BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064A07.T7 (MSMg01no064_a07.b1) | MSMg01-064A07.TJ (MSMg01no064_a07.g1) |
ACC | AG289606 | AG289607 |
length | 1,293 | 1,228 |
length of high quality (start - end) | 624 (42 - 665) | 382 (71 - 452) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_a07.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_a07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:08:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_a07.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_a07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:08:37 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (32,630,810 - 32,631,184) | (32,483,980 - 32,484,361) |
---|
sequence | CTTCCTTTTNNNTTCATTGGGCGCTAAGACTCCANAGGGAGAGGATCCGC
GGAATTCCACAATCTGGGAAGCACCCTTTGAAACTTTTTTTTTTTTTAAT
TCACTTTACATCCTGCCCTCTGCCCACCTCTGGCCAGCCCCTTCCACAAT
CCTTCCACCATCCCCTTCCCCTCTAAGTGAATACTGCACCCACCCCCCAC
CCCCGTAACCCCCTACCCCGGGCACTTTGAGTCTCTGTAGGGCTAGACAC
AATCTCTCTCACTGTACCTAGACAAGACAGCCTAGCTAGTAGAACATATC
CCACCCGCCGACAGGCAACAGCTTTTGGGAGAGCCCCTGCTCCAGTTGCT
ACACATGTGCAAGAAGGCCTAGGTCCAGCCTATGTATCCTCTCTGGTTAG
TAGTTCATTCCCTGGGAACCCTAAAGGTCTAGGTTAGTTGACTGTTAGTC
TTCCTGTGAGTACCCCTTGGGGCCCACAGTCCTTTCTACTTGAAACCAAA
ACTTTAACAGAGTAAAACTTTCCTAATTCTCTTATATAGCCTGACTTGCT
TGAGTTTTTCTTTACTTTGGATGAGATTAAGATATGTTATGGCTTGAGGT
TTTGGGTTTTTTTCTTCTTCTTTCCCAAGACTTACTGGCCATTTGAAAGT
AATTTTTTTTTCTTTATCAGACACATATTTAGAAAAATCATTAAATAATT
ACTAATGTAAAGTCTATTTCACACTTGTGAAGCGATTCCCTTTGAAATGC
CATTGTGCCTGTAAATTCATTTTCAAATCTGTGATAACCATATTCTTAAA
AGAATGACTATGTGAAGGGCTCAACTAATTATCCGTCTTTCTCTACAATA
TATTTATAGGAATAATATCATCTCTTTCATTAACAGATGGTTTGACTTAA
CTTGGCAAAATTCCCCCTATTAATACTTATATTTACCTTCACCGATAGCC
TGTATCCTCTTTCATTCCTTTGGTCTTTTTTTAAAAACTCTACCCCATTT
CTTTTGTTGTAAAAATTGTATATCCTTTATCCCCCTCTAACGTGCTGCTG
TTGGAATCCTTTACCTACTGTACTTTGTAGCCCCATTCAAAATGATTTTC
TATCAAATTTATATTTTTTCTACCCTCATAACTTATATCTCATTTTTTCT
CTCCTATATTTTCACTTCCATCATCTATAATATTCTTTATCTTAAGCTTC
ACATATACTCTTAATATCTTTTATATATCTTCCCTACCTTTATCTACTCT
TTTATACAACTCTTTTCTCTCCTCTCCTCTCACTCTCCATCTG
| NNNGGAGATGTGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGAAGGAGAAGCGGCACAGATACTGTTTGG
ATCTGCCATTGAAATGAGACAGCACAAACGGTCACTTTGTTTTGTTTTCT
TGCAACAGTGAGTTGCCTGGTACTGTTTCACATCCGTATAGGACATTGTT
AGGCTCACTCAGAGATTCTTCCCAGAGGCCAGTGGGCTATGGTGTGGGAA
AAGACTCCTGGAGAGAAATGACATTTTAGAAAACTCCACGTCAAGAAATT
GTGTGTTTCTGACTGAGTAGTTTCTAGAATGTAGACATAGTTACAACTAC
TTTGGATATTTTATGCCATTTAATCTTCATAACACCATATGAGGTAGAAA
TAAGTTTATCTATCTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC
TATTTTTTTCTCCCCCCCCCTATCTATCTATCTATCTATCAAAAAATCTA
TCTCAATTGTATAGAAGTTGACCTTTCCCAAAGCTATAACTACCAAGCAA
CAGGGCTGGTATCCAAATTCTGAGTTTCCTTAGGGGAAGGAGGGTTAAAT
ATATTTATGAAACCATTGAACTTGAACCATTTTGTTGAATTTGGAAAGTA
ATGGGCCATCGTGAATTTCTTTTTTTTTTTTAAAGATTTATTTTATGTGT
GTTTATTTGTCTGCATGTCTGTGCACTGTGAGCTCACAGAGGCCAGGAAA
AGGCATTGGATTCATTTCCTGAGACTGAATTACAGATGGTCATGAGCTGC
CCTGTTGTTGCTGGGGACTGAACCCAATTCCTGTGCAAGAGCAGCCAGTG
CTCTCACCATGAAGCGAGCCATCCCTTCTGTCTCCCTCTCTCTCTCTTTT
TCTTTTGCAACCGCGTTAATTAGTACAAAATAATAGGTTTTATTATGATA
TTTCCCCCCCCCCCTATATGCCCAATTAACCCCCTGGTTAAATTTAACTT
AAATTTAAAAAGTTGGCCAAAATATAATCATTAAAAACTTCCAGGTCCTC
CTGGTATTATTTTAATAATTCCACAACCCTCCCAAAAAAAATATTTTTTA
TCTTTGTCCCCCCCAATTTTTGGTAAGGTCTTCTCCCCCACCCTACAATA
AGGTGTTGGTGTGGTCCCTTCCTTCCTTCCTATTCTATTAAAATAGAATT
ATTTTTTGTCTCTTTCTAAGAAACAAAC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 7 9 9 21 3 0 0 0 3 7 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 15 19 8 8 8 3 0 3 9 19 19 16 19 19 24 29 33 39 47 50 47 50
