BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337M10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 127,463,870 - 127,603,232
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTsnax, Disc1
Upstream geneNup133, Abcb10, Taf5l, AK122209, LOC100042530, LOC100042535, Galnt2, Pgbd5, Cog2, Agt, Capn9, 2310022B05Rik, Ttc13, Arv1, 2310031A18Rik, LOC668444, Trim67, 2810004N23Rik, Gnpat, Exoc8, Gm505, Egln1
Downstream geneSipa1l2, 4933403G14Rik, 2310079N02Rik, E330039K12Rik, BC021891, Kcnk1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337M10.bB6Ng01-337M10.g
ACCGA122294GA122295
length7581,130
definitionB6Ng01-337M10.b B6Ng01-337M10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,463,870 - 127,464,622)(127,602,116 - 127,603,232)
sequence
gaattcctgatcctcctgcctcctcccccctaagtgcagggtttactgtc
atgctgctacctcagtttctgagatcatggaccaggaggttttgctctcg
agtgaggcacaactctaggagatattcggaccactgacagaggggagggg
aggcttctgaaatccccaaactcgatgctttctccaaaatgacagtttct
ctggtaagctttcctagcctatggactaccagggttcagcttctgagcgc
ccccaaaacagcaatccgtccaacccagctaggagctttccctccaacag
ctgagctgagaggacagagattgacctggcatctggggcccacaaaaggc
agattcatagtgtatgtagatagatactatagaaacaggtcacacacaga
atccagtttaaacctgttcctccatccactgactcctgtcctgccctact
agccctcacttcttctaacacaggggaactcaaaatgaaccacgctgtgt
ttgtcaagccttctaaaaatgggggggggggggctgtgtctcatccctgt
agagtcagttgctagggtgggagactgatgtaggagtctgtacatcctgt
tgtggctgctgcaggtatatacaaagaagccaggtacttgcgctctactg
tcctgggtcacatctactacaggtacactgatgcacctagcaggaaggtg
actcatccctctgctatacagatctatgtctaaaaccctggcaattcaat
gacagaaa
gaattcatttacatacaaaccatgcacattagttgctaagaacttggctc
ttcctgcttttatggtgcttctatatggtgagatcttgaagaaagcagtg
aactttaccctcagagtgagggtgtgaggaagccttggcctccacccatc
tgaggtgagccttggatacaaccatctgtttccacgttgtggaaagcaca
aaacatctccacccagctctctccgcaagctccagtatccaaagcagcac
ggcttacgacggttgaattatttaaatgagatgccactgtctcttgcagt
cactgccatcagacagatattacataaactctcagatcagggccatctgc
cacagcgggctgaaagccagagctgctggctgctccccgagggctgcgat
tcagagagtgttggtggctcctgtgcagacttgggtggtgtcaggtgacc
tggcaggttggaatcaaagggacaagtgcctgagccacttgaggctgggc
tctccaggaaggagcgagcctcacagcaggggtcagtgggcctggaagag
aagcaatacccagtgggcaccgaggtctcgctctgtggaatgcaggtcac
tggtgatgatctcataaaaaagcacgcttcacatgggggcacctatctcc
acagtgcagagacagccctctgcctgccgcactggctctcaccaccttct
tctggttcctgaggcataaacaacaaactcatcctctttgaacatcctgt
ggccaggtccgtgtggtcagcaagctctgtgggccttctgtcttcagaca
atggtggttttcttgtttgaaagtctcctccagtctgccttcctgagacc
tcttgatgcacctctgatcccagcgggagccctggtggggcagaggagat
attctacagagagacatgtgtgtcctgagtccatgctgagagggacagag
gaagctgctgggaacggagaaaatggaggccacctggaggcccagtctct
cctctctctggtgttgtgtcatcatgtgcgttcagaaggtcacatgtgta
tatatgcatattgccatgttccaatttacatatgtgttaccaccatgcca
tgttcagaatttctcaatgttgtgtatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_127463870_127464622
seq2: B6Ng01-337M10.b_46_802

seq1  GAATTCCTGATCCTCCTGCCTCCTCCCCCCTAAGTGCAGGGTTTACTGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGATCCTCCTGCCTCCTCCCCCCTAAGTGCAGGGTTTACTGTC  50

seq1  ATGCTGCTACCTCAGTTTCTGAGATCATGGACCAGGAGGTTTTGCTCTCG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCTACCTCAGTTTCTGAGATCATGGACCAGGAGGTTTTGCTCTCG  100

