaatctgctcacatgcatgctgtgaca
acagaaacccaagaaagtctgccagatttcaaaaacaaaaactcaggatg
cccagtttgagatacagtaggcttgaggcagatcctaatggttaaagggt
ccctctttcaaactatgagacgcagcatgtatctgaactgaaaaaaaaaa
aaaaaagacttgtttattagaacttcagatacagctgggaatctttctgt
gttttactgtgtgtgtcacagtatgcatgacctgtgcacaatgccaatag
tgtgcatgtgagctagagatagtcttctggtctcagcatctctactgtgg
agggtaggtttctcttgttcaccaactggtgtatgc
gaattccttggagagtgctctttgcaaccaaacggaagaacaaaaggaca
attctcagaagcacaccaaaaacgaaaccaaataaaaaccccataaaaaa
tccctatggggtaaaggaaataccagtctgatgccttttgtgtcttgtgt
tgggtcataaagggcaggctctctaagaggtggtgtcaacagtggcaatg
tggcaatgtttggactccagagagaatgctctggaaaacaatagaaggtg
acacccacgtgtctatgtgactggcagccatcagggacagcctcatggcc
agggcatgtatggagcctgggagaggcactgggcaggaaggagctcaaag
tttgcacatggtcaccgagagctggcaactgggcttgtcccttctgggca
tgactgatgtcagaggatctctgacctccacttagtcactagataccagt
ctggaactctctttgaagatgaagtaaacactcacagtgctgataataac
agctgggtgatgtcacacggttatctgtagcttgaagagctgcacctggg
tgctggagtgactgacaggcatcagactttctgttccctcatgggccttc
tgcacgaggggccacagtttgggggcgtggttcagaggctgcttcaagga
tggagctgaggatgcggtgactttcactcttgtttcaggaggtgacaaca
tgccagggatggagctgtgctgtcaaccacagcagctgcgtgtggcctgt
ggctggcagctcggcctacatgggtacctgccatgaggcttgtgggagat
ttcggttctgctctgtggctttgagcagcagggaagcccatggtgtgtgt

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_129221151_129222291
seq2: B6Ng01-333D24.b_45_1180

seq1  GAATTCTGGGTCTTCAATCATTTAATTGGCGCAGCTCTCTACCCAGCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGTCTTCAATCATTTAATTGGCGCAGCTCTCTACCCAGCCTC  50

seq1  AAGCAGGGAATCTGTTGAGGTGTCTCAACTGGAATAAGAAGGGACATAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGGAATCTGTTGAGGTGTCTCAACTGGAATAAGAAGGGACATAGC  100

seq1  TGTCACTGGGTGAGCTGTATGCGTGACCTGTCTAGGTGGTGACTTGGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACTGGGTGAGCTGTATGCGTGACCTGTCTAGGTGGTGACTTGGTGA  150

seq1  TTTTGCTGCCTGGCCATGGTTGAAAGGTTGAAGTCAGCTCTATACTTCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCTGCCTGGCCATGGTTGAAAGGTTGAAGTCAGCTCTATACTTCTC  200

seq1  AGATTGCTCACAGGGGTGGCACTTGCAGTATGCAGGGCTCACAGGAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGCTCACAGGGGTGGCACTTGCAGTATGCAGGGCTCACAGGAGCAC  250

seq1  CAACATGTGTCCCCCAGAGAGGATGTCAGGTCTAGAACCAGTTGTCATAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATGTGTCCCCCAGAGAGGATGTCAGGTCTAGAACCAGTTGTCATAC  300

seq1  ATGCTGTGACTGGGGAATAGACAGATGTCATGGCTGACCTTCGCTGTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTGACTGGGGAATAGACAGATGTCATGGCTGACCTTCGCTGTCTA  350

seq1  ATTCAGTAGACTAGGAAACACCTAGGACATCTGTGCAGTGAACCTCTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTAGACTAGGAAACACCTAGGACATCTGTGCAGTGAACCTCTAGA  400