53 53 53 53 53 53 53 50 50 36 36 36 33 44 39 37 37 37 24 21 10 6 6 6 7 6 8 8 11 12 12 21 18 30 34 37 40 47 59 59 59 59 59 59 50 50 38 42 37 36
50 50 50 50 36 36 31 33 33 33 33 21 21 11 11 10 12 10 10 10 17 17 28 34 43 39 36 36 50 36 36 28 26 28 28 23 23 37 34 43 42 42 42 42 57 68 68 50 48 48
54 48 54 54 54 54 57 50 50 57 57 57 57 57 50 50 53 57 57 57 57 50 50 50 50 50 46 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 50 50 57 57 57 59 59 54 57 57 57 57 57 59 59 57 52 59 57 57 57 57 57 57 57 52 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 43 43 52 52 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 50 52 57 57 43 43 35 35 35 50 50 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 59 59 59 59 59 59 50 47 50 43 43 43 59 50 44 42 29 29 29 42 42 57 42 47 47 46 46 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 48 48 48 59 59 57 57 57 44 44 28 28 28 40 40 54 57 57 57 43 47 39 36 36 43 43 57 57 57 48 48 48 48 48 48 40 40 43 43 40 43 39 47 39 43 43 43 43 39
39 39 23 23 12 16 15 13 11 12 12 12 15 16 15 26 29 39 43 50 53 57 57 48 48 48 46 46 43 47 47 46 39 39 35 35 35 47 43 48 54 48 48 54 47 59 43 44 30 32
40 34 47 30 30 27 22 30 28 44 37 43 43 46 54 57 57 47 44 43 43 43 43 57 57 48 47 40 36 28 28 36 44 59 59 57 57 57 57 54 50 50 47 44 44 43 42 43 39 43
43 44 44 57 57 48 44 44 43 43 43 43 43 43 44 44 48 59 57 44 43 43 43 43 59 43 47 48 48 43 43 43 43 40 46 32 42 37 37 41 42 39 43 43 43 43 43 43 39 43
37 39 32 32 35 39 43 48 43 43 43 43 43 39 43 47 37 34 32 25 25 24 24 13 14 14 28 28 28 12 12 11 19 19 34 34 40 43 37 39 33 30 30 32 37 43 39 43 43 43
35 39 32 28 20 32 32 40 40 34 34 23 22 22 32 32 46 46 41 47 47 48 48 48 30 21 21 15 15 22 33 29 42 35 28 24 21 19 23 25 36 37 46 43 43 36 30 19 17 17
18 27 28 42 28 28 19 22 23 31 31 33 33 13 11 10 12 10 9 10 19 13 13 13 18 15 16 12 10 8 8 11 12 15 11 10 10 8 8 8 8 12 11 12 9 10 10 17 24 16
14 11 13 10 11 10 10 10 10 10 13 10 10 10 17 17 24 22 17 11 11 11 11 11 17 19 10 10 10 10 10 11 10 13 10 13 8 11 8 9 12 19 20 20 24 18 15 17 9 9
9 9 8 10 6 6 6 6 8 10 10 12 19 21 22 19 18 18 22 24 37 30 21 15 13 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 19 19 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
12 10 10 10 10 24 15 15 12 12 10 16 19 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 11 8 8 8 23 23 30 16 15 10 15 10 10 10 8 7 11
10 9 8 9 8 8 8 8 10 15 23 28 21 16 10 10 10 13 13 13 8 6 6 6 7 8 11 8 8 8 9 9 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 12 15 13
10 10 9 8 8 8 8 8 9 15 10 8 8 8 8 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 10 10 13 10 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12
14 9 9 12 8 8 6 6 8 10 17 10 9 9 9 8 8 9 9 10 9 9 6 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 11 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 10 7 9 8 8 10 10 10 12 11 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8
10 10 9 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 10 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 8 8 8 6 6 10 10 14 10
10 10 9 9 8 8 10 8 8 8 10 10 13 13 12 12 12 8 8 8 6 6 8 15 16 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 10 9 10 10 10 8 8 6
6 8 8 8 8 8 8 11 12 9 12 11 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 13 7 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10
10 10 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 8 6 6 8 8 11 10 8 10 12 9 9 12 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10
