BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-125B21.T7 (MSMg01no125_b21.b1) | MSMg01-125B21.TJ (MSMg01no125_b21.g1) |
ACC | AG334293 | AG334294 |
length | 728 | 717 |
length of high quality (start - end) | 591 (77 - 667) | 492 (46 - 537) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no125_b21.b1 PHD_FILE: MSMg01no125_b21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:37:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no125_b21.g1 PHD_FILE: MSMg01no125_b21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:37:03 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (85,562,803 - 85,563,393) | (85,722,157 - 85,722,632) |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGAAGGCGCG
GAATTCAAGATTCCATCACATGGTTATGCACCACCATGATCCCTTATTTC
ATTCTTAAATGTTACACATGACTAAACTAGCACAGAGCTGTGTGAATTAG
GAGACATTACTTACACCATCACTTCTTTAAGGCAGTTTAAGGAAATGGTC
TTAATTTCTTCCCATATTCTAAATTAGTTTATTTTAGCTTAGTCTAGTCT
TGTCTTGTCTTCTTCAGACAGATTCTCCCTAGGTAACTCAGACTGATCTT
AAAGTTGTGATCCTCCTGCCTCAGACTTCCAAGGATCCCTGGGATTACAG
TTATGCACCACCATACTGCACTGGGGATTTCTTATTTAAGGACCATTGGG
AAGAGCCCACCTCTGCACAGTGATGCCTGTCAGTCCTTCACCTCTGTATC
CCTGGCTGTGCAGAGAGCTTTTGAGGAACTGGAGCCCTTGAGAGTCTTGA
ATGCTATCAGTCACAAAATCACACTTATGGATTACACCCCAGCTCTCCTT
GGAAGAATATCAACTCGTGGATGATGTAGTTGTGATTTCGACTCATTTGA
CTGTTCAAATCCAGGTGTTTTGGGTGTACTATATTTCTTTGTATTTGTGT
TATTTTTAGCTCAGTCCATTATGTACCTAAATATACAAATACACAGCACT
TGAGTCCAAACCCGAGCTGGAGACAATT
| ATGCAGTGCGAGCCTGGCGGCGCCGGCCTTCAAAAAGAGGTGACCTATAG
AAGGATTCCCCGAATTCTCACATATGCCAGCTTTTGCTATGCAGACCTCG
CTCCTTAATGTAAAACTATTGGTTGAATACAGATGCCTACAGCCTAAAGC
TAGGCAGAAAGCAGCTAGACAGGGCTTCAGTTCCTGGGCTTGGAGTCTGA
GGCAGAGACCACAGGAGAAAAAAAGGAACTCTGAGAAGAAGAAAGGGGAC
GACACCTTCTGCCAGGAAACATGACAGGAGACAGACATTATGATGGGCCT
GAAGGTATAGCTAGCCCTGTGGATGGATGGGGCTAGGTGGTCAGGTTTAC
TTAGCTGAGCTAGTTGAGAGTCTGCCCAGCTATGGCCTAACCAAGTTTTC
AAATATTAAGAGGTTTCTGTTTGGTTATTGGGAACTAGCTGGTTAAGGAA
TAATTGCCGCTGTAATTTCCAGGATTAGTTATTATCTACAGAATATTAAT
AACCATTAATTTACACTGGACTTTTAAACATTTTTCAGGGGCAGAGATAT
GGTAGAGGACCCAAATTCTGTCCCCAGCACACACACTGGGAAGCTTACGA
CTTCCTGTGCCTCAAATTCTAAGGGGTTTAATTCCTTCTTCTGCTTTCCA
CAGGGGGTGCATGCACCCAGGGACTGGGACACACTCACCCGTACCACCGA
CCCCCTCAGATTCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 9 9 18 23 29 30 33 28 28 17 17 17 29 29 36 36 36 36 38 36 53 48 28 28 24 19 19 21 22 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15
27 27 37 31 33 31 31 30 28 33 33 25 23 11 11 9 9 9 9 9 9 13 11 15 14 23 24 28 25 20 33 36 36 36 38 38 38 42 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 36
36 36 42 57 57 57 57 54 48 50 48 48 41 50 50 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 43 38 36 32 35 36 42 41 50 50 50 57 68 68 68 57 57 57 48 50 50 50 50 47 48
48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 50 50 50 50 50 47 52 52 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 57 57 57 50 38 23 19 11 11 27
27 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 62 62 62 52 62 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 62 62 68 68 62 62 39 39 39 39 39 26 20 14 16 23 43 44 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 44 44 29 43 43 57 52 52 52 57 52 43 43 43 43 52 57 57 59 57 54 54 57 59 57 57 59 59 57 52 52