seq1  AGTGAGGCACAACTCTAGGAGATATTCGGACCACTGACAGAGGGGAGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGCACAACTCTAGGAGATATTCGGACCACTGACAGAGGGGAGGGG  150

seq1  AGGCTTCTGAAATCCCCAAACTCGATGCTTTCTCCAAAATGACAGTTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCTGAAATCCCCAAACTCGATGCTTTCTCCAAAATGACAGTTTCT  200

seq1  CTGGTAAGCTTTCCTAGCCTATGGACTACCAGGGTTCAGCTTCTGAGCGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAAGCTTTCCTAGCCTATGGACTACCAGGGTTCAGCTTCTGAGCGC  250

seq1  CCCCAAAACAGCAATCCGTCCAACCCAGCTAGGAGCTTTCCCTCCAACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAAACAGCAATCCGTCCAACCCAGCTAGGAGCTTTCCCTCCAACAG  300

seq1  CTGAGCTGAGAGGACAGAGATTGACCTGGCATCTGGGGCCCACAAAAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTGAGAGGACAGAGATTGACCTGGCATCTGGGGCCCACAAAAGGC  350

seq1  AGATTCATAGTGTATGTAGATAGATACTATAGAAACAGGTCACACACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCATAGTGTATGTAGATAGATACTATAGAAACAGGTCACACACAGA  400

seq1  ATCCAGTTTAAACCTGTTCCTCCATCCACTGACTCCTGTCCTGCCCTACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTTTAAACCTGTTCCTCCATCCACTGACTCCTGTCCTGCCCTACT  450

seq1  AGCCCTCACTTCTTCTAACACAGGGGAACTCAAAATGAACCACGCTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTCACTTCTTCTAACACAGGGGAACTCAAAATGAACCACGCTGTGT  500

seq1  TTGTCAAGCCTTCTAAAAATGGGGGGGGGGGGGCTGTGTCTCATCCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAAGCCTTCTAAAAATGGGGGGGGGGGGGCTGTGTCTCATCCCTGT  550

seq1  AGAGTCAGTTGCTAGGGTGGGAGACTGATGTAGGAGTCTGTACATCCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAGTTGCTAGGGTGGGAGACTGATGTAGGAGTCTGTACATCCTGT  600

seq1  TGTGGCTGCTGCAGGTATATACAAAGAAGCCAGGTACTTGCGCTCTACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTGCTGCAGGTATATACAAAGAAGCCAGGTACTTGCGCTCTACTG  650

seq1  TCCT-GGTCACATCTACTACAGGTACACTGATGCACCTAGCAGGAAGGTG  699
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGGTCACATCTACTACAGGTACACTGATGCACCTAGCAGGAAGGTG  700

seq1  ACACATCCC-CTGCTATACAGAAC-ATGTCTAAAACCCTGGCAA-TCAAA  746
      || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| 
seq2  ACTCATCCCTCTGCTATACAGATCTATGTCTAAAACCCTGGCAATTCAAT  750

seq1  GACAGAA  753
      |||||||
seq2  GACAGAA  757

seq1: chr8_127602116_127603232
seq2: B6Ng01-337M10.g_64_1193 (reverse)

seq1  TATATACAC-ACA-TGAGAA--TCTGAACAT-GCAT-GTG--TACACATA  42
      ||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| |||   |||||||
seq2  TATATACACAACATTGAGAAATTCTGAACATGGCATGGTGGTAACACATA  50

seq1  TGTAAATTTGAACATG--CATATGC--ATATACACATGTGAC--TCTGAA  86
      |||||||| |||||||   ||||||  |||||||||||||||  ||||||
seq2  TGTAAATTGGAACATGGCAATATGCATATATACACATGTGACCTTCTGAA  100

seq1  CGCACATGATGGCCACAACA-CAGAGAAGGAGAGGAGACTGGGCCT-CAG  134
      |||||||||| | ||||||| ||||||  |||  |||||||||||| |||
seq2  CGCACATGAT-GACACAACACCAGAGA--GAGGAGAGACTGGGCCTCCAG  147

seq1  GTGGCCTCCATTTTCTCCGTTCCCAGCAGCTTCCTCTGTCCCTCTCAGCA  184
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTCCATTTTCTCCGTTCCCAGCAGCTTCCTCTGTCCCTCTCAGCA  197

