BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-079L05.T7 (MSMg01no079_l05.b1) | MSMg01-079L05.TJ (MSMg01no079_l05.g1) |
ACC | AG300718 | AG300719 |
length | 711 | 712 |
length of high quality (start - end) | 665 (40 - 704) | 572 (69 - 640) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no079_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no079_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:24 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCC
AGGCACTTGTGAGCCTCAGTACTAGATACTGGTGCTGGGAATCACACTGG
GTTCTCTGTAAGAGTAGTGCATGCCTTTCTCCACTAGGCCATCTCATCTC
TAGTGCCACACCTGGCGTCTGTAAGTGCTGGCAGTTTAGGCCCTCATGAT
TGCATAGCAGGAGATCTTACCTACTGAGTCATCACCCAGCCTCAGTTTGA
ATTAAACTACTGATGCTCTGGCAACTAAGATGCTAGGACATTATTTCCTA
GCATCTTATTAATCATTAGTTTTTAAAATGAAAATCTTCATCTCTCGGAT
CCAGTGGTAGAACTGCTTGCTGTAGAGGGAGATTAAAAGGAGGTATTCTT
ACTCTAGATACATTTACTTTAATCCAGATATCAGAGAGAATACCATTGCT
TCTAAAATGGTCTGGTTAATGCAAAAAACACAGTATACATTTAAGGTAAG
TCTATCATATTTAAATACTCAACCCAAGGGGATTATTAATGACAAAGCTA
GCTATTGACAGTTTCAGAGGCTATTTCTATATTGACATGTAACAGTGAAG
AAAGCAGTTTTATACATGGAGGAAAAGACTGAGAAAAGTGAGTAACATAC
TTAAAGGATCCATAAGGAATGTAGATAGATCAGCTTCTACACTCTTGCCA
AACCTTCCAGA
| GATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCA
CCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAA
CAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAAT
TCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCT
CCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCCGTCT
GGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCAGAGGATCCAGCAATA
CCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACAC
ATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGTTGGA
AAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTAC
ATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAA
ATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAA
CACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATAT
TAGCCCAAAACCTAGGATACCAAGATATTAGATACAATTTCCTTAACACA
TGAAACTTCAGA
|
quality values | Open.Hide.18 18 28 28 29 30 23 21 19 17 13 17 10 9 9 19 21 33 33 27 21 13 12 12 22 22 25 13 10 9 10 10 10 23 23 22 15 19 20 29 28 48 48 36 36 36 50 50 37 37
37 40 42 47 50 48 43 40 35 28 28 22 32 32 48 48 48 48 50 50 68 53 53 51 51 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 50 50 51 51 51 50 57 57 57 57 68 68 48 48 46 46 46 48 57 57 57 57 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 57 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 52 52 52 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68
68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 54 57 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 48 57 48 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48
54 54 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 47 47 39 39 39 37 43 39 37 37 37 37 37 35 31 31 39 43 59 59 47
50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 47 57 39 39 39 36 36 43 43 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 57 57 57 48 46 43 47 47 43 43 28 34 25 28 28 37 32 32
31 31 37 37 37 39 40 40 41 43 34 34 19 19 12 25 24 31 31 37 29 29 29 29 30 30 24 25 30 28 30 28 28 28 37 37 43 43 39 31 24 22 22 29 29 37 41 37 37 35
25 27 32 32 43 39 39 39 34 34 28 28 28 32 28 29 11 11 9 15 8 8 8 8 8 12 19 24 32 43 43 39 39 39 39 34 32 21 28 22 28 28 37 47 47 59 37 32 25 25
25 24 17 11 11 11 17 16 18 18 14 | Open.Hide. 6 6 6 8 21 21 11 12 10 14 18 24 27 29 33 33 31 31 33 33 33 42 42 37 29 23 13 9 9 11 11 9 12 11 15 13 19 20 24 24 23 22 9 9 10 23 26 57 57 57
57 57 53 43 42 32 24 28 28 21 21 16 15 32 32 50 47 47 42 42 42 47 50 57 57 57 68 48 50 50 50 40 40 57 50 51 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 51 48 48 48 48 48 46 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 51 68 50 48 48 48 48 46 50 50 50 50 50 50 57 57 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 43 42 42 44 43 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 57 57 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48
48 48 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 43 48 48 57 48 59 48 43 43 47 43 43 43 40 40 43 43 43 43 43 43 37 37 33 33 39
39 39 39 39 32 29 29 32 41 41 41 41 41 46 48 48 47 47 36 30 36 36 39 39 43 43 43 43 43 43 43 43 48 42 42 30 30 28 34 30 42 42 39 32 32 32 30 36 36 43
43 43 43 40 40 28 28 28 32 32 43 43 42 42 30 30 30 32 30 30 31 31 31 24 24 20 20 26 32 32 35 35 39 39 47 39 39 37 37 35 31 31 41 41 41 41 41 43 34 34
35 37 37 37 27 27 15 13 13 18 21 37 39 39 37 37 41 43 41 41 41 41 37 38 34 34 39 31 32 31 28 28 30 25 25 28 32 34 39 37 33 33 27 25 13 13 9 11 13 23
30 37 37 30 22 21 11 11 11 19 15 22 24 32 31 31 33 33 30 37 28 24 24 24 24 30 28 31 18 18 14 21 23 35 28 28 24 23 19 19 15 18 17 19 9 10 8 8 8 11
15 10 10 10 10 9 14 14 12 13 12 10 10 9 11 10 14 10 10 12 19 19 17 20 22 25 18 10 10 10 26 21 19 15 10 10 10 10 15 15 27 27 14 11 9 9 9 9 9 9
9 8 10 10 10 10 10 9 9 10 10 9 |