seq1  TGAAGAAGATGAGGAAGACCTTACCCTGAGTGTGGGTAGTGCCACCCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAGATGAGGAAGACCTTACCCTGAGTGTGGGTAGTGCCACCCCAT  450

seq1  GTCTAGGGTCCAGGATTGAGCAAAGGGAAGAAGAGAAAGCCAGCTGACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGGGTCCAGGATTGAGCAAAGGGAAGAAGAGAAAGCCAGCTGACCA  500

seq1  CCAGCCTTCCACTGTCCCTCTTCCTTGGCTTGTTGAGATGTGAAGAGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTTCCACTGTCCCTCTTCCTTGGCTTGTTGAGATGTGAAGAGCCA  550

seq1  GCTGTGTACTCCACAGCTATGGATCTTGTCACACCTGCAGTCTTCTCAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGTACTCCACAGCTATGGATCTTGTCACACCTGCAGTCTTCTCAGT  600

seq1  CCCTGAGCCAACATGGACCCTTCCTCCCATGAGTTGCTTTTGTCACAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGCCAACATGGACCCTTCCTCCCATGAGTTGCTTTTGTCACAAAA  650

seq1  GTAGCTAATCCAACAGTGCACCCAGACACGAAGCAGGAGCAAAGACTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTAATCCAACAGTGCACCCAGACACGAAGCAGGAGCAAAGACTGAA  700

seq1  CATAGGGCCCTGTGGGTTCATTTAACCAGAGTCTTAGAAAGAGAAGAATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CATAGGGCCCTGTGGGTTCATTTAACCAGAGTCTTAG-AAGAGAAGAATT  749

seq1  CCCCACTGGGCTTGAGTCTCCTTAGAATCTGCTCACATGCATGCTGTGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACTGGGCTTGAGTCTCCTTAGAATCTGCTCACATGCATGCTGTGAC  799

seq1  AACAGAAACCCAAGAAAGTCTGCCAGATTTCAAAAACAAAAACTCAGGAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAACCCAAGAAAGTCTGCCAGATTTCAAAAACAAAAACTCAGGAT  849

seq1  GCCCAGTTTGAGATACAGTAGGCTTGAGGCAGATCCTAATGGTTAAAGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGTTTGAGATACAGTAGGCTTGAGGCAGATCCTAATGGTTAAAGGG  899

seq1  TCCCTCTTTCAAACTATGAGACGCAGCATGTATCTGAACTG-AAAAAAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCCCTCTTTCAAACTATGAGACGCAGCATGTATCTGAACTGAAAAAAAAA  949

seq1  AAAAAAAGACTTGTTTATTAGAACTTCAGATACAGCTGGGAATCTTTCTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGACTTGTTTATTAGAACTTCAGATACAGCTGGGAATCTTTCTG  999

seq1  TGTTTTACTGTGTGTGTTCACAAGTATGCATGACCTGTGCAC-ATGCC-A  1047
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  TGTTTTACTGTGTGTG-TCAC-AGTATGCATGACCTGTGCACAATGCCAA  1047

seq1  TAGTGTGCATGTGGAGGTTAGAGGATAGTC-TCTGGTCTCAGCAATCTCC  1096
      |||||||||||||   | |||| ||||||| |||||||||||| |||| |
seq2  TAGTGTGCATGTG--AGCTAGA-GATAGTCTTCTGGTCTCAGC-ATCT-C  1092

seq1  TACCTTGTTGGAGGTAGGGTTTCTCTTGTTCACC-ACT-GTGTATGC  1141
      |||  || ||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||
seq2  TAC--TG-TGGAGGGTAGGTTTCTCTTGTTCACCAACTGGTGTATGC  1136

seq1: chr8_129371511_129372359
seq2: B6Ng01-333D24.g_66_915 (reverse)