52 57 50 57 52 48 48 59 59 57 57 46 43 43 44 44 48 57 59 59 57 48 48 48 48 46 46 48 48 48 48 46 44 46 57 54 44 44 42 42 35 37 37 46 44 37 44 39 57 44
43 43 47 47 48 48 46 42 37 36 28 28 32 41 42 48 48 43 43 43 43 43 43 48 57 57 57 48 48 48 48 39 43 30 30 30 30 37 34 30 24 15 15 19 26 32 47 39 39 39
34 34 39 41 41 47 47 47 47 59 43 41 41 59 47 57 48 48 43 43 43 43 43 37 37 28 28 28 28 28 40 40 48 48 48 43 43 43 37 33 37 32 28 22 26 26 33 32 37 35
31 31 30 28 30 37 37 28 28 35 31 31 35 36 36 36 36 27 30 28 27 20 18 15 15 15 24 22 28 37 41 41 46 46 46 47 41 33 19 15 10 10 10 18 23 37 37 39 31 23
19 14 14 11 22 25 44 47 47 35 34 28 23 14 12 12 15 13 16 17 15 17 11 15 11 12 12 16 15 14 18 22 22 12 13 8 8 8 12 12 12 9 10 10 10 10 10 11 14 14
17 16 12 13 13 11 10 12 13 13 14 19 19 18 15 14 14 15 19 22 15 21 11 12 12 11 11 11 | Open.Hide. 8 10 8 8 8 10 11 8 7 6 8 8 10 18 21 41 25 22 11 10 10 21 21 8 8 8 6 9 9 12 9 15 12 11 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 14 25 21 33 28 35
35 33 33 19 21 10 13 13 12 12 9 9 21 18 30 30 33 33 28 33 33 33 32 36 57 42 42 42 43 43 50 50 50 47 47 47 47 47 48 48 48 42 36 32 32 42 47 57 59 57
48 48 48 48 47 44 37 37 41 42 42 47 48 48 44 44 43 42 37 33 28 37 37 47 57 57 47 44 41 37 37 37 42 42 47 48 57 57 57 47 54 54 57 57 57 50 44 43 44 50
57 57 57 44 43 43 43 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 57 52 44 44 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 45
45 43 57 43 43 43 39 39 43 57 57 39 39 39 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 43 44 35 35 35 43 43 52 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 52
52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 45 45 62 62 62
62 62 47 39 39 35 43 44 62 62 62 62 62 52 52 43 44 29 29 23 14 14 16 29 43 43 52 62 62 52 52 43 47 43 43 43 35 26 28 14 14 14 38 38 52 52 52 62 62 62
62 62 43 35 35 39 43 35 57 44 38 32 18 18 23 34 30 35 20 20 20 35 38 39 52 52 57 43 52 57 52 57 57 57 57 57 43 43 28 28 28 33 33 42 43 52 52 57 57 43
43 32 35 41 42 38 38 28 28 33 32 43 32 32 22 32 43 50 43 43 43 35 32 32 43 35 37 43 43 28 23 23 23 36 36 43 36 35 35 35 35 35 43 43 44 43 43 37 44 39
44 41 57 47 47 43 37 37 30 27 28 20 28 36 44 44 57 46 47 41 42 39 35 35 32 36 28 37 41 43 37 37 37 43 43 39 30 27 30 17 17 24 19 25 23 31 24 20 20 28
28 28 28 28 28 30 37 39 43 39 43 33 33 24 28 20 23 20 28 28 35 33 34 31 24 20 18 19 20 23 23 34 34 19 19 22 22 21 21 23 18 18 18 18 20 24 24 37 39 25
23 11 11 11 19 19 29 31 32 33 33 28 31 32 32 28 32 19 18 11 16 25 32 37 32 28 19 8 8 12 12 14 20 25 29 22 19 21 14 14 12 16 12 15 12 22 12 11 10 19
15 17 16 16 21 24 21 28 28 23 21 10 12 12 15 19 26 34 34 39 30 30 28 28 21 12 10 10 10 10 15 19 39 34 34 39 39 37 30 26 15 15 13 19 19 34 28 32 23 23
22 28 17 16 11 11 11 15 11 11 11 10 15 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 9 9 9 13 9 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 13 13 8 8 8 9 9 10
16 12 14 14 10 10 8 10 8 10 8 8 7 11 10 7 7 |