8 8 10 12 8 8 6 6 6 6 12 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 10 6 6 6 6 6 8 8 7 7 8 8 8 7 7 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 9 9 10 9 11 12 13 8 8 8 8 8 12 12 19 19 19 10 10 13 21 19 29 17 28 28 36 34 36 36 36 36 37 39
39 43 43 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 43 34 32 31 42 42 37 37 48 48 46 48 48 48 48 54 57 57 57 57 57 57 50 47 42 57 46 46 48 48 47 47 48 48 48 48
48 57 57 57 54 57 57 50 50 50 50 50 57 57 59 59 48 57 57 57 57 68 59 59 38 32 20 18 21 18 12 32 32 50 57 50 50 50 57 57 57 57 59 57 59 57 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 57 62 62 62 62 52 52 43 43 33 35 35 47 44 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 52 52 43 57 44 43 35 43 44 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 59 59 57 59 59 59 59 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59
57 57 57 57 57 59 57 59 59 50 50 48 59 44 57 43 50 50 54 59 59 59 57 57 57 54 48 48 57 57 42 42 42 42 54 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59
68 57 54 54 54 54 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 48 48 48 48 47 37 37 30 25
28 24 13 13 13 29 30 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 48 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 32 32
18 24 18 22 17 24 14 10 10 6 6 6 9 18 37 26 19 13 13 12 25 28 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 28 25 15 11 11 9 11 11 11 14 10 12 13 15 24
32 37 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 48 48 57 59 54 54 48 59 59 59 48 48 48 48 59 57 59 54 54 54 57 57 54 54 48 48 48 48 48
59 59 59 35 35 35 42 42 43 43 57 57 57 57 59 54 57 57 59 59 57 57 48 57 57 59 59 57 59 59 59 47 48 48 48 48 54 57 57 57 57 47 47 47 57 59 59 59 59 57
57 57 57 57 68 59 59 54 54 54 54 48 48 48 48 54 48 48 54 54 54 59 48 54 47 47 48 43 47 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 47 47 48 43 33 33 37 37 37 37
39 39 31 28 32 28 34 28 34 28 28 28 30 30 30 37 41 41 41 41 41 39 33 33 36 36 38 50 50 57 57 43 43 43 43 28 28 15 20 20 34 34 48 54 42 42 29 32 36 36
36 39 46 43 43 47 42 42 28 28 20 41 27 42 42 42 39 39 43 43 43 39 39 35 28 28 23 20 15 26 21 28 21 22 19 15 13 10 10 10 13 13 24 19 18 10 10 8 8 8
8 19 17 15 17 18 25 15 18 20 21 17 10 10 10 17 23 37 37 21 21 12 12 10 10 11 23 17 26 29 22 21 12 15 15 19 28 22 23 19 13 13 10 9 9 9 9 19 21 25
18 15 15 15 13 13 9 10 10 15 20 24 15 14 15 11 11 16 17 19 17 29 25 20 10 10 10 13 10 12 17 24 15 10 10 9 9 8 8 9 9 9 9 10 10 15 14 10 10 9
8 8 9 9 10 10 13 19 15 17 12 12 12 12 12 11 12 12 10 10 10 10 13 19 8 8 8 8 10 10 12 11 17 10 10 10 19 13 14 14 15 13 15 12 14 12 21 21 28 22
22 23 18 17 16 13 11 11 11 16 12 10 9 10 10 9 9 9 9 10 11 10 10 11 10 13 13 10 8 8 8 10 14 19 21 23 23 23 15 17 8 8 8 11 18 12 8 8 8 8
10 15 14 9 10 10 10 12 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 15 14 14 16 14 14 13 9 9 9 9 10 9 13 8 8 8 8 8 10 8 13 11 21 18 11 8 10 9 9 11
11 9 9 8 8 8 8 14 10 15 11 11 11 12 12 11 11 11 11 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 10 10 9 8 8 6 6 6 6 8
8 10 9 11 15 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 9 10 11 13 10 8 6 6 6 6 9 8 13 11 10 9 9 10 10 8 8 12 13 8 8 8 8
8 8 8 8 8 11 12 12 12 14 13 10 10 8 8 8 10 15 11 15 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 13 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12
10 8 8 8 8 8 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 16 16 12 6 6 6 6 6 6 12 8 9 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 15 10 10 9 9 9 8 8 6
6 8 13 28 13 9 9 9 9 9 9 10 9 11 8 8 8 8 6 6 6 10 6 9 10 10 6 6 |