BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064H02.T7 (MSMg01no064_h02.b1) | MSMg01-064H02.TJ (MSMg01no064_h02.g1) |
ACC | AG289913 | AG289914 |
length | 718 | 733 |
length of high quality (start - end) | 320 (45 - 364) | 52 (173 - 224) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_h02.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_h02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_h02.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_h02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:23 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAGCAAATCTCCTAAAGCCAATTGATCGAACAAATGATTTAATGTA
AAGACCTCATACAAAACATGGTTTTCCTGAGAGTTTCACTTTTAACACGT
AATTTCTAGAATTTTAAAACTATTTTAATAGTTTTATTACTTGTAGTGAT
CTATTTCTATAACTTGTAGCCATCCACTTTGTTAGTTGCTTTGTTATAGA
AGGCCAAGGAAACAAAATGAGCAATCAGCTTTATTAAATACACTGTACAA
ATCATGGTAATAATTATTTATTAAGAAACTTTTAATCTAGATTATAATAG
ATGCCACTTTGTATCTCCCACCACTACCCCAATTAACTGTTTAGGAAGAT
GTAGGGAAATCAGATTCTTCATATACTGTTAGTGAGAATGCCAAGTTGGT
CTACTATAGAAGTAACTCAGTGAGACTTCAACCATATGCACATATACTTA
CCAAATGACCTAGCAACCAAATCTATTACTTGATTTTTGTTAAAAGAATT
AAAAATCATTTAGGCAATACACACACACACACACACACATATCAAAGTAT
AGCACTCACAAATACTAGCTACATAGAATAAGCCAAATATCCATTTATTG
TTGGGACAACTATAAGACTAAGCCATAATATTGGGGTGAATTACTATACA
ATTCATAGCACGAATGAA
| CATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATGGTTAAATAAGGAAGTTAAACCTG
AATTAAAGGAATTAATAACTTTAATCCTGGAAACCTGGTGAACTTAATAA
TTTAAAAAGGGGCTTGAAATACCTTTTTTTTGCTTTGCTAAAAAATTTTT
AAATAAGGAATTTCCTAATTTACCTTTCCAAAGGTATCCCCAAAGTCCCC
AAAACCCCCCCTCCCCTAACTAACACTCCCACTTCCTGGCCCCGGGGGTC
CCCCGGACCGGGGCAAAAAAAGGTTGCAAGAACCAGGGGCCCCCCCCCCC
CAAGAAGGCCCAATAATTTATTGGCCCCCCCCGCCGCCAAAAACCAAAAC
TCCGGGGTACTGGTTAAGTCCAAAAGGTGGACCAACCAAAAGGTTACCGA
ACCCCTTAACTCCCTGGGTGCTTTCCCCAACTCCCCCAATGGCGGCCCCG
GGGTCCCTCCGAAAACTGAACAAAAGGCAAGGGGAGTCCGGCCCCTTTAA
ACCCTTGGAAAAATTCCAAACTAACTAAACCGCTCCTTTTGAAAAACAAA
AGCGCCGCCACTGGACCAAAGGACCCCAAAAAGGAATAAGAATATTGGAA
GAAGTGGTGAAAAACCTAAAAAAATAACTTAATTGAAAAAAAAAAACCAC
CCCAAAAAGGCGTTTGGACCCCCAAAAAGAAGG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 15 37 47 41 37 37 37 29 29 37 25 21 10 10 10 22 22 41 30 30 31 31 31 32 48 48 53 53 50 59 59 59 59 47 47 39 34 37 42 39 47 47 42 47
42 42 42 36 28 28 36 36 47 44 44 37 36 43 43 36 36 44 44 48 42 37 37 37 42 42 57 57 57 47 47 47 57 47 54 54 57 57 57 57 57 57 68 57 57 47 47 47 57 57
68 59 44 43 43 37 37 35 35 36 42 37 37 50 50 50 50 50 50 50 57 59 59 44 43 52 52 41 41 38 57 57 57 44 57 43 42 37 37 43 50 50 57 57 57 57 52 52 52 57
57 57 43 43 43 43 43 44 42 57 57 57 57 57 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 43 59 43 59 59 52 52 43 44 43
52 52 59 59 59 52 52 52 59 59 59 52 52 43 59 43 59 44 43 27 41 38 43 57 43 39 39 43 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57
50 44 43 37 37 37 50 50 68 57 57 52 52 52 57 59 57 57 59 59 54 54 47 59 35 35 35 35 35 37 48 57 68 57 57 59 59 59 57 42 42 35 35 39 42 48 44 48 48 57
57 43 47 44 42 40 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 43 48 48 59 59 59 43 42 30 31 31 41 41 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57