seq1  ACACACACCAT-GGCTTCCCTGCTGCTCAAAGCCACAGAGCAGAACCGAA  49
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACCATGGGCTTCCCTGCTGCTCAAAGCCACAGAGCAGAACCGAA  50

seq1  ATCTCCCACAAGCCTCATGGCAGGTACCCATGTAGGCCGAGCTGCCAGCC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCCACAAGCCTCATGGCAGGTACCCATGTAGGCCGAGCTGCCAGCC  100

seq1  ACAGGCCACACGCAGCTGCTGTGGTTGACAGCACAGCTCCATCCCTGGCA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCCACACGCAGCTGCTGTGGTTGACAGCACAGCTCCATCCCTGGCA  150

seq1  TGTTGTCACCTCCTGAAACAAGAGTGAAAGTCACCGCATCCTCAGCTCCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTCACCTCCTGAAACAAGAGTGAAAGTCACCGCATCCTCAGCTCCA  200

seq1  TCCTTGAAGCAGCCTCTGAACCACGCCCCCAAACTGTGGCCCCTCGTGCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGAAGCAGCCTCTGAACCACGCCCCCAAACTGTGGCCCCTCGTGCA  250

seq1  GAAGGCCCATGAGGGAACAGAAAGTCTGATGCCTGTCAGTCACTCCAGCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCCCATGAGGGAACAGAAAGTCTGATGCCTGTCAGTCACTCCAGCA  300

seq1  CCCAGGTGCAGCTCTTCAAGCTACAGATAACCGTGTGACATCACCCAGCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTGCAGCTCTTCAAGCTACAGATAACCGTGTGACATCACCCAGCT  350

seq1  GTTATTATCAGCACTGTGAGTGTTTACTTCATCTTCAAAGAGAGTTCCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTATCAGCACTGTGAGTGTTTACTTCATCTTCAAAGAGAGTTCCAG  400

seq1  ACTGGTATCTAGTGACTAAGTGGAGGTCAGAGATCCTCTGACATCAGTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTATCTAGTGACTAAGTGGAGGTCAGAGATCCTCTGACATCAGTCA  450

seq1  TGCCCAGAAGGGACAAGCCCAGTTGCCAGCTCTCGGTGACCATGTGCAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGAAGGGACAAGCCCAGTTGCCAGCTCTCGGTGACCATGTGCAAA  500

seq1  CTTTGAGCTCCTTCCTGCCCAGTGCCTCTCCCAGGCTCCATACATGCCCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGCTCCTTCCTGCCCAGTGCCTCTCCCAGGCTCCATACATGCCCT  550

seq1  GGCCATGAGGCTGTCCCTGATGGCTGCCAGTCACATAGACACGTGGGTGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATGAGGCTGTCCCTGATGGCTGCCAGTCACATAGACACGTGGGTGT  600

seq1  CACCTTCTATTGTTTTCCAGAGCATTCTCTCTGGAGTCCAAACATTGCCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTCTATTGTTTTCCAGAGCATTCTCTCTGGAGTCCAAACATTGCCA  650

seq1  CATTGCCACTGTTGACACCACCTCTTAGAGAGCCTGCCCTTTATGACCCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCCACTGTTGACACCACCTCTTAGAGAGCCTGCCCTTTATGACCCA  700

seq1  ACACAAGACACAAAAGGCATCAGACTGGTATTTCCTTTACCCCATAGGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGACACAAAAGGCATCAGACTGGTATTTCCTTTACCCCATAGGGA  750

seq1  TTTTTTATGGGGTTTTTATTTGGTTTCGTTTTTGGTGTGCTTCTGAGAAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTATGGGGTTTTTATTTGGTTTCGTTTTTGGTGTGCTTCTGAGAAT  800

seq1  TGTCCTTTTGTTCTTCCGTTTGGTTGCAAAGAGCACTCTCCAAGGAATTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTTTGTTCTTCCGTTTGGTTGCAAAGAGCACTCTCCAAGGAATTC  850