seq1  TGGACTCAGGACACACATGTCTCTCTGTAGAATATCTCCTCTGCCCCACC  234
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTCAGGACACACATGTCTCTCTGTAGAATATCTCCTCTGCCCCACC  247

seq1  AGGGCTCCCGCTGGGATCAGAGGTGCATCAAGAGGTCTCAGGAAGGCAGA  284
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTCCCGCTGGGATCAGAGGTGCATCAAGAGGTCTCAGGAAGGCAGA  297

seq1  CTGGAGGAGACTTTCAAACAAGAAAACCACCATTGTCTGAAGACAGAAGG  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGAGACTTTCAAACAAGAAAACCACCATTGTCTGAAGACAGAAGG  347

seq1  CCCACAGAGCTTGCTGACCACACGGACCTGGCCACAGGATGTTCAAAGAG  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAGAGCTTGCTGACCACACGGACCTGGCCACAGGATGTTCAAAGAG  397

seq1  GATGAGTTTGTTGTTTATGCCTCAGGAACCAGAAGAAGGTGGTGAGAGCC  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTTTGTTGTTTATGCCTCAGGAACCAGAAGAAGGTGGTGAGAGCC  447

seq1  AGTGCGGCAGGCAGAGGGCTGTCTCTGCACTGTGGAGATAGGTGCCCCCA  484
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCGGCAGGCAGAGGGCTGTCTCTGCACTGTGGAGATAGGTGCCCCCA  497

seq1  TGTGAAGCGTGCTTTTTTATGAGATCATCACCAGTGACCTGCATTCCACA  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGCGTGCTTTTTTATGAGATCATCACCAGTGACCTGCATTCCACA  547

seq1  GAGCGAGACCTCGGTGCCCACTGGGTATTGCTTCTCTTCCAGGCCCACTG  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGAGACCTCGGTGCCCACTGGGTATTGCTTCTCTTCCAGGCCCACTG  597

seq1  ACCCCTGCTGTGAGGCTCGCTCCTTCCTGGAGAGCCCAGCCTCAAGTGGC  634
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTGCTGTGAGGCTCGCTCCTTCCTGGAGAGCCCAGCCTCAAGTGGC  647

seq1  TCAGGCACTTGTCCCTTTGATTCCAACCTGCCAGGTCACCTGACACCACC  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCACTTGTCCCTTTGATTCCAACCTGCCAGGTCACCTGACACCACC  697

seq1  CAAGTCTGCACAGGAGCCACCAACACTCTCTGAATCGCAGCCCTCGGGGA  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCTGCACAGGAGCCACCAACACTCTCTGAATCGCAGCCCTCGGGGA  747

seq1  GCAGCCAGCAGCTCTGGCTTTCAGCCCGCTGTGGCAGATGGCCCTGATCT  784
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCAGCAGCTCTGGCTTTCAGCCCGCTGTGGCAGATGGCCCTGATCT  797

seq1  GAGAGTTTATGTAATATCTGTCTGATGGCAGTGACTGCAAGAGACAGTGG  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTTTATGTAATATCTGTCTGATGGCAGTGACTGCAAGAGACAGTGG  847

seq1  CATCTCATTTAAATAATTCAACCGTCGTAAGCCGTGCTGCTTTGGATACT  884
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCATTTAAATAATTCAACCGTCGTAAGCCGTGCTGCTTTGGATACT  897

seq1  GGAGCTTGCGGAGAGAGCTGGGTGGAGATGTTTTGTGCTTTCCACAACGT  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTGCGGAGAGAGCTGGGTGGAGATGTTTTGTGCTTTCCACAACGT  947

seq1  GGAAACAGATGGTTGTATCCAAGGCTCACCTCAGATGGGTGGAGGCCAAG  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACAGATGGTTGTATCCAAGGCTCACCTCAGATGGGTGGAGGCCAAG  997

seq1  GCTTCCTCACACCCTCACTCTGAGGGTAAAGTTCACTGCTTTCTTCAAGA  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTCACACCCTCACTCTGAGGGTAAAGTTCACTGCTTTCTTCAAGA  1047

seq1  TCTCACCATATAGAAGCACCATAAAAGCAGGAAGAGCCAAGTTCTTAGCA  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCATATAGAAGCACCATAAAAGCAGGAAGAGCCAAGTTCTTAGCA  1097

seq1  ACTAATGTGCATGGTTTGTATGTAAATGAATTC  1117
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATGTGCATGGTTTGTATGTAAATGAATTC  1130