46 43 43 37 37 28 28 24 31 21 15 12 11 11 12 21 25 16 11 10 10 10 9 9 8 8 10 21 10 10 10 17 21 59 59 40 40 43 43 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 39 33 30 43 41 41 41 43 37 42 32 37 44 43 46 48 43 43 43 43 43 43 57 59 59 59 59 59 57 44 32 32 20 20 32 34 42 47 40 44 26
26 36 36 43 43 44 44 59 59 57 57 57 57 57 43 43 36 32 27 43 43 54 59 59 43 50 43 43 29 29 44 35 42 43 59 59 59 57 48 48 48 48 59 59 59 43 43 44 59 44
48 48 48 48 48 57 44 57 47 32 32 34 32 39 37 36 35 37 37 42 44 30 39 39 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 59 53 44 43 39 41 41 41 34 44 41 37 32 41 41 59 59 40 40 39 39 39 35 35 37 35 36 37 37 35 35 35 35 35 37 35 35 35 34 36 32 33 30 36 36 44 59 44 43
46 41 39 34 34 34 25 25 28 36 43 57 59 59 59 43 43 36 36 39 42 37 43 43 43 43 57 57 43 48 43 43 36 36 36 43 43 47 47 37 37 28 28 28 37 41 42 40 41 41
41 36 31 31 29 32 37 37 37 37 40 40 35 39 34 34 28 34 34 30 24 24 18 19 20 32 34 59 59 59 43 41 37 37 43 43 47 41 41 39 40 43 40 40 37 47 30 37 37 37
25 25 19 23 20 28 28 37 31 35 35 40 36 37 39 39 25 25 | Open.Hide.10 13 9 9 9 7 8 8 8 10 8 13 11 9 19 11 11 12 9 11 11 16 17 11 12 12 15 15 15 9 18 9 10 10 11 15 19 20 10 11 11 13 12 12 16 15 8 10 10 9
9 9 12 11 12 12 22 16 16 12 12 12 12 12 12 12 13 9 19 9 9 11 13 12 13 12 12 11 15 12 19 24 20 15 15 12 12 12 19 12 13 13 16 18 19 12 12 12 13 12
16 12 19 18 32 21 21 13 13 13 19 19 13 24 12 12 11 15 15 18 15 24 18 12 12 12 18 16 22 32 21 21 10 11 11 15 15 15 20 20 27 27 23 23 24 27 12 16 9 12
12 38 32 27 18 18 13 13 14 32 24 21 12 12 12 12 12 12 11 11 11 12 12 14 38 38 68 68 59 38 32 17 17 17 17 32 18 14 14 14 16 16 34 17 19 19 44 44 59 38
38 14 14 14 26 24 12 16 11 12 12 38 24 26 26 26 27 27 31 41 38 15 13 13 13 26 32 26 20 20 22 21 13 12 12 13 13 13 26 15 20 15 34 13 12 12 12 27 28 13
13 12 16 11 15 15 38 38 38 38 13 13 13 24 38 20 19 13 15 13 18 13 18 16 16 16 14 16 27 32 20 18 15 15 14 14 13 32 24 27 27 13 12 12 12 19 12 24 15 20
28 28 17 17 17 28 20 23 18 16 18 15 11 9 12 12 13 19 21 30 21 14 14 12 21 12 12 11 11 12 12 12 12 19 12 15 15 41 23 24 12 18 18 28 28 28 28 21 28 16
16 11 12 11 12 12 21 15 15 11 18 15 15 14 14 14 15 15 12 12 11 11 11 12 16 15 15 19 17 12 13 10 12 12 11 11 11 12 12 19 19 19 14 14 14 15 19 19 15 15
14 18 14 13 12 27 16 16 9 12 12 15 12 16 15 21 12 11 12 12 11 11 12 21 24 32 23 21 13 12 12 12 12 12 13 13 18 18 24 18 18 18 15 15 15 18 18 16 15 11
15 15 30 14 17 13 28 26 28 14 14 14 14 14 12 22 15 16 16 11 15 15 20 24 24 28 24 19 15 21 13 13 13 21 23 18 19 20 20 18 12 11 11 11 12 16 16 15 15 18
24 23 21 19 11 12 11 12 12 18 15 18 20 21 28 20 15 15 12 12 12 15 23 20 17 11 12 12 11 15 15 23 13 8 7 7 8 10 21 23 32 19 24 22 28 28 34 34 47 41
30 30 17 17 18 25 25 31 31 25 19 14 14 14 19 21 23 24 18 12 12 12 12 18 15 20 20 18 26 18 12 12 11 12 12 12 12 12 28 12 17 17 19 26 26 18 12 12 16 16
20 11 11 11 11 13 14 18 14 18 12 11 11 18 11 15 13 15 13 15 15 24 20 20 19 17 12 12 15 21 14 18 20 21 24 12 12 11 12 12 13 14 19 13 13 13 19 18 17 17
15 12 12 12 12 12 19 22 14 17 15 20 18 14 10 10 10 10 12 13 22 14 17 11 11 11 11 10 11 12 14 17 21 15 15 17 19 21 22 14 14 14 18 22 14 13 9 9 9 6
7 6 11 8 10 10 9 9 10 12 9 10 10 10 16 11 11 11 16 16 22 19 18 20 20 25 18 17 17 16 11 11 11 |